HHsearch 1.5 NAME c9jxsB_ FAM FILE c9jxsB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9jxsB_.a3m DATE Sat Dec 14 13:09:16 2024 LENG 165 match states, 165 columns in multiple alignment FILT 1 out of 3 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4068 -1.1058 SEQ >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9614667876652010317899986311022108653678986456543200040788999999999873125430770346775565206834675699 99765443000364212399999999753788898860899998763070024543667875339 >Consensus nrgtvdfiaslenlkegdlgilrklrgarldeklpgfdlfsalwwplrqknqrapkrevawliaklfaefrfeqregatlpilmggicrklepkkelprv larfdqlasldimqmeeplsvimgilrkhqqvcldwvgltdvlsfweqepvkrewsdsfikayki >c9jxsB_ NRGTVDFIASLENLKEGDLGILRKLRGARLDEKLPGFDLFSALWWPLRQKNQRAPKREVAWLIAKLFAEFRFEQREGATLPILMGGICRKLEPKKELPRV LARFDQLASLDIMQMEEPLSVIMGILRKHQQVCLDWVGLTDVLSFWEQEPVKREWSDSFIKAYKI # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * N 1 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 R 2 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 G 3 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 T 4 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 V 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 D 6 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 F 7 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 I 8 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 A 9 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 L 11 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 E 12 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 N 13 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 L 14 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 E 16 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 G 17 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 D 18 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 L 19 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 G 20 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 I 21 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 R 23 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 K 24 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 L 25 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 R 26 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 G 27 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 A 28 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 R 29 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 D 31 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 E 32 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 P 35 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 G 36 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 F 37 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 D 38 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 F 40 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 S 41 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 A 42 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 L 43 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 W 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 W 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 P 46 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 R 48 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 49 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 K 50 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 N 51 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 52 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 R 53 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 A 54 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 P 55 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 K 56 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 R 57 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 E 58 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 V 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 A 60 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 W 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 L 62 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 I 63 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 A 64 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 K 65 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 L 66 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 F 67 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 A 68 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 E 69 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 F 70 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 R 71 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 F 72 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 E 73 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 74 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 R 75 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 E 76 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 G 77 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 A 78 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 T 79 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 L 80 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 P 81 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 I 82 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 L 83 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 M 84 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 G 85 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 G 86 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 I 87 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 C 88 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 R 89 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 K 90 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 L 91 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 E 92 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 P 93 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 K 94 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 K 95 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 E 96 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 L 97 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 P 98 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 R 99 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 V 100 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 L 101 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 A 102 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 R 103 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 F 104 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 D 105 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 106 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 L 107 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 A 108 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 S 109 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 L 110 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 D 111 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 I 112 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 M 113 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 114 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 M 115 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 E 116 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 E 117 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 P 118 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 S 120 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 V 121 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 I 122 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 M 123 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 G 124 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 I 125 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 L 126 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 R 127 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 K 128 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 H 129 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 130 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 131 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 V 132 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 C 133 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 L 134 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 D 135 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 W 136 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 V 137 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 G 138 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 L 139 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 T 140 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 D 141 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 V 142 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 L 143 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 S 144 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 F 145 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 W 146 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 E 147 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 148 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 E 149 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 P 150 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 V 151 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 K 152 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 R 153 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 E 154 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 W 155 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 S 156 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 D 157 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 S 158 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 F 159 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 I 160 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 K 161 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 A 162 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 163 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 163 0 * * * * * * 1000 0 0 K 164 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 I 165 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 165 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //