HHsearch 1.5 NAME c9e3lB_ FAM FILE c9e3lB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9e3lB_.a3m DATE Sat Nov 1 10:18:19 2025 LENG 112 match states, 112 columns in multiple alignment FILT 3 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.7 EVD 0.4032 -0.6204 SEQ >ss_pred CCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEE EEEEECCCCCCC >ss_conf 9221125787668710110211222077675679998469724543178113722567899999999998549348999756447320014564312333 133107633269 >Consensus ixtxrxTxxPAtxxxYSnVxxtRLxxxxxxxLCAVFxRdGqpVixACxSPxxGrxrxxYxxLRrxLxxixxxGlxvRVxVxxexqxxxxxxxxxxtYalT GisxCNxgxxxc >c9e3lB_ IMTTRNTGQPATDHYYSNVTATRLLSSTNSRLCAVFVRSGQPVIGACTSPYDGKYWSMYSRLRKMLYLIYVAGISVRVHVSKEEQYYDYEDATFETYALT GISICNPGSSLC >UniRef50_P04979(116-227:227) Pertussis toxin subunit 3 n=7 Tax=Bordetella RepID=TOX3_BORPE E=5e-46 s/c=1.65 id=74% cov=101% ITTIYKTGQPAADHYYSKVTATRLLASTNSRLCAVFVRDGQSVIGACASPYEGRYRDMYDALRRLLYMIYMSGLAVRVHVSKEEQYYDYEDATFQTYALT GISLCNPAASIC >UniRef50_Q7WHG5(133-241:241) Putative toxin n=3 Tax=Bordetella RepID=Q7WHG5_BORBR E=3e-41 s/c=1.55 id=36% cov=96% ----RRTLPPATGlGHYSNVLVARLDDLPFGDLCAVFTRDGNPVVQACISPQAGRlHRESYPTLRRALETLRRQGLPLRVYVDHDRRPDFAAVPDMPAYS ITGLATCNRGGCM- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * I 1 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1189 0 0 M 2 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * 2 0 * * * * * * 1189 0 0 T 3 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 3 0 * * * * * * 1189 0 0 T 4 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 4 0 * * * * * * 1189 0 0 R 5 * * * * * * * * * * * * * * 516 * * * * 1734 5 0 * * * * * * 1674 0 0 N 6 * * * * * * * * 1734 * * 1734 * * 1326 * * * * * 6 0 * * * * * * 1674 0 0 T 7 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 7 0 * * * * * * 1674 0 0 G 8 * * * * * 734 * * * 1326 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1674 0 0 Q 9 * * * * * * * * * * * * 1326 734 * * * * * * 9 0 * * * * * * 1674 0 0 P 10 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1674 0 0 A 11 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1674 0 0 T 12 1734 * * * * * * * * * * * * * * * 516 * * * 12 0 * * * * * * 1674 0 0 D 13 * * 734 * * 1326 * * * * * * * * * * * * * * 13 734 1326 * 0 * * * 1674 1000 0 H 14 * * * * * 1326 734 * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1674 0 0 Y 15 * * * * * * 1326 * * * * * * * * * * * * 734 15 0 * * * * * * 1674 0 0 Y 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 16 0 * * * * * * 1674 0 0 S 17 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 17 0 * * * * * * 1674 0 0 N 18 * * * * * * * * 1734 * * 516 * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1674 0 0 V 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 19 0 * * * * * * 1674 0 0 T 20 * * * * * * * * * 1326 * * * * * * 734 * * * 20 0 * * * * * * 1674 0 0 A 21 734 * * * * * * * * * * * * * * * * 1326 * * 21 0 * * * * * * 1674 0 0 T 22 1326 * * * * * * * * * * * * * * * 734 * * * 22 0 * * * * * * 1674 0 0 R 23 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 23 0 * * * * * * 1674 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1674 0 0 L 25 * * 1326 * * * * * * 734 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1674 0 0 S 26 1734 * 1326 * * * * * * * * * * * * 1734 * * * * 26 0 * * * * * * 1674 0 0 S 27 * * * * * * * * * 1326 * * * * * 734 * * * * 27 0 * * * * * * 1674 0 0 T 28 * * * * * * * * * * * * 1326 * * * 734 * * * 28 0 * * * * * * 1674 0 0 N 29 * * * * 1326 * * * * * * 734 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1674 0 0 S 30 * * * * * 1326 * * * * * * * * * 734 * * * * 30 0 * * * * * * 1674 0 0 R 31 * * 1326 * * * * * * * * * * * 734 * * * * * 31 0 * * * * * * 1674 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1674 0 0 C 33 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1674 0 0 A 34 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1674 0 0 V 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 35 0 * * * * * * 1674 0 0 F 36 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1674 0 0 V 37 * * * * * * * * * * * * * * * * 1326 734 * * 37 0 * * * * * * 1674 0 0 R 38 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 38 0 * * * * * * 1674 0 0 S 39 * * 516 * * * * * * * * * * * * 1734 * * * * 39 0 * * * * * * 1674 0 0 G 40 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1674 0 0 Q 41 * * * * * * * * * * * 1326 * 734 * * * * * * 41 0 * * * * * * 1674 0 0 P 42 * * * * * * * * * * * * 516 * * 1734 * * * * 42 0 * * * * * * 1674 0 0 V 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 43 0 * * * * * * 1674 0 0 I 44 * * * * * * * 734 * * * * * * * * * 1326 * * 44 0 * * * * * * 1674 0 0 G 45 * * * * * 734 * * * * * * * 1326 * * * * * * 45 0 * * * * * * 1674 0 0 A 46 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1674 0 0 C 47 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1674 0 0 T 48 1734 * * * * * * 1326 * * * * * * * * 1734 * * * 48 0 * * * * * * 1674 0 0 S 49 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 49 0 * * * * * * 1674 0 0 P 50 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1674 0 0 Y 51 * * * * * * * * * * * * * 1326 * * * * * 734 51 0 * * * * * * 1674 0 0 D 52 1326 * 1734 1734 * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1674 0 0 G 53 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1674 0 0 K 54 * * * * * * * * 1734 * * * * * 516 * * * * * 54 734 1326 * 0 * * * 1674 1000 0 Y 55 * * * * * * 1326 * * * * * * * * * * * * 734 55 0 * * * * * * 1674 0 0 W 56 * * * * * * * * * * * * * * 516 * * * 1734 * 56 0 * * * * * * 1674 0 0 S 57 * * 1734 1326 * * * * * * * * * * * 1734 * * * * 57 0 * * * * * * 1674 0 0 M 58 * * * * * * * * * * 734 * * * * 1326 * * * * 58 0 * * * * * * 1674 0 0 Y 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 59 0 * * * * * * 1674 0 0 S 60 * * 1734 * * * * * * * * * 1326 * * 1734 * * * * 60 0 * * * * * * 1674 0 0 R 61 1734 * * * * * * * * * * * * * 1734 * 1326 * * * 61 0 * * * * * * 1674 0 0 L 62 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1674 0 0 R 63 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 63 0 * * * * * * 1674 0 0 K 64 * * * * * * * * 1734 * * * * * 516 * * * * * 64 0 * * * * * * 1674 0 0 M 65 1326 * * * * * * * * 1734 1734 * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1674 0 0 L 66 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1674 0 0 Y 67 * * * 1326 * * * * * * * * * * * * * * * 734 67 0 * * * * * * 1674 0 0 L 68 * * * * * * * * * 1734 1734 * * * * * 1326 * * * 68 0 * * * * * * 1674 0 0 I 69 * * * * * * * 734 * 1326 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1674 0 0 Y 70 * * * * * * * * * * * * * * 1326 * * * * 734 70 0 * * * * * * 1674 0 0 V 71 * * * * * * * * * * 1734 * * * 1326 * * 1734 * * 71 0 * * * * * * 1674 0 0 A 72 1734 * * * * * * * * * * * * 1326 * 1734 * * * * 72 0 * * * * * * 1674 0 0 G 73 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1674 0 0 I 74 * * * * * * * 1734 * 516 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1674 0 0 S 75 1734 * * * * * * * * * * * 1326 * * 1734 * * * * 75 0 * * * * * * 1674 0 0 V 76 * * * * * * * * * 1326 * * * * * * * 734 * * 76 0 * * * * * * 1674 0 0 R 77 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 77 0 * * * * * * 1674 0 0 V 78 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 78 0 * * * * * * 1674 0 0 H 79 * * * * * * 734 * * * * * * * * * * * * 1326 79 0 * * * * * * 1674 0 0 V 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 80 0 * * * * * * 1674 0 0 S 81 * * 1326 * * * * * * * * * * * * 734 * * * * 81 0 * * * * * * 1674 0 0 K 82 * * * * * * 1326 * 734 * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1674 0 0 E 83 * * 1326 734 * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1674 0 0 E 84 * * * 734 * * * * * * * * * * 1326 * * * * * 84 0 * * * * * * 1674 0 0 Q 85 * * * * * * * * * * * * * 734 1326 * * * * * 85 0 * * * * * * 1674 0 0 Y 86 * * * * * * * * * * * * 1326 * * * * * * 734 86 0 * * * * * * 1674 0 0 Y 87 * * 1326 * * * * * * * * * * * * * * * * 734 87 0 * * * * * * 1674 0 0 D 88 * * 734 * 1326 * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1674 0 0 Y 89 1326 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 734 89 0 * * * * * * 1674 0 0 E 90 1326 * * 734 * * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1674 0 0 D 91 * * 734 * * * * * * * * * * * * * * 1326 * * 91 0 * * * * * * 1674 0 0 A 92 734 * * * * * * * * * * * 1326 * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1674 0 0 T 93 * * 1326 * * * * * * * * * * * * * 734 * * * 93 0 * * * * * * 1674 0 0 F 94 * * * * 734 * * * * * 1326 * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1674 0 0 E 95 * * * 1734 * * * * * * * * 1326 1734 * * * * * * 95 0 * * * * * * 1674 0 0 T 96 1326 * * * * * * * * * * * * * * * 734 * * * 96 0 * * * * * * 1674 0 0 Y 97 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 97 0 * * * * * * 1674 0 0 A 98 734 * * * * * * * * * * * * * * 1326 * * * * 98 0 * * * * * * 1674 0 0 L 99 * * * * * * * 1326 * 734 * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1674 0 0 T 100 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 100 0 * * * * * * 1674 0 0 G 101 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1674 0 0 I 102 * * * * * * * 734 * 1326 * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1674 0 0 S 103 1326 * * * * * * * * * * * * * * 734 * * * * 103 0 * * * * * * 1674 0 0 I 104 * * * * * * * 1734 * 1734 * * * * * * 1326 * * * 104 0 * * * * * * 1674 0 0 C 105 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1674 0 0 N 106 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1674 0 0 P 107 * * * * * * * * * * * * 734 * 1326 * * * * * 107 0 * * * * * * 1674 0 0 G 108 1734 * * * * 516 * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1674 0 0 S 109 1734 * * * * 1326 * * * * * * * * * 1734 * * * * 109 0 * * * * * * 1674 0 0 S 110 * 1326 * * * * * * * * * * * * * 734 * * * * 110 0 * * * * * * 1674 0 0 L 111 * * * * * * * 1734 * 1734 1326 * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1674 0 0 C 112 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * 0 * * * 1189 0 0 //