HHsearch 1.5 NAME c9qqnB_ FAM FILE c9qqnB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9qqnB_.a3m DATE Sat Jun 14 11:44:45 2025 LENG 142 match states, 142 columns in multiple alignment FILT 7 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.8 EVD 0.4225 0.0569 SEQ >ss_pred CCEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCC CCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9026862048898899986376001750232212321077887899853188999998754466664234688899999958987573035765102258 545754689415955024543058998577899999765229 >Consensus xffxWslsGyCLexWxixxaxxKCFgNtavAKCNxxHdxEFCDmlrLfdyNknaiktlxxxtiNxlISDxllmknxlkxlmxiPYCNYtKFWYvnhtxtg xhslPrCWLxxNgSYLNetxFxxxwxxEsdxlxtEmLxkeYx >c9qqnB_ AFFSWSLTGYCLEEWMLVAAKMKCFGNTAVAKCNLNHDSEFCDMLRLFDYNKNAIKTLCGQTINALISDNLLMKNKIRELMSVPYCNYTKFWYVNHTLSG QHSLPRCWLIKNNSYLNISDFRNDWILESDFLISEMLSKEYS >UniRef50_Q6IUF7(263-423:496) Glycoprotein G2 n=136 Tax=New world arenaviruses RepID=GLYC_MACHU E=3e-68 s/c=1.61 id=89% cov=101% AFFSWSLTdssgkdmpgGYCLEEWMLIAAKMKCFGNTAVAKCNQNHDSEFCDMLRLFDYNKNAIKTlndeskkeinLLSQTVNALISDNLLMKNKIKELM SIPYCNYTKFWYVNHTLTGQHTLPRCWLIRNGSYLNTSEFRNDWILESDHLISEMLSKEYA >UniRef50_Q84168(184-518:518) Glycoprotein G2 n=12 Tax=New world arenaviruses RepID=GLYC_OLVVA E=1e-153 s/c=0.71 id=68% cov=101% AFLTWTLSdatgndlpgGYCLEQWAIVWAGIKCFGNTAVAKCNQNHDSEFCDMLRLFDYNRNAIKSLNDQsqsrlnlltnTINSLISDNLLMKNKLAEIM NIPYCNYTKFWYINDTRTGRHTLPQCWLISNGSYLNETKFRTQWLSESNALYTEMLTEDYD >UniRef50_Q9DK03(188-507:507) Glycoprotein G2 n=14 Tax=New world arenaviruses RepID=GLYC_ALLVP E=1e-134 s/c=0.71 id=57% cov=101% GFFTWDISdssgahvpgGYCLEQWAIVWAGIKCFDNAVMAKCNKDHNVEFCDTMRLFDFNQNAIKTlqlnvensvnLLKRSINGLISDSLVIRNSLKQLA KIPYCNYTKFWYVNDTITGKHSLPQCWLMRNGSYLNETHFKNEWLWESQNLYNEMLLKEYE >UniRef50_Q911P0(181-479:480) Glycoprotein G2 n=5 Tax=New world arenaviruses RepID=GLYC_WWAVU E=1e-113 s/c=0.78 id=70% cov=101% SFFAWSLSdatgtdmpgGYCLEKWMLISSELKCFGNTAIAKCNLDHSSEFCDMLKLFEFNRNAIKTLQNDSkhqldmiitaVNSLISDNTLMKNRLKELI NIPYCNYTKFWYVNHTGFNVHSLPRCWLTKNGSYLNVSDFRNQWLLESDHLISEILSREYE >UniRef50_P07399(221-498:498) Glycoprotein G2 n=93 Tax=Old world arenaviruses RepID=GLYC_LYCVW E=1e-111 s/c=0.82 id=58% cov=101% GTFTWTLSdssgvenpgGYCLTKWMILAAELKCFGNTAVAKCNVNHDEEFCDMLRLIDYNKAALSKfkqdvesalhVFKTTLNSLISDQLLMRNHLRDLM GVPYCNYSKFWYLEHAKTGETSVPKCWLVTNGSYLNETHFSDQIEQEADNMITEMLRKDYI >UniRef50_C5ILC1(183-453:454) Glycoprotein n=1 Tax=Lujo virus RepID=C5ILC1_9VIRU E=1e-107 s/c=0.85 id=60% cov=101% KLFQWSLSdetgsplpgGHCLERWLIFASDIKCFDNAAIAKCNKEHDEEFCDMLRLFDYNKASIAKLRGEAsssinllsgrINAIISDTLLMRSSLKRLM GIPYCNYTKFWYLNHTKLGIHSLPRCWLVSNGSYLNETKFTHDMEDEADKLLTEMLKKEYV # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * A 1 1435 * * * * 1609 * * 2673 * * * * * * 2780 * * * * 1 0 * * * * * * 1784 0 0 F 2 * * * * 566 * * * * 2673 * * * * * * 2576 * * * 2 0 * * * * * * 1784 0 0 F 3 * * * * 209 * * * * 2889 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1784 0 0 S 4 2780 * * * * * * * * * * * * 2673 * 2091 1112 * * * 4 0 * * * * * * 1784 0 0 W 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 5 0 * * * * * * 1784 0 0 S 6 * * 2643 * * * * * * * * * * * * 896 1724 * * * 6 0 * * * * * * 1784 0 0 L 7 * * * * * * * 2643 * 252 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1784 0 0 T 8 * * * * * * * * * * * * * * * 386 2091 * * * 8 3068 183 * 3170 170 * * 1784 1786 0 G 9 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1784 0 0 Y 10 * * * * * * 2673 * * * * * * * * * * * * 246 10 0 * * * * * * 1784 0 0 C 11 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1784 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1784 0 0 E 13 * * * 265 * * * * * * * * * * * * 2576 * * * 13 0 * * * * * * 1784 0 0 E 14 * * * 2091 * * * * 1675 * * * * 1761 2673 * * * * * 14 0 * * * * * * 1784 0 0 W 15 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 15 0 * * * * * * 1784 0 0 M 16 1761 * * * * * * * * 2673 868 * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1784 0 0 L 17 * * * * * * * 691 * 1394 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1784 0 0 V 18 * * * * 2673 * * 1937 * 2576 * * * * * * * 1271 * * 18 0 * * * * * * 1784 0 0 A 19 838 * * * * * * * * * * * * * * 2780 * * 1761 * 19 0 * * * * * * 1784 0 0 A 20 520 * * * * * * * * * * * * * * 1725 * * * * 20 0 * * * * * * 1784 0 0 K 21 * * 2673 1675 * 1761 * * 2091 * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1784 0 0 M 22 * * * * * * * 1146 * 1675 2091 * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1784 0 0 K 23 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1784 0 0 C 24 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1784 0 0 F 25 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1784 0 0 G 26 * * 1658 * * 550 * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1784 0 0 N 27 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1784 0 0 T 28 1658 * * * * * * * * * * * * * * * 550 * * * 28 0 * * * * * * 1784 0 0 A 29 252 * * * * * * * * * * * * * * * * 2643 * * 29 0 * * * * * * 1784 0 0 V 30 * * * * * * * 1725 * * 2643 * * * * * * 896 * * 30 0 * * * * * * 1784 0 0 A 31 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1784 0 0 K 32 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1784 0 0 C 33 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1784 0 0 N 34 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1784 0 0 L 35 * * * * * * * * 1658 1917 * * * 1997 * * * 2576 * * 35 0 * * * * * * 1784 0 0 N 36 * * 1710 2673 * * * * * * * 896 * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1784 0 0 H 37 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1784 0 0 D 38 * * 526 * * * * * * * * 2643 * * * 2780 * * * * 38 0 * * * * * * 1784 0 0 S 39 * * * 1624 * * * * * * * * * * * 956 * 2643 * * 39 0 * * * * * * 1784 0 0 E 40 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1784 0 0 F 41 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1784 0 0 C 42 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1784 0 0 D 43 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1784 0 0 M 44 * * * * * * * * * * 252 * * * * * 2643 * * * 44 0 * * * * * * 1784 0 0 L 45 * * * * * * * * * 252 2643 * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1784 0 0 R 46 * * * * * * * * 2780 * * * * * 227 * * * * * 46 0 * * * * * * 1784 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1784 0 0 F 48 * * * * 265 * * 2576 * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1784 0 0 D 49 * * 227 2780 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1784 0 0 Y 50 * * * * 1710 * * * * * * * * * * * * * * 526 50 0 * * * * * * 1784 0 0 N 51 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1784 0 0 K 52 * * * * * * * * 838 * * * * 2643 1833 * * * * * 52 0 * * * * * * 1784 0 0 N 53 1624 * * * * * * * * * * 566 * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1784 0 0 A 54 246 * * * * * * * * * * * * * * 2673 * * * * 54 0 * * * * * * 1784 0 0 I 55 * * * * * * * 265 * 2576 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1784 0 0 K 56 2673 * * * * * * * 566 * * * * * * 2576 * * * * 56 0 * * * * * * 1784 0 0 T 57 * * * * * * * * 1624 * * * * * * 2889 888 * * * 57 845 1174 * 3322 152 * * 1784 1552 0 L 58 * * * * * * * * * 265 * * * * * * * 2576 * * 58 0 * * * * * * 1784 0 0 C 59 * 3068 * * 2576 * * * * 1859 * 2889 * 2780 2673 * * * * * 59 0 * * * * * * 1784 0 0 G 60 * * 2889 * * 1857 * * 1609 * * 2780 * * * 3113 * * * * 60 0 * * * * * * 1784 0 0 Q 61 * * 2780 2673 * * * * * * * * * 1435 2643 * 2576 * * * 61 209 2889 * 3322 152 * * 1784 1000 0 T 62 2673 * * * * * * * * * * * * * * 1710 896 * * * 62 520 1725 * 3322 152 * * 1784 1366 0 I 63 * * * * * * * 808 * 2576 * * * * * * * 1937 * * 63 0 * * * * * * 1784 0 0 N 64 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1784 0 0 A 65 1352 * * * * 2643 * * * * * * * * * 1158 * * * * 65 0 * * * * * * 1784 0 0 L 66 * * * * * * * 2673 * 246 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1784 0 0 I 67 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1784 0 0 S 68 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 68 0 * * * * * * 1784 0 0 D 69 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1784 0 0 N 70 * * * * * * * * * * * 956 * 2576 * 2643 2673 * * * 70 0 * * * * * * 1784 0 0 L 71 * * * * * * * * * 227 * * * * * * 2780 * * * 71 0 * * * * * * 1784 0 0 L 72 * * * * * * * * * 252 * * * * * * * 2643 * * 72 0 * * * * * * 1784 0 0 M 73 * * * * * * * 2643 * * 252 * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1784 0 0 K 74 * * * * * * * * 956 * * * * * 1045 * * * * * 74 0 * * * * * * 1784 0 0 N 75 * * * * * * * * * * * 246 * * * 2673 * * * * 75 0 * * * * * * 1784 0 0 K 76 * * * * * * 2576 * 1435 * * * * * 2780 1658 * * * * 76 0 * * * * * * 1784 0 0 I 77 * * * * * * * 2091 * 386 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1784 0 0 R 78 2889 * * * * * * * 791 * * * * * 1801 * * * * * 78 0 * * * * * * 1784 0 0 E 79 * * 2576 956 * * * * * * * * * 2643 2673 * * * * * 79 0 * * * * * * 1784 0 0 L 80 * * * * * * * 2889 * 209 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1784 0 0 M 81 2643 * * * * * * 2780 * * 526 * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1784 0 0 S 82 * * * * * 1624 * * 2643 * * 1833 * * * 2091 * * * * 82 0 * * * * * * 1784 0 0 V 83 * * * * * * * 488 * * * * * * * * * 1801 * * 83 0 * * * * * * 1784 0 0 P 84 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1784 0 0 Y 85 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 85 0 * * * * * * 1784 0 0 C 86 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1784 0 0 N 87 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1784 0 0 Y 88 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 88 0 * * * * * * 1784 0 0 T 89 * * * * * * * * * * * * * * * 2576 265 * * * 89 0 * * * * * * 1784 0 0 K 90 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1784 0 0 F 91 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1784 0 0 W 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 92 0 * * * * * * 1784 0 0 Y 93 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 93 0 * * * * * * 1784 0 0 V 94 * * * * * * * 2889 * 1624 * * * * * * * 888 * * 94 0 * * * * * * 1784 0 0 N 95 * * * 2576 * * * * * * * 265 * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1784 0 0 H 96 * * 1761 * * * 505 * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1784 0 0 T 97 2576 * * * * * * * * * * * * * * * 265 * * * 97 0 * * * * * * 1784 0 0 L 98 * * * * * 2780 * 2643 1624 2091 * * * * 2889 * * * * * 98 0 * * * * * * 1784 0 0 S 99 * * * * 2780 * * * * 2673 * * * * * 3068 790 * * * 99 0 * * * * * * 1784 0 0 G 100 * * * * * 227 * * * * * 2780 * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1784 0 0 Q 101 * * * 2576 * * * 2673 2643 * * * * 2091 2889 * * 2780 * * 101 0 * * * * * * 1784 0 0 H 102 * * * * * * 265 * * * * * * * * * 2576 * * * 102 0 * * * * * * 1784 0 0 S 103 * * * * * * * * * * * * * * * 416 1997 * * * 103 0 * * * * * * 1784 0 0 L 104 * * * * * * * * * 265 * * * * * * * 2576 * * 104 0 * * * * * * 1784 0 0 P 105 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1784 0 0 R 106 * * * * * * * * 2576 * * * * 1761 896 * * * * * 106 0 * * * * * * 1784 0 0 C 107 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1784 0 0 W 108 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 108 0 * * * * * * 1784 0 0 L 109 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1784 0 0 I 110 * * * * * * * 1435 * * 2643 * * * * * 2780 1624 * * 110 0 * * * * * * 1784 0 0 K 111 * * * * * * * * 1917 * * * * * 1859 1777 2576 * * * 111 0 * * * * * * 1784 0 0 N 112 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1784 0 0 N 113 * * * * * 183 * * * * * 3068 * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1784 0 0 S 114 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 114 0 * * * * * * 1784 0 0 Y 115 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 115 0 * * * * * * 1784 0 0 L 116 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1784 0 0 N 117 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1784 0 0 I 118 * * * 691 * * * 3068 * * * * * * * * 3113 2780 * * 118 0 * * * * * * 1784 0 0 S 119 * * * * * * * * * * * * * * * 1394 691 * * * 119 0 * * * * * * 1784 0 0 D 120 * * 1917 3113 * * 1609 * 1777 * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1784 0 0 F 121 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1784 0 0 R 122 * * * * * * * * 2643 * * * * * 956 2576 2673 * * * 122 0 * * * * * * 1784 0 0 N 123 * * 2576 * * * 2673 * * * * 888 * * * * 2889 * * * 123 0 * * * * * * 1784 0 0 D 124 * * 1352 2643 * * * * * * * * * 1158 * * * * * * 124 0 * * * * * * 1784 0 0 W 125 * * * * * * * 2576 * * 2673 * * * * * * * 566 * 125 0 * * * * * * 1784 0 0 I 126 * * * 1624 * * * 2091 * 1182 * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1784 0 0 L 127 * * 2673 * * * * * * 1394 * * * 2576 * 2889 * * 2643 * 127 0 * * * * * * 1784 0 0 E 128 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1784 0 0 S 129 1624 * * * * * * * * * * * * * * 566 * * * * 129 0 * * * * * * 1784 0 0 D 130 * * 505 * * * * * * * * 2889 * 2643 * * * * * * 130 0 * * * * * * 1784 0 0 F 131 2889 * * * 3068 * 1937 * 2673 * * 1609 * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1784 0 0 L 132 * * * * * * * * * 265 2576 * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1784 0 0 I 133 * * * * * * * 868 * 2673 * * * * * * * * * 1761 133 0 * * * * * * 1784 0 0 S 134 * * * * * * * * * * * 2643 * * * 1394 1122 * * * 134 0 * * * * * * 1784 0 0 E 135 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1784 0 0 M 136 * * * * * * * 2780 * * 227 * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1784 0 0 L 137 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1784 0 0 S 138 * * * * * * * * 2673 2643 * * * * 2576 1394 2889 * * * 138 0 * * * * * * 1784 0 0 K 139 * * * 2889 * * * * 475 * * * * * 2780 * * * * * 139 0 * * * * * * 1784 0 0 E 140 * * 1724 520 * * * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1784 0 0 Y 141 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 141 0 * * * * * * 1784 0 0 S 142 3113 * 2889 1710 * * * 2576 * * * * * * * 3068 * 2673 * * 142 0 * * 0 * * * 1784 0 0 //