Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P18392 Date Thu Jan 5 11:36:55 GMT 2012 Unique Job ID 02085f6bdf69d422

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	K	L	F	I	Q	F	Y	L	L	L	F	V	C	F	L	V	M	S	L	L	V	G	L	V	Y	K	F	T	A	E	R	A	G	K	Q	S	L	D	D	L	M	N	S	S	L	Y	L	M	R	S	E	L	R	E	I	P	P	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																													?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	W	G	K	T	L	K	E	M	D	L	N	L	S	F	D	L	R	V	E	P	L	S	K	Y	H	L	D	D	I	S	M	H	R	L	R	G	G	E	I	V	A	L	D	D	Q	Y	T	F	L	Q	R	I	P	R	S	H	Y	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	V	G	P	V	P	Y	L	Y	Y	L	H	Q	M	R	L	L	D	I	A	L	I	A	F	I	A	I	S	L	A	F	P	V	F	I	W	M	R	P	H	W	Q	D	M	L	K	L	E	A	A	A	Q	R	F	G	D	G	H	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?																																														?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	R	I	H	F	D	E	G	S	S	F	E	R	L	G	V	A	F	N	Q	M	A	D	N	I	N	A	L	I	A	S	K	K	Q	L	I	D	G	I	A	H	E	L	R	T	P	L	V	R	L	R	Y	R	L	E	M	S	D	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	A	A	E	S	Q	A	L	N	R	D	I	S	Q	L	E	A	L	I	E	E	L	L	T	Y	A	R	L	D	R	P	Q	N	E	L	H	L	S	E	P	D	L	P	L	W	L	S	T	H	L	A	D	I	Q	A	V	T	P	D	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?																												?	?	?	?	?																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	V	R	I	K	T	L	V	Q	G	H	Y	A	A	L	D	M	R	L	M	E	R	V	L	D	N	L	L	N	N	A	L	R	Y	C	H	S	T	V	E	T	S	L	L	L	S	G	N	R	A	T	L	I	V	E	D	D	G	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	A	P	E	N	R	E	H	I	F	E	P	F	V	R	L	D	P	S	R	D	R	S	T	G	G	C	G	L	G	L	A	I	V	H	S	I	A	L	A	M	G	G	T	V	N	C	D	T	S	E	L	G	G	A	R	F	S	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
Sequence		W	P	L	W	H	N	I	P	Q	F	T	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand