HHsearch 1.5 NAME c9fwyB_ FAM FILE c9fwyB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9fwyB_.a3m DATE Sat Jul 12 09:34:10 2025 LENG 159 match states, 159 columns in multiple alignment FILT 7 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.3649 -3.1075 SEQ >ss_pred CCCCCCEEECCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9866884751688000011012789999999999999999999986112172688999999986515200264667766676665430430124899999 95133166999998899999998528886687466970378850389999975565169 >Consensus rxrehpfivtepgexargkkngldylfxlyeqcxxflxevqxiakergekcptkvtnqvfrxakxxgaxyinkpkmrhyvhcyalhcldxxxsnxlrxxx kergenvgawrqacyxplvxxaxxxxwdidxxfnxxxklxiwyvptklrqlchxerxkh >c9fwyB_ RPREHPFVVTEPGELARGKKNGLDYLFNLYEQAGKFLEEVQHIAREKGEKCPTKVTNQVFRHAKVQGAGYINKPKMRQYVHCYALHCLASDKSDELRRCC KERGENVGAWCQACYLPLIKMAKEKSWDIEGLFNSHDKLKIWYVPKKLIQLCHQEKSKH >UniRef50_Q94IF4(189-347:349) FLORICAULA/LEAFY homolog 2 n=6 Tax=Bryophyta RepID=Q94IF4_PHYPA E=2e-84 s/c=1.96 id=76% cov=101% RPREHPFIVTEPGEPAKGKKNGLDYLFDLYEQCGKFLEEVQHIAKEKGEKCPSKVTNEVFRHAKLTGAGYINKPKMRDYVHCYALHCLDVETSNNLRKEF KERGENVGAWCQACYFPLVTLARQNEWDIDDLFNQNDKLRIWYVPTKLRQLCHIERMKH >UniRef50_O04407(244-401:404) Floricaula/leafy-like protein FL1 n=41 Tax=Embryophyta RepID=NEED_PINRA E=3e-83 s/c=1.95 id=79% cov=100% RPREHPFIVTEPGELARGKKNGLDYLFDLYEQCGKFLLEVQRIAKEKGEKCPTKVTNQVFRHAKHNGAVYINKPKMRHYVHCYALHCLDSEQSNHLRRLY KERGENVGAWRQACYYPLVAIARENNWDIEGIFNRNEKLKIWYVPTKLRQLCHMERSK- >UniRef50_Q9LLB5(222-379:387) BotdiFLO protein n=3 Tax=Tracheophyta RepID=Q9LLB5_BOTDI E=7e-83 s/c=1.94 id=74% cov=100% RPREHPFIVTEPGELARGKKNGLDYLFDLYEQCARFLGEVQQISKERGEKCPTKVTNQVFRHAKLKGASYINKPKMRHYVHCYALHCLDLEQSNHLRKLY KDRGENVGAWRQACYYPLVEMARQNGWDIEGVFNRNEKLRIWYVPTKLRQLCHIEKSK- >UniRef50_Q4TVN5(195-351:367) FLORICULA/LEAFY-like protein n=54 Tax=rosids RepID=Q4TVN5_CARPA E=1e-82 s/c=1.95 id=69% cov=99% RQREHPFIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCRDFLIQVQNIAKERGEKCPTKVTNQVFRYAKKAGASYINKPKMRHYVHCYALHCLDEKESNALRTAF KERGENVGSWRQACYKPLVAIAARQGWDIDAIFNAHPRLAIWYVPNKLRQLCHAERN-- >UniRef50_Q00958(231-387:420) Protein LEAFY n=129 Tax=Spermatophyta RepID=LFY_ARATH E=3e-88 s/c=2.07 id=69% cov=99% RQREHPFIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEKCPTKVTNQVFRYAKKSGASYINKPKMRHYVHCYALHCLDEEASNALRRAF KERGENVGSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWYVPTKLRQLCHLERN-- >UniRef50_Q84KZ6(260-417:458) LFY-like protein OrcLFY n=39 Tax=Magnoliophyta RepID=Q84KZ6_DACRO E=2e-79 s/c=1.87 id=66% cov=99% RQREHPFIVTEPGEVARAKKNGLDYLFNLYEQCHEFLLQVQSVAKERGDKCPTKVTNLVFRYAKKKvGASYINKPKMRHYVHCYALHVLDEDSSNSLRRA FKERGENVGAWRLACYKPLVAISAAHGFDIDAVFNAHPRLSIWYVPTRLRQLCHLDRS-- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * R 1 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 1 0 * * * * * * 1425 0 0 P 2 * * * * * * * * * * * * 791 1244 * * * * * * 2 0 * * * * * * 1425 0 0 R 3 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 3 0 * * * * * * 1425 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1425 0 0 H 5 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1425 0 0 P 6 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1425 0 0 F 7 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1425 0 0 V 8 * * * * * * * 255 * * * * * * * * * 2628 * * 8 0 * * * * * * 1425 0 0 V 9 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 9 0 * * * * * * 1425 0 0 T 10 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 10 0 * * * * * * 1425 0 0 E 11 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1425 0 0 P 12 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1425 0 0 G 13 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1425 0 0 E 14 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1425 0 0 L 15 * * * * * * * * * 1219 * * 2753 * * * * 1244 * * 15 0 * * * * * * 1425 0 0 A 16 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1425 0 0 R 17 * * * * * * * * 2753 * * * * * 232 * * * * * 17 0 * * * * * * 1425 0 0 G 18 2702 * * * * 241 * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1425 0 0 K 19 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1425 0 0 K 20 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1425 0 0 N 21 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1425 0 0 G 22 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1425 0 0 L 23 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1425 0 0 D 24 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1425 0 0 Y 25 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 25 0 * * * * * * 1425 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1425 0 0 F 27 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1425 0 0 N 28 * * 1265 * * * 1897 * * * * 1664 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1425 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1425 0 0 Y 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 30 0 * * * * * * 1425 0 0 E 31 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1425 0 0 Q 32 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 32 0 * * * * * * 1425 0 0 A 33 2628 255 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1425 0 0 G 34 2865 * * * * 1182 2702 * * * * * * * 1897 * * * * * 34 0 * * * * * * 1425 0 0 K 35 * * 2871 1809 * * * * 1182 * * * * * 2865 * * * * * 35 0 * * * * * * 1425 0 0 F 36 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1425 0 0 L 37 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1425 0 0 E 38 * * * 1689 * 2865 * 2871 * 1266 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1425 0 0 E 39 * * * 791 * * * * * * * * * 1244 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1425 0 0 V 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 40 0 * * * * * * 1425 0 0 Q 41 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 41 0 * * * * * * 1425 0 0 H 42 * * * * * * 1689 * * * * 2871 * 2865 2938 2702 2925 * * * 42 0 * * * * * * 1425 0 0 I 43 * * * * * * * 241 * * * * * * * * * 2702 * * 43 0 * * * * * * 1425 0 0 A 44 213 * * * * * * * * * * * * * * 2865 * * * * 44 0 * * * * * * 1425 0 0 R 45 * * * * * * * * 255 * * * * * 2628 * * * * * 45 0 * * * * * * 1425 0 0 E 46 * * 2925 204 * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1425 0 0 K 47 * * * * * * * * 1182 * * * * * 838 * * * * * 47 0 * * * * * * 1425 0 0 G 48 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1425 0 0 E 49 * * 2702 241 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1425 0 0 K 50 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1425 0 0 C 51 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1425 0 0 P 52 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1425 0 0 T 53 * * * * * * * * * * * * * * * 2753 232 * * * 53 0 * * * * * * 1425 0 0 K 54 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1425 0 0 V 55 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 55 0 * * * * * * 1425 0 0 T 56 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 56 0 * * * * * * 1425 0 0 N 57 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1425 0 0 Q 58 * * * 2753 * * * * * 2702 * * * 519 * * * * * * 58 0 * * * * * * 1425 0 0 V 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 59 0 * * * * * * 1425 0 0 F 60 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1425 0 0 R 61 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 61 0 * * * * * * 1425 0 0 H 62 * * * * * * 791 * * * * * * * * * * * * 1244 62 0 * * * * * * 1425 0 0 A 63 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1425 0 0 K 64 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1425 0 0 V 65 * * * * * * 2938 * 1244 1808 * * * * * * * 2628 * * 65 0 * * * * * * 1425 0 0 Q 66 2871 * * * * * * * 1781 * * 2938 * 2628 * 2925 2753 * * * 66 241 2702 * 0 * * * 1425 1000 0 G 67 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1425 0 0 A 68 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1425 0 0 G 69 * * * * * 1689 * * * * * * * * * 838 * 2938 * * 69 0 * * * * * * 1425 0 0 Y 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 70 0 * * * * * * 1425 0 0 I 71 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1425 0 0 N 72 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1425 0 0 K 73 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1425 0 0 P 74 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1425 0 0 K 75 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1425 0 0 M 76 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1425 0 0 R 77 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 77 0 * * * * * * 1425 0 0 Q 78 * * 2753 * * * 536 * * * * * * 2628 * * * * * * 78 0 * * * * * * 1425 0 0 Y 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 79 0 * * * * * * 1425 0 0 V 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 80 0 * * * * * * 1425 0 0 H 81 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1425 0 0 C 82 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1425 0 0 Y 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 83 0 * * * * * * 1425 0 0 A 84 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1425 0 0 L 85 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1425 0 0 H 86 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1425 0 0 C 87 * 241 * * * * * * * * * * * * * * * 2702 * * 87 0 * * * * * * 1425 0 0 L 88 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1425 0 0 A 89 2628 * 255 * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1425 0 0 S 90 * * * 1244 * * * * * 2865 * * * * * 1775 * 2753 * * 90 0 * * * * * * 1425 0 0 D 91 * * 1664 868 * * * * 2871 * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1425 0 0 K 92 2925 * * 2871 * * * * 2628 * * * * 1901 * 2702 2753 * * * 92 0 * * * * * * 1425 0 0 S 93 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 93 0 * * * * * * 1425 0 0 D 94 * * 2628 * * * * * * * * 255 * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1425 0 0 E 95 1897 * * 2628 * * 1901 * * * * 2753 * * * 2702 * * * * 95 0 * * * * * * 1425 0 0 L 96 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1425 0 0 R 97 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 97 0 * * * * * * 1425 0 0 R 98 * * * * * * * * 1808 * * * * * 792 * 2871 * * * 98 0 * * * * * * 1425 0 0 C 99 1244 2628 * 2753 * * * * * 1901 * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1425 0 0 C 100 * 2628 * * 810 * * * * * * * * * * * * * * 1901 100 0 * * * * * * 1425 0 0 K 101 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1425 0 0 E 102 * * 2865 213 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1425 0 0 R 103 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 103 0 * * * * * * 1425 0 0 G 104 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1425 0 0 E 105 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1425 0 0 N 106 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1425 0 0 V 107 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 107 0 * * * * * * 1425 0 0 G 108 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1425 0 0 A 109 451 * * * * * * * * * * * * * * 1897 * * * * 109 0 * * * * * * 1425 0 0 W 110 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 110 0 * * * * * * 1425 0 0 C 111 * 1689 * * * * * * * * * * * * 536 * * * * * 111 0 * * * * * * 1425 0 0 Q 112 * * * * * * * * * 2702 * * * 241 * * * * * * 112 0 * * * * * * 1425 0 0 A 113 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1425 0 0 C 114 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1425 0 0 Y 115 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 115 0 * * * * * * 1425 0 0 L 116 * * * * 2753 * * * 1244 2628 * * * * * * * * * 1901 116 0 * * * * * * 1425 0 0 P 117 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1425 0 0 L 118 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1425 0 0 I 119 * * * * * * * 2628 * * * * * * * * * 255 * * 119 0 * * * * * * 1425 0 0 K 120 1248 * * 2865 * * * * 2628 * * 2925 * * * * 2753 * * * 120 0 * * * * * * 1425 0 0 M 121 * * * * * * * 856 * 2753 1742 * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1425 0 0 A 122 241 * * * * * * * * * * * * * * 2702 * * * * 122 0 * * * * * * 1425 0 0 K 123 1784 2925 * * * * * * 2628 * * * * * 1265 * * * * * 123 0 * * * * * * 1425 0 0 E 124 2702 * * 1775 * * * * * * * * * 1808 1897 * * * * * 124 0 * * * * * * 1425 0 0 K 125 * * * * * * 1809 * 2628 * * 1265 * 2871 * * * * * * 125 0 * * * * * * 1425 0 0 S 126 * * * 2753 * 838 * * * * * 2938 * * * 2628 * * * * 126 0 * * * * * * 1425 0 0 W 127 * * * * 2702 * * * * * * * * * * * * * 241 * 127 0 * * * * * * 1425 0 0 D 128 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1425 0 0 I 129 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1425 0 0 E 130 * * 810 1219 * * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1425 0 0 G 131 1244 * 2753 * * 1219 * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1425 0 0 L 132 * * * * * * * 1904 * 1689 * * * * * * * 1242 * * 132 0 * * * * * * 1425 0 0 F 133 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1425 0 0 N 134 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1425 0 0 S 135 1244 * * * * * * * * * * * * 2753 1901 2628 * * * * 135 0 * * * * * * 1425 0 0 H 136 * * * * * * 776 * * * * 1265 * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1425 0 0 D 137 * * 1689 1901 * * * * * * * * 1244 * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1425 0 0 K 138 * * * * * * * * 791 * * * * * 1244 * * * * * 138 0 * * * * * * 1425 0 0 L 139 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1425 0 0 K 140 2871 * * * * * * * 1775 * * * * * 1808 1809 * * * * 140 0 * * * * * * 1425 0 0 I 141 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1425 0 0 W 142 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 142 0 * * * * * * 1425 0 0 Y 143 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 143 0 * * * * * * 1425 0 0 V 144 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 144 0 * * * * * * 1425 0 0 P 145 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1425 0 0 K 146 * * * * * * * * 2628 * * 2871 * * * * 511 * * * 146 0 * * * * * * 1425 0 0 K 147 * * * * * * * * 241 * * * * * 2702 * * * * * 147 0 * * * * * * 1425 0 0 L 148 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1425 0 0 I 149 * * * * * * * 2628 * * * * * * 255 * * * * * 149 0 * * * * * * 1425 0 0 Q 150 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 150 0 * * * * * * 1425 0 0 L 151 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1425 0 0 C 152 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1425 0 0 H 153 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1425 0 0 Q 154 2871 * * * * * * 1808 * 1809 2938 * * 2628 * * * * * * 154 0 * * * * * * 1425 0 0 E 155 * * 2702 241 * * * * * * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1425 0 0 K 156 * * * * * * * * 1742 * * * * * 513 * * * * * 156 0 * * * * * * 1425 0 0 S 157 * * * * * * * * * * 2753 1897 * * * 778 * * * * 157 0 * * * * * * 1425 0 0 K 158 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1274 0 0 H 159 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 159 0 * * 0 * * * 1180 0 0 //