HHsearch 1.5 NAME c9hacD_ FAM FILE c9hacD_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9hacD_.a3m DATE Sat Dec 21 14:07:02 2024 LENG 121 match states, 121 columns in multiple alignment FILT 1 out of 3 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4427 0.6199 SEQ >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHCCCHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9479999999999999999878999999999999999999761301025404430754406998899985311588999899999999999999999995 404823999999999998559 >Consensus qeeiqkkvrelleklieyleepfkekleevieglerlkeevqlnmnlivfeglevdeegrvwfivkemlhatteeealenmdkfleswekvfkelleyhf ehndptfdffldflwwqlyge >c9hacD_ QEEIQKKVRELLEKLIEYLEEPFKEKLEEVIEGLERLKEEVQLNMNLIVFEGLEVDEEGRVWFIVKEMLHATTEEEALENMDKFLESWEKVFKELLEYHF EHNDPTFDFFLDFLWWQLYGE # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * Q 1 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 I 4 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 5 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 K 6 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 K 7 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 V 8 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 R 9 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 E 10 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 L 11 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 E 13 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 K 14 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 I 16 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 E 17 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 18 0 * * * * * * 1000 0 0 L 19 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 E 20 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 E 21 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 P 22 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 F 23 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 K 24 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 E 25 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 K 26 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 E 29 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 I 31 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 E 32 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 G 33 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 E 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 R 36 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 L 37 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 K 38 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 E 39 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 E 40 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 V 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 42 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 L 43 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 N 44 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 M 45 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 N 46 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 I 48 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 V 49 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 F 50 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 E 51 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 G 52 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 E 54 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 V 55 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 D 56 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 E 57 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 E 58 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 G 59 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 R 60 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 V 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 W 62 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 F 63 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 I 64 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 V 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 K 66 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 E 67 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 M 68 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 L 69 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 H 70 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 A 71 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 T 72 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 T 73 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 E 74 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 E 75 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 E 76 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 A 77 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 L 78 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 E 79 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 N 80 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 M 81 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 D 82 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 K 83 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 F 84 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 L 85 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 E 86 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 S 87 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 W 88 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 E 89 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 K 90 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 V 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 F 92 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 K 93 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 E 94 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 L 95 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 L 96 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 E 97 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 98 0 * * * * * * 1000 0 0 H 99 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 F 100 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 E 101 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 H 102 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 N 103 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 D 104 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 P 105 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 T 106 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 F 107 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 D 108 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 F 109 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 F 110 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 L 111 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 D 112 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 F 113 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 L 114 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 W 115 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 W 116 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 117 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 L 118 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 119 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 119 0 * * * * * * 1000 0 0 G 120 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 E 121 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //