HHsearch 1.5 NAME c9mgwB_ FAM FILE c9mgwB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9mgwB_.a3m DATE Sat Jun 28 10:34:19 2025 LENG 221 match states, 221 columns in multiple alignment FILT 118 out of 307 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 4.8 EVD 0.3788 -3.4229 SEQ >ss_pred CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHCCCHHCCCCCCCCCHHHCC >ss_conf 9864208899999868987788668575112688889999999778776899999868775553035632133322232233689999999999999865 3143477767877887767338985899999998769999999999999971694379999999608102525303420689999999999899998786 303750024676788613219 >Consensus axrxxwxPxxxxPxxLdGslpGDxGFDPLGLsxxxexlxxxReAELkHGRvAMLAxvGxivxExxxxpxxxxagxxxxxxxxxxxxxxxixxxgxxExxr xxxxxxxxxxgxxGxxxfDPlgxxxxxxklkELkNGRLAMiAixGxixQxxvtGxgPiexLxxhladPxxxnxxtxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx >c9mgwB_ AGREMWYPGATPPPHLDGSMLGDYGFDPLRLGTNPDRLKWFREAELMNGRWAMAAVVGILFTDLVGLPKWWEAGAQTYPIDNQTLLIIEIAVFSFLESKR YEGYKKTGGTGFAFFFPFDPMGMRSQDKELKELKNGRLAMLAFLGFASTAAVNGQGPIESLQTHLADPAHNNIFTSSVGKESCVFVAVLSILPMLIEANK ALGKGQESVPLFPWNEEWEKV >UniRef50_B7GC99(32-202:206) Protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein n=1 Tax=Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1 RepID=B7GC99_PHATR E=3e-20 s/c=0.58 id=25% cov=69% --------NAVAPEKEIGVLPPIGFFDPLGFttrgpyGSREENFRHYRGVEVKHGRIAMAATLGTLVQQNYRFEGFLSPSAnlEFAEVPNGLAALDVVPL AGWVQMAVVIGaheflvkerpGRKPGDFG-TGYFGVALDDQSAKQLRLlnVEVSNGRLAMLGILGMFASEIIHGEALFET-------------------- ----------------------------------------- >UniRef50_B5YM25(48-186:201) Fucoxanthin chl a/c light-harvesting protein, major type n=1 Tax=Thalassiosira pseudonana CCMP1335 RepID=B5YM25_THAPS E=7e-18 s/c=0.67 id=27% cov=58% -------------------------WDPLNFCTDQASFDKMRYAELKHGRVAQLAAWGYAttwsgarFPGCEDFPAGHEAVLKIGTenlIPVLVVAGALE TLWKQKEGSFPGDFSATSFP--VGFGPFAKTEADMIDLRTKELNNGRAAMMGILGMIVHEQIDGK----------------------------------- ------------------------------- >UniRef50_B7FV42(32-199:206) Protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein n=2 Tax=Bacillariophyta RepID=B7FV42_PHATR E=6e-20 s/c=0.59 id=27% cov=65% ---------------LAGSTAPLKRFDPLGLAQvgSEQTFAWFQAAELKHSRAAMLATTGFIVQAAGIHFPGmlskdisFESLSGMNPVEQWAGVpdagk WQIILTIFIAEIATEAKKPHYMMGGDLPtmvFPPIDFSKVDAATLKTKrsrELNNGRLAMIGIMSFISEYNIPGSVPV---------------------- ----------------------------------------- >UniRef50_A9SNV6(45-242:244) Predicted protein n=3 Tax=Viridiplantae RepID=A9SNV6_PHYPA E=1e-24 s/c=0.58 id=28% cov=70% -------PAVVPPNVLEYakTMPGvtapfENIFDPADLlaraASSPRPIKelnRWRESEITHGRVAMLASLGFIVQEQLQDYSLFYNFDGQISGPAiyhf qqveargAVFWEPLIFAIALCEAYRVglgwatprsQDFNTLRDDYEPGNLGFDPLGLLPTDpaerkvMQTKELNNGRLAMIAIAAFVAQELVSGEEIFEH L------------------------------------------------------------ >UniRef50_O50032(41-206:207) Violaxanthin/chlorophyll a binding protein n=1 Tax=Nannochloropsis sp. RepID=O50032_9STRA E=5e-18 s/c=0.56 id=27% cov=64% -------------------------WDPLGLSADGdvDKFNRYRAIEIKHGRVAMLAMLHTLITGAGVTLPGLVTAGDGIPQSMPTAlapysgawaqgWA QVLIFCSALEVLAPQKEDKIPGDVQPDTSAFAKLDDKTEEEALKyqntEINNGRLAMVAWTGATVGALLTnGEHPVTTLLNKL----------------- --------------------------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * A 1 500 * * * * * * * * * * * * * * 1772 * * * * 1 0 * * * * * * 3315 0 0 G 2 4231 * 2325 2545 * 1473 * * 4588 * * 3000 * * * 4349 * * * * 2 0 * * * * * * 3864 0 0 R 3 3793 * 3508 * * * * * 2908 * * * * * 601 * 4393 * * * 3 0 * * * * * * 3980 0 0 E 4 2362 * 4438 2866 * 5038 * * * 4598 * * 2139 3865 3218 2764 * * * * 4 0 * * * * * * 3984 0 0 M 5 3100 * * 5094 * * * 4686 4301 1082 3411 4252 * 4506 * 3837 4979 * * * 5 0 * * * * * * 4022 0 0 W 6 2991 * * * 3603 * * * * * * * * * * 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