HHsearch 1.5 NAME c9m3lA_ FAM FILE c9m3lA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9m3lA_.a3m DATE Sat Jan 24 10:11:39 2026 LENG 157 match states, 157 columns in multiple alignment FILT 4 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.3702 -2.7174 SEQ >ss_pred CCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCEECCCCCCCHHEHEEECCCCCCCEEEEEEEEEEECCEEEEECHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHH HHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >ss_conf 9885799962898310307997255311134441210001011268873024444665540327897442356665086575211111358555216986 444552588786203573310123999999879999996313467899999998609 >Consensus xxgDxWiVhxxgxxxxnevFiadaxxixxxpxGIxsaqIxqLfexxsxptltAyxvqxxCxkrrVrxxnAxxxsxxxnxxxnxkxxxgWxxxexxexwlq xsxxFvCaPxqRxxnqMxplGkmpxxxmixavxxxfxemxxxqakxxxmxxlDxxlg >c9m3lA_ STGDYWIVYGKGERYNNEVFVANATGILQQPKGIQSAQIIQLFEDRSMPTLTAYEVQFKCKERRVRFDNARAMRRIDNVITNVKTVDGWIDPEKYDYWLQ RSFAFVCAPAIRDNNQMLPLGKMPIARMVQTVQAMFVELQGVQAKKQTMRDLDAMLG >UniRef50_A6V9M7(28-184:188) Putative uncharacterized protein n=7 Tax=Pseudomonas aeruginosa RepID=A6V9M7_PSEA7 E=4e-78 s/c=1.85 id=85% cov=101% SSGDYWIVYGKGERYNNEIFVADAAGIVQKPKGIQSAQIMQIFEDPSMPTLAAYEVQFKCKERRIRFYNARAMRRIDNVINNVKTVEGWIDPEKYDYWLQ RSFAFVCAPAIRANNQMLPLGKMATARMVRTVQAMFAELKGVQARKQTMRDLDEMLG >UniRef50_Q02NU9(30-192:198) Putative uncharacterized protein n=6 Tax=Pseudomonas aeruginosa RepID=Q02NU9_PSEAB E=2e-05 s/c=0.31 id=35% cov=91% ---DWWVVHKGDDPAELDVFLADADSLAPVP-GIENAwqvQIAMLFD--SFHLLSAH--QYRCDKREVKVVNAKTFSN-NGQPTNLQFTfaKGWtpLPNE SHEAVLQ----FICAPQQRERNGMRSTGRgVPLQAVITAVG--MVEMERAQAnlaearrkleeakSDRVMGELDRLLG >UniRef50_Q4KB34(27-179:187) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Pseudomonas fluorescens Pf-5 RepID=Q4KB34_PSEF5 E=2e-56 s/c=1.43 id=29% cov=97% -AGDFWMIHHQGSLNKNEAFIVDGepSNIFLRKGGVRSLGVYQLYEEGGKPTMTAYDVEVDCAKNRVRLNGAQNYSKFFNDLRPKKVSTQWQ--KQPEPW IAQTRDFLCHPEQRQAKQMYPLGKMPTSQMISAAPGLFQLMNHEHTKTAILKIVDQ--- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1102 0 0 T 2 1241 * * * * * * * * * * * * * * 1782 1806 * * * 2 0 * * * * * * 1706 0 0 G 3 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1706 0 0 D 4 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 2147 0 0 Y 5 * * * * 1646 * * * * * * * * * * * * * 1849 1312 5 0 * * * * * * 2147 0 0 W 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 6 0 * * * * * * 2147 0 0 I 7 * * * * * * * 1312 * * 1646 * * * * * * 1849 * * 7 0 * * * * * * 2147 0 0 V 8 * * * * * * * 1646 * * * * * * * * * 555 * * 8 0 * * * * * * 2147 0 0 Y 9 * * * * * * 744 * * * * * * * * * * * * 1312 9 0 * * * * * * 2147 0 0 G 10 * * * * * 1312 1646 * 1849 * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 2147 0 0 K 11 * * * * * 1849 * * 1312 * * * * 1646 * * * * * * 11 0 * * * * * * 2147 0 0 G 12 * * 1849 * * 469 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 2147 0 0 E 13 * * 1849 1312 * * * * * * * * * * * 1646 * * * * 13 0 * * * * * * 2147 0 0 R 14 * * * * * * * * * 1646 * * 1849 * 1312 * * * * * 14 0 * * * * * * 2147 0 0 Y 15 1849 * * * * * * * * * * 1646 * * * * * * * 1312 15 0 * * * * * * 2147 0 0 N 16 * * * 1849 * * * * 1646 * * 1312 * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 2147 0 0 N 17 * * * * * * * * * 1849 * 469 * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 2147 0 0 E 18 * * 1849 469 * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 2147 0 0 V 19 1646 * * * * * * 2280 * * * * * * * * * 1075 * * 19 0 * * * * * * 2147 0 0 F 20 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 2147 0 0 V 21 * * * * * * * 1646 * 1849 * * * * * * * 1312 * * 21 0 * * * * * * 2147 0 0 A 22 555 * * * * * * * * * * * * * * * * 1646 * * 22 0 * * * * * * 2147 0 0 N 23 * * 317 * * * * * * * * 2344 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 2147 0 0 A 24 555 * * * * 1646 * * * * * * * * * * * * * * 24 555 1646 * 1000 1000 * * 2147 1000 0 T 25 2280 * 1849 * * * * * * * * * * * * 1646 2344 * * * 25 0 * * * * * * 2147 0 0 G 26 * * * * * 1312 * * * * * 1646 * * * 1849 * * * * 26 0 * * * * * * 2147 0 0 I 27 * * * * * * * 469 * 1849 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 2147 0 0 L 28 1849 * * * 1646 * * * * 2344 * * * * * * * 2280 * * 28 0 * * * * * * 2147 0 0 Q 29 * * * * * * * * * 1646 * * 1849 1312 * * * * * * 29 0 * * * * * * 2147 0 0 Q 30 * * * * * * * * 2280 * * * * 2344 1646 * * 1849 * * 30 0 * * * * * * 2147 0 0 P 31 * * * * * * * * 1646 * * * 555 * * * * * * * 31 469 * 1849 * * * * 2147 0 0 K 32 * * * * * 1241 * * 794 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * 0 * 1706 0 1000 G 33 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 2147 0 0 I 34 * * * * * * * 555 * * * * * * * * * 1646 * * 34 0 * * * * * * 2147 0 0 Q 35 * * * 1849 * * * * * * * * * 1312 1646 * * * * * 35 0 * * * * * * 2147 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * 1849 * * * 469 * * * * 36 0 * * * * * * 2147 0 0 A 37 555 * * * * * * * * 1646 * * * * * * * * * * 37 469 1849 * 1585 585 * * 2147 1000 0 Q 38 * * * * * 1646 * * * * * * * 555 * * * * * * 38 0 * * * * * * 2147 0 0 I 39 * * * * * * * 555 * * * * * * * * * 1646 * * 39 0 * * * * * * 2147 0 0 I 40 1849 * * * * * * 2344 * * 2280 * * * * * * * * 1646 40 0 * * * * * * 2147 0 0 Q 41 * * * * * * * * * * 1849 * * 469 * * * * * * 41 0 * * * * * * 2147 0 0 L 42 * * * * * * * 2280 * 333 * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 2147 0 0 F 43 * * * * 555 * * * * * * * * * * * * * * 1646 43 0 * * * * * * 2147 0 0 E 44 * * 1849 469 * * * * * * * * * * * * * * * * 44 469 * 1849 * * * * 2147 0 0 D 45 * * 794 1241 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * 0 1706 0 1000 R 46 * * * * * 1241 * * * * * * 1782 * 1806 * * * * * 46 0 * * * * 0 * 1706 0 1000 S 47 * * * * * 1646 * * * * * * * * * 555 * * * * 47 0 * * * * * * 2147 0 0 M 48 * * * * 1849 * * * 1646 * 1312 * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 2147 0 0 P 49 * * * * * * 1849 * * * * * 469 * * * * * * * 49 0 * * * * * * 2147 0 0 T 50 * * * * * * * * * 1849 * * * * * * 469 * * * 50 0 * * * * * * 2147 0 0 L 51 * * * * * * * * * 555 1646 * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 2147 0 0 T 52 2280 * * * * * * * * * * * * * * 1849 953 * * * 52 0 * * * * * * 2147 0 0 A 53 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 2147 0 0 Y 54 * * * * * * 1849 * * * * * * * * * * * * 469 54 469 * 1849 * * * * 2147 0 0 E 55 * * 1241 794 * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * 0 1706 0 1000 V 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 56 0 * * * * 0 * 1706 0 1000 Q 57 * * * 1646 * * * * * * * * * 555 * * * * * * 57 0 * * * * * * 2147 0 0 F 58 * * * * 1312 * * * * * * * * * * * * 1646 * 1849 58 0 * * * * * * 2147 0 0 K 59 * * 1646 * * * * * 1312 * * * * * 1849 * * * * * 59 0 * * * * * * 2147 0 0 C 60 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 2147 0 0 K 61 1646 * 1849 * * * * * 1312 * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 2147 0 0 E 62 * * * 1312 * * * * 744 * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 2147 0 0 R 63 * * * * * * * * * * * 1646 * * 555 * * * * * 63 0 * * * * * * 2147 0 0 R 64 * * * 1849 * * * * * * * * * * 469 * * * * * 64 0 * * * * * * 2147 0 0 V 65 * * * * * * * 2280 * * * * * * * * * 333 * * 65 0 * * * * * * 2147 0 0 R 66 * * * * * * * * 1849 * * * * * 469 * * * * * 66 0 * * * * * * 2147 0 0 F 67 * * * * 1312 * * * * 1646 * * * * * * * 1849 * * 67 0 * * * * * * 2147 0 0 D 68 * * 2344 * * * * * * * * 1646 * * * * * 1849 * 2280 68 0 * * * * * * 2147 0 0 N 69 * * * * * 1646 * * * * * 555 * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 2147 0 0 A 70 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 2147 0 0 R 71 * * * * * * * * 1849 * * * * 1646 1312 * * * * * 71 0 * * * * * * 2147 0 0 A 72 1312 * * * * * * * * * * 1646 * * * * 1849 * * * 72 0 * * * * * * 2147 0 0 M 73 * * * * 1849 * * * * * 1312 * * * * * * * * 1646 73 0 * * * * * * 2147 0 0 R 74 * * * * * * * * * * * * * * 1312 744 * * * * 74 0 * * * * * * 2147 0 0 R 75 * * * * * * * * 1646 * * 1849 * * 1312 * * * * * 75 469 * 1849 * * * * 2147 0 0 I 76 * * * * 1241 * * 794 * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * 0 * 1706 0 1000 D 77 * * 1312 * 1646 * * * * * * 1849 * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 2147 0 0 N 78 * * * * * 1849 * * * * * 469 * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 2147 0 0 V 79 * * 1646 * * * * * * * * * * 1849 * * * 1312 * * 79 0 * * * * * * 2147 0 0 I 80 * * * * * * * 1312 * 1646 * * 1849 * * * * * * * 80 0 * * * * * * 2147 0 0 T 81 * * * * * * * * * * * 2280 * * 1646 * 1075 * * * 81 0 * * * * * * 2147 0 0 N 82 * * * * * * * * * * * 555 1646 * * * * * * * 82 0 * * * * * * 2147 0 0 V 83 * * * * * * * * 1646 1849 * * * * * * * 1312 * * 83 0 * * * * * * 2147 0 0 K 84 * * * * * * * * 469 * * * * 1849 * * * * * * 84 0 * * * * * * 2147 0 0 T 85 * * * * 1849 * * * * * * * * * * * 1312 1646 * * 85 0 * * * * * * 2147 0 0 V 86 * * * * * * * * * * * * * * * 1646 1849 1312 * * 86 469 1849 * 1000 1000 * * 2147 1000 0 D 87 * * 2344 2280 * * * * 1849 * * * * * * * 1646 * * * 87 0 * * * * * * 2147 0 0 G 88 * * * * * 555 * * * * * * * 1646 * * * * * * 88 0 * * * * * * 2147 0 0 W 89 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 89 469 1849 * 1000 1000 * * 2147 1000 0 I 90 * * * * * * * 1312 * 1849 * * * 1646 * * * * * * 90 555 * 1646 * * * * 2147 0 0 D 91 * * 708 * * * * * * * * * 1366 * * * * * * * 91 0 * * * * * 0 1589 0 1000 P 92 * * * * * * * * * * * 1366 708 * * * * * * * 92 0 * * * * 0 * 1589 0 1000 E 93 * * * 555 * * * * 1646 * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 2147 0 0 K 94 * * * * * * * * 1312 * * * * 1646 * 1849 * * * * 94 0 * * * * * * 2147 0 0 Y 95 * * * * * * 1849 * * * * * 1646 * * * * * * 1312 95 0 * * * * * * 2147 0 0 D 96 * * 1312 744 * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 2147 0 0 Y 97 1849 * * * * * * * * * * * 1646 * * * * * * 1312 97 0 * * * * * * 2147 0 0 W 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1849 469 * 98 0 * * * * * * 2147 0 0 L 99 * * * * * * * 1646 * 555 * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 2147 0 0 Q 100 1646 * * * * * * * * * * * * 555 * * * * * * 100 469 * 1849 * * * * 2147 0 0 R 101 * * * * * * * * * * * * * 1241 794 * * * * * 101 0 * * * * * 0 1706 0 1000 S 102 * * * * * * * * * * * * * * * 794 1241 * * * 102 0 * * * * * 0 1706 0 1000 F 103 * * * * 794 * * * * * * * * * 1241 * * * * * 103 0 * * * * * 0 1706 0 1000 A 104 794 * 1241 * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * 0 * 1706 0 1000 F 105 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 2147 0 0 V 106 * * * * * * * 1849 * 1646 * * * * * * * 1312 * * 106 0 * * * * * * 2147 0 0 C 107 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 2147 0 0 A 108 555 * * * * * 1646 * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 2147 0 0 P 109 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 109 0 * * * * * * 2147 0 0 A 110 1312 * * 1646 * * * * * * * * * 1849 * * * * * * 110 0 * * * * * * 2147 0 0 I 111 * * * * * * * 1312 * * * * * 744 * * * * * * 111 0 * * * * * * 2147 0 0 R 112 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 112 0 * * * * * * 2147 0 0 D 113 2280 * 2344 1849 * * * * * * * * * 1646 * * * * * * 113 0 * * * * * * 2147 0 0 N 114 1646 * * * * * * * * * * 1312 * * 1849 * * * * * 114 0 * * * * * * 2147 0 0 N 115 * * * * * * * * 1646 * * 555 * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 2147 0 0 Q 116 * * * * * 1849 * * * * * * * 469 * * * * * * 116 0 * * * * * * 2147 0 0 M 117 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 2147 0 0 L 118 * * * * * * * * * 1312 * * * * 1849 * * * * 1646 118 0 * * * * * * 2147 0 0 P 119 * * * * * * * * * * * * 469 * * 1849 * * * * 119 0 * * * * * * 2147 0 0 L 120 * * * * * * * * * 469 * * * * * * 1849 * * * 120 0 * * * * * * 2147 0 0 G 121 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 2147 0 0 K 122 * * * * * * * * 469 * * * * * 1849 * * * * * 122 469 1849 * 0 * * * 2147 1000 0 M 123 * * * * * * * * * * 469 * * * * * * 1849 * * 123 0 * * * * * * 2147 0 0 P 124 2280 * * * * * * * * * * * 333 * * * * * * * 124 0 * * * * * * 2147 0 0 I 125 * * * * * * * 2344 * 1849 * * * * * * 929 * * * 125 0 * * * * * * 2147 0 0 A 126 1312 * * * * * * * * * * * * 1849 * 1646 * * * * 126 0 * * * * * * 2147 0 0 R 127 1849 * * * * * * * * * * * * 1646 1312 * * * * * 127 0 * * * * * * 2147 0 0 M 128 * * * * * * * * * * 469 * * * * * * 1849 * * 128 0 * * * * * * 2147 0 0 V 129 * * * * * * * 744 * * * * * * * * * 1312 * * 129 0 * * * * * * 2147 0 0 Q 130 * * * * * * * * * * * * * 2344 2280 1646 1849 * * * 130 0 * * * * * * 2147 0 0 T 131 744 * * * * * * * * * * * * * * * 1312 * * * 131 0 * * * * * * 2147 0 0 V 132 1646 * * * * * * * * * * * * * * * * 555 * * 132 0 * * * * * * 2147 0 0 Q 133 * * * * * 1849 * * * * * * 1646 1312 * * * * * * 133 469 * 1849 * * * * 2147 0 0 A 134 794 * * * * 1241 * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * 0 1706 0 1000 M 135 * * * * * * * * * 1241 794 * * * * * * * * * 135 0 * * * * 0 * 1706 0 1000 F 136 * * * * 469 * * * * * 1849 * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 2147 0 0 V 137 2280 * * * * * * * * * * * * 1646 * * * 1075 * * 137 0 * * * * * * 2147 0 0 E 138 * * * 555 * * * * * 1646 * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 2147 0 0 L 139 * * * * * * * * * 1312 744 * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 2147 0 0 Q 140 * * * 1849 * * * * 2280 * * 1646 * 2344 * * * * * * 140 0 * * * * * * 2147 0 0 G 141 * * * * * 1312 1646 * * * * * * * 1849 * * * * * 141 0 * * * * * * 2147 0 0 V 142 1849 * * 1646 * * * * * * * * * * * * * 1312 * * 142 0 * * * * * * 2147 0 0 Q 143 * * * * * * 1646 * * * * * * 555 * * * * * * 143 0 * * * * * * 2147 0 0 A 144 555 * * * * * * * * * * * * * * * 1646 * * * 144 469 1849 * 3700 115 * * 2147 1000 0 K 145 * * * * * * * * 953 * * * * * 2280 1849 * * * * 145 0 * * * * * * 2147 0 0 K 146 * * 1849 * * * * * 1312 * * * * * * * 1646 * * * 146 0 * * * * * * 2147 0 0 Q 147 1646 * * * * * * * * * * * * 1312 1849 * * * * * 147 0 * * * * * * 2147 0 0 T 148 * * * * * * * 1646 * * * * * * * * 1312 1849 * * 148 0 * * * * * * 2147 0 0 M 149 * * * * * * * * * 1646 555 * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 2147 0 0 R 150 * * * * * 1849 * * 1646 * * * * * 1312 * * * * * 150 0 * * * * * * 2147 0 0 D 151 * * 1312 1849 * * * 1646 * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 2147 0 0 L 152 * * * * * * * * * 555 * * * * * * * 1646 * * 152 0 * * * * * * 2147 0 0 D 153 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 2147 0 0 A 154 2344 * * 2280 * * * * * * * * * 1646 1849 * * * * * 154 0 * * * * * * 2147 0 0 M 155 * * * * * * * * * 1366 708 * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1589 0 0 L 156 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1589 0 0 G 157 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 157 0 * * 0 * * * 1589 0 0 //