HHsearch 1.5 NAME d1hica_ FAM FILE d1hica_ COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i d1hica_.a3m DATE Mon Mar 8 18:04:07 2010 LENG 51 match states, 51 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.2 EVD 0.4591 1.5663 SEQ >ss_dssp CCCCBCSSTTEESSEEETTEECCTTEEEECCSSSCCCEEEESCCEECCSCC >sa_dssp EECEEBEDDCBBDACBEEEEDACECDCACDCEEEEEDDCEEDECEEBDEEE >ss_pred CEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEECCCCCCCCCC >ss_conf 903010015871899832653367861377278875414515678885569 >Consensus vxytdctesgqnxclcxgsnvcgxgxxcxlxsxgeknqcvxgegtpkpxsx >d1hica_ VVYTDCTESGQNLCLCEGSNVCGQGNKCILGSDGEKNQCVTGEGTPKPQSH >UniRef50_P81492(21-69:84) Hirudin-HM2 n=20 Tax=Hirudinidae RepID=HIRM2_HIRMA E=4e-13 s/c=1.54 id=74% cov=98% VSYTDCTESGQNYCLCVGSNVCGEGKNCQLSSSG--NQCVHGEGTPKPKSQ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * V 1 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 1 0 * * * * * * 1177 0 0 V 2 * * * * * * * * * * * * * * * 1058 * 945 * * 2 0 * * * * * * 1177 0 0 Y 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 3 0 * * * * * * 1177 0 0 T 4 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 4 0 * * * * * * 1177 0 0 D 5 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1177 0 0 C 6 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1177 0 0 T 7 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 7 0 * * * * * * 1177 0 0 E 8 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1177 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 9 0 * * * * * * 1177 0 0 G 10 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1177 0 0 Q 11 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 11 0 * * * * * * 1177 0 0 N 12 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1177 0 0 L 13 * * * * * * * * * 945 * * * * * * * * * 1058 13 0 * * * * * * 1177 0 0 C 14 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1177 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1177 0 0 C 16 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1177 0 0 E 17 * * * 945 * * * * * * * * * * * * * 1058 * * 17 0 * * * * * * 1177 0 0 G 18 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1177 0 0 S 19 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 19 0 * * * * * * 1177 0 0 N 20 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1177 0 0 V 21 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 21 0 * * * * * * 1177 0 0 C 22 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1177 0 0 G 23 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1177 0 0 Q 24 * * * 1058 * * * * * * * * * 945 * * * * * * 24 0 * * * * * * 1177 0 0 G 25 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1177 0 0 N 26 * * * * * * * * 1058 * * 945 * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1177 0 0 K 27 * * * * * * * * 945 * * 1058 * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1177 0 0 C 28 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1177 0 0 I 29 * * * * * * * 945 * * * * * 1058 * * * * * * 29 0 * * * * * * 1177 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1177 0 0 G 31 * * * * * 945 * * * * * * * * * 1058 * * * * 31 0 * * * * * * 1177 0 0 S 32 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 32 0 * * * * * * 1177 0 0 D 33 * * 945 * * * * * * * * * * * * 1058 * * * * 33 0 * * * * * * 1177 0 0 G 34 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 34 945 * 1058 * * * * 1177 0 0 E 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * 0 1000 0 1000 K 36 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 N 37 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1177 0 0 Q 38 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 38 0 * * * * * * 1177 0 0 C 39 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1177 0 0 V 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 40 0 * * * * * * 1177 0 0 T 41 * * * * * * 1058 * * * * * * * * * 945 * * * 41 0 * * * * * * 1177 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1177 0 0 E 43 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1177 0 0 G 44 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1177 0 0 T 45 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 45 0 * * * * * * 1177 0 0 P 46 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1177 0 0 K 47 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1177 0 0 P 48 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1177 0 0 Q 49 * * * * * * * * 1058 * * * * 945 * * * * * * 49 0 * * * * * * 1177 0 0 S 50 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 50 0 * * * * * * 1177 0 0 H 51 * * * * * * 945 * * * * * * 1058 * * * * * * 51 0 * * 0 * * * 1177 0 0 //