HHsearch 1.5 NAME c9u78A_ FAM FILE c9u78A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9u78A_.a3m DATE Sat Apr 12 11:21:30 2025 LENG 118 match states, 118 columns in multiple alignment FILT 3 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.4184 -2.2332 SEQ >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9179999999854579899889999985313445787889887778765477789996404679999999999999776489899997514679999999 999998587499777509 >Consensus xxxexxlRkiieDevrsiaxxexxekwlxxxvxexxxrkixeDevrsiaexEdxekwlxxxvxedxxrsixEdexRhvaexEdxekwlxxxvxedxxrsi xEdexRhvaexEdxekwl >c9u78A_ GGIEELLRKIIEDEVRHIAELEDIEKWLKDPVIEELLRKIIEDEVRHIAELEDIEKWLKDPVIEELLRKIIEDEVRHIAELEDIEKWLKDPVIEELLRKI IEDEVRHIAELEDIEKWL >UniRef50_A7S3E8(396-514:646) Predicted protein n=2 Tax=Nematostella vectensis RepID=A7S3E8_NEMVE E=1e-06 s/c=0.46 id=41% cov=87% --LEKWLRhKIIFDTVESI---ERLEKWLR--------YKIVFDTVKSI---ERLEKWLRHKIVFDTVKSIerLEKWLRHkivfdtVKSIERLEKWLHHK IVFDTVKSIesLEKWLRHkivfdtVESIERLEKWL >UniRef50_Q85WU2(365-453:2046) Putative protein ycf1 n=4 Tax=cellular organisms RepID=YCF1_PINKO E=3e-11 s/c=0.79 id=43% cov=76% -------RSVAEDEDRSVAMAKK-----DRSVAEDEDRSVAEDEDRSVAEDED------RSVAEDEDRSVAEDEDRSVAEDED------RFVAEDEDRSV AEDEDRSVAEDED----- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 G 2 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 I 3 * * * * * * * 836 * 1186 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1426 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1426 0 0 E 5 * * * 836 * * * * 1186 * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1426 0 0 L 6 * * * * * * * * * 836 * * * * * * * * 1186 * 6 0 * * * * * * 1426 0 0 L 7 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1426 0 0 R 8 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 8 592 1571 * 0 * * * 1754 1000 0 K 9 * * * * * * * * 512 * * * * * * 1743 * * * * 9 0 * * * * * * 1754 0 0 I 10 * * * * * * * 512 * * * * * * * * * 1743 * * 10 0 * * * * * * 1754 0 0 I 11 1743 * * * * * * 512 * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1754 0 0 E 12 * * * 592 1571 * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1754 0 0 D 13 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1754 0 0 E 14 * * * 592 * * * * * * * * * * * * 1571 * * * 14 0 * * * * * * 1754 0 0 V 15 * * 1743 * * * * * * * * * * * * * * 512 * * 15 0 * * * * * * 1754 0 0 R 16 * * * 1571 * * * * * * * * * * 592 * * * * * 16 0 * * * * * * 1754 0 0 H 17 * * * * * * 1455 * * * * * * * * 655 * * * * 17 0 * * * * * * 1754 0 0 I 18 * * * * * * * 512 * * * * * * * * * 1743 * * 18 592 * 1571 * * * * 1754 0 0 A 19 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * 0 1378 0 1000 E 20 * * * 785 * * * * * * 1252 * * * * * * * * * 20 0 * * * * * 0 1378 0 1000 L 21 1252 * * * * * * * * 785 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * 0 * 1378 0 1000 E 22 * * * 512 * * * * 1743 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1754 0 0 D 23 * * 1455 * * * * * 1743 * * * * * 1571 * * * * * 23 512 * 1743 * * * * 1754 0 0 I 24 * * * * * * * 836 * 1186 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * 0 1426 0 1000 E 25 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * 0 1426 0 1000 K 26 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * 0 1426 0 1000 W 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 27 0 * * * * * 0 1426 0 1000 L 28 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * 0 * 1426 0 1000 K 29 * * 1743 * * * * * 1455 * * * * * 1571 * * * * * 29 592 * 1571 * * * * 1754 0 0 D 30 * * 785 * * * * * * * * * * * 1252 * * * * * 30 0 * * * * * 0 1378 0 1000 P 31 * * * * * * * * * * * * 785 * * 1252 * * * * 31 0 * * * * * 0 1378 0 1000 V 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 32 0 * * * * * 0 1378 0 1000 I 33 1252 * * * * * * 785 * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * 0 1378 0 1000 E 34 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * 0 1378 0 1000 E 35 * * 1252 785 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * 0 1378 0 1000 L 36 * * * 1252 * * * * * 785 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * 0 1378 0 1000 L 37 * * 1252 * * * * * * 785 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * 0 * 1378 0 1000 R 38 * * * * * * * * * * * * * * 592 * * * * 1571 38 0 * * * * * * 1754 0 0 K 39 * * * * * * * * 512 * * * * * * 1743 * * * * 39 0 * * * * * * 1754 0 0 I 40 * * * * * * * 512 * * * * * * * * * 1743 * * 40 0 * * * * * * 1754 0 0 I 41 1743 * * * * * * 1455 * * * * * * * * * 1571 * * 41 0 * * * * * * 1754 0 0 E 42 * * * 592 1571 * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1754 0 0 D 43 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1754 0 0 E 44 * * * 592 * * * * * * * * * * * * 1571 * * * 44 0 * * * * * * 1754 0 0 V 45 * * 1743 * * * * * * * * * * * * * * 512 * * 45 0 * * * * * * 1754 0 0 R 46 * * * * * * * * 1571 * * * * * 592 * * * * * 46 0 * * * * * * 1754 0 0 H 47 * * * * * * 1455 * * * * * * * * 655 * * * * 47 0 * * * * * * 1754 0 0 I 48 * * * * * * * 512 * * * * * * * * * 1743 * * 48 592 * 1571 * * * * 1754 0 0 A 49 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * 0 1378 0 1000 E 50 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * 0 1378 0 1000 L 51 * * 1252 * * * * * * 785 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * 0 * 1378 0 1000 E 52 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1754 0 0 D 53 * * 592 * * * * * * * * * * * 1571 * * * * * 53 512 * 1743 * * * * 1754 0 0 I 54 * * * * * * * 836 * 1186 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * 0 1426 0 1000 E 55 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * 0 1426 0 1000 K 56 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * 0 1426 0 1000 W 57 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 57 0 * * * * * 0 1426 0 1000 L 58 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * 0 1426 0 1000 K 59 * * * * * * * * 836 * * * * * 1186 * * * * * 59 0 * * * * 0 * 1426 0 1000 D 60 * * 1455 * * * 1571 * * * * * * * 1743 * * * * * 60 0 * * * * * * 1754 0 0 P 61 * * * * * * * * 1571 * * * 1455 * * 1743 * * * * 61 0 * * * * * * 1754 0 0 V 62 * * * * * * * 1571 * * * * * * * * * 592 * * 62 0 * * * * * * 1754 0 0 I 63 1743 * * * * * * 1455 * * * * * * * * * 1571 * * 63 0 * * * * * * 1754 0 0 E 64 * * * 592 1571 * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1754 0 0 E 65 * * 655 1455 * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1754 0 0 L 66 * * * 1743 * * * * * 1455 * * * * * * 1571 * * * 66 0 * * * * * * 1754 0 0 L 67 * * 1743 * * * * * * 1455 * * * * * * * 1571 * * 67 0 * * * * * * 1754 0 0 R 68 * * * * * * * * 1571 * * * * * 592 * * * * * 68 0 * * * * * * 1754 0 0 K 69 * * * * * * * * 1455 * * * * * * 655 * * * * 69 0 * * * * * * 1754 0 0 I 70 * * * * * * * 512 * * * * * * * * * 1743 * * 70 592 1571 * 1000 1000 * * 1754 1000 0 I 71 1743 * * * * * * 1455 * 1571 * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1754 0 0 E 72 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1754 0 0 D 73 * * 592 * * * * * 1571 * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1754 0 0 E 74 * * * 592 * * * * * * * * * * * * * * 1571 * 74 0 * * * * * * 1754 0 0 V 75 * * 1743 * * * * * * 1571 * * * * * * * 1455 * * 75 0 * * * * * * 1754 0 0 R 76 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 76 0 * * * * * * 1754 0 0 H 77 * * * * * * 512 * * * * * * * * 1743 * * * * 77 592 1571 * 2585 263 * * 1754 1000 0 I 78 * * * * * * * 1455 * * * * * * * * * 655 * * 78 0 * * * * * * 1754 0 0 A 79 592 * * * * * * * 1571 * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1754 0 0 E 80 * * * 592 * * * * * * * * * * * 1571 * * * * 80 0 * * * * * * 1754 0 0 L 81 * * 1743 * * * * 1571 * 1455 * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1754 0 0 E 82 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1754 0 0 D 83 * * 592 * * * * * * * * * * * 1571 * * * * * 83 512 * 1743 * * * * 1754 0 0 I 84 * * * * * * * 836 * 1186 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * 0 1426 0 1000 E 85 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * 0 1426 0 1000 K 86 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * 0 1426 0 1000 W 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 87 0 * * * * * 0 1426 0 1000 L 88 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * 0 1426 0 1000 K 89 * * * * * * 1186 * 836 * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * 0 * 1426 0 1000 D 90 * * 1455 * * * 1571 * * * * * * * 1743 * * * * * 90 0 * * * * * * 1754 0 0 P 91 * * * * 1743 * * * 1571 * * * 1455 * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1754 0 0 V 92 * * * * * * * 1571 * * * * * * * * * 592 * * 92 0 * * * * * * 1754 0 0 I 93 1743 * * * * * * 1455 * * * * * * * * * 1571 * * 93 0 * * * * * * 1754 0 0 E 94 * * * 592 1571 * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1754 0 0 E 95 * * 655 1455 * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1754 0 0 L 96 * * * 1743 * * * * * 1455 * * * * * * 1571 * * * 96 0 * * * * * * 1754 0 0 L 97 * * 1743 * * * * * * 1455 * * * * * * * 1571 * * 97 0 * * * * * * 1754 0 0 R 98 * * * * * * * * 1571 * * * * * 592 * * * * * 98 0 * * * * * * 1754 0 0 K 99 * * * * * * * * 1455 * * * * * * 655 * * * * 99 0 * * * * * * 1754 0 0 I 100 * * * * * * * 512 * * * * * * * * * 1743 * * 100 592 1571 * 1000 1000 * * 1754 1000 0 I 101 1743 * * * * * * 1455 * 1571 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1754 0 0 E 102 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1754 0 0 D 103 * * 592 * * * * * 1571 * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1754 0 0 E 104 * * * 592 * * * * * * * * * * * * * * 1571 * 104 0 * * * * * * 1754 0 0 V 105 * * 1743 * * * * * * 1571 * * * * * * * 1455 * * 105 0 * * * * * * 1754 0 0 R 106 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 106 0 * * * * * * 1754 0 0 H 107 * * * * * * 512 * * * * * * * * 1743 * * * * 107 592 1571 * 2585 263 * * 1754 1000 0 I 108 * * * * * * * 1455 * * * * * * * * * 655 * * 108 0 * * * * * * 1754 0 0 A 109 592 * * 1571 * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1754 0 0 E 110 * * * 592 * * * * * * * * * * * 1571 * * * * 110 0 * * * * * * 1754 0 0 L 111 * * 1743 * * * * 1571 * 1455 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1754 0 0 E 112 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1754 0 0 D 113 * * 592 * * * * * * * * * * * 1571 * * * * * 113 0 * * * * * * 1754 0 0 I 114 * * * * * * * 836 * 1186 * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1426 0 0 E 115 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1426 0 0 K 116 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1426 0 0 W 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 117 0 * * * * * * 1426 0 0 L 118 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 118 0 * * 0 * * * 1426 0 0 //