HHsearch 1.5 NAME c9velN_ FAM FILE c9velN_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9velN_.a3m DATE Sat Aug 30 10:49:48 2025 LENG 171 match states, 171 columns in multiple alignment FILT 1 out of 3 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4144 -0.9383 SEQ >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCEECCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCCC CCCCCCEEEECCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCC >ss_conf 9465554300015766798998888751320057865121103302566300334265435501047787788766530444564316146752887555 87345257621102115588863121123345446657765415303689987410022023010027889 >Consensus mlfkyihdvnakveegrrylsdvvrvaldkeettdpdtqevtstsyrvtaypvvqvgeeevpyipvhpktaepgqkvtvptydvpeklpvlvrgrnpeat gdyddhiwvteevevrplvdevfkedefekarlyyenvaaqlaegddirhyyrkdldreaghysvsrypsf >c9velN_ MLFKYIHDVNAKVEEGRRYLSDVVRVALDKEETTDPDTQEVTSTSYRVTAYPVVQVGEEEVPYIPVHPKTAEPGQKVTVPTYDVPEKLPVLVRGRNPEAT GDYDDHIWVTEEVEVRPLVDEVFKEDEFEKARLYYENVAAQLAEGDDIRHYYRKDLDREAGHYSVSRYPSF # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 L 2 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 F 3 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 K 4 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 5 0 * * * * * * 1000 0 0 I 6 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 H 7 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 D 8 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 V 9 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 N 10 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 A 11 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 K 12 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 V 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 E 14 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 E 15 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 G 16 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 R 17 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 R 18 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 19 0 * * * * * * 1000 0 0 L 20 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 S 21 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 D 22 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 V 23 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 V 24 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 R 25 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 V 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 L 28 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 D 29 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 K 30 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 E 31 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 E 32 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 T 33 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 T 34 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 D 35 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 P 36 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 D 37 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 T 38 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 39 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 E 40 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 V 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 T 42 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 S 43 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 T 44 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 S 45 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 46 0 * * * * * * 1000 0 0 R 47 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 V 48 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 T 49 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 A 50 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 51 0 * * * * * * 1000 0 0 P 52 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 V 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 V 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 55 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 V 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 G 57 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 E 58 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 E 59 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 E 60 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 V 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 P 62 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 63 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 63 0 * * * * * * 1000 0 0 I 64 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 P 65 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 V 66 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 H 67 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 P 68 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 K 69 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 T 70 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 A 71 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 E 72 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 P 73 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 G 74 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 75 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 K 76 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 V 77 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 T 78 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 V 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 P 80 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 T 81 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 82 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 82 0 * * * * * * 1000 0 0 D 83 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 V 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 P 85 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 E 86 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 K 87 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 L 88 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 P 89 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 V 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 L 91 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 V 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 R 93 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 G 94 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 R 95 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 N 96 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 P 97 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 E 98 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 A 99 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 T 100 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 G 101 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 D 102 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 103 0 * * * * * * 1000 0 0 D 104 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 D 105 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 H 106 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 I 107 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 W 108 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 V 109 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 T 110 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 E 111 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 E 112 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 V 113 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 E 114 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 V 115 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 R 116 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 P 117 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 L 118 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 V 119 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 D 120 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 E 121 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 V 122 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 F 123 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 K 124 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 E 125 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 D 126 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 E 127 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 F 128 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 E 129 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 K 130 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 A 131 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 R 132 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 L 133 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 134 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 134 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 135 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 135 0 * * * * * * 1000 0 0 E 136 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 N 137 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 V 138 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 A 139 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 A 140 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 141 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 L 142 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 A 143 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 E 144 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 G 145 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 D 146 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 D 147 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 I 148 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 R 149 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 H 150 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 151 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 151 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 152 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 152 0 * * * * * * 1000 0 0 R 153 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 K 154 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 D 155 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 L 156 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 D 157 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 R 158 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 E 159 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 A 160 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 G 161 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 H 162 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 163 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 163 0 * * * * * * 1000 0 0 S 164 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 V 165 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 S 166 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 R 167 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 168 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 168 0 * * * * * * 1000 0 0 P 169 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1000 0 0 S 170 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 170 0 * * * * * * 1000 0 0 F 171 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 171 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //