HHsearch 1.5 NAME c9rkuA_ FAM FILE c9rkuA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9rkuA_.a3m DATE Sat Dec 13 13:21:26 2025 LENG 172 match states, 172 columns in multiple alignment FILT 1 out of 3 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4085 -0.6405 SEQ >ss_pred CCHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHEEEECCCCEE EECCCEEECCCCEEEEEEECCEEEEECCCCEEEEEHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC >ss_conf 9403444304456630799944876444654151477887887432659998078876650457870555431151100770276681225884286068 533717524783589998188389955887235501321103632473310700035667743357897679 >Consensus ferhvfrkldhtdtgaivtvegsgtmdedvpvinsgygfnpeddeelevfllsdgsdasgkfgvmtiprnkqrkwpkktggiqhpfnadkfvqldddsiw lkdgkftlgdnrslsitvegnnvvidtgggeldirssklmhngvnigdshvhpqqadsdgdteadtdppkrd >c9rkuA_ FERHVFRKLDHTDTGAIVTVEGSGTMDEDVPVINSGYGFNPEDDEELEVFLLSDGSDASGKFGVMTIPRNKQRKWPKKTGGIQHPFNADKFVQLDDDSIW LKDGKFTLGDNRSLSITVEGNNVVIDTGGGELDIRSSKLMHNGVNIGDSHVHPQQADSDGDTEADTDPPKRD # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * F 1 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 R 3 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 H 4 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 V 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 F 6 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 R 7 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 K 8 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 D 10 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 H 11 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 T 12 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 D 13 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 T 14 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 G 15 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 A 16 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 I 17 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 V 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 T 19 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 V 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 E 21 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 G 22 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 S 23 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 G 24 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 T 25 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 M 26 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 D 27 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 D 29 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 P 31 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 V 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 I 33 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 N 34 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 G 36 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 37 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 37 0 * * * * * * 1000 0 0 G 38 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 F 39 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 N 40 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 P 41 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 E 42 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 D 43 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 D 44 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 E 45 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 E 46 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 E 48 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 V 49 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 F 50 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 L 51 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 S 53 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 D 54 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 S 56 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 D 57 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 A 58 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 S 59 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 G 60 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 K 61 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 F 62 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 G 63 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 V 64 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 M 65 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 T 66 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 I 67 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 P 68 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 R 69 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 N 70 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 K 71 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 72 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 R 73 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 K 74 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 W 75 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 P 76 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 K 77 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 K 78 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 T 79 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 G 80 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 G 81 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 I 82 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 83 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 H 84 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 P 85 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 F 86 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 N 87 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 A 88 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 D 89 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 K 90 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 F 91 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 V 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 93 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 L 94 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 D 95 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 D 96 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 D 97 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 S 98 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 I 99 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 W 100 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 L 101 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 K 102 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 D 103 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 G 104 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 K 105 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 F 106 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 T 107 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 L 108 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 G 109 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 D 110 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 N 111 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 R 112 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 S 113 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 L 114 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 S 115 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 I 116 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 T 117 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 V 118 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 E 119 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 G 120 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 N 121 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 N 122 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 V 123 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 V 124 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 I 125 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 D 126 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 T 127 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 G 128 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 G 129 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 G 130 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 E 131 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 L 132 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 D 133 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 I 134 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 R 135 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 S 136 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 S 137 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 K 138 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 L 139 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 M 140 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 H 141 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 N 142 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 G 143 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 V 144 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 N 145 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 I 146 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 G 147 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 D 148 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 S 149 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 H 150 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 V 151 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 H 152 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 P 153 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 154 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 155 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 A 156 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 D 157 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 S 158 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 D 159 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 G 160 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 D 161 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 T 162 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 E 163 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 A 164 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 D 165 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 T 166 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 D 167 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 P 168 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 P 169 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1000 0 0 K 170 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 170 0 * * * * * * 1000 0 0 R 171 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 171 0 * * * * * * 1000 0 0 D 172 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 172 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //