HHsearch 1.5 NAME c9kycG_ FAM FILE c9kycG_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9kycG_.a3m DATE Sat Nov 1 09:54:32 2025 LENG 119 match states, 119 columns in multiple alignment FILT 5 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.5 EVD 0.4128 -0.1931 SEQ >ss_pred CCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHCCCC EEEEEECCCCCCCCCCCCC >ss_conf 9556401043237406543211486087489998213577776307899861232001238999853101454287089998289436815776425552 2577404577600288899 >Consensus xxxxxxxxixyxsxvvIxxfhxGqixxGxyfCvxxxxxggxxpxxxiACavxnxsxwxxsFdxxxxqaxyxyaTgxxvriyyxxnVWTxpxfxxxfSxna lvgistCxxxxxCxGPxxx >c9kycG_ EWTGDYENIGYFSHEVISEFHVGQIDGGAYFCIKAVKADGSRSTPLIACSVSNESVWAPSFKVLLEQARYFYVTEQSVRIYYDHNVWTNQPFVNTFSTNA LVGLSSCSAATDCFGPGKP >UniRef50_Q404H3(29-140:141) ArtB protein n=6 Tax=Enterobacteriaceae RepID=Q404H3_SALTY E=3e-14 s/c=0.71 id=32% cov=92% ----------YQSNVQINNLSYGVYRSGdkesQFFCV-GLKRGSQVPNVHTICKIDVFGTHKQGFDNMLATARYYYATGEDVRIYYKENVWTDRNFTAAF SGNELIAITTCTSSDYCMGPTLP >UniRef50_C0B0U4(26-131:133) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Proteus penneri ATCC 35198 RepID=C0B0U4_9ENTR E=8e-37 s/c=1.45 id=43% cov=90% -------NIEYYSNVTLTDFNSGKIEDGRYFCVKAMNHGGQ----FIACAVSNKSDWASSYEHFFQQAHYYYTTGKSFRLYVQPNVWTHPKFTRVYSNKA IAGFASCH-NSRCMGPTK- >UniRef50_Q7W9A1(33-131:138) Putative exported protein n=3 Tax=Bordetella RepID=Q7W9A1_BORPA E=4e-29 s/c=1.29 id=20% cov=82% -----------YPSAVIEAYHIGQLHTGstPFVCARFHPEGQASPQALrIACAVQRYGKARRHFDEHVARIITCHAANRPTSLRVESDVWTDPQIYRLFS RAEILSIAPC------------ >UniRef50_Q6EZC3(8-140:141) SubB n=20 Tax=Enterobacteriaceae RepID=Q6EZC3_ECOLX E=3e-53 s/c=1.19 id=54% cov=97% EWTGDARD-GMFSGVVITQFHTGQIDNKPYFCIEGKQSAGSS---ISACSMKNSSVWGASFSTLYNQALYFYTTGQPVRIYYKPGVWTYPPFVKALTSNA LVGLSTCTTSTECFGPDRK # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * E 1 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1353 0 0 W 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 2 0 * * * * * * 1353 0 0 T 3 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 3 0 * * * * * * 1353 0 0 G 4 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1353 0 0 D 5 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1353 0 0 Y 6 1049 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 952 6 0 * * * * * * 1353 0 0 E 7 * * * 952 * * * * * * * * * * 1049 * * * * * 7 0 * * * * * * 1353 0 0 N 8 * * 1641 * * * * * * * * 558 * * * * * * * * 8 558 * 1641 * * * * 1733 0 0 I 9 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * 0 * 1454 0 1000 G 10 * * * 1534 * 611 * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1733 0 0 Y 11 * * * * * * * * * * 2101 * * * * * * * * 383 11 0 * * * * * * 2152 0 0 F 12 * * * * 1507 * * * * * * * * 2241 * * * * * 1196 12 0 * * * * * * 2643 0 0 S 13 * * * * * * * * * * * * 1987 * * 419 * * * * 13 0 * * * * * * 2643 0 0 H 14 * * * * * 2517 2497 * * * * 1337 * * * 1987 * * * * 14 0 * * * * * * 2643 0 0 E 15 1987 * * 2497 * * * * * * * * * * * * * 809 * * 15 0 * * * * * * 2643 0 0 V 16 * * * * * * * * * * * * * 2241 * * 2439 727 * * 16 0 * * * * * * 2643 0 0 I 17 * * * * * * * 294 * 2439 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 2643 0 0 S 18 * * * 1987 * * * * * * * 2241 * * * 2497 1478 * * * 18 0 * * * * * * 2643 0 0 E 19 1987 * 2439 2497 * * * * * * * 2241 * 2517 * * * * * * 19 0 * * * * * * 2643 0 0 F 20 * * * * 899 * * * * 2241 * * * * * * * * * 1987 20 0 * * * * * * 2643 0 0 H 21 * * * * * * 727 * * * * 2439 * * * 2241 * * * * 21 0 * * * * * * 2643 0 0 V 22 * * * * * * * 1987 * * * * * * * 2439 2517 2497 * 2241 22 0 * * * * * * 2643 0 0 G 23 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 2643 0 0 Q 24 * * * * * * * * 2439 * * * * 727 * * * 2241 * * 24 0 * * * * * * 2643 0 0 I 25 * * * * * * * 899 * 1987 * * * * * * * * * 2241 25 0 * * * * * * 2643 0 0 D 26 * * 1507 2439 * * 1987 * * * * * * * 2241 * * * * * 26 0 * * * * * * 2643 0 0 G 27 * * 2439 * * 2497 * * * * * 2517 * * * 2241 1987 * * * 27 0 * * * * * * 2643 0 0 G 28 * * * * * 277 * * 2517 * * * * * * * * * * * 28 899 1108 * 1549 603 * * 2643 1690 0 A 29 2497 * * * * * * * * * * * 1228 2241 2439 * * * * * 29 0 * * * * * * 2643 0 0 Y 30 * * * * 1108 * * * * * * * * * * * * * * 899 30 0 * * * * * * 2643 0 0 F 31 * * * * 419 * * * * * * * * * * * * 1987 * * 31 0 * * * * * * 2643 0 0 C 32 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2643 0 0 I 33 1987 * * * * * * 1507 * * * * * * * * * 1337 * * 33 343 * 2241 * * * * 2643 0 0 K 34 * * * 2170 * * * * 1120 * * * * * 1654 * * * * * 34 0 * * * * 0 * 2314 0 1000 A 35 1468 * * * 1987 1372 * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 2643 0 0 V 36 * * * * * * 1987 * 2517 2241 2439 * * * * * * 2497 * * 36 0 * * * * * * 2643 0 0 K 37 * * * * * * * * 1363 * * 2439 1987 2517 * * * * * * 37 0 * * * * * * 2643 0 0 A 38 2497 * * 1987 * * 2439 * * * * * * * 2241 2517 * * * * 38 0 * * * * * * 2643 0 0 D 39 2517 * 2497 * * 626 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 2643 0 0 G 40 * * * * * 899 * * * * * * * 1987 * 2241 * * * * 40 0 * * * * * * 2643 0 0 S 41 1987 * * * * * * * * * * * * 1337 * 1507 * * * * 41 294 * 2439 * * * * 2643 0 0 R 42 * * * * * * * * * * * * * * 2148 948 * 1965 * * 42 356 * 2193 * * * 0 2419 0 1000 S 43 * * * * * * * * * * * * 579 * * 1596 * * * * 43 0 * * * * * 0 2202 0 1547 T 44 * * * * * * * * * * * 1654 * 1508 * * 1596 * * * 44 0 * * * * * 0 2202 0 1547 P 45 1508 * * * * * * * * * * * 1596 * * * * 1654 * * 45 0 * * * * 0 * 2202 0 1547 L 46 * * * * 2439 * 2241 2517 * 1220 * * * * * * * * * * 46 419 1987 * 0 * * * 2643 1000 0 I 47 * * * * * * * 704 * * * * * * * 2517 2241 * * * 47 0 * * * * * * 2643 0 0 A 48 343 * * * * * * 2241 * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 2643 0 0 C 49 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 2643 0 0 S 50 1196 * * * * * * * 2241 * * * * * * 1507 * * * * 50 0 * * * * * * 2643 0 0 V 51 * * * * * * * 2241 * * 2517 * * * * * * 704 * * 51 0 * * * * * * 2643 0 0 S 52 * * 2241 * * * * * 2517 * * * * 1987 * 1468 * * * * 52 0 * * * * * * 2643 0 0 N 53 * * * * * * * * * * * 899 * * 1987 * * 2241 * * 53 0 * * * * * * 2643 0 0 E 54 * * * 2497 2241 * * * 2439 * * * * * * 2517 * * * 1987 54 0 * * * * * * 2643 0 0 S 55 * * * * * 1108 * * * * * * * * * 899 * * * * 55 0 * * * * * * 2643 0 0 V 56 * * 2439 * * * * * 1987 * * * * * * * 2241 1507 * * 56 0 * * * * * * 2643 0 0 W 57 1987 * * * * * 2241 * * * * * * * * * * * 899 * 57 0 * * * * * * 2643 0 0 A 58 1468 * * * * 2517 * * 2241 * * * * * 1987 * * * * * 58 0 * * * * * * 2643 0 0 P 59 2517 * * * * * * * * * * * 2497 2241 1987 2439 * * * * 59 0 * * * * * * 2643 0 0 S 60 * * * * * 2241 1987 * * * * * * * * 899 * * * * 60 0 * * * * * * 2643 0 0 F 61 * * * * 294 * * * * * * * * * * * * * * 2439 61 0 * * * * * * 2643 0 0 K 62 * * 1108 2439 * * * * 2497 * * * * * * 2517 * * * * 62 0 * * * * * * 2643 0 0 V 63 * * * 1987 * * 2439 * * * * 2241 * * * * 2517 2497 * * 63 0 * * * * * * 2643 0 0 L 64 * * * * 2439 * 1987 * * 1507 2241 * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 2643 0 0 L 65 * * * * 2439 * * * * 1363 * * * * * * * 1987 * 2517 65 0 * * * * * * 2643 0 0 E 66 1108 * * 2497 * * * * * * * 2517 * 2439 * * * * * * 66 0 * * * * * * 2643 0 0 Q 67 * * * * * * * * * * * * * 899 1987 * 2241 * * * 67 0 * * * * * * 2643 0 0 A 68 419 * * * * * * 1987 * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 2643 0 0 R 69 * * * * * * 2439 1987 * 2517 * * * * 1363 * * * * * 69 0 * * * * * * 2643 0 0 Y 70 * * * * * * * * * * * * * * * * 1987 * * 419 70 0 * * * * * * 2643 0 0 F 71 * 1987 * * 1507 * * * * * * * * * * * * * * 1337 71 0 * * * * * * 2643 0 0 Y 72 * * * * * * 1987 * * * * * * * * * * * * 419 72 0 * * * * * * 2643 0 0 V 73 1108 * * * * * * * * * * * * * * * 1478 2497 * * 73 0 * * * * * * 2643 0 0 T 74 1987 * * * * * * * * * * * * * * * 419 * * * 74 0 * * * * * * 2643 0 0 E 75 * * * 2497 * 809 * * * * * 1987 * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 2643 0 0 Q 76 * * * 2241 * * * * 2439 * * * * 1507 1987 * * * * * 76 0 * * * * * * 2643 0 0 S 77 * * 2241 * * * * * * * * * 1228 * * 1468 * * * * 77 0 * * * * * * 2643 0 0 V 78 * * * * 2439 * * * * * * * * * * * 1987 828 * * 78 0 * * * * * * 2643 0 0 R 79 * * * * * * * * * * * * * * 419 1987 * * * * 79 0 * * * * * * 2643 0 0 I 80 * * * * * * * 828 * 1196 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 2643 0 0 Y 81 * * * * * * * * * * * * * * 1987 * * * * 419 81 0 * * * * * * 2643 0 0 Y 82 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1196 * 828 82 0 * * * * * * 2643 0 0 D 83 * * 2497 1987 * * * * 1372 * * * * 2439 * * * * * * 83 0 * * * * * * 2643 0 0 H 84 * * * 2241 * * 2497 * * * * * 1478 * * 1987 * * * * 84 0 * * * * * * 2643 0 0 N 85 * * 1987 * * 2517 * * * * * 803 * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 2643 0 0 V 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 86 0 * * * * * * 2643 0 0 W 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 87 0 * * * * * * 2643 0 0 T 88 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 88 0 * * * * * * 2643 0 0 N 89 * * 1108 * * * 2439 * * * * 2497 * * * * * * * 2517 89 0 * * * * * * 2643 0 0 Q 90 * * * * * * * * * * * * 710 2497 2241 * * * * * 90 0 * * * * * * 2643 0 0 P 91 * * * * * * * * 2439 * * 2241 1507 1987 * * * * * * 91 0 * * * * * * 2643 0 0 F 92 * * * * 419 * * 1987 * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 2643 0 0 V 93 * * * * * * * * * * * * * * * * 1337 1507 * 1987 93 0 * * * * * * 2643 0 0 N 94 2241 * * * * * * * 2517 * * 2497 * * 1196 * * * * * 94 0 * * * * * * 2643 0 0 T 95 1372 * * * * * * * * 1987 * * * * * * 2497 2439 * * 95 0 * * * * * * 2643 0 0 F 96 * * * * 642 * * * * 2517 * * * * * * * * * 2439 96 0 * * * * * * 2643 0 0 S 97 * * * * * * * * * * * * * * * 277 2517 * * * 97 0 * * * * * * 2643 0 0 T 98 * * * * * 2241 * * * * * 2439 * * 1987 2517 2497 * * * 98 0 * * * * * * 2643 0 0 N 99 1987 * * * * * * * 2439 * * 828 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 2643 0 0 A 100 899 * * 1108 * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 2643 0 0 L 101 * * * * * * * 1196 * 828 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 2643 0 0 V 102 2439 * * * * * * 2241 * 1987 * * * * * * * 1507 * * 102 0 * * * * * * 2643 0 0 G 103 2241 * * * * 899 * * * * * * * * * 1987 * * * * 103 0 * * * * * * 2643 0 0 L 104 * * * * 2439 * * 1108 * 1507 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 2643 0 0 S 105 1196 * * * * * * * * * * * * * * 1507 2241 * * * 105 0 * * * * * * 2643 0 0 S 106 * * * * * * * * * * * * 1987 * * 1468 1372 * * * 106 0 * * * * * * 2643 0 0 C 107 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 2643 0 0 S 108 * * * * * * 2013 * * * * * * * * 2087 952 * * * 108 411 * 2013 * * * * 2152 0 0 A 109 1639 * * * * * * * * * * * * * * 1437 1691 * * * 109 0 * * * * 0 * 1862 0 1000 A 110 2087 * * * * * * * * * * 2013 * * * 952 * * * * 110 0 * * * * * * 2152 0 0 T 111 * * 1816 * * * * * * * * * * * * 2013 1094 * * * 111 0 * * * * * * 2152 0 0 D 112 * * 2087 2101 * * * * * * * * * * 2013 * * * * 1816 112 0 * * * * * * 2152 0 0 C 113 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 2152 0 0 F 114 * * * * 1094 * * * * * 911 * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 2152 0 0 G 115 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 2152 0 0 P 116 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 116 0 * * * * * * 2152 0 0 G 117 * * 2101 * * 2087 * * * * * * * * * * 911 * * * 117 0 * * * * * * 2152 0 0 K 118 * * * * * * * * 1050 1816 * * * * 2101 * * * * * 118 0 * * * * * * 2152 0 0 P 119 * * * * * * * * 1691 * * * 535 * * * * * * * 119 0 * * 0 * * * 1862 0 0 //