HHsearch 1.5 NAME c9fq6E_ FAM FILE c9fq6E_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9fq6E_.a3m DATE Sat Jun 28 10:21:14 2025 LENG 111 match states, 111 columns in multiple alignment FILT 5 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.7 EVD 0.3716 -1.7497 SEQ >ss_pred CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEECCCCCCHHHHHHHHHH HHHHHHHCCCC >ss_conf 9877267899999999997655545999886998766577628630244301288899999999999752898589924883712133785778999999 99999722479 >Consensus xxxxxxxxisxrixxiKxrYTRRiSLfEitGIlaESyNLLqRGRlPLvxdxsdxtxxxxxlxvxvxEiEegxCPiVixKNGellSxxDFDxxglryHLdY ixxiWkxQxry >c9fq6E_ DIIDYESHIGNHISALKRRYTRRISLFEIAGIIAESYNLLQRGRLPLVSEFSDETMKQNMLHVIIQEIEEGSCPIVIEKNGELLSVNDFDKDGLKFHLDY IIKIWKLQKRY >UniRef50_Q98275(1-165:165) MC108R n=1 Tax=Molluscum contagiosum virus subtype 1 RepID=Q98275_MCV1 E=5e-69 s/c=1.00 id=64% cov=101% ETQSPPRQISERIADIKRRYTRRISLFEITGILCESFNLLQRGRLPLVSDLSDETFREEILHVVVREIEEGTCPVVIQKNGELLSVTDFDATGLRYHLDY IISIWKQQHRY >UniRef50_Q05569(1-166:167) DNA-directed RNA polymerase 19 kDa subunit n=3 Tax=Avipoxvirus RepID=RPO7_FOWPV E=5e-55 s/c=0.97 id=54% cov=100% TQSPHPKQLSERIKAIKQRYTRRISLFEITGILSESYNLLQRGRIPLLNDLTEETFKDSIINIMFKEIEQGNCPIVIQKNGELLSLTDFDKKGVQYHLDY IKTIWRNQRK- >UniRef50_Q070C5(1-157:158) RNA polymerase subunit RPO19 n=1 Tax=Crocodilepox virus RepID=Q070C5_CPRV E=2e-54 s/c=0.91 id=55% cov=97% SGIE---NVSEKILEIKRNYTRRISLLELTGILAESYNLLQRGRLPLVNDLSEATFRKSLLQIFIQEIEEDNCPVVVCKNGRLMSLKDFDPDGVRYHLDY IKSLWKQQRK- >UniRef50_Q6TVN9(70-172:173) ORF081 RNA polymerase subunit RPO19 n=5 Tax=Parapoxvirus RepID=Q6TVN9_ORFV E=5e-42 s/c=1.37 id=55% cov=94% ------QRVTARVEELKARYTRRMSLFELTGIVAESFNLLCRGRLPLVADAADPAL-DNELKVVVRELEEGVCPIVIEKNGEFLSPGDFDPECLRYHLTY MTDLWKSQGR- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * D 1 * * 1928 2090 * * * * * * * * * * * 2004 1983 * * * 1 0 * * * * * * 1618 0 0 I 2 * * * * * 2004 * 1928 * * * * * 1983 * * 2090 * * * 2 0 * * * * * * 1618 0 0 I 3 * * * * * * * 965 * * * * * 2090 * 1983 * * * * 3 0 * * * * * * 1618 0 0 D 4 * * 1928 2004 * * * * * * * * 1983 * * 2090 * * * * 4 414 * 2004 * * * * 1618 0 0 Y 5 * * * * * * 1546 * * * * * 1656 * * * * * * 1556 5 0 * * * * * 0 1490 0 1000 E 6 * * * 1556 * * * * * * * * 600 * * * * * * * 6 0 * * * * * 0 1490 0 1000 S 7 * * * * * * * * 1946 * * * * 1872 2161 2037 * * * * 7 0 * * * * 0 * 1656 0 1000 H 8 * * * * * * 2334 * * * * 2330 * 1412 2140 * * * * * 8 0 * * * * * * 1737 0 0 I 9 * * * * * * * 1424 * 2311 * * * * * * * 1232 * * 9 0 * * * * * * 1737 0 0 G 10 * * * * * 2334 * * * * * * * * * 799 2140 * * * 10 0 * * * * * * 1737 0 0 N 11 2140 * * 799 * * * * * * * 2334 * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1737 0 0 H 12 * * * * * * 2334 * 2330 * * * * * 730 * * * * * 12 0 * * * * * * 1737 0 0 I 13 * * * * * * * 371 * * * * * * * * * 2140 * * 13 0 * * * * * * 1737 0 0 S 14 2520 * * 2140 * * * * 2311 2330 * * * * * 2334 * * * * 14 0 * * * * * * 1737 0 0 A 15 1322 * 2520 1232 * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1737 0 0 L 16 * * * * * * * 799 * 1234 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1737 0 0 K 17 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1737 0 0 R 18 2140 * * * * * * * * * * * * 2311 807 * * * * * 18 0 * * * * * * 1737 0 0 R 19 * * * * * * * * * * * 2330 * * 320 * * * * * 19 0 * * * * * * 1737 0 0 Y 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 20 0 * * * * * * 1737 0 0 T 21 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 21 0 * * * * * * 1737 0 0 R 22 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 22 0 * * * * * * 1737 0 0 R 23 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 23 0 * * * * * * 1737 0 0 I 24 * * * * * * * 371 * * 2140 * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1737 0 0 S 25 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 25 0 * * * * * * 1737 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1737 0 0 F 27 * * * * 320 * * * * 2330 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1737 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1737 0 0 I 29 * * * * * * * 800 * 1232 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1737 0 0 A 30 2334 * * * * * * * * * * * * * * * 319 * * * 30 0 * * * * * * 1737 0 0 G 31 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1737 0 0 I 32 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1737 0 0 I 33 * * * * * * * 2334 * 799 * * * * * * * 2140 * * 33 0 * * * * * * 1737 0 0 A 34 680 2520 * * * * * * * * * * * * * 2311 * * * * 34 0 * * * * * * 1737 0 0 E 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1737 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 36 0 * * * * * * 1737 0 0 Y 37 * * * * 1317 * * * * * * * * * * * * * * 740 37 0 * * * * * * 1737 0 0 N 38 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1737 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1737 0 0 L 40 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1737 0 0 Q 41 * 2140 * * * * * * * * * * * 371 * * * * * * 41 0 * * * * * * 1737 0 0 R 42 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 42 0 * * * * * * 1737 0 0 G 43 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1737 0 0 R 44 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 44 0 * * * * * * 1737 0 0 L 45 * * * * * * * 2311 * 325 * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1737 0 0 P 46 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1737 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1737 0 0 V 48 * * * * * * * * * 2311 * * * * * * * 325 * * 48 0 * * * * * * 1737 0 0 S 49 2140 * * * * * * * * * * 1320 * * * 1424 * * * * 49 0 * * * * * * 1737 0 0 E 50 * * 319 2334 * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1737 0 0 F 51 2140 * * * 2334 * * * * 799 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1737 0 0 S 52 2140 * * * * * * * * * * * * * * 807 2311 * * * 52 0 * * * * * * 1737 0 0 D 53 * * 738 1320 * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1737 0 0 E 54 2330 * * 800 * * * * * * * * 2140 * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1737 0 0 T 55 2140 * * * * * * * * * * * * * * * 371 * * * 55 0 * * * * * * 1737 0 0 M 56 * * * * 799 * * * * 2140 2334 * * * * * * * * * 56 371 * 2140 * * * * 1737 0 0 K 57 * * * * * * * * 955 * * * * * 1047 * * * * * 57 0 * * * * 0 * 1618 0 1000 Q 58 * * 1223 2520 * * * * 2330 * * * * 2334 * * * * * * 58 0 * * * * * * 1737 0 0 N 59 * * * 2520 * * * * * * * 1234 * * * 1320 * * * * 59 0 * * * * * * 1737 0 0 M 60 * * * 2140 * * * 1412 * 2330 2334 * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1737 0 0 L 61 * * * * * * * 2311 * 325 * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1737 0 0 H 62 * * * * * * 1424 * 2140 * * 2311 * 2330 * * * * * * 62 0 * * * * * * 1737 0 0 V 63 * * * * * * * 1320 * * * * * * * * * 738 * * 63 0 * * * * * * 1737 0 0 I 64 * * * * 2330 * * 2334 * * 2311 * * * * * * 1317 * * 64 0 * * * * * * 1737 0 0 I 65 * * * * 2311 * * 1332 * * * * * * * * * 1317 * * 65 0 * * * * * * 1737 0 0 Q 66 * * * * * * * * 2311 * * * * 1332 1317 * * * * * 66 0 * * * * * * 1737 0 0 E 67 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1737 0 0 I 68 * * * * * * * 371 * 2140 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1737 0 0 E 69 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1737 0 0 E 70 * * * 325 * * * * * * * * * 2311 * * * * * * 70 0 * * * * * * 1737 0 0 G 71 * * 2330 * * 320 * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1737 0 0 S 72 * * * * * * * * * * * 1320 * * * 2334 2520 2140 * * 72 0 * * * * * * 1737 0 0 C 73 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1737 0 0 P 74 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1737 0 0 I 75 * * * * * * * 674 * * * * * * * * * 1422 * * 75 0 * * * * * * 1737 0 0 V 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 76 0 * * * * * * 1737 0 0 I 77 * * * * * * * 320 * * * * * * * * * 2330 * * 77 0 * * * * * * 1737 0 0 E 78 * 2330 * 1234 * * * * * * * * * 1412 * * * * * * 78 0 * * * * * * 1737 0 0 K 79 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1737 0 0 N 80 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1737 0 0 G 81 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1737 0 0 E 82 * * * 320 * * * * * * * * * * 2330 * * * * * 82 0 * * * * * * 1737 0 0 L 83 * * * * 2140 * * * * 371 * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1737 0 0 L 84 * * * * * * * * * 320 2330 * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1737 0 0 S 85 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 85 0 * * * * * * 1737 0 0 V 86 * * * * * * * * * 1320 * * 2140 * * * * 1424 * * 86 0 * * * * * * 1737 0 0 N 87 * * * * * 2140 * * 2330 * * 2334 * * * * 1412 * * * 87 0 * * * * * * 1737 0 0 D 88 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1737 0 0 F 89 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1737 0 0 D 90 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1737 0 0 K 91 2520 * * * * * * * 1322 * * * 1232 * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1737 0 0 D 92 * * 1332 2140 * * * * 2311 * * * * * * * 2520 * * * 92 0 * * * * * * 1737 0 0 G 93 * 2140 * * * 371 * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1737 0 0 L 94 * * * * * * * * * 738 * * * * * * * 1320 * * 94 0 * * * * * * 1737 0 0 K 95 * * * * * * * * 2334 * * * * 2311 737 * * * * * 95 0 * * * * * * 1737 0 0 F 96 * * * * 2334 * * * * * * * * * * * * * * 319 96 0 * * * * * * 1737 0 0 H 97 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1737 0 0 L 98 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1737 0 0 D 99 * * 371 * * * * * * * * * * * * * 2140 * * * 99 0 * * * * * * 1737 0 0 Y 100 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 100 0 * * * * * * 1737 0 0 I 101 * * * * * * * 371 * * 2140 * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1737 0 0 I 102 * * * * * * * 1424 1320 * * * * * * * 2140 * * * 102 0 * * * * * * 1737 0 0 K 103 * * 2140 * * * * * 2334 * * * * * * 1422 2311 * * * 103 0 * * * * * * 1737 0 0 I 104 * * * * * * * 800 * 1232 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1737 0 0 W 105 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 105 0 * * * * * * 1737 0 0 K 106 * * * * * * * * 325 * * * * * 2311 * * * * * 106 0 * * * * * * 1737 0 0 L 107 * * * * * * * * * 2334 * 2311 * 1422 * 2140 * * * * 107 0 * * * * * * 1737 0 0 Q 108 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 108 0 * * * * * * 1737 0 0 K 109 * * * * * 2140 2520 * 2334 * * * * * 1320 * * * * * 109 0 * * * * * * 1737 0 0 R 110 * * * * * * * * 1320 * * * * * 738 * * * * * 110 0 * * * * * * 1737 0 0 Y 111 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 111 0 * * 0 * * * 1276 0 0 //