Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37690 Date Thu Jan 5 11:57:02 GMT 2012 Unique Job ID 02676dfa28fa15fd

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	R	A	V	K	P	R	R	F	A	I	R	P	I	I	Y	A	S	V	L	S	A	G	V	L	L	C	A	F	S	A	H	A	D	E	R	D	Q	L	K	S	I	Q	A	D	I	A	A	K	E	R	A	V	R	Q	K	Q	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	A	S	L	L	A	Q	L	K	K	Q	E	E	A	I	S	E	A	T	R	K	L	R	E	T	Q	N	T	L	N	Q	L	N	K	Q	I	D	E	M	N	A	S	I	A	K	L	E	Q	Q	K	A	A	Q	E	R	S	L	A	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	D	A	A	F	R	Q	G	E	H	T	G	I	Q	L	I	L	S	G	E	E	S	Q	R	G	Q	R	L	Q	A	Y	F	G	Y	L	N	Q	A	R	Q	E	T	I	A	Q	L	K	Q	T	R	E	E	V	A	M	Q	R	A	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	E	K	Q	S	E	Q	Q	T	L	L	Y	E	Q	R	A	Q	Q	A	K	L	T	Q	A	L	N	E	R	K	K	T	L	A	G	L	E	S	S	I	Q	Q	G	Q	Q	Q	L	S	E	L	R	A	N	E	S	R	L	R	N	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	R	A	E	A	A	A	K	A	R	A	E	R	E	A	R	E	A	Q	A	V	R	D	R	Q	K	E	A	T	R	K	G	T	T	Y	K	P	T	E	S	E	K	S	L	M	S	R	T	G	G	L	G	A	P	R	G	Q	A	F	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	V	R	G	P	T	L	H	R	Y	G	E	Q	L	Q	G	E	L	R	W	K	G	M	V	I	G	A	S	E	G	T	E	V	K	A	I	A	D	G	R	V	I	L	A	D	W	L	Q	G	Y	G	L	V	V	V	V	E	H	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		G	D	M	S	L	Y	G	Y	N	Q	S	A	L	V	S	V	G	S	Q	V	R	A	G	Q	P	I	A	L	V	G	S	S	G	G	Q	G	R	P	S	L	Y	F	E	I	R	R	Q	G	Q	A	V	N	P	Q	P	W	L	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?				?																																?			?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand