Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P31447 Date Thu Jan 5 11:47:37 GMT 2012 Unique Job ID 01d1d50d0eade7ac

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	R	P	N	F	L	F	V	M	T	D	T	Q	A	T	N	M	V	G	C	Y	S	G	K	P	L	N	T	Q	N	I	D	S	L	A	A	E	G	I	R	F	N	S	A	Y	T	C	S	P	V	C	T	P	A	R	A	G	L	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	G	I	Y	A	N	Q	S	G	P	W	T	N	N	V	A	P	G	K	N	I	S	T	M	G	R	Y	F	K	D	A	G	Y	H	T	C	Y	I	G	K	W	H	L	D	G	H	D	Y	F	G	T	G	E	C	P	P	E	W	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?		?	?	?																															?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	Y	W	F	D	G	A	N	Y	L	S	E	L	T	E	K	E	I	S	L	W	R	N	G	L	N	S	V	E	D	L	Q	A	N	H	I	D	E	T	F	T	W	A	H	R	I	S	N	R	A	V	D	F	L	Q	Q	P	A	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?		?	?	?	?	?	?		?				?							?		?																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	E	P	F	L	M	V	V	S	Y	D	E	P	H	H	P	F	T	C	P	V	E	Y	L	E	K	Y	A	D	F	Y	Y	E	L	G	E	K	A	Q	D	D	L	A	N	K	P	E	H	H	R	L	W	A	Q	A	M	P	S	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?						?			?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	D	D	G	L	Y	H	H	P	L	Y	F	A	C	N	D	F	V	D	D	Q	I	G	R	V	I	N	A	L	T	P	E	Q	R	E	N	T	W	V	I	Y	T	S	D	H	G	E	M	M	G	A	H	K	L	I	S	K	G	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		M	Y	D	D	I	T	R	I	P	L	I	I	R	S	P	Q	G	E	R	R	Q	V	D	T	P	V	S	H	I	D	L	L	P	T	M	M	A	L	A	D	I	E	K	P	E	I	L	P	G	E	N	I	L	A	V	K	E	P	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	M	V	E	F	N	R	Y	E	I	E	H	D	S	F	G	G	F	I	P	V	R	C	W	V	T	D	D	F	K	L	V	L	N	L	F	T	S	D	E	L	Y	D	R	R	N	D	P	N	E	M	H	N	L	I	D	D	I	R	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?																																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	D	V	R	S	K	M	H	D	A	L	L	D	Y	M	D	K	I	R	D	P	F	R	S	Y	Q	W	S	L	R	P	W	R	K	D	A	R	P	R	W	M	G	A	F	R	P	R	P	Q	D	G	Y	S	P	V	V	R	D	Y	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		T	G	L	P	T	Q	G	V	K	V	E	E	K	K	Q	K	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand