HHsearch 1.5 NAME c9o5wF_ FAM FILE c9o5wF_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9o5wF_.a3m DATE Sat Aug 9 10:19:40 2025 LENG 158 match states, 158 columns in multiple alignment FILT 7 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.3 EVD 0.4077 -0.2874 SEQ >ss_pred CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHH HHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCCC >ss_conf 9631222122234765110223168899999999988899999989999998889999999999999986655676655313466313168812547799 9999999999821015551742467652202899999981887833247101036789 >Consensus eGmIxGWyGyxhxnxxGtgxAADxxSTQxAidxItxklNxxixkxnxxfxxixxefxeiexxIxxlxxkidDxxxDxwsynaEllVllENextidxxDxx vxxLxxkvrrxLrxnAxdxGnGCFexxHkCdnxCmxxIrnGTYdxxxYxxxxfxsxxx >c9o5wF_ DGMIAGWHGYSSTGDHGTKVAADLVSTQKAMDAITARINNMNKMTERAFSVTDSTMQEIQKEIKDLDKKIDDVRADETAAQIEMIVLLENENIINAEDEH VHALKQKLTKMLGPSAQDMGDGCFIVDHQCKEDCLREIVSGNYTPSKYGMDEFKSPII >UniRef50_P17504(377-531:585) Hemagglutinin HA2 chain n=2833 Tax=Orthomyxoviridae RepID=HEMA_INBBE E=5e-41 s/c=1.08 id=49% cov=99% EGMIAGWHGYTSHGAHGVAVAADLKSTQEAINKITKNLNSLSELEVKNLQRLSGAMDELHNEILELDEKVDDLRADTISSQIELAVLLSNEGIINSEDEH LLALERKLKKMLGPSAVDIGNGCFETKHKCNQTCLDRIAAGTFNAGEFSLPTFDS--- >UniRef50_P26100(364-511:570) Hemagglutinin HA2 chain n=1146 Tax=root RepID=HEMA_I77A9 E=2e-19 s/c=0.65 id=32% cov=94% EGLIDGWYGYRHQNAQGEGTAADYKSTQSAVNQITGKLNRLIEKTNQQFELIDNEFNEIEKQIGNVINWTRDSIIEIWSYNAEFLVAVENQHTIDLTDSE MNKLYEKVRRQLRENAEEDGNGCFEIFHQCDNDCMASIRNNTYDHKKY---------- >UniRef50_Q03909(365-512:571) Hemagglutinin HA2 chain n=10813 Tax=Orthomyxoviridae RepID=HEMA_I89A7 E=7e-64 s/c=1.65 id=35% cov=94% EGMIDGWYGFRHQNSEGTGQAADLKSTQAALDQINGKLNRVIEKTNEKFHQIEKEFSEVEGRIQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALENQHTIDLTDSE MNKLFEKTRRQLRENAEDMGNGCFKIYHNCDNACIESIRNGTYDHNIY---------- >UniRef50_P13103(359-506:566) Hemagglutinin HA2 chain n=174 Tax=Influenza A virus RepID=HEMA_I77AF E=8e-64 s/c=1.65 id=34% cov=94% -GLINGWYGFQHQNEQGTGIAADKESTQKAIDQITTKINNIIDKMNGNYDSIRGEFNQVEKRINMLADRIDDAVTDIWSYNAKLLVLLENDKTLDMHDAN VKNLHEQVRRELKDNAIDEGNGCFELLHKCNDSCMETIRNGTYDHTEYA--------- >UniRef50_P03446(358-504:564) Hemagglutinin HA2 chain n=993 Tax=Influenza A virus RepID=HEMA_I76A2 E=2e-63 s/c=1.65 id=34% cov=94% -GLVAGWYGFQHQNAEGTGIAADRDSTQRAIDNMQNKLNNVIDKMNKQFEVVNHEFSEVESRINMINSKIDDQITDIWAYNAELLVLLENQKTLDEHDAN VRNLHDRVRRVLRENAIDTGDGCFEILHKCDNNCMDTIRNGTYNHKEY---------- >UniRef50_O56140(361-509:568) Hemagglutinin HA2 chain n=10790 Tax=root RepID=HEMA_I97A1 E=4e-62 s/c=1.60 id=31% cov=95% QGMVDGWYGYHHSNEQGSGYAADKESTQKAIDGVTNKVNSIINKMNTQFEAVGREFNNLERRIENLNKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMENERTLDFHDSN VKNLYDKVRLQLRDNAKELGNGCFEFYHKCDNECMESVKNGTYDYPQYS--------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * D 1 * * 2198 789 * * * * * * * * * 2297 * * * * * * 1 0 * * * * * * 2243 0 0 G 2 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 2389 0 0 M 3 * * * * * * * * * 1390 693 * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 2389 0 0 I 4 * * * * * * * 433 * * * * * * * * * 1947 * * 4 0 * * * * * * 2389 0 0 A 5 1073 * 1331 * * * * * * * * 2974 * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 2389 0 0 G 6 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 2389 0 0 W 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 7 0 * * * * * * 2389 0 0 H 8 * * * * * * 1500 * * * * * * * * * * * * 629 8 0 * * * * * * 2389 0 0 G 9 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 2389 0 0 Y 10 * * * * 1410 * * * * * * * * * * * * * * 681 10 0 * * * * * * 2389 0 0 S 11 * * * * * * 2860 * * * * * * 2006 1945 2509 2491 * * * 11 0 * * * * * * 2389 0 0 S 12 * * * * * * 629 * * * * * * * * 1500 * * * * 12 0 * * * * * * 2389 0 0 T 13 * * * * * * 2491 * * * * * * 975 * 2860 2509 * * * 13 0 * * * * * * 2389 0 0 G 14 * * * * * 1500 * * * * * 629 * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 2389 0 0 D 15 1211 * 2509 1916 * * * * * * * * * * * 2974 * * * * 15 0 * * * * * * 2389 0 0 H 16 * * * 2006 * * 1500 * * * * * * 1331 * * * * * * 16 0 * * * * * * 2389 0 0 G 17 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 2389 0 0 T 18 * * * 2916 * * * * * * * * * * * 2860 857 2491 * * 18 0 * * * * * * 2389 0 0 K 19 2491 * * * * 629 * * 2509 * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 2389 0 0 V 20 * * * * * * * 2006 * * * * * 2974 * * 2916 1500 * 2860 20 0 * * * * * * 2389 0 0 A 21 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 2389 0 0 A 22 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 2389 0 0 D 23 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 2389 0 0 L 24 * * * * * * * * 1916 1056 * * * * 3039 * * * * 2916 24 0 * * * * * * 2389 0 0 V 25 * * 3039 1916 * * * * 1192 * * * * * * * * 2509 * * 25 0 * * * * * * 2389 0 0 S 26 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 26 0 * * * * * * 2389 0 0 T 27 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 27 0 * * * * * * 2389 0 0 Q 28 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 28 0 * * * * * * 2389 0 0 K 29 2974 * * 2491 * * * * 1182 * * * * * 3039 2916 * * * * 29 0 * * * * * * 2389 0 0 A 30 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 2389 0 0 M 31 * * * * * * * 825 * 2974 2509 * * * * * * 2916 * * 31 0 * * * * * * 2389 0 0 D 32 * * 536 * * * * * * * * 1688 * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2389 0 0 A 33 2509 * * * * 2860 * * 2491 * * 3039 * 1369 * * * * * * 33 0 * * * * * * 2389 0 0 I 34 * * * * * * * 433 * * 3039 * * * * * * 2860 * * 34 0 * * * * * * 2389 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * 2974 * 3039 * * 413 * * * 35 0 * * * * * * 2389 0 0 A 36 2509 * * * * 1945 * * 2491 * * 1947 * * * * 2974 * * * 36 0 * * * * * * 2389 0 0 R 37 * * * * * * * * 629 * * 2491 * * 2509 * * * * * 37 0 * * * * * * 2389 0 0 I 38 * * * * * * * 1723 * 838 * * * * * * * 2860 * * 38 0 * * * * * * 2389 0 0 N 39 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 2389 0 0 N 40 * * * * * * * * * * * 1236 * * 1945 1664 * * * * 40 0 * * * * * * 2389 0 0 M 41 * * * * * * * 1916 * 1688 2509 * * * * * * 2006 * * 41 0 * * * * * * 2389 0 0 N 42 * * * * * * * 629 * * * 2509 * * * 2491 * * * * 42 0 * * * * * * 2389 0 0 K 43 * * 2006 1192 * * * * 2509 * * 2860 * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 2389 0 0 M 44 * * * * * * * * 629 2491 2509 * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 2389 0 0 T 45 * * * 2491 * * * * * * 1371 * * * * * 1199 * * * 45 0 * * * * * * 2389 0 0 E 46 * * * 2509 * * * * * * * 629 * * * * * 2491 * * 46 0 * * * * * * 2389 0 0 R 47 * * * 2974 * 2974 * * 1739 * * * * 2916 2509 * 2860 * * * 47 0 * * * * * * 2389 0 0 A 48 2509 * * * * * * * 2974 * * 1712 * 1351 * * * * * * 48 0 * * * * * * 2389 0 0 F 49 * * * * 525 * * * * 2491 * * * * * * * * * 2974 49 0 * * * * * * 2389 0 0 S 50 * * 2974 1351 * * 2974 * * * * * * 2491 * 2509 * * * * 50 0 * * * * * * 2389 0 0 V 51 2860 * * * * * * * * 2916 * * * 2974 2491 2974 * 1750 * * 51 0 * * * * * * 2389 0 0 T 52 * * * * * * * 1369 * 2491 * * * * * * 2509 1947 * * 52 0 * * * * * * 2389 0 0 D 53 * * 1698 2974 * 2860 * * * * * 3039 * * 2974 2491 * * * * 53 0 * * * * * * 2389 0 0 S 54 * * * * * 1712 3039 * 2974 * * 2916 * * 2860 2509 * * * * 54 0 * * * * * * 2389 0 0 T 55 2491 * * 629 * * * * * * * * * * * * 2509 * * * 55 0 * * * * * * 2389 0 0 M 56 * * * * 629 * * * * * 1500 * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 2389 0 0 Q 57 * * 2491 * * * * * * * * 1331 * 2509 * 2006 * * * * 57 0 * * * * * * 2389 0 0 E 58 * * * 444 * * * * * * * 2860 * 2974 * * * * * * 58 0 * * * * * * 2389 0 0 I 59 * * * * * * * 1698 * 1664 * * * * * * * 1410 * * 59 0 * * * * * * 2389 0 0 Q 60 * * * 629 * * 2491 * * * * * * 2509 * * * * * * 60 0 * * * * * * 2389 0 0 K 61 * * * * * 2974 * * 1200 * * 2491 * * 2860 3039 * * * * 61 0 * * * * * * 2389 0 0 E 62 * * * 1500 * * * * * * * * * 2916 960 * * * * * 62 0 * * * * * * 2389 0 0 I 63 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 2389 0 0 K 64 * * * 2860 * 2916 * * 2509 2491 * 2006 * 2974 * * * * * * 64 0 * * * * * * 2389 0 0 D 65 * * 1723 2491 * * * * * * 2006 1888 * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2389 0 0 L 66 * * * * * * * 3039 * 423 * * * * * * * 2916 * * 66 0 * * * * * * 2389 0 0 D 67 2974 * 1500 2974 * * * 2916 * * * 1947 * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 2389 0 0 K 68 * * 2974 2491 * * * * 1182 * * 2916 * * * 3039 * * * * 68 0 * * * * * * 2389 0 0 K 69 * * * * * * * * 706 * * * * * 2974 * * * 2916 2974 69 0 * * * * * * 2389 0 0 I 70 * * * * * * * 1236 * * 2860 * * * * * 2916 1712 * * 70 0 * * * * * * 2389 0 0 D 71 * * 731 1916 * * * * * * * * * * 2916 * * * * * 71 0 * * * * * * 2389 0 0 D 72 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 2389 0 0 V 73 2974 * * * * 2860 * * * 2491 * * * 3039 * 2916 2974 2509 * * 73 0 * * * * * * 2389 0 0 R 74 * * * * 2860 * * 1976 2974 * * * * * 1500 * * 2974 * * 74 0 * * * * * * 2389 0 0 A 75 1500 * * * * * * 1945 * 2860 * * * * * * 2006 * * * 75 0 * * * * * * 2389 0 0 D 76 * * 205 2916 * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 2389 0 0 E 77 * * * 2509 * * * 1390 * 2974 * * * * * * 2491 2860 * * 77 0 * * * * * * 2389 0 0 T 78 * * * * * * * 2491 * * * * * * * * 2509 * 629 * 78 0 * * * * * * 2389 0 0 A 79 1750 * * * * * * * * * * * * * * 824 2860 * * * 79 0 * * * * * * 2389 0 0 A 80 2509 * * * * * * * * * * * * * * 2491 * * * 629 80 0 * * * * * * 2389 0 0 Q 81 * * * * * * * * * * * 629 * 1500 * * * * * * 81 0 * * * * * * 2389 0 0 I 82 629 * * * * * * 1500 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 2389 0 0 E 83 * * * 196 * * * * 2974 * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 2389 0 0 M 84 * * * * 2916 * * * * 531 2509 * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 2389 0 0 I 85 2491 * * * * * * 2509 * 629 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 2389 0 0 V 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 86 0 * * * * * * 2389 0 0 L 87 1945 * * * * * * * * 434 * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 2389 0 0 L 88 * * * * * * * * * 454 2860 * * * * * * 2916 * * 88 0 * * * * * * 2389 0 0 E 89 * * * 283 * * * * * * * * * * * 2491 * * * * 89 0 * * * * * * 2389 0 0 N 90 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 2389 0 0 E 91 * * 2974 1025 * * * * * * * * * 1390 * * * * * * 91 0 * * * * * * 2389 0 0 N 92 * * * * * 2491 1945 * 2006 * * 2509 * * 2860 * * * * * 92 0 * * * * * * 2389 0 0 I 93 * * * * * * * 1500 * * * * * * * * 629 * * * 93 0 * * * * * * 2389 0 0 I 94 * * * * * * * 705 * 1371 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 2389 0 0 N 95 * * 629 * * * * * * * * 1500 * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 2389 0 0 A 96 2509 * * 3039 2860 * * * * 1945 2974 * * * * 2491 * * * * 96 0 * * * * * * 2389 0 0 E 97 * * * 1500 * * 1371 * * * * * * * * * 1945 * * * 97 0 * * * * * * 2389 0 0 D 98 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 2389 0 0 E 99 2006 * * 1500 * * * * * * * * * * * 1331 * * * * 99 0 * * * * * * 2389 0 0 H 100 * * * 1945 * * 1500 * * * * 1371 * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 2389 0 0 V 101 * * * * * * * * * 2491 1945 * * * * * * 831 * * 101 0 * * * * * * 2389 0 0 H 102 * * * * * * 2509 * 1916 2491 * 1945 * * 3039 * * * * * 102 0 * * * * * * 2389 0 0 A 103 1500 * * * * * * * 1945 * * 1371 * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 2389 0 0 L 104 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 2389 0 0 K 105 * * * 2491 2974 * 2006 * 2509 * * * * * * * * * * 1888 105 0 * * * * * * 2389 0 0 Q 106 * * 1947 1369 * * * * * * * * * 2509 2491 * * * * * 106 0 * * * * * * 2389 0 0 K 107 * * * * * * * * 413 * * * * 2974 3039 * * * * * 107 0 * * * * * * 2389 0 0 L 108 * * * * * * * * * 1500 * * * * * * 2974 946 * * 108 0 * * * * * * 2389 0 0 T 109 * * * * * * * * 2491 * * * * * 629 * 2509 * * * 109 0 * * * * * * 2389 0 0 K 110 * * * * * * * * 1500 2860 * * * * 975 * * * * * 110 0 * * * * * * 2389 0 0 M 111 * * * 2974 * * * * * * 1500 * * 1331 * * * 3039 * * 111 0 * * * * * * 2389 0 0 L 112 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 2389 0 0 G 113 * * * * * 1500 * * 2974 * * * * * 946 * * * * * 113 0 * * * * * * 2389 0 0 P 114 * * 1916 1390 * * * * * * * * 1500 * * * * * * * 114 0 * * * * * * 2389 0 0 S 115 * * * * * * * * * * * 629 * * * 1500 * * * * 115 0 * * * * * * 2389 0 0 A 116 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 2389 0 0 Q 117 * * * 1945 * * * 2006 2860 * * * * 2509 * * * 2491 * * 117 0 * * * * * * 2389 0 0 D 118 * * 454 1888 * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 2389 0 0 M 119 * * 2916 2974 * * * 2491 * 2860 1723 * * * * * 3039 * * * 119 0 * * * * * * 2389 0 0 G 120 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 2389 0 0 D 121 * * 1750 * * * * * * * * 509 * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 2389 0 0 G 122 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 2389 0 0 C 123 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 2389 0 0 F 124 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 2389 0 0 I 125 * * * 521 * * * 2509 2974 * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 2389 0 0 V 126 * * * * 2860 * * 1390 * 2974 * * * * * * 2491 2509 * * 126 0 * * * * * * 2389 0 0 D 127 * * 2509 * 2916 * * * 2491 2006 * * * * * * * * * 1916 127 0 * * * * * * 2389 0 0 H 128 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 2389 0 0 Q 129 * * * * * * * * 825 * * 2974 * 1698 * * * * * * 129 0 * * * * * * 2389 0 0 C 130 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 2389 0 0 K 131 * * 946 * * * * * 2509 * * 1712 * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 2389 0 0 E 132 * * 2974 2509 * * * * * * * 946 * 2491 * * * * * * 132 0 * * * * * * 2389 0 0 D 133 2974 * 1698 2860 * * * * * * * 3039 * * * 2974 2491 * * * 133 0 * * * * * * 2389 0 0 C 134 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 2389 0 0 L 135 * * * * * * * 2974 * 1500 946 * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 2389 0 0 R 136 2916 * 1739 1350 * * * * * * * * * * 2509 * * * * * 136 0 * * * * * * 2389 0 0 E 137 * * * 2509 * * * * * * * * * * 2491 1331 2006 * * * 137 0 * * * * * * 2389 0 0 I 138 * * * * * * * 214 * * * * * * * * * 2860 * * 138 0 * * * * * * 2389 0 0 V 139 2491 * * * * * * * 2860 * * * * * 975 * * 2509 * * 139 0 * * * * * * 2389 0 0 S 140 2491 * * * * * * * * * * 629 * * * 2509 * * * * 140 0 * * * * * * 2389 0 0 G 141 * * * * * 205 * * * * * 2916 * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 2389 0 0 N 142 * * * * * * * * * * * 2509 * * * * 279 * * * 142 0 * * * * * * 2389 0 0 Y 143 * * * * 2491 * * * * * * * * * * * * * * 283 143 0 * * * * * * 2389 0 0 T 144 * * 930 * * * * * * * * 1739 * * * * 2509 * * * 144 0 * * * * * * 2389 0 0 P 145 2491 * * * * * 975 * * * * * 2509 * * * * * * 2860 145 0 * * * * * * 2389 0 0 S 146 * * * * * 2491 * * 1976 * * 2974 2860 * * 2509 2974 * * * 146 0 * * * * * * 2389 0 0 K 147 * * * 1228 * * * 2974 1698 * * * * 2860 * * * * * * 147 0 * * * * * * 2389 0 0 Y 148 * * * * 2491 * * * * * * * * * * * * * * 283 148 0 * * * * * * 2389 0 0 G 149 2050 * * * * 1965 * * * * * * * * * 994 * * * * 149 0 * * * * * * 2116 0 0 M 150 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1424 0 0 D 151 * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1424 0 0 E 152 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 152 0 * * * * * * 1424 0 0 F 153 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1424 0 0 K 154 * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1424 0 0 S 155 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 155 0 * * * * * * 1424 0 0 P 156 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 I 157 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 I 158 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 158 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //