Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76417 Date Thu Jan 5 12:22:51 GMT 2012 Unique Job ID 01061c50b086b599

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	T	T	A	K	L	S	F	M	M	F	V	E	W	F	I	W	G	A	W	F	V	P	L	W	L	W	L	S	K	S	G	F	S	A	G	E	I	G	W	S	Y	A	C	T	A	I	A	A	I	L	S	P	I	L	V	G	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	D	R	F	F	S	A	Q	K	V	L	A	V	L	M	F	A	G	A	L	L	M	Y	F	A	A	Q	Q	T	T	F	A	G	F	F	P	L	L	L	A	Y	S	L	T	Y	M	P	T	I	A	L	T	N	S	I	A	F	A	N	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	D	V	E	R	D	F	P	R	I	R	V	M	G	T	I	G	W	I	A	S	G	L	A	C	G	F	L	P	Q	I	L	G	Y	A	D	I	S	P	T	N	I	P	L	L	I	T	A	G	S	S	A	L	L	G	V	F	A	F	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	P	D	T	P	P	K	S	T	G	K	M	D	I	K	V	M	L	G	L	D	A	L	I	L	L	R	D	K	N	F	L	V	F	F	F	C	S	F	L	F	A	M	P	L	A	F	Y	Y	I	F	A	N	G	Y	L	T	E	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	K	N	A	T	G	W	M	T	L	G	Q	F	S	E	I	F	F	M	L	A	L	P	F	F	T	K	R	F	G	I	K	K	V	L	L	L	G	L	V	T	A	A	I	R	Y	G	F	F	I	Y	G	S	A	D	E	Y	F	T	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	L	L	F	L	G	I	L	L	H	G	V	S	Y	D	F	Y	Y	V	T	A	Y	I	Y	V	D	K	K	A	P	V	H	M	R	T	A	A	Q	G	L	I	T	L	C	C	Q	G	F	G	S	L	L	G	Y	R	L	G	G	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		M	E	K	M	F	A	Y	Q	E	P	V	N	G	L	T	F	N	W	S	G	M	W	T	F	G	A	V	M	I	A	I	I	A	V	L	F	M	I	F	F	R	E	S	D	N	E	I	T	A	I	K	V	D	D	R	D	I	A	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?		?		?																																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.
Sequence		Q	G	E	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand