HHsearch 1.5 NAME c9mn2A_ FAM FILE c9mn2A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9mn2A_.a3m DATE Sat Aug 30 11:20:27 2025 LENG 153 match states, 153 columns in multiple alignment FILT 1 out of 3 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4275 -1.4191 SEQ >ss_pred CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9721114899999974200045478999998789999999889997642112678899999987389899878897662126765235699999995101 20369999875799999963100023587678998999999999999997339 >Consensus gskagldqeiqehvkketsseentqkvdehyanslqnlaqksleeldkattneqatqvknqflenaqklkeiqpliketnvklykasesleqvekelkhn seanledlvakskeivreyegklnqsknlpelkqleeeahsklkqvvedfrkk >c9mn2A_ GSKAGLDQEIQEHVKKETSSEENTQKVDEHYANSLQNLAQKSLEELDKATTNEQATQVKNQFLENAQKLKEIQPLIKETNVKLYKASESLEQVEKELKHN SEANLEDLVAKSKEIVREYEGKLNQSKNLPELKQLEEEAHSKLKQVVEDFRKK # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 K 3 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 A 4 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 G 5 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 D 7 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 8 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 E 9 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 I 10 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 11 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 E 12 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 H 13 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 V 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 K 16 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 E 17 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 T 18 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 S 19 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 S 20 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 E 21 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 E 22 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 N 23 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 T 24 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 25 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 K 26 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 V 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 D 28 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 E 29 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 H 30 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 31 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 31 0 * * * * * * 1000 0 0 A 32 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 N 33 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 S 34 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 L 35 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 36 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 N 37 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 L 38 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 A 39 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 40 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 S 42 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 L 43 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 E 44 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 E 45 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 L 46 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 D 47 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 K 48 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 A 49 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 T 50 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 T 51 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 N 52 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 E 53 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 54 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 A 55 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 T 56 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 57 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 V 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 K 59 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 N 60 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 61 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 F 62 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 L 63 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 E 64 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 N 65 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 A 66 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 67 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 K 68 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 L 69 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 K 70 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 E 71 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 I 72 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 73 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 P 74 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 L 75 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 I 76 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 K 77 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 E 78 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 T 79 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 N 80 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 V 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 K 82 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 L 83 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 84 0 * * * * * * 1000 0 0 K 85 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 A 86 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 S 87 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 E 88 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 S 89 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 E 91 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 92 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 V 93 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 E 94 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 K 95 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 E 96 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 L 97 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 K 98 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 H 99 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 N 100 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 S 101 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 E 102 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 A 103 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 N 104 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 L 105 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 E 106 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 D 107 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 L 108 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 V 109 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 A 110 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 K 111 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 S 112 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 K 113 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 E 114 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 I 115 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 V 116 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 R 117 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 E 118 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 119 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 119 0 * * * * * * 1000 0 0 E 120 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 G 121 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 K 122 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 L 123 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 N 124 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 125 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 S 126 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 K 127 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 N 128 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 L 129 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 P 130 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 E 131 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 L 132 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 K 133 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 134 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 L 135 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 E 136 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 E 137 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 E 138 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 A 139 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 H 140 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 S 141 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 K 142 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 L 143 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 K 144 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 145 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 V 146 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 V 147 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 E 148 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 D 149 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 F 150 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 R 151 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 K 152 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 K 153 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 153 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //