HHsearch 1.5 NAME c9n4fB_ FAM FILE c9n4fB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9n4fB_.a3m DATE Sat Oct 11 10:40:36 2025 LENG 164 match states, 164 columns in multiple alignment FILT 6 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.4200 0.1048 SEQ >ss_pred CCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9656542556603320013577621001115779999999876689999998788999887899999999999999765557777631468862006782 3436799999999999982000444160189999862489999997188773566578765219 >Consensus GFiEgGWeGmixGWyGyxhqnaxGxgxAADxkSTQxAIdxitxklNxiiekxnxxfxxixxefxevexrIxxlxxkvdDxxxDiwsynaellVlleNxxt idxxDxxxxxLxxkvrrxLrxnAxdxGnGCFexxHKCdnxCmxsIrngTydhxeyxxeaxxxrx >c9n4fB_ GFIENGWEGMIDGWYGFRHQNSEGTGQAADLKSTQAAIDQINGKLNRVIEKTNEKFHQIEKEFSEVEGRIQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALENQHT IDLTDSEMNKLFEKTRRQLRENAEDMGNGCFKIYHKCDNACIESIRNGTYDHDIYRDEALNNRF >UniRef50_P26100(357-520:570) Hemagglutinin HA2 chain n=1146 Tax=root RepID=HEMA_I77A9 E=5e-64 s/c=1.49 id=68% cov=100% GFIENGWEGLIDGWYGYRHQNAQGEGTAADYKSTQSAVNQITGKLNRLIEKTNQQFELIDNEFNEIEKQIGNVINWTRDSIIEIWSYNAEFLVAVENQHT IDLTDSEMNKLYEKVRRQLRENAEEDGNGCFEIFHQCDNDCMASIRNNTYDHKKYRKEAIQNR- >UniRef50_O56140(354-516:568) Hemagglutinin HA2 chain n=10790 Tax=root RepID=HEMA_I97A1 E=5e-51 s/c=1.23 id=54% cov=100% GFIEGGWQGMVDGWYGYHHSNEQGSGYAADKESTQKAIDGVTNKVNSIINKMNTQFEAVGREFNNLERRIENLNKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMENERT LDFHDSNVKNLYDKVRLQLRDNAKELGNGCFEFYHKCDNECMESVKNGTYDYPQYSEEARLNR- >UniRef50_P13103(351-513:566) Hemagglutinin HA2 chain n=174 Tax=Influenza A virus RepID=HEMA_I77AF E=1e-72 s/c=1.67 id=54% cov=100% GFIEGGWPGLINGWYGFQHQNEQGTGIAADKESTQKAIDQITTKINNIIDKMNGNYDSIRGEFNQVEKRINMLADRIDDAVTDIWSYNAKLLVLLENDKT LDMHDANVKNLHEQVRRELKDNAIDEGNGCFELLHKCNDSCMETIRNGTYDHTEYAEESKLKR- >UniRef50_P03446(350-512:564) Hemagglutinin HA2 chain n=993 Tax=Influenza A virus RepID=HEMA_I76A2 E=1e-72 s/c=1.67 id=55% cov=100% GFIEGGWPGLVAGWYGFQHQNAEGTGIAADRDSTQRAIDNMQNKLNNVIDKMNKQFEVVNHEFSEVESRINMINSKIDDQITDIWAYNAELLVLLENQKT LDEHDANVRNLHDRVRRVLRENAIDTGDGCFEILHKCDNNCMDTIRNGTYNHKEYEEESKIER- >UniRef50_P17504(370-525:585) Hemagglutinin HA2 chain n=2833 Tax=Orthomyxoviridae RepID=HEMA_INBBE E=1e-59 s/c=1.47 id=37% cov=96% GFLEGGWEGMIAGWHGYTSHGAHGVAVAADLKSTQEAINKITKNLNSLSELEVKNLQRLSGAMDELHNEILELDEKVDDLRADTISSQIELAVLLSNEGI INSEDEHLLALERKLKKMLGPSAVDIGNGCFETKHKCNQTCLDRIAAGTFNAGEFS-------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 2119 0 0 F 2 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 2119 0 0 I 3 * * * * * * * 399 * 2050 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 2119 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 2119 0 0 N 5 * * * * * 524 * * * * * 1715 * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 2119 0 0 G 6 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 2119 0 0 W 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 7 0 * * * * * * 2119 0 0 E 8 * * * 873 * * * * * * * * 1763 2649 * * * * * * 8 0 * * * * * * 2119 0 0 G 9 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 2119 0 0 M 10 * * * * * * * * * 1145 868 * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 2119 0 0 I 11 * * * * * * * 525 * * * * * * * * * 1713 * * 11 0 * * * * * * 2119 0 0 D 12 1370 * 1108 * * * * * * * * 2746 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 2119 0 0 G 13 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 2119 0 0 W 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 14 0 * * * * * * 2119 0 0 Y 15 * * * * * * 2050 * * * * * * * * * * * * 399 15 0 * * * * * * 2119 0 0 G 16 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 2119 0 0 F 17 * * * * 1179 * * * * * * * * * * * * * * 840 17 0 * * * * * * 2119 0 0 R 18 * * * * * * 2649 * * * * * * 1763 1715 * 2050 * * * 18 0 * * * * * * 2119 0 0 H 19 * * * * * * 399 * * * * * * * * 2050 * * * * 19 0 * * * * * * 2119 0 0 Q 20 * * * * * * 2050 * * * * * * 739 * 2649 * * * * 20 0 * * * * * * 2119 0 0 N 21 * * * * * 2050 * * * * * 399 * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 2119 0 0 S 22 877 * * 1697 * * * * * * * * * * * 2767 * * * * 22 0 * * * * * * 2119 0 0 E 23 * * * 1773 * * 2050 * * * * * * 1101 * * * * * * 23 0 * * * * * * 2119 0 0 G 24 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 2119 0 0 T 25 * * * 2665 * * * * * * * * * * * 2649 1179 2050 * * 25 0 * * * * * * 2119 0 0 G 26 2050 * * * * 399 * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 2119 0 0 Q 27 * * * * * * * 1763 * * * * * 2767 * * 2665 2050 * 2649 27 0 * * * * * * 2119 0 0 A 28 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 2119 0 0 A 29 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 2119 0 0 D 30 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 2119 0 0 L 31 * * * * * * * * 1697 1364 * * * * 2780 * * * * 2665 31 0 * * * * * * 2119 0 0 K 32 * * 2780 1697 * * * * 873 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2119 0 0 S 33 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 33 0 * * * * * * 2119 0 0 T 34 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 34 0 * * * * * * 2119 0 0 Q 35 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 35 0 * * * * * * 2119 0 0 A 36 2767 * * 2050 * * * * 1697 * * * * * 2780 2665 * * * * 36 0 * * * * * * 2119 0 0 A 37 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 2119 0 0 I 38 * * * * * * * 247 * * * * * * * * * 2665 * * 38 0 * * * * * * 2119 0 0 D 39 * * 735 * * * * * * * * 1325 * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 2119 0 0 Q 40 * * * * * 2649 * * 2050 * * 2780 * 1140 * * * * * * 40 0 * * * * * * 2119 0 0 I 41 * * * * * * * 525 * * 2780 * * * * * * 2649 * * 41 0 * * * * * * 2119 0 0 N 42 * * * * * * * * * * * 2767 * 2780 * * 499 * * * 42 0 * * * * * * 2119 0 0 G 43 * * * * * 1715 * * 2050 * * 1713 * * * * 2746 * * * 43 0 * * * * * * 2119 0 0 K 44 * * * * * * * * 399 * * 2050 * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 2119 0 0 L 45 * * * * * * * 2746 * 532 * * * * * * * 2649 * * 45 0 * * * * * * 2119 0 0 N 46 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 2119 0 0 R 47 * * * * * * * * * * * 1763 * * 1715 1319 * * * * 47 0 * * * * * * 2119 0 0 V 48 * * * * * * * 1697 * 1325 * * * * * * * 1773 * * 48 0 * * * * * * 2119 0 0 I 49 * * * * * * * 399 * * * * * * * 2050 * * * * 49 0 * * * * * * 2119 0 0 E 50 * * 1763 873 * * * * * * * 2649 * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 2119 0 0 K 51 * * * * * * * * 399 2050 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 2119 0 0 T 52 * * * 2050 * * * * * * 1139 * * * * * 1715 * * * 52 0 * * * * * * 2119 0 0 N 53 * * * * * * * * * * * 399 * * * * * 2050 * * 53 0 * * * * * * 2119 0 0 E 54 * * * 2767 * 2746 * * 1370 * * * * 2665 * * 2649 * * * 54 0 * * * * * * 2119 0 0 K 55 * * * * * * * * 2767 * * 1357 * 1112 * * * * * * 55 0 * * * * * * 2119 0 0 F 56 * * * * 714 * * * * 2050 * * * * * * * * * 2746 56 0 * * * * * * 2119 0 0 H 57 * * 2746 1112 * * 2767 * * * * * * 2050 * * * * * * 57 0 * * * * * * 2119 0 0 Q 58 2649 * * * * * * * * 2665 * * * 2767 2050 2746 * 2780 * * 58 0 * * * * * * 2119 0 0 I 59 * * * * * * * 1140 * 2050 * * * * * * * 1713 * * 59 0 * * * * * * 2119 0 0 E 60 * * 2665 2767 * 2649 * * * * * 2780 * * 2746 2050 * * * * 60 0 * * * * * * 2119 0 0 K 61 * * * * * 1357 2780 * 2767 * * 2665 * * 2649 * * * * * 61 0 * * * * * * 2119 0 0 E 62 2050 * * 399 * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 2119 0 0 F 63 * * * * 399 * * * * * 2050 * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 2119 0 0 S 64 * * 2050 * * * * * * * * 1101 * * * 1773 * * * * 64 0 * * * * * * 2119 0 0 E 65 * * * 532 * * * * * * * 2649 * 2746 * * * * * * 65 0 * * * * * * 2119 0 0 V 66 * * * * * * * 2665 * 1319 * * * * * * * 1179 * * 66 0 * * * * * * 2119 0 0 E 67 * * * 399 * * 2050 * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 2119 0 0 G 68 * * * * * 2767 * * 1705 * * 2050 * * 2649 2780 * * * * 68 0 * * * * * * 2119 0 0 R 69 * * * 2050 * * * * * * * * * 2665 735 * * * * * 69 0 * * * * * * 2119 0 0 I 70 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 2119 0 0 Q 71 * * * 2649 * 2665 * * * 2050 * 1763 * 2767 * * * * * * 71 0 * * * * * * 2119 0 0 D 72 * * 2767 2050 * * * * * * 1763 1657 * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 2119 0 0 L 73 * * * * * * * 2780 * 521 * * * * * * * 2665 * * 73 0 * * * * * * 2119 0 0 E 74 2746 * 2050 2767 * * * 2665 * * * 1713 * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 2119 0 0 K 75 * * 2746 2050 * * * * 1707 * * 2665 * * * 2780 * * * * 75 0 * * * * * * 2119 0 0 Y 76 * * * * * * * * 872 * * * * * 2746 * * * 2665 2767 76 0 * * * * * * 2119 0 0 V 77 * * * * * * * 1763 * * 2649 * * * * * 2665 1364 * * 77 0 * * * * * * 2119 0 0 E 78 * * 900 1707 * * * * * * * * * * 2665 * * * * * 78 0 * * * * * * 2119 0 0 D 79 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 2119 0 0 T 80 2746 * * * * 2649 * * * 2050 * * * 2780 * 2665 2767 * * * 80 0 * * * * * * 2119 0 0 K 81 * * * * 2649 * * 1722 2767 * * * * * 2050 * * 2746 * * 81 0 * * * * * * 2119 0 0 I 82 2050 * * * * * * 1715 * 2649 * * * * * * 1763 * * * 82 0 * * * * * * 2119 0 0 D 83 * * 247 2665 * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 2119 0 0 L 84 * * * * * * * 1145 * 2767 * * * * * * 2050 2649 * * 84 0 * * * * * * 2119 0 0 W 85 * * * * * * * 2050 * * * * * * * * * * 399 * 85 0 * * * * * * 2119 0 0 S 86 2780 * * * * * * * * * * * * * * 525 2649 * * * 86 0 * * * * * * 2119 0 0 Y 87 * * * * * * * * * * * * * * * 2050 * * * 399 87 0 * * * * * * 2119 0 0 N 88 * * * * * * * * * * * 399 * 2050 * * * * * * 88 0 * * * * * * 2119 0 0 A 89 399 * * * * * * 2050 * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 2119 0 0 E 90 * * * 233 * * * * 2746 * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 2119 0 0 L 91 * * * * 2665 * * * * 247 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 2119 0 0 L 92 2050 * * * * * * * * 399 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 2119 0 0 V 93 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 93 0 * * * * * * 2119 0 0 A 94 1715 * * * * * * * * 524 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 2119 0 0 L 95 * * * * * * * * * 550 2649 * * * * * * 2665 * * 95 0 * * * * * * 2119 0 0 E 96 * * * 399 * * * * * * * * * * * 2050 * * * * 96 0 * * * * * * 2119 0 0 N 97 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 2119 0 0 Q 98 * * 2746 1319 * * * * * * * * * 1152 * * * * * * 98 0 * * * * * * 2119 0 0 H 99 * * * * * 2050 1715 * 1763 * * * * * 2649 * * * * * 99 0 * * * * * * 2119 0 0 T 100 * * * * * * * 2050 * * * * * * * * 399 * * * 100 0 * * * * * * 2119 0 0 I 101 * * * * * * * 873 * 1139 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 2119 0 0 D 102 * * 399 * * * * * * * * 2050 * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 2119 0 0 L 103 * * * 2780 2649 * * * * 1715 2746 * * * * 2050 * * * * 103 0 * * * * * * 2119 0 0 T 104 * * * 2050 * * 1139 * * * * * * * * * 1715 * * * 104 0 * * * * * * 2119 0 0 D 105 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 2119 0 0 S 106 1763 * * 2050 * * * * * * * * * * * 1108 * * * * 106 0 * * * * * * 2119 0 0 E 107 * * * 1715 * * 2050 * * * * 1139 * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 2119 0 0 M 108 * * * * * * * * * 2050 1715 * * * * * * 1139 * * 108 0 * * * * * * 2119 0 0 N 109 * * * * * * * * 1697 2050 * 1715 * * 2780 * * * * * 109 0 * * * * * * 2119 0 0 K 110 2050 * * * * * * * 1715 * * 1139 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 2119 0 0 L 111 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 2119 0 0 F 112 * * * 2050 2767 * 1763 * * * * * * * * * * * * 1657 112 0 * * * * * * 2119 0 0 E 113 * * 1713 1140 * * * * * * * * * * 2050 * * * * * 113 0 * * * * * * 2119 0 0 K 114 * * * * * * * * 503 * * * * 2746 2780 * * * * * 114 0 * * * * * * 2119 0 0 T 115 * * * * * * * * * 2050 * * * * * * 2767 709 * * 115 0 * * * * * * 2119 0 0 R 116 * * * * * * * * 2050 * * * * * 399 * * * * * 116 0 * * * * * * 2119 0 0 R 117 * * * * * * * * 2050 2649 * * * * 739 * * * * * 117 0 * * * * * * 2119 0 0 Q 118 * * * 2746 * * * * * * 2050 * * 1108 * * * 2780 * * 118 0 * * * * * * 2119 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 2119 0 0 R 120 * * * * * 2050 * * 2746 * * * * * 714 * * * * * 120 0 * * * * * * 2119 0 0 E 121 * * 1697 1152 * * * * * * * * 2050 * * * * * * * 121 0 * * * * * * 2119 0 0 N 122 * * * * * * * * * * * 399 * * * 2050 * * * * 122 0 * * * * * * 2119 0 0 A 123 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 2119 0 0 E 124 * * * 1715 * * * 1763 2649 * * * * * * * * 2050 * * 124 0 * * * * * * 2119 0 0 D 125 * * 550 1657 * * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 2119 0 0 M 126 * * 2665 2746 * * * 2050 * 2649 2767 * * * * * 2780 * * * 126 0 * * * * * * 2119 0 0 G 127 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 2119 0 0 N 128 * * 2780 * * * * * * * * 227 * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 2119 0 0 G 129 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 2119 0 0 C 130 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 2119 0 0 F 131 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 2119 0 0 K 132 * * * 229 * * * * 2767 * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 2119 0 0 I 133 * * * * 2649 * * 1152 * 2746 * * * * * * 2050 * * * 133 0 * * * * * * 2119 0 0 Y 134 * * * * 2665 * * * 2050 1763 * * * * * * * * * 1707 134 0 * * * * * * 2119 0 0 H 135 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 2119 0 0 K 136 * * * * * * * * 247 * * * * 2665 * * * * * * 136 0 * * * * * * 2119 0 0 C 137 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 2119 0 0 D 138 * * 714 * * * * * * * * 1357 * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 2119 0 0 N 139 * * 2746 * * * * * * * * 714 * 2050 * * * * * * 139 0 * * * * * * 2119 0 0 A 140 2767 * 2665 2649 * * * * * * * 2780 * * * 2746 2050 * * * 140 0 * * * * * * 2119 0 0 C 141 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 2119 0 0 I 142 * * * * * * * 2767 * 2050 709 * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 2119 0 0 E 143 2665 * 1370 1135 * * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 2119 0 0 S 144 * * * * * * * * * * * * * * 2050 1108 1763 * * * 144 0 * * * * * * 2119 0 0 I 145 * * * * * * * 251 * * * * * * * * * 2649 * * 145 0 * * * * * * 2119 0 0 R 146 2050 * * * * * * * 2649 * * * * * 739 * * * * * 146 0 * * * * * * 2119 0 0 N 147 2050 * * * * * * * * * * 399 * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 2119 0 0 G 148 * * * * * 247 * * * * * 2665 * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 2119 0 0 T 149 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 149 0 * * * * * * 2119 0 0 Y 150 * * * * 2050 * * * * * * * * * * * * * * 399 150 0 * * * * * * 2119 0 0 D 151 * * 706 * * * * * * * * 1370 * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 2119 0 0 H 152 2050 * * * * * 739 * * * * * * * * * * * * 2649 152 0 * * * * * * 2119 0 0 D 153 * * 2767 * * 2050 * * 1722 * * * 2649 * * * 2746 * * * 153 0 * * * * * * 2119 0 0 I 154 * * * 900 * * * 2767 2665 * * * * 2649 * * * * * * 154 0 * * * * * * 2119 0 0 Y 155 * * * * 2050 * * * * * * * * * * * * * * 399 155 0 * * * * * * 2119 0 0 R 156 2746 * * 2780 * * * * * * * * * * 1715 1319 * * * * 156 0 * * * * * * 2119 0 0 D 157 * * 2350 739 * * * * 2289 * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1780 0 0 E 158 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1780 0 0 A 159 715 * * * * * * * * * * * * * * 1356 * * * * 159 0 * * * * * * 1780 0 0 L 160 * * * * * * * 2289 1356 2350 * * * * 2261 * * * * * 160 0 * * * * * * 1780 0 0 N 161 * * * * * * * 2370 * 1301 * 2350 * 2289 * * * * * * 161 0 * * * * * * 1780 0 0 N 162 * * * 2370 * * * * 2342 * * 715 * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1780 0 0 R 163 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 163 0 * * * * * * 1780 0 0 F 164 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 164 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //