HHsearch 1.5 NAME c9t38B_ FAM FILE c9t38B_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9t38B_.a3m DATE Sat Dec 27 22:10:09 2025 LENG 154 match states, 154 columns in multiple alignment FILT 5 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.3754 -2.1223 SEQ >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCEEEEEHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCEEEC >ss_conf 9679998886555566418155438856760014788638026898553310010658865468054285443256899999999998620566546674 136788754599999999999986088149999999872866520204621629 >Consensus xxxxxlxxixxtxffsxmgxxxxxxxxvilixxvexxfvnptxxxfxgxyxxxeWLPTSxtqxDPFyxxpkdlxxxrxxvxKavxkxtrxlxkxkfxxGP hDftxxakxaixfAfrxyxxExxlxlgxkWexivxiYxsGhWPxGitkxkiivI >c9t38B_ DFDSLLQRIDSSCFFSRMGLPDVLDSRVILIENVEKVFVNPTDAEFKGYYDSVEWLPTSMTQEDPFYVLPKELTGLRIRVNKAVMNATKGLSKDKFNYGP HDFSLAARNGICFAFREYVSEQYLHLGNKWEEVVGIYFSGHWPVGIAKDKIVTI >UniRef50_Q7N9J8(3-159:159) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Photorhabdus luminescens subsp. laumondii RepID=Q7N9J8_PHOLL E=5e-53 s/c=1.32 id=61% cov=101% DINEELGQIKKTSFFSNMGLSDLQDEDVILIESVEKVFINPSDIEFKGYYKNTKWLPTSPTQEDPFYKKqdsPKDLVEIRVKINKAVMSMTKELAKGKFI SGPHDFNQVARNAICYAFRQYISEKYLNLGNKWERIVKIYYAGHWPVGISKEKIIVI >UniRef50_C2M553(15-171:171) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Capnocytophaga gingivalis ATCC 33624 RepID=C2M553_CAPGI E=1e-61 s/c=1.50 id=41% cov=101% NLEAEIDKIIQTDFFTKMGVKEFLGSNVILLKDVEQAFVNPTEEAFAGMYKEVQWLPSALTDADPFYkniQIPENLLPYRKEIVQFFLKEHRNLNKKLFS FGPYDFTEVAKKAIAFAFRQYLVEKQLTLGLYWENIVNVYYSGHWPIGYYKEKIFAI >UniRef50_B1KNR0(18-122:123) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Shewanella woodyi ATCC 51908 RepID=B1KNR0_SHEWM E=3e-07 s/c=0.54 id=35% cov=65% --------------------------------------------------DEWEWLPTSRDSIDPfccqFARSPKE-----SDVYKATLKSLRRLGESIP NLvdGPNDYTNAFKGAALYTFKMAARELFNKTPGKWVELASIYESGKWPLGITQSGRIIV >UniRef50_A0KRZ7(31-142:143) Putative uncharacterized protein n=5 Tax=Shewanella RepID=A0KRZ7_SHESA E=1e-06 s/c=0.49 id=30% cov=66% ------------------------------------------------------WLPTSRDQSDPFegtFTANADQRPYDKEAEKRVYKAalrslrTVGN AHPKLVNGPHNYTEPMKGSALFACKHAAKEVLSNQPGKWLTILALYKNGVWPCGITQTGELVI # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * D 1 * * 655 * * * * * * * * 1455 * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1694 0 0 F 2 * * * * 1640 * * 1669 * 1455 * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1694 0 0 D 3 * * 1640 1455 * * * * * * * 1669 * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1694 0 0 S 4 1455 * * 1669 * * * * * * * * * * * 1640 * * * * 4 0 * * * * * * 1694 0 0 L 5 * * * 558 * * * * * 1640 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1694 0 0 L 6 * * * * * * * 1455 * 655 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1694 0 0 Q 7 * * 1455 * * 1669 * * * * * * * 1640 * * * * * * 7 0 * * * * * * 1694 0 0 R 8 * * * * * * * * 1455 * * * * 1669 1640 * * * * * 8 0 * * * * * * 1694 0 0 I 9 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1694 0 0 D 10 * * 1640 * * * * 1455 1669 * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1694 0 0 S 11 * * * * * * * * 1669 * * * * 1455 * 1640 * * * * 11 0 * * * * * * 1694 0 0 S 12 * * * * * * * * * * * * * * * 1640 558 * * * 12 0 * * * * * * 1694 0 0 C 13 * 1640 1455 * * * * * * * * * * * * 1669 * * * * 13 0 * * * * * * 1694 0 0 F 14 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1694 0 0 F 15 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1694 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * * * * * 655 1455 * * * 16 0 * * * * * * 1694 0 0 R 17 * * * * * * * * 1455 * * 1669 * * 1640 * * * * * 17 0 * * * * * * 1694 0 0 M 18 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1694 0 0 G 19 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1694 0 0 L 20 * * * * * * * * * 655 * * * * * * * 1455 * * 20 0 * * * * * * 1694 0 0 P 21 * * * * * * * * 1455 * * * 1640 * * 1669 * * * * 21 0 * * * * * * 1694 0 0 D 22 * * 655 1455 * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1694 0 0 V 23 * * * * 1455 * * * * 1669 * * * * * * * 1640 * * 23 0 * * * * * * 1694 0 0 L 24 * * * * * * * * * 545 * * * 1669 * * * * * * 24 0 * * * * * * 1694 0 0 D 25 * * 655 * * 1455 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1694 0 0 S 26 * * * 1669 * * * * * * * * * * * 545 * * * * 26 0 * * * * * * 1694 0 0 R 27 * * 1669 * * * * * * * * 1455 * * 1640 * * * * * 27 0 * * * * * * 1694 0 0 V 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 28 0 * * * * * * 1694 0 0 I 29 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1694 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1694 0 0 I 31 * * * * * * * 655 * 1455 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1694 0 0 E 32 * * * 655 * * * * 1455 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1694 0 0 N 33 * * 1455 * * * * * * * * 1640 * * * 1669 * * * * 33 0 * * * * * * 1694 0 0 V 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 34 0 * * * * * * 1694 0 0 E 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1694 0 0 K 36 * * * * * * * * 655 * * * * 1455 * * * * * * 36 0 * * * * * * 1694 0 0 V 37 1455 * * * * * * * * * * * * * * * * 655 * * 37 0 * * * * * * 1694 0 0 F 38 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1694 0 0 V 39 * * * * * * * 1669 * * * * * * * * * 545 * * 39 0 * * * * * * 1694 0 0 N 40 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1694 0 0 P 41 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1694 0 0 T 42 * * * * * * * * * * * * * * * 1669 545 * * * 42 0 * * * * * * 1694 0 0 D 43 * * 655 1455 * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1694 0 0 A 44 1640 * * 1455 * * * 1669 * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1694 0 0 E 45 1455 * * 655 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1694 0 0 F 46 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1694 0 0 K 47 1455 * * * * * * * 655 * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1694 0 0 G 48 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1694 0 0 Y 49 * * * * * * * * * * 1455 * * * * * * * * 655 49 0 * * * * * * 1694 0 0 Y 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 50 0 * * * * * * 1694 0 0 D 51 * * 963 * * * * * 1037 * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 2080 0 0 S 52 * * * 863 * * * * * * * 2156 * * * 2146 * * * * 52 0 * * * * * * 2080 0 0 V 53 * * * * * * * * * * * * * * * * 2156 1033 1802 * 53 0 * * * * * * 2080 0 0 E 54 * * * 963 * * * * 2156 * * * * 1928 * * * * * * 54 0 * * * * * * 2080 0 0 W 55 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 55 0 * * * * * * 2378 0 0 L 56 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 2378 0 0 P 57 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 57 0 * * * * * * 2378 0 0 T 58 * * * * * * * * * * * * * * * 2249 341 * * * 58 0 * * * * * * 2378 0 0 S 59 2249 * * * * * * * * * * * * * * 341 * * * * 59 0 * * * * * * 2378 0 0 M 60 * * * * * * * * * 2249 2492 * 2545 * 1183 * * * * * 60 0 * * * * * * 2378 0 0 T 61 * * 1183 * * * * * * * * * * * * * 838 * * * 61 0 * * * * * * 2378 0 0 Q 62 * * 2249 * * * * * * * * * * 787 * 2252 * * * * 62 0 * * * * * * 2378 0 0 E 63 2249 * * 1518 * * * 2252 * * * * * * * 2117 * * * * 63 0 * * * * * * 2378 0 0 D 64 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 2378 0 0 P 65 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 65 340 2252 * 2000 415 * * 2378 1000 0 F 66 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 66 378 2117 * 1585 585 * * 2378 1000 0 Y 67 2252 * * * 2117 * * * * * * * * * * * * * * 838 67 341 2249 * 1585 585 * * 2378 1000 0 V 68 * * * * * * * * 2545 * * * * 2249 2252 * 2117 2492 * * 68 0 * * * * * * 2378 0 0 L 69 2117 * * * * * * 2249 2545 2492 * * * * * 2252 * * * * 69 271 2545 * 1585 585 * * 2378 1000 0 P 70 * * * * * * * * * * * 2117 378 * * * * * * * 70 0 * * * * * * 2378 0 0 K 71 2117 * * 2249 * * * * 839 * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 2378 0 0 E 72 * * 1315 1367 * * * * * * * 2249 * * * * * * * * 72 340 * 2252 * * * * 2378 0 0 L 73 * * * * * * * * * 528 * * * 1705 * * * * * * 73 0 * * * * * 0 2099 0 1000 T 74 * * * * * * * * * 1962 * * * * 1705 * 2152 2240 * * 74 0 * * * * * 0 2099 0 1000 G 75 * * * 2240 * 2152 * * * * * * 828 * * * * * * * 75 0 * * * * * 0 2099 0 1000 L 76 * * * * * * * 2240 * 2152 * * * * * * * * * 828 76 0 * * * * * 0 2099 0 1000 R 77 * * 1705 * * * * * * * * * * * 528 * * * * * 77 0 * * * * 0 * 2099 0 1000 I 78 * * * * * * * 2492 1181 * * * * * * 2252 * 2545 * * 78 0 * * * * * * 2378 0 0 R 79 * * 2252 1181 * * * * 2545 * * * * * 2492 * * * * * 79 0 * * * * * * 2378 0 0 V 80 2117 * * * * * * 1389 * * * * * * * * * 1367 * * 80 0 * * * * * * 2378 0 0 N 81 * * * 2117 * * * * * * * 1518 * * * * * 2249 * 2252 81 0 * * * * * * 2378 0 0 K 82 * * * * * * * * 341 * * * * 2249 * * * * * * 82 0 * * * * * * 2378 0 0 A 83 839 * * * 2249 * * * * * * * * * 2117 * * * * * 83 0 * * * * * * 2378 0 0 V 84 * * * * 2249 * * * * * * * * * * * 2252 787 * * 84 0 * * * * * * 2378 0 0 M 85 * * * * * * * * * 1251 1518 * * * * * * * * 2117 85 0 * * * * * * 2378 0 0 N 86 * * * * * * * * 620 * * 2492 * * * 2545 * * * * 86 0 * * * * * * 2378 0 0 A 87 1292 * * 2249 * * * * * * 2545 * * * * 2252 * * * * 87 378 2117 * 2585 263 * * 2378 1000 0 T 88 * * * * * * 2249 * * 2252 * * * * * * 787 * * * 88 0 * * * * * * 2378 0 0 K 89 * * * * * * * * 1518 * * * * * 1251 * * 2117 * * 89 0 * * * * * * 2378 0 0 G 90 * * * 2545 * 1292 * * * * * 2249 * * 2252 * * * * * 90 0 * * * * * * 2378 0 0 L 91 * * * * * * * * * 378 * 2117 * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 2378 0 0 S 92 1315 * * * * 2252 * * * * * 2249 * * * 2492 * * * * 92 0 * * * * * * 2378 0 0 K 93 * * * 2252 * * 2117 * 838 * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 2378 0 0 D 94 * * 2492 * * 2545 * * 2249 * * * 2117 * * 2252 * * * * 94 0 * * * * * * 2378 0 0 K 95 * * * * * * * 2252 787 2249 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 2378 0 0 F 96 * * * * 838 * * * * 2117 * * 2252 * * * * * * * 96 0 * * * * * * 2378 0 0 N 97 * * * * * * * 2545 * * * 1367 * * * 2249 * 2117 * * 97 0 * * * * * * 2378 0 0 Y 98 * * * * 2249 * * * * 2252 * 2117 * * * 2545 * * * 2492 98 340 2252 * 1000 1000 * * 2378 1000 0 G 99 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 2378 0 0 P 100 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 100 0 * * * * * * 2378 0 0 H 101 * * * * * * 787 * * * * 2252 * * * * * * * 2249 101 0 * * * * * * 2378 0 0 D 102 * * 378 * * * * * * * * 2117 * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 2378 0 0 F 103 * * * * 838 * * * * * * * * * * * * * * 1183 103 0 * * * * * * 2378 0 0 S 104 * * * * * * * * * * * 2545 * * * 2492 620 * * * 104 0 * * * * * * 2378 0 0 L 105 * * * 1181 * * * * * 2492 * 2252 * 2545 * * * * * * 105 0 * * * * * * 2378 0 0 A 106 1367 * * * * * * * * * * * 2117 * * * * 1389 * * 106 0 * * * * * * 2378 0 0 A 107 838 * * * 2252 * * * * * 2117 * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 2378 0 0 R 108 * * * * * * * * 620 * * * * * 1518 * * * * * 108 0 * * * * * * 2378 0 0 N 109 * * * * * 1183 * * 2249 * * 1518 * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 2378 0 0 G 110 757 * * * * 2492 * * * * * * * * * 2117 * * * * 110 0 * * * * * * 2378 0 0 I 111 1183 * * * * * * 838 * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 2378 0 0 C 112 2249 1518 * * * * * * * 1183 * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 2378 0 0 F 113 * * * * 693 * * * * * * * * * * * * * * 1391 113 0 * * * * * * 2378 0 0 A 114 340 * * * * * * * * * * * * * * * 2252 * * * 114 0 * * * * * * 2378 0 0 F 115 * 2117 * * 378 * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 2378 0 0 R 116 * * * * * * * * 1183 * * * * * 838 * * * * * 116 0 * * * * * * 2378 0 0 E 117 * * * 2492 * * 2117 * * * 2252 * * 1389 * * * * * * 117 0 * * * * * * 2378 0 0 Y 118 1183 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 838 118 0 * * * * * * 2378 0 0 V 119 1183 * * * * * * 2545 * 2249 * * * * * * * 2492 * * 119 0 * * * * * * 2378 0 0 S 120 * * * * * * * * 2117 * * * * * 2252 1518 * 2249 * * 120 0 * * * * * * 2378 0 0 E 121 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 2378 0 0 Q 122 * * * * * * * * 1389 2252 * * * 2492 * * * 2117 * * 122 0 * * * * * * 2378 0 0 Y 123 * * * * 2252 * * * * 2117 * * * 2249 * * * * * 1518 123 0 * * * * * * 2378 0 0 L 124 * * * * * * * * * 838 * 2252 * * * 2117 * * * * 124 0 * * * * * * 2378 0 0 H 125 * * * * * * 2492 * 2252 * * 1315 * * * * 2249 * * * 125 0 * * * * * * 2378 0 0 L 126 * * * * * * * * * 838 * * * 2117 * * 2252 * * * 126 0 * * * * * * 2378 0 0 G 127 * * * * * 838 * * * * * * 1183 * * * * * * * 127 0 * * * * * * 2378 0 0 N 128 * * * * * 1183 * * * 2249 * 1518 * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 2378 0 0 K 129 * * * * * * * * 341 * * * * * * * * * * 2249 129 0 * * * * * * 2378 0 0 W 130 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 130 0 * * * * * * 2378 0 0 E 131 * * * 838 * * * * * 2117 * * * * * * * 2252 * * 131 0 * * * * * * 2378 0 0 E 132 * * * 1367 * * * * * * * 2249 * * 2545 * 2117 * * * 132 0 * * * * * * 2378 0 0 V 133 * * * * * * * 708 * 2252 * * * * * * * 2492 * * 133 0 * * * * * * 2378 0 0 V 134 2252 * * * * * * * * 2117 * * * * * * * 838 * * 134 0 * * * * * * 2378 0 0 G 135 2117 * * * * 2492 * * 2545 * * 2249 * * * 2252 * * * * 135 0 * * * * * * 2378 0 0 I 136 * * * * * * * 839 * 2117 * * * * * * * 2249 * * 136 0 * * * * * * 2378 0 0 Y 137 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 137 0 * * * * * * 2378 0 0 F 138 * * * 2252 2492 * * * 2117 * * * * * * * * * * 1389 138 0 * * * * * * 2378 0 0 S 139 2545 * * * * * * * * * * 2117 * * * 742 * * * * 139 0 * * * * * * 2378 0 0 G 140 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 2378 0 0 H 141 * * * * * * 838 * 2252 * * * * * * * * 2117 * * 141 0 * * * * * * 2378 0 0 W 142 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 142 0 * * * * * * 2378 0 0 P 143 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 143 0 * * * * * * 2378 0 0 V 144 * 2117 * * * * * 2249 * 2252 * * * * * * * 1518 * * 144 0 * * * * * * 2378 0 0 G 145 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 2378 0 0 I 146 * * * * * * * 341 * * * * * * * * * * * 2249 146 0 * * * * * * 2378 0 0 A 147 2492 * * * * * * * * * * * * * * 2545 1183 * * 2249 147 0 * * * * * * 2378 0 0 K 148 * * * * * * * * 838 * * * * 1183 * * * * * * 148 0 * * * * * * 2378 0 0 D 149 * * 2492 1389 * * * * * * * * * * * 2252 2117 * * * 149 0 * * * * * * 2378 0 0 K 150 * * * * * 1183 * * 838 * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 2378 0 0 I 151 * * * 2117 * * * 838 * * * * * * 2252 * * * * * 151 0 * * * * * * 2378 0 0 V 152 * * * * 2249 * * 1391 * 2117 * * * * * * * 2492 * * 152 0 * * * * * * 2378 0 0 T 153 2249 * * * * * * 2252 * * * * * * * * 2492 1315 * * 153 0 * * * * * * 2378 0 0 I 154 * * * * * * * 340 * * * * * * * * * 2252 * * 154 0 * * 0 * * * 2378 0 0 //