HHsearch 1.5 NAME c9k3eC_ FAM FILE c9k3eC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9k3eC_.a3m DATE Sat Nov 30 09:29:47 2024 LENG 116 match states, 116 columns in multiple alignment FILT 1 out of 3 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4358 0.2675 SEQ >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEECCEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEEEEEEE EEEEEEECEEEEEECC >ss_conf 9134667775887687763010122330555227825899985034223887765168730046762545401266248976799997898799998720 1024420101011249 >Consensus tkskmlsniviqevkfaiedycailsfasdsyevpeqyfiitrsttersggipegdiylesnlfldfnpyglsgyllsepncvdlliepnnyvrlrliek idilevenhlkflfdn >c9k3eC_ TKSKMLSNIVIQEVKFAIEDYCAILSFASDSYEVPEQYFIITRSTTERSGGIPEGDIYLESNLFLDFNPYGLSGYLLSEPNCVDLLIEPNNYVRLRLIEK IDILEVENHLKFLFDN # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * T 1 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 K 2 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 S 3 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 K 4 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 M 5 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 S 7 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 N 8 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 I 9 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 V 10 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 I 11 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 12 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 E 13 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 V 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 F 16 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 A 17 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 I 18 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 E 19 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 D 20 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 21 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 21 0 * * * * * * 1000 0 0 C 22 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 A 23 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 I 24 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 L 25 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 S 26 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 F 27 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 A 28 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 S 29 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 D 30 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 S 31 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 32 0 * * * * * * 1000 0 0 E 33 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 V 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 P 35 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 E 36 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 37 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 38 0 * * * * * * 1000 0 0 F 39 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 I 40 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 I 41 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 T 42 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 R 43 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 S 44 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 T 45 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 T 46 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 E 47 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 R 48 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 S 49 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 G 50 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 G 51 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 I 52 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 P 53 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 E 54 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 D 56 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 I 57 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 58 0 * * * * * * 1000 0 0 L 59 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 E 60 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 S 61 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 N 62 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 L 63 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 F 64 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 L 65 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 D 66 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 F 67 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 N 68 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 P 69 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 70 0 * * * * * * 1000 0 0 G 71 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 L 72 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 S 73 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 G 74 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 75 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 75 0 * * * * * * 1000 0 0 L 76 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 L 77 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 S 78 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 E 79 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 P 80 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 N 81 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 C 82 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 V 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 D 84 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 L 85 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 I 87 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 E 88 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 P 89 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 N 90 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 N 91 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 92 0 * * * * * * 1000 0 0 V 93 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 R 94 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 L 95 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 R 96 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 L 97 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 I 98 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 E 99 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 K 100 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 I 101 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 D 102 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 I 103 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 L 104 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 E 105 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 V 106 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 E 107 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 N 108 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 H 109 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 L 110 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 K 111 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 F 112 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 L 113 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 F 114 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 D 115 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 N 116 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 116 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //