HHsearch 1.5 NAME c9rksC_ FAM FILE c9rksC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9rksC_.a3m DATE Sat Dec 13 10:53:21 2025 LENG 173 match states, 173 columns in multiple alignment FILT 1 out of 3 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4123 -0.5830 SEQ >ss_pred CEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCHHHCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCHHCCCCCEEEECCCEEEEEECCHHHHHCCCCCCEEE EEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCHHCCCCCCCEEEECEEEECC >ss_conf 9257643621147898654083111004724200124542100022125433447873277781210766512201317999853976741165530013 2103587999988878754115432699998674056888999999515765000234443046302035229 >Consensus klkltysnrltlpeiakhivsptfhelegraipvtgveddkegqsaitkpfalvglrigdtsgpaeigensrinlrddfiiefnfnkdrykkggaetslf syydyesirdrlfnamvafageygitfefvsldistegdtvyiefrfrqnfdwceadresdtvikagsfslnl >c9rksC_ KLKLTYSNRLTLPEIAKHIVSPTFHELEGRAIPVTGVEDDKEGQSAITKPFALVGLRIGDTSGPAEIGENSRINLRDDFIIEFNFNKDRYKKGGAETSLF SYYDYESIRDRLFNAMVAFAGEYGITFEFVSLDISTEGDTVYIEFRFRQNFDWCEADRESDTVIKAGSFSLNL # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * K 1 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 L 2 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 K 3 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 T 5 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 6 0 * * * * * * 1000 0 0 S 7 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 N 8 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 R 9 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 T 11 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 P 13 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 E 14 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 I 15 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 A 16 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 K 17 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 H 18 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 I 19 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 V 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 S 21 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 P 22 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 T 23 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 F 24 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 H 25 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 E 26 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 G 29 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 R 30 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 A 31 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 I 32 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 P 33 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 V 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 G 36 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 V 37 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 E 38 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 D 39 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 D 40 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 E 42 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 G 43 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 44 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 S 45 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 A 46 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 I 47 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 T 48 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 K 49 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 P 50 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 F 51 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 A 52 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 V 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 L 56 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 R 57 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 I 58 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 G 59 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 D 60 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 T 61 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 S 62 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 G 63 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 P 64 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 A 65 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 E 66 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 I 67 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 G 68 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 E 69 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 N 70 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 S 71 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 R 72 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 I 73 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 N 74 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 L 75 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 R 76 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 D 77 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 D 78 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 F 79 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 I 80 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 I 81 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 E 82 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 F 83 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 N 84 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 F 85 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 N 86 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 K 87 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 D 88 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 R 89 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 90 0 * * * * * * 1000 0 0 K 91 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 K 92 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 G 93 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 G 94 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 A 95 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 E 96 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 T 97 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 S 98 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 L 99 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 F 100 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 S 101 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 102 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 102 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 103 0 * * * * * * 1000 0 0 D 104 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 105 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 105 0 * * * * * * 1000 0 0 E 106 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 S 107 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 I 108 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 R 109 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 D 110 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 R 111 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 L 112 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 F 113 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 N 114 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 A 115 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 M 116 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 V 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 A 118 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 F 119 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 A 120 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 G 121 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 E 122 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 123 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 123 0 * * * * * * 1000 0 0 G 124 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 I 125 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 T 126 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 F 127 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 E 128 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 F 129 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 V 130 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 S 131 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 L 132 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 D 133 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 I 134 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 S 135 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 T 136 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 E 137 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 G 138 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 D 139 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 T 140 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 V 141 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 142 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 142 0 * * * * * * 1000 0 0 I 143 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 E 144 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 F 145 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 R 146 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 F 147 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 R 148 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 149 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 N 150 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 F 151 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 D 152 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 W 153 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 C 154 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 E 155 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 A 156 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 D 157 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 R 158 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 E 159 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 S 160 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 D 161 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 T 162 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 V 163 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 I 164 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 K 165 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 A 166 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 G 167 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 S 168 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 F 169 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1000 0 0 S 170 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 170 0 * * * * * * 1000 0 0 L 171 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 171 0 * * * * * * 1000 0 0 N 172 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 172 0 * * * * * * 1000 0 0 L 173 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 173 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //