HHsearch 1.5
NAME  c9dxdJ_
FAM   
FILE  c9dxdJ_
COM   /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9dxdJ_.a3m 
DATE  Sat Jan 24 12:53:44 2026
LENG  56 match states, 56 columns in multiple alignment
FILT  1 out of 3 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100)
NEFF  1.0 
EVD   0.4626  2.0024 
SEQ
>ss_pred
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>ss_conf
90259999999999998517305576300001208999999999999999753149
>Consensus
pyqryeelkkktikvvqkenysiryitqdeasndldefykqfaqhlleaalerkae
>c9dxdJ_
PYQRYEELKKKTIKVVQKENYSIRYITQDEASNDLDEFYKQFAQHLLEAALERKAE
#
NULL   3706	5728	4211	4064	4839	3729	4763	4308	4069	3323	5509	4640	4464	4937	4285	4423	3815	3783	6325	4665	
HMM    A	C	D	E	F	G	H	I	K	L	M	N	P	Q	R	S	T	V	W	Y	
       M->M	M->I	M->D	I->M	I->I	D->M	D->D	Neff	Neff_I	Neff_D
       0	*	*	0	*	0	*	*	*	*	
P 1    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	1
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Y 2    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	2
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Q 3    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	3
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

R 4    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	4
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Y 5    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	5
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 6    *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	6
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 7    *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	7
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 8    *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	8
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 9    *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	9
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 10   *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	10
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 11   *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	11
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

T 12   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	12
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 13   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	13
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 14   *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	14
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

V 15   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	15
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

V 16   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	16
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Q 17   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	17
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 18   *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	18
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 19   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	19
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

N 20   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	20
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Y 21   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	21
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 22   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	22
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 23   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	23
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

R 24   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	24
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Y 25   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	25
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

I 26   *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	26
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

T 27   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	27
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Q 28   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	28
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

D 29   *	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	29
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 30   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	30
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 31   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	31
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

S 32   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	32
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

N 33   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	33
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

D 34   *	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	34
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 35   *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	35
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

D 36   *	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	36
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 37   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	37
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

F 38   *	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	38
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Y 39   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	39
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 40   *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	40
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Q 41   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	41
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

F 42   *	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	42
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 43   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	43
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

Q 44   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	44
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

H 45   *	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	45
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 46   *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	46
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 47   *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	47
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 48   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	48
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 49   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	49
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 50   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	50
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

L 51   *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	51
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 52   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	52
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

R 53   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	53
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

K 54   *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	54
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

A 55   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	55
       0	*	*	*	*	*	*	1000	0	0	

E 56   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	56
       0	*	*	0	*	*	*	1000	0	0	

//
