HHsearch 1.5
NAME  c9n42A_
FAM   
FILE  c9n42A_
COM   /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9n42A_.a3m 
DATE  Sat Feb  7 10:54:45 2026
LENG  105 match states, 105 columns in multiple alignment
FILT  1 out of 3 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100)
NEFF  1.0 
EVD   0.4295  0.4916 
SEQ
>ss_pred
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEEEEECCCEEEEECCCCCCCCEEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
HHHCC
>ss_conf
9775122008899989777667652712999999994005424898457268884158056641387788320132101103888845899999987667
76149
>Consensus
migsekqvnwaksiiekeveaweaigvdvrevaaflrsisdarviidnrnlihfqssgisyslessplnspiflrrfsacsvgfeeiptalqrirsvyta
klled
>c9n42A_
MIGSEKQVNWAKSIIEKEVEAWEAIGVDVREVAAFLRSISDARVIIDNRNLIHFQSSGISYSLESSPLNSPIFLRRFSACSVGFEEIPTALQRIRSVYTA
KLLED
#
NULL   3706	5728	4211	4064	4839	3729	4763	4308	4069	3323	5509	4640	4464	4937	4285	4423	3815	3783	6325	4665	
HMM    A	C	D	E	F	G	H	I	K	L	M	N	P	Q	R	S	T	V	W	Y	
       M->M	M->I	M->D	I->M	I->I	D->M	D->D	Neff	Neff_I	Neff_D
       0	*	*	0	*	0	*	*	*	*	
M 1    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	1
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 2    *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	2
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

G 3    *	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	3
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 4    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	4
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 5    *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	5
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 6    *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	6
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Q 7    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	7
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

V 8    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	8
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

N 9    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	9
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

W 10   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	10
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 11   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	11
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 12   *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	12
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 13   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	13
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 14   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	14
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 15   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	15
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 16   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	16
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 17   *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	17
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 18   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	18
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

V 19   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	19
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 20   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	20
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 21   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	21
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

W 22   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	22
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 23   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	23
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 24   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	24
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 25   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	25
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

G 26   *	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	26
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

V 27   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	27
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

D 28   *	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	28
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

V 29   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	29
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

R 30   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	30
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 31   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	31
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

V 32   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	32
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 33   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	33
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 34   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	34
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

F 35   *	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	35
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 36   *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	36
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

R 37   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	37
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 38   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	38
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 39   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	39
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 40   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	40
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

D 41   *	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	41
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 42   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	42
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

R 43   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	43
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

V 44   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	44
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 45   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	45
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 46   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	46
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

D 47   *	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	47
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

N 48   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	48
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

R 49   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	49
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

N 50   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	50
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 51   *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	51
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 52   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	52
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

H 53   *	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	53
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

F 54   *	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	54
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Q 55   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	55
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 56   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	56
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 57   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	57
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

G 58   *	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	58
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 59   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	59
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 60   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	60
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Y 61   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	61
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 62   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	62
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 63   *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	63
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 64   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	64
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 65   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	65
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 66   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	66
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

P 67   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	67
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 68   *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	68
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

N 69   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	69
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 70   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	70
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

P 71   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	71
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 72   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	72
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

F 73   *	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	73
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 74   *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	74
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

R 75   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	75
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

R 76   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	76
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

F 77   *	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	77
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 78   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	78
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 79   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	79
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

C 80   *	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	80
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 81   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	81
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

V 82   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	82
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

G 83   *	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	83
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

F 84   *	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	84
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 85   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	85
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 86   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	86
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 87   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	87
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

P 88   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	88
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

T 89   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	89
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 90   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	90
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 91   *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	91
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Q 92   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	92
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

R 93   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	93
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 94   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	94
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

R 95   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	95
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 96   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	96
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

V 97   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	97
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Y 98   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	98
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

T 99   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	99
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 100  0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	100
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 101  *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	101
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 102  *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	102
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 103  *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	103
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 104  *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	104
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

D 105  *	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	105
       0	*	*	0	*	*	*	1000	0	0	

//
