HHsearch 1.5
NAME  c9jj8L_
FAM   
FILE  c9jj8L_
COM   /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9jj8L_.a3m 
DATE  Sat Aug 23 10:52:16 2025
LENG  48 match states, 48 columns in multiple alignment
FILT  1 out of 3 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100)
NEFF  1.0 
EVD   0.5091  4.3581 
SEQ
>ss_pred
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHCCCHHHHCCCCC
>ss_conf
945777787525456787667863032201022220012243272469
>Consensus
mtipglnapglvpatkkpagakpsfesyrdtshfwssqgimdsvpkvk
>c9jj8L_
MTIPGLNAPGLVPATKKPAGAKPSFESYRDTSHFWSSQGIMDSVPKVK
#
NULL   3706	5728	4211	4064	4839	3729	4763	4308	4069	3323	5509	4640	4464	4937	4285	4423	3815	3783	6325	4665	
HMM    A	C	D	E	F	G	H	I	K	L	M	N	P	Q	R	S	T	V	W	Y	
       M->M	M->I	M->D	I->M	I->I	D->M	D->D	Neff	Neff_I	Neff_D
       0	*	*	0	*	0	*	*	*	*	
M 1    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	1
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

T 2    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	2
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 3    *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	3
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

P 4    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	4
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

G 5    *	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	5
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 6    *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	6
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

N 7    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	7
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 8    0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	8
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

P 9    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	9
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

G 10   *	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	10
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 11   *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	11
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

V 12   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	12
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

P 13   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	13
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 14   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	14
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

T 15   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	15
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 16   *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	16
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 17   *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	17
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

P 18   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	18
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 19   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	19
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

G 20   *	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	20
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 21   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	21
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 22   *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	22
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

P 23   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	23
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 24   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	24
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

F 25   *	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	25
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 26   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	26
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 27   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	27
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Y 28   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	28
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

R 29   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	29
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

D 30   *	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	30
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

T 31   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	31
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 32   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	32
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

H 33   *	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	33
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

F 34   *	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	34
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

W 35   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	35
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 36   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	36
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 37   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	37
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Q 38   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	38
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

G 39   *	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	39
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 40   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	40
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

M 41   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	41
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

D 42   *	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	42
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 43   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	43
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

V 44   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	44
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

P 45   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	45
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 46   *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	46
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

V 47   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	47
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 48   *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	48
       0	*	*	0	*	*	*	1000	0	0	

//
