HHsearch 1.5 NAME c9e4wS_ FAM FILE c9e4wS_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9e4wS_.a3m DATE Sat Feb 1 08:46:53 2025 LENG 90 match states, 90 columns in multiple alignment FILT 1 out of 3 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4482 1.1851 SEQ >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCEEEEECCCCEEEEECCCEEEEECCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >ss_conf 976567789887478689999974002157766886089995077157873230477404310101046789999999988800253579 >Consensus kinaenfeclresklkrkvyedlvkeatfvrvspkstvcvvtdhnsfevigtssvykvenfndeigrdtalsqaldsfikflaysgelsd >c9e4wS_ KINAENFECLRESKLKRKVYEDLVKEATFVRVSPKSTVCVVTDHNSFEVIGTSSVYKVENFNDEIGRDTALSQALDSFIKFLAYSGELSD # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * K 1 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 I 2 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 N 3 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 A 4 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 E 5 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 N 6 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 F 7 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 E 8 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 C 9 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 R 11 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 E 12 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 S 13 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 K 14 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 K 16 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 R 17 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 K 18 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 V 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 20 0 * * * * * * 1000 0 0 E 21 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 D 22 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 L 23 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 V 24 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 K 25 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 E 26 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 T 28 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 F 29 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 R 31 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 V 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 S 33 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 P 34 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 K 35 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 T 37 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 V 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 C 39 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 V 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 V 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 T 42 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 D 43 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 H 44 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 N 45 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 S 46 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 F 47 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 E 48 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 V 49 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 I 50 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 G 51 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 T 52 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 S 53 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 S 54 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 V 55 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 56 0 * * * * * * 1000 0 0 K 57 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 V 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 E 59 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 N 60 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 F 61 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 N 62 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 D 63 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 E 64 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 I 65 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 G 66 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 R 67 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 D 68 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 T 69 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 A 70 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 L 71 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 S 72 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 73 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 A 74 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 L 75 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 D 76 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 S 77 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 F 78 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 I 79 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 K 80 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 F 81 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 L 82 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 A 83 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 84 0 * * * * * * 1000 0 0 S 85 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 G 86 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 E 87 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 L 88 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 S 89 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 D 90 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //