HHsearch 1.5 NAME c9q36A_ FAM FILE c9q36A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9q36A_.a3m DATE Sun Dec 28 01:07:02 2025 LENG 104 match states, 104 columns in multiple alignment FILT 108 out of 839 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 7.4 EVD 0.4355 0.2634 SEQ >ss_pred CEEEEECCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCEEEE CCCC >ss_conf 9599974999889999589986789999888986655458744046217998168535677989889986324701137781679878976555826998 2588 >Consensus PkvtxixxxGxxxxixxxxGxxLlxaxxxxgixxxxxxCxGxgxCgtCxvxvxxgxxxxlxxxxxxExxxLxxxxxxxxxxxRLaCQxxvxxdldgixVx iPxp >c9q36A_ PRVVFIDEQSGEYAVDAQDGQSLMEVATQNGVPGIVAECGGSSVCATCRIEIEDAWVEIVGEANPDENDLLQSTGEPMTAGTRLSCQVFIDPSMDGLIVR VPLP >UniRef50_C6Y3W7(7-102:110) Ferredoxin n=2 Tax=Pedobacter RepID=C6Y3W7_PEDHD E=2e-14 s/c=0.83 id=22% cov=93% -KINFEEQGKETIELPIAGGESVLDVCLDHGIE-LQHNCGGVCGCSTCHVYVTRG-MDDIQEISDKEEDFIDRAVRPKIS-SRLGCQCVVIS--GDIEVT IP-- >UniRef50_UPI00006CC388(17-115:122) hypothetical protein TTHERM_00590010 n=1 Tax=Tetrahymena thermophila RepID=UPI00006CC388 E=5e-12 s/c=0.73 id=19% cov=94% ---IFVTQDNVKSIIYGKEGDNLMEITMPAvdQKLHLFGICNKELSCTSCSVHIKS-KLNCFNAPQDKELDVLYGLNDYRDGETRMSCQIFLTKEMNDME IEI--- >UniRef50_B8GG94(2-90:642) Ferredoxin n=1 Tax=Methanosphaerula palustris E1-9c RepID=B8GG94_METPE E=3e-08 s/c=0.67 id=21% cov=84% PIVTFLP---SYRKAEVEFGATILDAAQRAGL-NINVVCGGQGKCGKCIVYRKSGRV-----AFERQQYSRFFSHGELEKGALLACEAFVNGDLE----- ---- >UniRef50_C7I041(2-88:353) Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein n=1 Tax=Thiomonas intermedia K12 RepID=C7I041_THIIN E=7e-05 s/c=0.56 id=21% cov=40% -----------ETDLLADPDENLLKLLRRHQVPI--RYSCKSGECGSCKCVLES---------------------------------------------- ---- >UniRef50_B7GAP1(116-234:242) Predicted protein n=1 Tax=Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1 RepID=B7GAP1_PHATR E=2e-10 s/c=0.56 id=20% cov=97% --LTLVDPSGARRKIKGVIGRTLYEVCDMYDIDIGPASGGsapeeartetwfeptfGEGTTsGYDHVVLVGKGSDKAQRMTPVEEQMLDDhwSFDEIYEG SRLASAVKLVKEMDGMTVYIP-- >UniRef50_P37097(2-109:123) Ferredoxin-5 n=26 Tax=Proteobacteria RepID=FER5_RHOCA E=0.0002 s/c=0.43 id=15% cov=90% PNITFTSPiMKKDKTIYAVAGntATILALAKEHAIPIPFECGDGDCASCLIEVTHLDNKPAMAMMLTEKEKARLKELqmitaeeieaaeVSDLPPRFRLA CQFIPRDE----------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * P 1 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 1 0 * * * * * * 5804 0 0 R 2 * * * * * * * 3959 939 3724 * 3777 * 6240 3070 5558 4579 3832 * * 2 0 * * * * * * 6787 0 0 V 3 5065 * * * 6209 * * 1783 * 3120 4959 * * * * * * 984 * 6230 3 19 6274 * 1000 1000 * * 7147 1000 0 V 4 * * 5884 3986 * * 6368 2774 4609 6410 * 5536 * * 4124 5290 1026 3139 * * 4 35 * 5400 * * * * 7233 0 0 F 5 5414 * * * 1576 * * 1852 * 3912 * * * * 6359 5200 6024 2232 * 5053 5 78 * 4240 * * 0 * 7310 0 1632 I 6 5704 * 5869 6623 6589 * 4085 1699 4029 3664 6505 * * 5387 6304 6250 3294 1959 * 5955 6 31 6626 6505 2585 263 951 1051 7469 1000 2399 D 7 6323 * 2175 3007 5387 6201 4070 6788 5295 4677 5778 3456 3904 4031 * 3291 3282 * * 5118 7 95 5398 4632 703 1374 1542 607 7513 1619 1939 E 8 3884 * 4892 3000 3935 4681 3724 5590 4886 3665 * 4554 2412 3775 3696 4888 5403 5498 * * 8 47 5855 6074 0 * 1206 820 7509 1000 2952 Q 9 4426 * 1454 2756 * 4241 * 6828 4927 6299 5112 3411 * 4514 5562 2993 6411 * * 6986 9 88 6174 4473 0 * 2147 369 7565 1523 2741 S 10 4837 * 5020 5421 * 583 6321 * 3137 * * 4433 6402 7037 * 4277 * * * * 10 70 6500 4775 2000 415 635 1490 7521 1000 3781 G 11 3512 * 5215 2281 5497 4627 5462 4201 3404 6361 * 4241 5693 3459 4533 4458 3245 3716 * * 11 46 6629 5556 0 * 1079 925 7596 1000 3644 E 12 4065 * 3288 2744 5424 6640 * * 2900 6493 * 5753 * 3595 2678 3431 3590 4239 6590 6197 12 28 * 5678 * * 612 1533 7585 0 2999 Y 13 4467 * * 4962 6042 5777 3769 3008 3011 3664 5130 * * 4817 2839 5939 3529 3783 * 3193 13 28 6441 6962 1000 1000 1026 974 7631 1000 2718 A 14 5307 6490 4673 1919 5017 * 6681 5411 3504 4959 6769 6674 5924 4388 4389 4516 2214 3549 * * 14 26 5785 * 1000 1000 569 1618 7614 1617 2221 V 15 4258 5401 6379 * 3529 * * 1631 * 2473 * * * * 5645 * 5476 1836 * * 15 79 6050 4712 2325 321 0 * 7617 1591 1000 D 16 4739 * 2786 2147 6850 * 5524 * 3373 6156 5429 4346 3639 3796 4984 4558 4276 5345 * 3720 16 44 * 5057 * * * 0 7630 0 2640 A 17 1666 3934 * * 5672 2678 * 3850 * 4985 6648 * 5588 6826 * * 5033 2205 4849 5578 17 13 * 6803 * * 700 1379 7590 0 3647 Q 18 4419 * 3758 2485 5580 6484 5693 6907 3080 4877 4781 4326 2678 5947 3289 4552 4792 4710 * 6538 18 0 * * * * 427 1963 7633 0 2488 D 19 2855 * 2957 2736 5546 4740 * 4036 4862 6923 * 5540 2669 6476 5729 5029 4445 2888 * * 19 54 5728 5804 1000 1000 0 * 7637 1646 1000 G 20 6120 * 3496 6643 6751 526 5726 * 6683 * * 3187 * 6379 * 6155 6655 * * 6828 20 36 5345 * 1312 744 1000 1000 7637 1377 1489 Q 21 3880 * 3152 1936 6914 7105 5188 6853 4540 5890 4920 * 6972 2608 4057 5099 3021 5092 * * 21 10 7201 * 3322 152 0 * 7634 1000 1000 S 22 * * 5808 * * * * 4453 6483 5890 6427 2328 4682 * 3159 2434 1683 4847 * 6006 22 0 * * * * * * 7645 0 0 L 23 * * * * 5432 * * 2481 * 636 * * * * * * * 2698 * * 23 17 6396 * 0 * * * 7645 1000 0 M 24 3929 * * * 5085 6851 * 4652 * 891 3374 * * 6706 3152 6572 6612 4266 * 5272 24 30 6087 7495 3585 126 * * 7645 1000 0 E 25 4573 * 1718 2109 7617 * 6501 * 3989 6738 6801 * * 3295 3602 3878 4044 * * 6383 25 16 * 6494 * * 0 * 7644 0 1000 V 26 1184 * * 4988 * 4642 5398 3511 * 3378 6854 * * * 6078 * 3921 2542 * 5673 26 0 * * * * 0 * 7624 0 1000 A 27 1433 3869 * * * 4168 * 4101 * 1663 4756 * * * * 4881 5061 5030 * * 27 0 * * * * * * 7645 0 0 T 28 4051 * 5064 3007 4717 6193 6981 3766 4046 2169 6036 * * 3616 2606 * 4819 4903 * 4663 28 26 * 5821 * * * * 7645 0 0 Q 29 3828 * 3936 2569 6512 3841 * 6807 3579 4633 4351 3466 6015 4279 2135 5252 6562 * * 6485 29 14 * 6695 * * 0 * 7636 0 1564 N 30 2302 5651 4686 5769 5311 6491 3402 * 5930 4530 * 1763 * 3624 5217 4051 5173 5965 * 5452 30 39 5221 * 2088 387 0 * 7644 1729 1000 G 31 3992 * 3042 3681 6396 1167 6644 * 3804 * 6774 4138 6612 5663 4434 4936 6591 * * 6193 31 27 * 5732 * * * * 7645 0 0 V 32 4335 * 6743 5620 4374 7478 7712 1702 4783 2733 * * 6381 6034 6992 * 5231 1865 6253 5747 32 320 6679 2402 1000 1000 0 * 7636 1000 1512 P 33 3381 * 3066 3262 6447 4470 * 4931 4933 4254 5054 5458 2074 4715 6330 3556 5226 4948 * 5597 33 285 * 2481 * * 0 * 7501 0 5117 G 34 5033 6514 3340 4905 4494 3531 3637 4183 5047 2891 * 3564 3999 5669 6246 4835 * 3737 4090 4431 34 114 6434 3952 1000 1000 0 * 7594 1000 4860 I 35 5481 * 6618 6316 5856 4120 6482 1757 6429 2424 5317 3864 3253 * * 5958 5386 3679 6684 4363 35 82 * 4184 * * 1392 692 7515 0 3271 V 36 4587 6079 3748 2981 4596 4037 6545 6616 5155 3680 5031 3933 2173 4183 4650 5843 5344 5149 * 5048 36 14 6697 * 3459 138 466 1858 7516 1000 3959 A 37 2444 5595 4227 6120 3903 2515 3683 * 6569 * 6449 7490 4690 * 5062 2683 4702 5112 * 3493 37 73 4521 7514 2003 414 0 * 7564 2577 2032 E 38 3220 2897 3883 3968 * 4749 6745 4301 6862 4059 5926 3431 4408 6959 6733 2863 4095 4722 6460 4573 38 64 5926 5208 2322 322 * 0 7575 1466 1000 C 39 6733 429 4863 6371 6855 4780 * * 5684 * * 6557 * 5368 4306 5516 6171 5972 * * 39 70 6716 4719 1000 1000 382 2104 7541 1000 2561 G 40 4669 3603 5014 4022 * 1278 6796 * 5340 * 4891 3956 6149 5160 3022 4157 6759 * * 6486 40 175 5189 3529 4000 93 0 * 7557 1444 2797 G 41 4139 6473 * 6330 5215 443 * 5405 4875 * 5955 6531 * * 4455 5940 6565 * * * 41 65 * 4505 * * 0 * 7589 0 3752 S 42 5305 * 3824 3108 * 3352 6938 5197 4254 5703 3716 3391 * 3937 3581 3363 4039 3505 * 5903 42 74 6137 4816 1000 1000 0 * 7566 1000 2684 S 43 2905 2844 5962 5321 * 853 6144 * 6613 3967 5736 * 6920 6804 * 6920 * * * * 43 76 5157 5440 4216 80 * 0 7553 1680 2482 V 44 2530 4273 6386 4528 * 5335 * 4449 4884 4502 5149 5772 * 4172 3024 3103 2747 3878 * 6266 44 7 * 7600 * * 205 2918 7537 0 3556 C 45 6661 268 * * 6314 5085 * * * * * * * * 6814 4057 4361 * * * 45 34 6228 6661 0 * 966 1035 7577 1000 1461 A 46 2541 4516 6277 6203 * 1162 6683 * * * * * 4416 5539 5899 2777 3828 * * * 46 13 * 6766 * * 1000 1000 7568 0 1714 T 47 4317 * 5065 5402 6459 4830 6974 5138 3317 4233 6647 6288 * 3748 5184 3061 1349 6720 * 6224 47 0 * * * * 0 * 7627 0 1566 C 48 5092 147 5381 * 6284 * * 6152 * * * * * * * 5894 * * * * 48 33 6279 6678 0 * * * 7645 1000 0 R 49 3467 * * 4924 6700 6358 2195 4652 2355 4023 4862 * 6475 4241 2543 4589 * 5704 6824 * 49 0 * * * * * 0 7564 0 1000 I 50 3603 3211 * * 5896 5223 * 3495 * 5491 5351 * * * * 4862 5901 787 * * 50 0 * * * * * 0 7564 0 1000 E 51 5720 * 6758 3325 3986 * 4591 5325 2969 3663 * 4922 * 4640 2379 5007 3685 3401 * 3901 51 41 * 5148 * * 0 * 7564 0 1000 I 52 * 4649 * * 4290 * 6023 1898 * 2412 5697 * 6808 * 6261 * * 1387 6180 * 52 52 5164 7061 1212 815 * 0 7547 2073 1970 E 53 4110 5649 4415 3139 * * 4840 5019 3818 2712 * 6746 3732 4759 5280 4140 3164 2776 * 6509 53 104 5466 4405 2496 281 * 0 7539 1682 2466 D 54 4506 * 2772 2401 6642 4744 6397 * 3073 * * 4026 4160 3937 6221 2411 5694 5558 * 5820 54 77 6400 4642 2000 415 1077 927 7581 1000 4044 A 55 3775 * 3975 3287 * 775 6515 * 5311 * * 4890 5640 6217 * 4031 * 6392 * * 55 307 6227 2488 1000 1000 1635 560 7446 1000 3905 W 56 3526 * 4112 3214 4604 2741 5339 6617 3082 6446 * 4744 * 6632 5823 3652 3501 4576 3248 6337 56 139 * 3446 * * 875 1136 7355 0 5583 V 57 4267 * 4430 4750 3377 4264 6290 2776 4513 3678 3893 * 5140 4196 5355 4458 * 2647 * 4167 57 151 5039 3857 2976 196 1566 595 7371 1785 4928 E 58 3612 * 2598 1970 4361 3323 4803 4787 4536 6255 * 3890 4937 4822 4954 6243 6464 6339 * 5939 58 74 * 4316 * * 1994 417 7396 0 5115 I 59 3320 4685 5573 4930 * 5156 3796 4472 3131 3396 3471 4618 6610 4130 3535 4038 4992 5463 * 4224 59 17 * 6417 * * 2435 295 7348 0 5005 V 60 3855 5714 4716 6444 5189 4093 * 4128 5339 1017 6335 5941 6367 * * 6211 4056 3540 * * 60 46 * 4982 * * 2533 274 7391 0 4668 G 61 6278 6448 4415 4177 6464 2752 * 6497 * * 5036 3967 2030 4792 4451 3030 3561 4646 5313 6744 61 47 6459 5598 3907 100 735 1325 7421 1000 4808 E 62 2813 * 4305 2036 * 5655 * * 4797 6047 5980 4458 1734 5418 5447 4226 5710 6453 * * 62 19 * 6263 * * 826 1198 7520 0 3670 A 63 2669 * 6643 4575 6891 5017 * 3435 4913 3823 4189 * 2282 5589 3734 6382 6151 3013 5621 5134 63 27 * 5746 * * 1266 775 7547 0 2788 N 64 4800 * 3374 3531 4771 3499 4433 * 6029 * 6432 3124 5602 5237 4942 3083 2003 5568 * * 64 27 * 5733 * * * 0 7552 0 2729 P 65 3757 * 2417 3184 5773 * 6384 5398 5230 3757 4252 5840 2612 6547 3947 4488 * 4318 6162 4145 65 59 6527 5081 2322 322 1582 587 7526 1000 2954 D 66 2551 6195 2571 3009 6188 5378 5150 4488 3382 3892 * 5363 * 5826 3743 4692 4319 4504 * * 66 30 6633 6535 1585 585 2508 279 7509 1000 3203 E 67 4075 6600 6236 412 * * 4858 * 5527 * * * * 6252 5573 4981 6411 6696 6546 6422 67 45 6590 5628 0 * 2841 217 7513 1000 3155 N 68 4914 * 3304 2436 6310 5647 * 5661 2771 4517 4188 3713 * 2923 3105 5614 * 5156 6546 * 68 89 6401 4376 2585 263 * 0 7557 1000 3489 D 69 2971 * 1809 3296 * 5614 5777 5427 4161 4627 6713 4432 * 4381 3146 3714 6796 * * 5329 69 29 * 5651 * * 1835 474 7440 0 4311 L 70 3769 6498 5342 5920 5165 * 5228 3571 4831 2813 2830 5506 * 4162 3948 5368 3277 2865 * 6595 70 17 * 6414 * * 3249 160 7467 0 4184 L 71 4903 * * * 4987 6777 6679 3501 4233 621 4310 * 6499 * 5493 6120 6338 6141 * * 71 169 * 3174 * * 902 1105 7467 0 4218 Q 72 4085 * 2270 2809 4530 3616 5768 6294 3162 5249 * 4846 * 6721 3642 5568 3709 6691 5392 4582 72 144 5747 3706 1000 1000 3557 128 7431 1000 4820 S 73 5329 5394 3325 3509 2999 5213 * 4778 3753 2345 5228 * 6035 4321 3629 4588 6677 4196 * 5291 73 195 5975 3177 1000 1000 1189 833 7425 1000 5300 T 74 4138 6093 4664 6179 * 6164 * 3428 5403 2651 6311 4040 3875 6290 6517 2345 2763 4036 * 6042 74 120 4982 4374 2868 213 644 1474 7504 1757 5326 G 75 1981 * 3249 3209 6072 3129 4887 * 5705 4917 * 5947 3259 * * 4224 3832 4067 6154 * 75 89 4778 5406 3264 159 557 1643 7593 2165 4473 E 76 3565 * 2343 2075 5679 4328 4944 * 5229 6349 5824 * 3890 5215 2904 4440 5751 * * 5054 76 71 * 4385 * * 1529 614 7519 0 3278 P 77 4575 6973 2885 1724 6569 2534 6491 * 6482 6477 * * 3558 4494 3554 * 5343 5085 * 5226 77 67 * 4451 * * 1159 857 7539 0 3895 M 78 4851 * 6208 * 5717 * 6222 3082 3343 1944 5567 5080 6332 5099 2795 6366 4231 2914 * 6862 78 31 * 5560 * * 952 1050 7559 0 3888 T 79 3245 6784 4776 2333 * 3805 * 4814 5396 5400 * 3797 2956 4071 5106 3260 3675 6632 * 6174 79 73 6235 4791 1000 1000 734 1327 7554 1000 3290 A 80 3093 * 2259 2961 * 4087 * * 2964 5838 * 5140 2978 4038 4703 3531 * * * * 80 37 * 5285 * * 1479 641 7521 0 3137 G 81 6531 6392 4582 4013 6862 1243 4853 * 5391 * * 2778 * * 4307 4841 3044 * * 4986 81 49 4916 * 2440 294 1211 816 7560 2078 3321 T 82 4243 6916 6386 5139 4839 * 5391 5252 * 5135 6641 * * 5291 4509 1813 4385 3691 2746 2768 82 66 4484 * 1996 416 407 2024 7553 2220 2488 R 83 5805 6571 * * 6949 * * 4761 * 6285 * * * * 335 * 4390 3769 * * 83 17 6445 * 0 * * 0 7569 1000 1000 L 84 6051 * * * * * * * * 78 4729 * * * * * * * * * 84 0 * * * * * 0 7569 0 1000 S 85 982 5768 * * 6901 3020 * 6330 * 5175 * 6524 6571 * * 2170 4059 * * * 85 0 * * * * 0 * 7569 0 1000 C 86 * 108 * * * * * * * * * * * * * 4187 5876 * * * 86 57 * 4683 * * * * 7571 0 0 Q 87 4779 * 6714 4135 * * 5370 * 4928 * 4976 5906 * 617 3367 4972 * 6513 * * 87 18 6371 * 2000 415 * 0 7536 1000 2242 V 88 2344 4063 * * 5931 * 4771 2389 * 3000 5253 * * * * 4348 3695 2253 * 6375 88 13 * 6794 * * 1969 426 7489 0 2242 F 89 6296 * * 4141 3917 * 5629 3979 2485 4251 6324 6516 6395 5802 2417 5410 3135 2787 6085 6358 89 0 * * * * 481 1819 7503 0 2361 I 90 3665 6456 * * * 5532 * 3132 * 1977 5520 * 3249 * * * 6600 1431 * 6401 90 53 * 4795 * * * 0 7537 0 1000 D 91 4739 5534 4943 3805 * 3190 * 6764 4456 4769 6755 3900 6444 5047 4074 2924 2088 4421 * 4474 91 19 * 6264 * * 2208 352 7517 0 2745 P 92 4707 * 3318 2506 5012 2624 4657 * 2321 * * * 3355 3963 * 3689 6263 * * * 92 75 6684 4601 2000 415 * 0 7451 1000 2797 S 93 4620 * 1323 1845 * 4282 * 6639 6577 * * 4448 4278 5149 6494 4706 5572 * 6219 * 93 212 6460 2994 2807 222 852 1165 7524 1000 3809 M 94 * 3477 4969 * 5164 * 6080 4382 * 1364 2366 4737 * * * 5037 5259 3170 * * 94 210 4369 3526 724 1342 1366 708 7243 1987 4667 D 95 5811 * 1058 2250 * 3142 * * * * * 3816 * 5008 * * 4945 4514 * * 95 120 5686 4047 1000 1000 1133 879 6821 1000 4765 G 96 5746 * 2145 4253 * 867 5746 * 4629 5316 * 5915 * 5913 5720 5787 * * * * 96 0 * * * * 775 1266 6839 0 4181 L 97 3833 * 5820 * * 4690 * 1930 * 2124 2887 * * * * * * 2236 4872 * 97 0 * * * * 413 2005 6948 0 2633 I 98 6289 * * 2697 * * * 4190 4610 4971 * 5994 6115 5542 3386 * 2450 1474 * 6034 98 0 * * * * 0 * 7026 0 1000 V 99 4808 * 5557 * 5939 * * 1889 * 3075 * * * * * * * 894 * * 99 0 * * * * * * 7059 0 0 R 100 4002 * 3698 2298 5960 * 3835 * 4025 3728 * * * 3745 2235 4659 4542 6124 * 4313 100 0 * * * * * * 7035 0 0 V 101 * * * * 4706 * * 2069 6044 1724 3658 * * * * * 5504 1806 * 5776 101 0 * * * * * * 7002 0 0 P 102 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 102 0 * * * * * * 6351 0 0 L 103 3309 * * 3459 * * * 3519 2537 2747 * 2067 * * * * * 2635 * * 103 0 * * * * * * 4443 0 0 P 104 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 104 0 * * 0 * * * 3365 0 0 //