HHsearch 1.5 NAME c9k2vC_ FAM FILE c9k2vC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9k2vC_.a3m DATE Sat Apr 12 11:35:06 2025 LENG 40 match states, 40 columns in multiple alignment FILT 1 out of 3 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.5640 5.5097 SEQ >ss_pred CCCCCEEECCEEEEHHCCCCEECCCCCCEEEEECCCCCCC >ss_conf 9876412335032000046300267321233320424679 >Consensus qtnpfydiggvslqnaiganiqadganelinfttgvntna >c9k2vC_ QTNPFYDIGGVSLQNAIGANIQADGANELINFTTGVNTNA # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * Q 1 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 T 2 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 N 3 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 P 4 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 F 5 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 6 0 * * * * * * 1000 0 0 D 7 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 I 8 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 G 9 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 G 10 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 V 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 S 12 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 L 13 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 14 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 N 15 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 A 16 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 I 17 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 G 18 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 A 19 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 N 20 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 I 21 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 22 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 A 23 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 D 24 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 G 25 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 A 26 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 N 27 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 I 30 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 N 31 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 F 32 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 T 33 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 T 34 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 G 35 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 V 36 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 N 37 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 T 38 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 N 39 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 A 40 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //