HHsearch 1.5 NAME c9j6zA_ FAM FILE c9j6zA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9j6zA_.a3m DATE Sat Jul 26 11:06:37 2025 LENG 82 match states, 82 columns in multiple alignment FILT 2 out of 4 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.4640 2.1377 SEQ >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCCCCC >ss_conf 9024889873899999999851251110011344724576543133873312111113331148720000356766521239 >Consensus hsqsldrlmnplidqylyylsrtxttqslxfsqxgxxxxxxqxxnwlpgeygivadnlqqqntapqigtvnsqgalpgmvwq >c9j6zA_ HSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTQTTQTLGFSQGGPNTMANQAKNWLPGEYGIVADNLQQQNTAPQIGTVNSQGALPGMVWQ >UniRef50_P03135(224-278:504) Probable coat protein 3 n=269 Tax=Dependovirus RepID=COA3_AAV2 E=6e-13 s/c=1.37 id=74% cov=61% HSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNtpsgtTTQSrLQFSQAGASDIRDQSRNWLPG--------------------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * H 1 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1185 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 2 0 * * * * * * 1185 0 0 Q 3 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 3 0 * * * * * * 1185 0 0 S 4 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 4 0 * * * * * * 1185 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1185 0 0 D 6 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1185 0 0 R 7 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 7 0 * * * * * * 1185 0 0 L 8 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1185 0 0 M 9 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1185 0 0 N 10 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1185 0 0 P 11 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1185 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1185 0 0 I 13 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1185 0 0 D 14 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1185 0 0 Q 15 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 15 0 * * * * * * 1185 0 0 Y 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 16 0 * * * * * * 1185 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1185 0 0 Y 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 18 0 * * * * * * 1185 0 0 Y 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 19 0 * * * * * * 1185 0 0 L 20 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1185 0 0 S 21 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 21 0 * * * * * * 1185 0 0 R 22 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 22 0 * * * * * * 1185 0 0 T 23 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 23 0 * * * * * * 1185 0 0 Q 24 * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * 24 1000 1000 * 2322 322 * * 1185 1000 0 T 25 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 25 0 * * * * * * 1185 0 0 T 26 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 26 0 * * * * * * 1185 0 0 Q 27 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 27 0 * * * * * * 1185 0 0 T 28 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 28 1000 1000 * 0 * * * 1185 1000 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1185 0 0 G 30 * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * 30 0 * * * * * * 1185 0 0 F 31 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1185 0 0 S 32 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 32 0 * * * * * * 1185 0 0 Q 33 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 33 0 * * * * * * 1185 0 0 G 34 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1185 0 0 G 35 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1185 0 0 P 36 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1185 0 0 N 37 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 37 0 * * * * * * 1185 0 0 T 38 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 38 0 * * * * * * 1185 0 0 M 39 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1185 0 0 A 40 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 40 0 * * * * * * 1185 0 0 N 41 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1185 0 0 Q 42 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 42 0 * * * * * * 1185 0 0 A 43 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 43 0 * * * * * * 1185 0 0 K 44 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 44 0 * * * * * * 1185 0 0 N 45 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1185 0 0 W 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 46 0 * * * * * * 1185 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1185 0 0 P 48 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1185 0 0 G 49 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1185 0 0 E 50 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 51 0 * * * * * * 1000 0 0 G 52 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 I 53 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 V 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 A 55 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 D 56 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 N 57 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 L 58 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 59 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 60 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 61 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 N 62 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 T 63 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 A 64 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 P 65 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 66 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 I 67 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 G 68 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 T 69 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 V 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 N 71 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 S 72 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 73 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 G 74 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 A 75 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 L 76 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 P 77 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 G 78 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 M 79 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 V 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 W 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 82 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 82 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //