Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39285 Date Thu Jan 5 11:58:57 GMT 2012 Unique Job ID 0106ad3fe443e7d2

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	L	I	I	T	F	L	M	A	W	C	L	S	W	G	A	Y	A	A	T	A	P	D	S	K	Q	I	T	Q	E	L	E	Q	A	K	A	A	K	P	A	Q	P	E	V	V	E	A	L	Q	S	A	L	N	A	L	E	E	R	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	S	L	E	R	I	K	Q	Y	Q	Q	V	I	D	N	Y	P	K	L	S	A	T	L	R	A	Q	L	N	N	M	R	D	E	P	R	S	V	S	P	G	M	S	T	D	A	L	N	Q	E	I	L	Q	V	S	S	Q	L	L	D	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	R	Q	A	Q	Q	E	Q	E	R	A	R	E	I	A	D	S	L	N	Q	L	P	Q	Q	Q	T	D	A	R	R	Q	L	N	E	I	E	R	R	L	G	T	L	T	G	N	T	P	L	N	Q	A	Q	N	F	A	L	Q	S	D	S
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SS confidence
Disorder																						?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	R	L	K	A	L	V	D	E	L	E	L	A	Q	L	S	A	N	N	R	Q	E	L	A	R	L	R	S	E	L	A	E	K	E	S	Q	Q	L	D	A	Y	L	Q	A	L	R	N	Q	L	N	S	Q	R	Q	L	E	A	E	R	A
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Disorder															?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	E	S	T	E	L	L	A	E	N	S	A	D	L	P	K	D	I	V	A	Q	F	K	I	N	R	E	L	S	A	A	L	N	Q	Q	A	Q	R	M	D	L	V	A	S	Q	Q	R	Q	A	A	S	Q	T	L	Q	V	R	Q	A	L
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Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	T	L	R	E	Q	S	Q	W	L	G	S	S	N	L	L	G	E	A	L	R	A	Q	V	A	R	L	P	E	M	P	K	P	Q	Q	L	D	T	E	M	A	Q	L	R	V	Q	R	L	R	Y	E	D	L	L	N	K	Q	P	L	L
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Disorder											?	?	?	?	?															?		?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	Q	I	H	Q	A	D	G	Q	P	L	T	A	E	Q	N	R	I	L	E	A	Q	L	R	T	Q	R	E	L	L	N	S	L	L	Q	G	G	D	T	L	L	L	E	L	T	K	L	K	V	S	N	G	Q	L	E	D	A	L	K	E
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	N	E	A	T	H	R	Y	L	F	W	T	S	D	V	R	P	M	T	I	A	W	P	L	E	I	A	Q	D	L	R	R	L	I	S	L	D	T	F	S	Q	L	G	K	A	S	V	M	M	L	T	S	K	E	T	I	L	P	L	F
Secondary structure
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Disorder																?	?	?																				?													?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		G	A	L	I	L	V	G	C	S	I	Y	S	R	R	Y	F	T	R	F	L	E	R	S	A	A	K	V	G	K	V	T	Q	D	H	F	W	L	T	L	R	T	L	F	W	S	I	L	V	A	S	P	L	P	V	L	W	M	T	L	G
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		Y	G	L	R	E	A	W	P	Y	P	L	A	V	A	I	G	D	G	V	T	A	T	V	P	L	L	W	V	V	M	I	C	A	T	F	A	R	P	N	G	L	F	I	A	H	F	G	W	P	R	E	R	V	S	R	G	M	R	Y	Y
Secondary structure
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Disorder				?			?	?	?																													?	?	?		?	?	?					?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		L	M	S	I	G	L	I	V	P	L	I	M	A	L	M	M	F	D	N	L	D	D	R	E	F	S	G	S	L	G	R	L	C	F	I	L	I	C	G	A	L	A	V	V	T	L	S	L	K	K	A	G	I	P	L	Y	L	N	K	E
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Disorder																			?	?	?	?	?	?	?		?																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		G	S	G	D	N	I	T	N	H	M	L	W	N	M	M	I	G	A	P	L	V	A	I	L	A	S	A	V	G	Y	L	A	T	A	Q	A	L	L	A	R	L	E	T	S	V	A	I	W	F	L	L	L	V	V	Y	H	V	I	R	R
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		W	M	L	I	Q	R	R	R	L	A	F	D	R	A	K	H	R	R	A	E	M	L	A	Q	R	A	R	G	E	E	E	A	H	H	H	S	S	P	E	G	A	I	E	V	D	E	S	E	V	D	L	D	A	I	S	A	Q	S	L	R
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		L	V	R	S	I	L	M	L	I	A	L	L	S	V	I	V	L	W	S	E	I	H	S	A	F	G	F	L	E	N	I	S	L	W	D	V	T	S	T	V	Q	G	V	E	S	L	E	P	I	T	L	G	A	V	L	I	A	I	L	V
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SS confidence
Disorder																																							?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		F	I	I	T	T	Q	L	V	R	N	L	P	A	L	L	E	L	A	I	L	Q	H	L	D	L	T	P	G	T	G	Y	A	I	T	T	I	T	K	Y	L	L	M	L	I	G	G	L	V	G	F	S	M	I	G	I	E	W	S	K	L
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SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?	?	?	?																									?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		Q	W	L	V	A	A	L	G	V	G	L	G	F	G	L	Q	E	I	F	A	N	F	I	S	G	L	I	I	L	F	E	K	P	I	R	I	G	D	T	V	T	I	R	D	L	T	G	S	V	T	K	I	N	T	R	A	T	T	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		D	W	D	R	K	E	I	I	V	P	N	K	A	F	I	T	E	Q	F	I	N	W	S	L	S	D	S	V	T	R	V	V	L	T	I	P	A	P	A	D	A	N	S	E	E	V	T	E	I	L	L	T	A	A	R	R	C	S	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?		?																																										?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		I	D	N	P	A	P	E	V	F	L	V	D	L	Q	Q	G	I	Q	I	F	E	L	R	I	Y	A	A	E	M	G	H	R	M	P	L	R	H	E	I	H	Q	L	I	L	A	G	F	H	A	H	G	I	D	M	P	F	P	P	F	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		M	R	L	E	S	L	N	G	K	Q	T	G	R	T	L	T	S	A	G	K	G	R	Q	A	G	S	L
Secondary structure
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