HHsearch 1.5 NAME c9qceD_ FAM FILE c9qceD_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9qceD_.a3m DATE Sat Sep 13 11:02:31 2025 LENG 138 match states, 138 columns in multiple alignment FILT 2 out of 4 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4429 0.1698 SEQ >ss_pred CCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCEEEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCEEEECCEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEC EEEEEEEECCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCEEEEECC >ss_conf 9236578724445534817988622236751666565514567998436865761023743112132414575266301038888522899987311100 14789873577621171010456221377417876309 >Consensus rtflpngnyxiksxfsxslylsxxsgxlsfsnxssxxnqkwxxeyxxxxxxfxxsnvaepnkylxyxxxgfisxxxxxwxpikiainsyixxslxxvnxx dyawxiydxnxnixxqpxlxlpnfdixnsnqxxklekx >c9qceD_ RTFLPNGNYNIKSIFSGSLYLSPVSGSLTFSNESSANNQKWNVEYMAENRCFKISNVAEPNKYLSYDNFGFISLDSLYWFPIKIAVNTYIMLSLNKVNEL DYAWDIYDTNENILSQPLLLLPNFDIYNSNQMFKLEKI >UniRef50_P46083(5-146:146) Hemagglutinin component HA-17 n=27 Tax=root RepID=HA17_CLOBO E=3e-45 s/c=1.28 id=63% cov=101% RTFLPNGNYKIKSLFSDSLYLTYSSGALSFSNTSSLDNQKWKLEYISSSNGFRFSNVAEPNKYLAYNDYGFIylssSSNNSLWNPIKIAINSYIICTLSI VNVTDYAWTIYDNNNNITDQPILNLPNFDINNSNQILKLEKL # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * R 1 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 1 0 * * * * * * 1292 0 0 T 2 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 2 0 * * * * * * 1292 0 0 F 3 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1292 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1292 0 0 P 5 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1292 0 0 N 6 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1292 0 0 G 7 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1292 0 0 N 8 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1292 0 0 Y 9 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 9 0 * * * * * * 1292 0 0 N 10 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1292 0 0 I 11 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1292 0 0 K 12 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1292 0 0 S 13 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 13 0 * * * * * * 1292 0 0 I 14 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1292 0 0 F 15 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1292 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 16 0 * * * * * * 1292 0 0 G 17 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1292 0 0 S 18 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 18 0 * * * * * * 1292 0 0 L 19 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1292 0 0 Y 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 20 0 * * * * * * 1292 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1292 0 0 S 22 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 22 0 * * * * * * 1292 0 0 P 23 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 23 0 * * * * * * 1292 0 0 V 24 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * 24 0 * * * * * * 1292 0 0 S 25 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 25 0 * * * * * * 1292 0 0 G 26 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1292 0 0 S 27 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 27 0 * * * * * * 1292 0 0 L 28 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1292 0 0 T 29 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 29 0 * * * * * * 1292 0 0 F 30 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1292 0 0 S 31 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 31 0 * * * * * * 1292 0 0 N 32 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1292 0 0 E 33 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 33 0 * * * * * * 1292 0 0 S 34 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 34 0 * * * * * * 1292 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 35 0 * * * * * * 1292 0 0 A 36 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1292 0 0 N 37 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1292 0 0 N 38 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1292 0 0 Q 39 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1292 0 0 K 40 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1292 0 0 W 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 41 0 * * * * * * 1292 0 0 N 42 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1292 0 0 V 43 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 43 0 * * * * * * 1292 0 0 E 44 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1292 0 0 Y 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 45 0 * * * * * * 1292 0 0 M 46 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1292 0 0 A 47 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 47 0 * * * * * * 1292 0 0 E 48 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 48 0 * * * * * * 1292 0 0 N 49 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 49 0 * * * * * * 1292 0 0 R 50 * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * 50 0 * * * * * * 1292 0 0 C 51 * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1292 0 0 F 52 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1292 0 0 K 53 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 53 0 * * * * * * 1292 0 0 I 54 * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1292 0 0 S 55 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 55 0 * * * * * * 1292 0 0 N 56 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1292 0 0 V 57 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 57 0 * * * * * * 1292 0 0 A 58 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1292 0 0 E 59 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1292 0 0 P 60 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1292 0 0 N 61 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1292 0 0 K 62 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1292 0 0 Y 63 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 63 0 * * * * * * 1292 0 0 L 64 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1292 0 0 S 65 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 65 0 * * * * * * 1292 0 0 Y 66 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 66 0 * * * * * * 1292 0 0 D 67 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1292 0 0 N 68 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1292 0 0 F 69 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 69 0 * * * * * * 1292 0 0 G 70 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1292 0 0 F 71 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1292 0 0 I 72 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 72 1000 1000 * 2000 415 * * 1292 1000 0 S 73 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 73 0 * * * * * * 1292 0 0 L 74 * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * 74 0 * * * * * * 1292 0 0 D 75 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1292 0 0 S 76 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 76 0 * * * * * * 1292 0 0 L 77 * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * 77 0 * * * * * * 1292 0 0 Y 78 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 78 0 * * * * * * 1292 0 0 W 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 79 0 * * * * * * 1292 0 0 F 80 * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1292 0 0 P 81 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1292 0 0 I 82 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1292 0 0 K 83 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1292 0 0 I 84 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1292 0 0 A 85 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1292 0 0 V 86 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 86 0 * * * * * * 1292 0 0 N 87 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1292 0 0 T 88 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 88 0 * * * * * * 1292 0 0 Y 89 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 89 0 * * * * * * 1292 0 0 I 90 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1292 0 0 M 91 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1292 0 0 L 92 * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1292 0 0 S 93 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 93 0 * * * * * * 1292 0 0 L 94 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1292 0 0 N 95 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 95 0 * * * * * * 1292 0 0 K 96 * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1292 0 0 V 97 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 97 0 * * * * * * 1292 0 0 N 98 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1292 0 0 E 99 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 99 0 * * * * * * 1292 0 0 L 100 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 100 0 * * * * * * 1292 0 0 D 101 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1292 0 0 Y 102 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 102 0 * * * * * * 1292 0 0 A 103 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1292 0 0 W 104 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 104 0 * * * * * * 1292 0 0 D 105 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 105 0 * * * * * * 1292 0 0 I 106 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1292 0 0 Y 107 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 107 0 * * * * * * 1292 0 0 D 108 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1292 0 0 T 109 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 109 0 * * * * * * 1292 0 0 N 110 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1292 0 0 E 111 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1292 0 0 N 112 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1292 0 0 I 113 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1292 0 0 L 114 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 114 0 * * * * * * 1292 0 0 S 115 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 115 0 * * * * * * 1292 0 0 Q 116 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 116 0 * * * * * * 1292 0 0 P 117 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1292 0 0 L 118 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1292 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1292 0 0 L 120 * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1292 0 0 L 121 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1292 0 0 P 122 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1292 0 0 N 123 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1292 0 0 F 124 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1292 0 0 D 125 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1292 0 0 I 126 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1292 0 0 Y 127 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 127 0 * * * * * * 1292 0 0 N 128 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1292 0 0 S 129 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 129 0 * * * * * * 1292 0 0 N 130 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1292 0 0 Q 131 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 131 0 * * * * * * 1292 0 0 M 132 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1292 0 0 F 133 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1292 0 0 K 134 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1292 0 0 L 135 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1292 0 0 E 136 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1292 0 0 K 137 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1292 0 0 I 138 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 138 0 * * 0 * * * 1292 0 0 //