HHsearch 1.5 NAME c9h1lH_ FAM FILE c9h1lH_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9h1lH_.a3m DATE Sat Mar 1 10:34:26 2025 LENG 114 match states, 114 columns in multiple alignment FILT 3 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.3877 -1.0938 SEQ >ss_pred CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCHHHH HHHHHHHHHHHCCC >ss_conf 9289983425546999999998888875202322201013258954888850565033899999997542525200233320120113314888878999 99984587543029 >Consensus axixvxcxdeagkxiyxkviqtaledlxlgksiirxxxixkexxpyfilgvlpkaxxdfidkvmdfmxrvfpegmrikxtxxdkxivxiaserpxeeexi xeaxklkexlxifk >c9h1lH_ AYIDVECNDEAGKAIYERIIQTSLEDLVLGKSIIKAKMICKQDVPYFIIGILPKSKEDFIDRVLDFMNRVFPEGMRIRKTIRDKTIVMVASEKPIEEEWM NEAVKLQEELKIFK >UniRef50_C9RF24(29-207:215) Methanogenesis marker protein 17 n=1 Tax=Methanocaldococcus vulcanius M7 RepID=C9RF24_METVM E=4e-34 s/c=0.81 id=61% cov=98% AEIIVHCEDEAGKNIYTKVIQTALEDLILGKSIIRVEFIAKEKVPYFILGVLPKhtrraiklrdfaeiaeqkkengktiyklkitdetylpyllkkihvi dqpsrfevitdsdidldmevydASKDFLDKVMDFMGRVFPEGMRVKNTYIDKAIVSIASERPFEEEEIKEALKLKEKLE--- >UniRef50_Q58212(2-180:188) Uncharacterized protein MJ0802 n=11 Tax=Methanococcales RepID=Y802_METJA E=3e-32 s/c=0.78 id=58% cov=98% AEIVVHCEDKAGKEIYTKVIQTALEDLLLGKSIIRVEFIAKEKEPYFILGVLPKhtrraiklrdfaeiveqkkeggkiiyklkitdetylphllkkihvi dqpsrfevvtdsdidldmevydAGKDFIDKVMDFMGRVFPEGMRIKNTYIDKAIVCIASERPLKDEEIEEALKLKDKLE--- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * A 1 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1365 0 0 Y 2 * * * 688 * * * * * * * * * * * * * * * 1399 2 0 * * * * * * 1365 0 0 I 3 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1365 0 0 D 4 * * 1399 * * * * 1703 * * * * * * * * * 1672 * * 4 0 * * * * * * 1365 0 0 V 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 5 0 * * * * * * 1365 0 0 E 6 * * * 1399 * * 688 * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1365 0 0 C 7 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1365 0 0 N 8 * * * 688 * * * * * * * 1399 * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1365 0 0 D 9 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1365 0 0 E 10 * * * 543 * * * * 1672 * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1365 0 0 A 11 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1365 0 0 G 12 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1365 0 0 K 13 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1365 0 0 A 14 1399 * * 1672 * * * * * * * 1703 * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1365 0 0 I 15 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1365 0 0 Y 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 16 0 * * * * * * 1365 0 0 E 17 * * * 1399 * * * * * * * * * * * * 688 * * * 17 0 * * * * * * 1365 0 0 R 18 * * * * * * * * 688 * * * * * 1399 * * * * * 18 0 * * * * * * 1365 0 0 I 19 * * * * * * * 1399 * * * * * * * * * 688 * * 19 0 * * * * * * 1365 0 0 I 20 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1365 0 0 Q 21 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 21 0 * * * * * * 1365 0 0 T 22 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 22 0 * * * * * * 1365 0 0 S 23 688 * * * * * * * * * * * * * * 1399 * * * * 23 0 * * * * * * 1365 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1365 0 0 E 25 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1365 0 0 D 26 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1365 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1365 0 0 V 28 * * * * * * * 1703 * 1672 * * * * * * * 1399 * * 28 0 * * * * * * 1365 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1365 0 0 G 30 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1365 0 0 K 31 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1365 0 0 S 32 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 32 0 * * * * * * 1365 0 0 I 33 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1365 0 0 I 34 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1365 0 0 K 35 * * * * * * * * 1399 * * * * * 688 * * * * * 35 0 * * * * * * 1365 0 0 A 36 1399 * * * * * * * * * * * * * * * * 688 * * 36 0 * * * * * * 1365 0 0 K 37 * * * 688 * * * * 1399 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1365 0 0 M 38 * * * * 688 * * * * * 1399 * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1365 0 0 I 39 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1365 0 0 C 40 688 1399 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1365 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1365 0 0 Q 42 * * * 688 * * * * * * * * * 1399 * * * * * * 42 0 * * * * * * 1365 0 0 D 43 * * 1399 * * * * * 688 * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1365 0 0 V 44 * * * 1672 * * * * * * * * * * * * * 543 * * 44 0 * * * * * * 1365 0 0 P 45 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1365 0 0 Y 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 46 0 * * * * * * 1365 0 0 F 47 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1365 0 0 I 48 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1365 0 0 I 49 * * * * * * * 1399 * 688 * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1365 0 0 G 50 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1365 0 0 I 51 * * * * * * * 1399 * * * * * * * * * 688 * * 51 0 * * * * * * 1365 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1365 0 0 P 53 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1365 0 0 K 54 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 54 1399 688 * 6087 21 * * 1365 1091 0 S 55 688 * * * * * * * * * * * * * * 1399 * * * * 55 0 * * * * * * 1365 0 0 K 56 * * * * * 1672 * * 1399 * * * * * * 1703 * * * * 56 0 * * * * * * 1365 0 0 E 57 * * * 1399 * * * * 688 * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1365 0 0 D 58 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1365 0 0 F 59 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1365 0 0 I 60 * * * * * * * 529 * 1703 * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1365 0 0 D 61 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1365 0 0 R 62 * * * * * * * * 688 * * * * * 1399 * * * * * 62 0 * * * * * * 1365 0 0 V 63 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 63 0 * * * * * * 1365 0 0 L 64 * * * * * * * * * 1399 688 * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1365 0 0 D 65 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1365 0 0 F 66 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1365 0 0 M 67 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1365 0 0 N 68 * * * * * 688 * * * * * 1399 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1365 0 0 R 69 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 69 0 * * * * * * 1365 0 0 V 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 70 0 * * * * * * 1365 0 0 F 71 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1365 0 0 P 72 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1365 0 0 E 73 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1365 0 0 G 74 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1365 0 0 M 75 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1365 0 0 R 76 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 76 0 * * * * * * 1365 0 0 I 77 * * * * * * * 529 * * * * * * * * * 1703 * * 77 0 * * * * * * 1365 0 0 R 78 * * * * * * * * 688 * * * * * 1399 * * * * * 78 0 * * * * * * 1365 0 0 K 79 * * * * * * * * 1399 * * 688 * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1365 0 0 T 80 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 80 0 * * * * * * 1365 0 0 I 81 * * * * * * * 1399 * * * * * * * * * * * 688 81 0 * * * * * * 1365 0 0 R 82 * * * * * * * 688 * * * * * * 1399 * * * * * 82 0 * * * * * * 1365 0 0 D 83 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1365 0 0 K 84 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1365 0 0 T 85 688 * * * * * * * * * * * * * * * 1399 * * * 85 0 * * * * * * 1365 0 0 I 86 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1365 0 0 V 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 87 0 * * * * * * 1365 0 0 M 88 * 1672 * * * * * * * * 1399 * * * * 1703 * * * * 88 0 * * * * * * 1365 0 0 V 89 * * * * * * * 688 * * * * * * * * * 1399 * * 89 0 * * * * * * 1365 0 0 A 90 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1365 0 0 S 91 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 91 0 * * * * * * 1365 0 0 E 92 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1365 0 0 K 93 * * * * * * * * 1399 * * * * * 688 * * * * * 93 0 * * * * * * 1365 0 0 P 94 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1365 0 0 I 95 * * * * 1703 * * 1399 * 1672 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1365 0 0 E 96 * * * 543 * * * * 1672 * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1365 0 0 E 97 * * 1672 543 * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1365 0 0 E 98 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1365 0 0 W 99 * * * 688 * * * * * * * * * * * * * * 1399 * 99 0 * * * * * * 1365 0 0 M 100 * * * * * * * 688 * * 1399 * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1365 0 0 N 101 * * * 1672 * * * * 1703 * * 1399 * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1365 0 0 E 102 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1365 0 0 A 103 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1365 0 0 V 104 * * * * * * * * * 688 * * * * * * * 1399 * * 104 0 * * * * * * 1365 0 0 K 105 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1365 0 0 L 106 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1365 0 0 Q 107 * * * * * * * * 688 * * * * 1399 * * * * * * 107 0 * * * * * * 1365 0 0 E 108 * * 1672 543 * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1365 0 0 E 109 * * * 1399 * * * * 688 * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1365 0 0 L 110 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1365 0 0 K 111 * * * 688 * * * * 1399 * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1365 0 0 I 112 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 F 113 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 K 114 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 114 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //