HHsearch 1.5 NAME c9vp2A_ FAM FILE c9vp2A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9vp2A_.a3m DATE Sun Dec 28 01:27:18 2025 LENG 69 match states, 69 columns in multiple alignment FILT 2 out of 4 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.2 EVD 0.4858 2.2161 SEQ >ss_pred CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHC >ss_conf 974303677999986530378578999999999999987457724799999999998273899998619 >Consensus gsddgaxgdiwxymsexxtgapgkixaxxmlxsxxyfxvxkpnxglalvsxxmmlvmangekiisxfxx >c9vp2A_ GSDDGAFGDIWAYMSEALTGAPGKIIACGMLFSVAYFGVVKPNLGLALVSALMMLVMANGEKIISSFLA >UniRef50_Q19NT2(1-126:126) HtdZ n=11 Tax=Enterobacteriaceae RepID=Q19NT2_ECOK1 E=5e-47 s/c=0.91 id=73% cov=101% GSDDGALGDIWSYMSESMTGAPGKILAAAMLISSVYFSVLKPNPGLALVSLFMMLVMANGEKIISTFMD # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1198 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 2 0 * * * * * * 1198 0 0 D 3 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1198 0 0 D 4 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1198 0 0 G 5 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1198 0 0 A 6 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1198 0 0 F 7 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1198 0 0 G 8 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1198 0 0 D 9 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1198 0 0 I 10 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1198 0 0 W 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 11 0 * * * * * * 1198 0 0 A 12 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 12 0 * * * * * * 1198 0 0 Y 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 13 0 * * * * * * 1198 0 0 M 14 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1198 0 0 S 15 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 15 0 * * * * * * 1198 0 0 E 16 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1198 0 0 A 17 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 17 0 * * * * * * 1198 0 0 L 18 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1198 0 0 T 19 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 19 0 * * * * * * 1198 0 0 G 20 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1198 0 0 A 21 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1198 0 0 P 22 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1198 0 0 G 23 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1198 0 0 K 24 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1198 0 0 I 25 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1198 0 0 I 26 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1198 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1198 0 0 C 28 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1198 0 0 G 29 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1198 0 0 M 30 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1198 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1198 0 0 F 32 * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1198 0 0 S 33 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 33 0 * * * * * * 1198 0 0 V 34 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * 34 0 * * * * * * 1198 0 0 A 35 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 35 0 * * * * * * 1198 0 0 Y 36 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 36 0 * * * * * * 1198 0 0 F 37 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1198 0 0 G 38 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 38 0 * * * * * * 1198 0 0 V 39 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 39 0 * * * * * * 1198 0 0 V 40 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 40 0 * * * * * * 1198 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1198 0 0 P 42 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1198 0 0 N 43 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1198 0 0 L 44 * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1198 0 0 G 45 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1198 0 0 L 46 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1198 0 0 A 47 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1198 0 0 L 48 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1198 0 0 V 49 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 49 0 * * * * * * 1198 0 0 S 50 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 50 0 * * * * * * 1198 0 0 A 51 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1198 0 0 L 52 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1198 0 0 M 53 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1198 0 0 M 54 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1198 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1198 0 0 V 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 56 0 * * * * * * 1198 0 0 M 57 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1198 0 0 A 58 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1198 0 0 N 59 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1198 0 0 G 60 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1198 0 0 E 61 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1198 0 0 K 62 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1198 0 0 I 63 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1198 0 0 I 64 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1198 0 0 S 65 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 65 0 * * * * * * 1198 0 0 S 66 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 66 0 * * * * * * 1198 0 0 F 67 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1198 0 0 L 68 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1198 0 0 A 69 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * 0 * * * 1198 0 0 //