HHsearch 1.5 NAME c9ghiB_ FAM FILE c9ghiB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9ghiB_.a3m DATE Sat Jun 14 10:08:22 2025 LENG 143 match states, 143 columns in multiple alignment FILT 6 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.8 EVD 0.4138 -0.3521 SEQ >ss_pred CCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCC CCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9222899999999996376101750233312220077886888752375313456887665554235688999999958987573036765102358445 7546883068531335431589986778999999898886319 >Consensus fxWslsyCLexWxixxaxiKCFgNtavAKCNxxHdxEFCDmlrLfdyNknaxlnlxxxxiNxlISDxllmrnxlkxlmxiPYCNYtKFWYvnhtxtgxhs lPxCWLxxNGSYLNetxFxxxwxxEsdxlxtEmLxkeYxxRQg >c9ghiB_ FSWSLTYCLEEWMLIAAKMKCFGNTAVAKCNQDHDSEFCDMLRLFDYNKNAEINLCSQTVNALISDNLLMKNKIKELMSIPYCNYTKFWYVNHTLTGQHT LPRCWLIRNGSYLNTSEFRNDWILESDHLISEMLSKEYAERQG >UniRef50_Q911P0(249-411:480) Glycoprotein G2 n=5 Tax=New world arenaviruses RepID=GLYC_WWAVU E=2e-62 s/c=1.47 id=69% cov=101% FAWSLSdatgtdmpggYCLEKWMLISSELKCFGNTAIAKCNLDHSSEFCDMLKLFEFNRNAiktlqndskhQLDMIITAVNSLISDNTLMKNRLKELINI PYCNYTKFWYVNHTGFNVHSLPRCWLTKNGSYLNVSDFRNQWLLESDHLISEILSREYEARQG >UniRef50_Q9DK03(275-437:507) Glycoprotein G2 n=14 Tax=New world arenaviruses RepID=GLYC_ALLVP E=2e-61 s/c=1.45 id=58% cov=101% FTWDISdssgahvpggYCLEQWAIVWAGIKCFDNAVMAKCNKDHNVEFCDTMRLFDFNQNAiktlqlnvenSVNLLKRSINGLISDSLVIRNSLKQLAKI PYCNYTKFWYVNDTITGKHSLPQCWLMRNGSYLNETHFKNEWLWESQNLYNEMLLKEYEDRQG >UniRef50_P07399(268-430:498) Glycoprotein G2 n=93 Tax=Old world arenaviruses RepID=GLYC_LYCVW E=4e-61 s/c=1.44 id=58% cov=101% FTWTLSdssgvenpggYCLTKWMILAAELKCFGNTAVAKCNVNHDEEFCDMLRLIDYNKAAlskfkqdvesALHVFKTTLNSLISDQLLMRNHLRDLMGV PYCNYSKFWYLEHAKTGETSVPKCWLVTNGSYLNETHFSDQIEQEADNMITEMLRKDYIKRQG >UniRef50_Q84168(186-518:518) Glycoprotein G2 n=12 Tax=New world arenaviruses RepID=GLYC_OLVVA E=1e-151 s/c=0.72 id=67% cov=101% LTWTLSdatgndlpggYCLEQWAIVWAGIKCFGNTAVAKCNQNHDSEFCDMLRLFDYNRNAikslndqsqsRLNLLTNTINSLISDNLLMKNKLAEIMNI PYCNYTKFWYINDTRTGRHTLPQCWLISNGSYLNETKFRTQWLSESNALYTEMLTEDYDKRQG >UniRef50_C5ILC1(183-453:454) Glycoprotein n=1 Tax=Lujo virus RepID=C5ILC1_9VIRU E=1e-107 s/c=0.87 id=62% cov=101% FQWSLSdetgsplpggHCLERWLIFASDIKCFDNAAIAKCNKEHDEEFCDMLRLFDYNKasiaklrgeaSSSINLLSGRINAIISDTLLMRSSLKRLMGI PYCNYTKFWYLNHTKLGIHSLPRCWLVSNGSYLNETKFTHDMEDEADKLLTEMLKKEYVRRQE # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * F 1 * * * * 237 * * * * 2722 * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1791 0 0 S 2 2550 * * * * * * * * * * * * 2550 * 2727 979 * * * 2 0 * * * * * * 1791 0 0 W 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 3 0 * * * * * * 1791 0 0 S 4 * * 2506 * * * * * * * * * * * * 1022 1593 * * * 4 0 * * * * * * 1791 0 0 L 5 * * * * * * * 2506 * 279 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1791 0 0 T 6 * * * * * * * * * * * * * * * 236 2727 * * * 6 2727 236 * 3322 152 * * 1791 1760 0 Y 7 * * * * * * 2550 * * * * * * * * * * * * 270 7 0 * * * * * * 1791 0 0 C 8 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1791 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1791 0 0 E 10 * * * 286 * * * * * * * * * * * * 2475 * * * 10 0 * * * * * * 1791 0 0 E 11 * * * 2727 * * * * 1512 * * * * 1610 2550 * * * * * 11 0 * * * * * * 1791 0 0 W 12 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 12 0 * * * * * * 1791 0 0 M 13 1610 * * * * * * * * 2550 995 * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1791 0 0 L 14 * * * * * * * 560 * 1636 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1791 0 0 I 15 * * * * 2550 * * 1636 * 2475 * * * * * * * 1610 * * 15 0 * * * * * * 1791 0 0 A 16 995 * * * * * * * * * * * * * * 2550 * * 1610 * 16 0 * * * * * * 1791 0 0 A 17 603 * * * * * * * * * * * * * * 1550 * * * * 17 0 * * * * * * 1791 0 0 K 18 * * 2550 1512 * 1610 * * 2727 * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1791 0 0 M 19 * * * * * * * 1005 * 1512 2727 * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1791 0 0 K 20 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1791 0 0 C 21 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1791 0 0 F 22 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1791 0 0 G 23 * * 1528 * * 615 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1791 0 0 N 24 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1791 0 0 T 25 1528 * * * * * * * * * * * * * * * 615 * * * 25 0 * * * * * * 1791 0 0 A 26 279 * * * * * * * * * * * * * * * * 2506 * * 26 0 * * * * * * 1791 0 0 V 27 * * * * * * * 1550 * * 2506 * * * * * * 1052 * * 27 0 * * * * * * 1791 0 0 A 28 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1791 0 0 K 29 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1791 0 0 C 30 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1791 0 0 N 31 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1791 0 0 Q 32 * * * * * * * * 1528 2550 * * * 1725 * * * 2475 * * 32 0 * * * * * * 1791 0 0 D 33 * * 1006 2550 * * * * * * * 1593 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1791 0 0 H 34 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1791 0 0 D 35 * * 614 * * * * * * * * 2506 * * * 2550 * * * * 35 0 * * * * * * 1791 0 0 S 36 * * * 1512 * * * * * * * * * * * 1079 * 2506 * * 36 0 * * * * * * 1791 0 0 E 37 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1791 0 0 F 38 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1791 0 0 C 39 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1791 0 0 D 40 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1791 0 0 M 41 * * * * * * * * * * 279 * * * * * 2506 * * * 41 0 * * * * * * 1791 0 0 L 42 * * * * * * * * * 279 2506 * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1791 0 0 R 43 * * * * * * * * 2550 * * * * * 270 * * * * * 43 0 * * * * * * 1791 0 0 L 44 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1791 0 0 F 45 * * * * 286 * * 2475 * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1791 0 0 D 46 * * 270 2550 * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1791 0 0 Y 47 * * * * 1528 * * * * * * * * * * * * * * 614 47 0 * * * * * * 1791 0 0 N 48 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1791 0 0 K 49 * * * * * * * * 995 * * * * 2506 1634 * * * * * 49 270 2550 * 3322 152 * * 1791 1000 0 N 50 2475 * * * * * * * * * * 623 * * * 2550 * * * * 50 0 * * * * * * 1791 0 0 A 51 270 * * * * * * * * * * * * * * 2550 * * * * 51 1636 560 * 3322 152 * * 1791 1658 0 E 52 2475 * * 2727 * * * * * * * * * 2550 2722 1528 * * * * 52 0 * * * * * * 1791 0 0 I 53 * * * * * * * 1636 * 994 * * * * * * * 2506 * * 53 0 * * * * * * 1791 0 0 N 54 * * 2550 * * * 2475 * * * * 623 * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1791 0 0 L 55 * * * * * * * * * 623 2550 * * * * * * 2475 * * 55 0 * * * * * * 1791 0 0 C 56 * 2727 * * 2475 * * 2550 * 1005 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1791 0 0 S 57 * * * * * * * 2550 1490 * * * * * * 1636 2722 * * * 57 0 * * * * * * 1791 0 0 Q 58 * * * * * 2550 * * * * * 2722 * 2727 2506 * 1512 * * * 58 0 * * * * * * 1791 0 0 T 59 2550 * * * * * * * * * * * * * 2550 2506 1052 * * * 59 0 * * * * * * 1791 0 0 V 60 * * * * * * * 1005 * 2475 * * * * * * * 1636 * * 60 0 * * * * * * 1791 0 0 N 61 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1791 0 0 A 62 1636 * * * * 2506 * * * * * * * * * 994 * * * * 62 0 * * * * * * 1791 0 0 L 63 * * * * * * * 2550 * 270 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1791 0 0 I 64 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1791 0 0 S 65 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 65 0 * * * * * * 1791 0 0 D 66 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1791 0 0 N 67 * * * * * * * * * * * 1079 * 2475 * 2506 2550 * * * 67 0 * * * * * * 1791 0 0 L 68 * * * * * * * * * 270 * * * * * * 2550 * * * 68 0 * * * * * * 1791 0 0 L 69 * * * * * * * * * 279 * * * * * * * 2506 * * 69 0 * * * * * * 1791 0 0 M 70 * * * * * * * 2506 * * 279 * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1791 0 0 K 71 * * * * * * * * 1079 * * * * * 925 * * * * * 71 0 * * * * * * 1791 0 0 N 72 * * * * * * * * * * * 270 * * * 2550 * * * * 72 0 * * * * * * 1791 0 0 K 73 * * * * * * 2475 * 1725 * * * * * 2550 1528 * * * * 73 0 * * * * * * 1791 0 0 I 74 * * * * * * * 2727 * 236 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1791 0 0 K 75 2722 * * * * * * * 581 * * * * * 2475 * * * * * 75 0 * * * * * * 1791 0 0 E 76 * * 2475 1079 * * * * * * * * * 2506 2550 * * * * * 76 0 * * * * * * 1791 0 0 L 77 * * * * * * * 2722 * 237 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1791 0 0 M 78 2506 * * * * * * 2550 * * 614 * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1791 0 0 S 79 * * * * * 1512 * * 2506 * * 1634 * * * 2727 * * * * 79 0 * * * * * * 1791 0 0 I 80 * * * * * * * 286 * * * * * * * * * 2475 * * 80 0 * * * * * * 1791 0 0 P 81 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1791 0 0 Y 82 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 82 0 * * * * * * 1791 0 0 C 83 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1791 0 0 N 84 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1791 0 0 Y 85 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 85 0 * * * * * * 1791 0 0 T 86 * * * * * * * * * * * * * * * 2475 286 * * * 86 0 * * * * * * 1791 0 0 K 87 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1791 0 0 F 88 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1791 0 0 W 89 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 89 0 * * * * * * 1791 0 0 Y 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 90 0 * * * * * * 1791 0 0 V 91 * * * * * * * 2722 * 1512 * * * * * * * 1006 * * 91 0 * * * * * * 1791 0 0 N 92 * * * 2475 * * * * * * * 286 * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1791 0 0 H 93 * * 1610 * * * 573 * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1791 0 0 T 94 2475 * * * * * * * * * * * * * * * 286 * * * 94 0 * * * * * * 1791 0 0 L 95 * * * * * 2550 * 2506 1512 2727 * * * * 2722 * * * * * 95 0 * * * * * * 1791 0 0 T 96 * * * * 2550 * * * * 2550 * * * * * * 603 * * * 96 0 * * * * * * 1791 0 0 G 97 * * * * * 270 * * * * * 2550 * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1791 0 0 Q 98 * * * 2475 * * * 2550 2506 * * * * 2727 2722 * * 2550 * * 98 0 * * * * * * 1791 0 0 H 99 * * * * * * 286 * * * * * * * * * 2475 * * * 99 0 * * * * * * 1791 0 0 T 100 * * * * * * * * * * * * * * * 520 1725 * * * 100 0 * * * * * * 1791 0 0 L 101 * * * * * * * * * 286 * * * * * * * 2475 * * 101 0 * * * * * * 1791 0 0 P 102 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1791 0 0 R 103 * * * * * * * * 2475 * * * * 1610 1022 * * * * * 103 0 * * * * * * 1791 0 0 C 104 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1791 0 0 W 105 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 105 0 * * * * * * 1791 0 0 L 106 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1791 0 0 I 107 * * * * * * * 1725 * * 2506 * * * * * 2550 1512 * * 107 0 * * * * * * 1791 0 0 R 108 * * * * * * * * 2550 * * * * * 1612 1634 2475 * * * 108 0 * * * * * * 1791 0 0 N 109 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1791 0 0 G 110 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1791 0 0 S 111 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 111 0 * * * * * * 1791 0 0 Y 112 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 112 0 * * * * * * 1791 0 0 L 113 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1791 0 0 N 114 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1791 0 0 T 115 * * * 560 * * * * * * * * * * * * 2727 2550 * * 115 0 * * * * * * 1791 0 0 S 116 * * * * * * * * * * * * * * * 1636 560 * * * 116 0 * * * * * * 1791 0 0 E 117 * * 2550 2727 * * 1490 * 1634 * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1791 0 0 F 118 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1791 0 0 R 119 * * * * * * * * 2506 * * * * * 1079 2475 2550 * * * 119 0 * * * * * * 1791 0 0 N 120 * * 2475 * * * 2550 * * * * 1006 * * * * 2722 * * * 120 0 * * * * * * 1791 0 0 D 121 * * 1636 2506 * * * * * * * * * 994 * * * * * * 121 0 * * * * * * 1791 0 0 W 122 * * * * * * * 2475 * * 2550 * * * * * * * 623 * 122 0 * * * * * * 1791 0 0 I 123 * * * 1512 * * * 2727 * 1005 * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1791 0 0 L 124 * * 2550 * * * * * * 1636 * * * 2475 * 2722 * * 2506 * 124 0 * * * * * * 1791 0 0 E 125 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1791 0 0 S 126 1512 * * * * * * * * * * * * * * 623 * * * * 126 0 * * * * * * 1791 0 0 D 127 * * 573 * * * * * * * * 2722 * 2506 * * * * * * 127 0 * * * * * * 1791 0 0 H 128 2722 * * * * * 1636 * 2550 * * 1490 * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1791 0 0 L 129 * * * * * * * * * 286 2475 * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1791 0 0 I 130 * * * * * * * 995 * 2550 * * * * * * * * * 1610 130 0 * * * * * * 1791 0 0 S 131 * * * * * * * * * * * 2506 * * * 1636 994 * * * 131 0 * * * * * * 1791 0 0 E 132 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1791 0 0 M 133 * * * * * * * 2550 * * 270 * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1791 0 0 L 134 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1791 0 0 S 135 * * * * * * * * 2550 2506 * * * * 2475 1636 2722 * * * 135 0 * * * * * * 1791 0 0 K 136 * * * 2722 * * * * 561 * * * * * 2550 * * * * * 136 0 * * * * * * 1791 0 0 E 137 * * 1593 581 * * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1791 0 0 Y 138 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 138 0 * * * * * * 1791 0 0 A 139 2727 * 2722 1528 * * * 2475 * * * * * * * * * 2550 * * 139 0 * * * * * * 1791 0 0 E 140 2550 * 2506 2727 * * * * 1593 * * * * * 2550 * * * * * 140 0 * * * * * * 1791 0 0 R 141 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 141 0 * * * * * * 1791 0 0 Q 142 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 142 0 * * * * * * 1791 0 0 G 143 * * * 2550 * 270 * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * 0 * * * 1791 0 0 //