HHsearch 1.5 NAME c9exnE_ FAM FILE c9exnE_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9exnE_.a3m DATE Sat Nov 29 10:20:06 2025 LENG 103 match states, 103 columns in multiple alignment FILT 5 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.7 EVD 0.3782 -1.3733 SEQ >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC CCC >ss_conf 9038999999765554599988699876657762863024420128889999999999975289858992388371212378577899999999999722 479 >Consensus isxrixxiKxrYTRRiSLfEitGIlaESyNLLqRGRlPLvxdxsdxtxxxxxlxvxxxEiEegxCPiVixKNGellSxxDFDxxglryHLdYixxiWkxQ xry >c9exnE_ IGNHISALKRRYTRRISLFEIAGIIAESYNLLQRGRLPLVSEFSDETMKQNMLHVIIQEIEEGSCPIVIEKNGELLSVNDFDKDGLKFHLDYIIKIWKLQ KRY >UniRef50_Q98275(63-165:165) MC108R n=1 Tax=Molluscum contagiosum virus subtype 1 RepID=Q98275_MCV1 E=6e-39 s/c=1.56 id=69% cov=101% ISERIADIKRRYTRRISLFEITGILCESFNLLQRGRLPLVSDLSDETFREEILHVVVREIEEGTCPVVIQKNGELLSVTDFDATGLRYHLDYIISIWKQQ HRY >UniRef50_Q05569(65-166:167) DNA-directed RNA polymerase 19 kDa subunit n=3 Tax=Avipoxvirus RepID=RPO7_FOWPV E=8e-33 s/c=1.37 id=58% cov=100% LSERIKAIKQRYTRRISLFEITGILSESYNLLQRGRIPLLNDLTEETFKDSIINIMFKEIEQGNCPIVIQKNGELLSLTDFDKKGVQYHLDYIKTIWRNQ RK- >UniRef50_Q6TVN9(72-172:173) ORF081 RNA polymerase subunit RPO19 n=5 Tax=Parapoxvirus RepID=Q6TVN9_ORFV E=2e-41 s/c=1.67 id=56% cov=99% VTARVEELKARYTRRMSLFELTGIVAESFNLLCRGRLPLVADAADPAL-DNELKVVVRELEEGVCPIVIEKNGEFLSPGDFDPECLRYHLTYMTDLWKSQ GR- >UniRef50_Q070C5(1-157:158) RNA polymerase subunit RPO19 n=1 Tax=Crocodilepox virus RepID=Q070C5_CPRV E=1e-53 s/c=0.89 id=56% cov=100% VSEKILEIKRNYTRRISLLELTGILAESYNLLQRGRLPLVNDLSEATFRKSLLQIFIQEIEEDNCPVVVCKNGRLMSLKDFDPDGVRYHLDYIKSLWKQQ RK- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * I 1 * * * * * * * 1429 * 2309 * * * * * * * 1228 * * 1 0 * * * * * * 1710 0 0 G 2 * * * * * 2341 * * * * * * * * * 795 2143 * * * 2 0 * * * * * * 1710 0 0 N 3 2143 * * 795 * * * * * * * 2341 * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1710 0 0 H 4 * * * * * * 2341 * 2320 * * * * * 731 * * * * * 4 0 * * * * * * 1710 0 0 I 5 * * * * * * * 370 * * * * * * * * * 2143 * * 5 0 * * * * * * 1710 0 0 S 6 2522 * * 2143 * * * * 2309 2320 * * * * * 2341 * * * * 6 0 * * * * * * 1710 0 0 A 7 1325 * 2522 1228 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1710 0 0 L 8 * * * * * * * 795 * 1239 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1710 0 0 K 9 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1710 0 0 R 10 2143 * * * * * * * * * * * * 2309 807 * * * * * 10 0 * * * * * * 1710 0 0 R 11 * * * * * * * * * * * 2320 * * 323 * * * * * 11 0 * * * * * * 1710 0 0 Y 12 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 12 0 * * * * * * 1710 0 0 T 13 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 13 0 * * * * * * 1710 0 0 R 14 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 14 0 * * * * * * 1710 0 0 R 15 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 15 0 * * * * * * 1710 0 0 I 16 * * * * * * * 370 * * 2143 * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1710 0 0 S 17 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 17 0 * * * * * * 1710 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1710 0 0 F 19 * * * * 323 * * * * 2320 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1710 0 0 E 20 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1710 0 0 I 21 * * * * * * * 803 * 1228 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1710 0 0 A 22 2341 * * * * * * * * * * * * * * * 317 * * * 22 0 * * * * * * 1710 0 0 G 23 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1710 0 0 I 24 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1710 0 0 I 25 * * * * * * * 2341 * 795 * * * * * * * 2143 * * 25 0 * * * * * * 1710 0 0 A 26 680 2522 * * * * * * * * * * * * * 2309 * * * * 26 0 * * * * * * 1710 0 0 E 27 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1710 0 0 S 28 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 28 0 * * * * * * 1710 0 0 Y 29 * * * * 1320 * * * * * * * * * * * * * * 738 29 0 * * * * * * 1710 0 0 N 30 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1710 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1710 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1710 0 0 Q 33 * 2143 * * * * * * * * * * * 370 * * * * * * 33 0 * * * * * * 1710 0 0 R 34 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 34 0 * * * * * * 1710 0 0 G 35 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1710 0 0 R 36 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 36 0 * * * * * * 1710 0 0 L 37 * * * * * * * 2309 * 325 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1710 0 0 P 38 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1710 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1710 0 0 V 40 * * * * * * * * * 2309 * * * * * * * 325 * * 40 0 * * * * * * 1710 0 0 S 41 2143 * * * * * * * * * * 1314 * * * 1429 * * * * 41 0 * * * * * * 1710 0 0 E 42 * * 317 2341 * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1710 0 0 F 43 2143 * * * 2341 * * * * 795 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1710 0 0 S 44 2143 * * * * * * * * * * * * * * 807 2309 * * * 44 0 * * * * * * 1710 0 0 D 45 * * 742 1314 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1710 0 0 E 46 2320 * * 803 * * * * * * * * 2143 * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1710 0 0 T 47 2143 * * * * * * * * * * * * * * * 370 * * * 47 0 * * * * * * 1710 0 0 M 48 * * * * 795 * * * * 2143 2341 * * * * * * * * * 48 370 * 2143 * * * * 1710 0 0 K 49 * * * * * * * * 967 * * * * * 1033 * * * * * 49 0 * * * * 0 * 1537 0 1000 Q 50 * * 1223 2522 * * * * 2320 * * * * 2341 * * * * * * 50 0 * * * * * * 1710 0 0 N 51 * * * 2522 * * * * * * * 1239 * * * 1314 * * * * 51 0 * * * * * * 1710 0 0 M 52 * * * 2143 * * * 1412 * 2320 2341 * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1710 0 0 L 53 * * * * * * * 2309 * 325 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1710 0 0 H 54 * * * * * * 1429 * 2143 * * 2309 * 2320 * * * * * * 54 0 * * * * * * 1710 0 0 V 55 * * * * * * * 1314 * * * * * * * * * 742 * * 55 0 * * * * * * 1710 0 0 I 56 * * * * 2320 * * 2341 * * 2309 * * * * * * 1320 * * 56 0 * * * * * * 1710 0 0 I 57 * * * * 2309 * * 1330 * * * * * * * * * 1320 * * 57 0 * * * * * * 1710 0 0 Q 58 * * * * * * * * 2309 * * * * 1330 1320 * * * * * 58 0 * * * * * * 1710 0 0 E 59 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1710 0 0 I 60 * * * * * * * 370 * 2143 * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1710 0 0 E 61 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1710 0 0 E 62 * * * 325 * * * * * * * * * 2309 * * * * * * 62 0 * * * * * * 1710 0 0 G 63 * * 2320 * * 323 * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1710 0 0 S 64 * * * * * * * * * * * 1314 * * * 2341 2522 2143 * * 64 0 * * * * * * 1710 0 0 C 65 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1710 0 0 P 66 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1710 0 0 I 67 * * * * * * * 677 * * * * * * * * * 1417 * * 67 0 * * * * * * 1710 0 0 V 68 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 68 0 * * * * * * 1710 0 0 I 69 * * * * * * * 323 * * * * * * * * * 2320 * * 69 0 * * * * * * 1710 0 0 E 70 * 2320 * 1239 * * * * * * * * * 1412 * * * * * * 70 0 * * * * * * 1710 0 0 K 71 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1710 0 0 N 72 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1710 0 0 G 73 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1710 0 0 E 74 * * * 323 * * * * * * * * * * 2320 * * * * * 74 0 * * * * * * 1710 0 0 L 75 * * * * 2143 * * * * 370 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1710 0 0 L 76 * * * * * * * * * 323 2320 * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1710 0 0 S 77 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 77 0 * * * * * * 1710 0 0 V 78 * * * * * * * * * 1314 * * 2143 * * * * 1429 * * 78 0 * * * * * * 1710 0 0 N 79 * * * * * 2143 * * 2320 * * 2341 * * * * 1412 * * * 79 0 * * * * * * 1710 0 0 D 80 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1710 0 0 F 81 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1710 0 0 D 82 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1710 0 0 K 83 2522 * * * * * * * 1325 * * * 1228 * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1710 0 0 D 84 * * 1330 2143 * * * * 2309 * * * * * * * 2522 * * * 84 0 * * * * * * 1710 0 0 G 85 * 2143 * * * 370 * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1710 0 0 L 86 * * * * * * * * * 742 * * * * * * * 1314 * * 86 0 * * * * * * 1710 0 0 K 87 * * * * * * * * 2341 * * * * 2309 735 * * * * * 87 0 * * * * * * 1710 0 0 F 88 * * * * 2341 * * * * * * * * * * * * * * 317 88 0 * * * * * * 1710 0 0 H 89 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1710 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1710 0 0 D 91 * * 370 * * * * * * * * * * * * * 2143 * * * 91 0 * * * * * * 1710 0 0 Y 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 92 0 * * * * * * 1710 0 0 I 93 * * * * * * * 370 * * 2143 * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1710 0 0 I 94 * * * * * * * 1429 1314 * * * * * * * 2143 * * * 94 0 * * * * * * 1710 0 0 K 95 * * 2143 * * * * * 2341 * * * * * * 1417 2309 * * * 95 0 * * * * * * 1710 0 0 I 96 * * * * * * * 803 * 1228 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1710 0 0 W 97 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 97 0 * * * * * * 1710 0 0 K 98 * * * * * * * * 325 * * * * * 2309 * * * * * 98 0 * * * * * * 1710 0 0 L 99 * * * * * * * * * 2341 * 2309 * 1417 * 2143 * * * * 99 0 * * * * * * 1710 0 0 Q 100 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 100 0 * * * * * * 1710 0 0 K 101 * * * * * 2143 2522 * 2341 * * * * * 1314 * * * * * 101 0 * * * * * * 1710 0 0 R 102 * * * * * * * * 1314 * * * * * 742 * * * * * 102 0 * * * * * * 1710 0 0 Y 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 103 0 * * 0 * * * 1232 0 0 //