HHsearch 1.5 NAME c9im1E_ FAM FILE c9im1E_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9im1E_.a3m DATE Sat Jun 21 12:01:25 2025 LENG 423 match states, 423 columns in multiple alignment FILT 131 out of 146 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 5.0 EVD 0.3830 -3.1690 SEQ >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCE EECCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCEEECHHHCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCEEEEE EECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCC CCCHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC >ss_conf 9778999999998761201132115523363143688741212342000147842799957909999648877422555522652155589998622642 3114584899967513545545078999999997403332232102234312013783002200202799626021782577626701058853104787 4125666876677654102578999998853115889999999999867617898237999992499848999999999965531136656752135678 8814554159859997437655544530116567454308970775031699996588864037881124568986345647832123201333348999 99999998651068512688889 >Consensus xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxdxxxx xxxxxxxxxxWxgxxWxxxxxxxxixxxixxxxxxixxxxxxxxlxxxxkxxxxxnxxxxxvxxxexDxxPxLLxfxNGVlDLkTGefxpxxPxdxxxxt xxixyxYdpxxxxxxxxxxxxxxkflxxIxxxxxgDxelxxxlqxxlgxxLxGxsxqxxfxlxGxGxNGKSTxxxlixxllGdyavxxxxxxlxxxxxxx xxxxlAxLxGKRlvixsExxdgxxxxxxxlxexxiKxlTGxdxixxrpxxklixxtNxxPxixxxDxaixRRlxiIPFxxxfxxxxdxKIxxxyxrxaxL xxLlExxxkyxxxgLxxxxxpxx >c9im1E_ FISFEDAIKRVSKIFINSIINFNDLDENNFTTVPLVIDYVTPCALCKKRSHKHPHQLSLENGAIRIYKTGNPHSCKVKIVPLDGNKLFNIAQRILDTNSV LLTERGDHIVWINNSWKFNSEEPLITKLILSIRHQLPKEYSSELLCPRKRKTVEANIRDMLVDSVETDTYPDKLPFKNGVLDLVDGMFYSGDDAKKYTCT VSTGFKFDDTKFVEDSPEMEELMNIINDIQPLTDENKKNRELYEKTLSSCLCGATKGCLTFFFGETATGKSTTKRLLKSAIGDLFVETGQTILTDVLDKG PNPFIANMHLKRSVFCSELPDFACSGSKKIRSDNIKKLTEPCVINNRNHATIIIDTNYKPVFDRIDNALMRRIAVVRFRTHLDEGLDGKIQNNRYRFAFL YLLVKWYKKYHIPIMKLYPTPEE >UniRef50_D2XAF6(519-796:903) D5 family helicase-primase n=1 Tax=Marseillevirus RepID=D2XAF6_9VIRU E=3e-47 s/c=0.69 id=23% cov=55% ---------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------DLLGMEDGVCDLKLGIFRDGSPDDYISMS TGISYK----ALSEEDRSVIECREFLKKLFP----NPRIRKCALRMVSSCMQGGNRNKrIYICTGKGNNGKSVFFSLLEYIFGQYLIKFPREMCLA--GR AGNPSSARPELARAPGTRYGVIQEVHKNEKFNPGILKELSGNDSFFVRnlfekgrdikPMFTIFMMANKPPGVPGSDQATWNRIRLIPFEATFlseqden wiedpelrreakmfkaDEHFEEKIPG--LAHALLWLCVEDFRKYKEEGL-------- >UniRef50_A8Z1F9(417-649:790) Possible DNA primase n=7 Tax=Staphylococcus RepID=A8Z1F9_STAAT E=6e-14 s/c=0.35 id=18% cov=51% ---------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------MVDIKEKTNSPYLIPVKNGVFNRKTKQLESFTP--DYIFT SKIDTSYVRQDIVPEINGW-NIDRWIEEI---ACNDNQVVKLLWQVINDSMNGNyTRKKAIFFVGDGNNGKGTFQELLSNVIG-YSNIASLKVneFDERF KLSVLEGKTAVIGDDVPVGVYVDDSSNFKSVVTGDPVLVEFKNKPLYRATFKCTVIQSTNGMPKFKDKTGGTLRRLLIVPFNANFN-------------- -------------------------- >UniRef50_A4CRK8(396-663:854) ATPase-like protein n=1 Tax=Synechococcus sp. 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