HHsearch 1.5 NAME c9dl1D_ FAM FILE c9dl1D_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9dl1D_.a3m DATE Sat Nov 23 09:55:52 2024 LENG 124 match states, 124 columns in multiple alignment FILT 5 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.4174 -0.4504 SEQ >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9358999999999999999877424702499999879999999971156224542030210581210024687432376533889999840264789999 999999999999999977886379 >Consensus dkeiakeifxmmflxlxxvxxxqrxexnnvexikxnixildximxxadndlxyfigthdxxeNPKxxxxxxxqnlnNxVfTxkELedIxxLsNkeeTKEV lkxFkxKvNqFYrHAFxIxnxYgl >c9dl1D_ DKEIAKEIFNMMFMLLWRVFRSQRIDANNVELIKFNIRVLDWIMAEADNDLCYFIGTHDKCENPKEQWVANYQNLNNVVFTNKELEDIYDLSNKEETKEV LKKFKEKVNQFYRHAFDIINKYGL >UniRef50_B3PLU9(29-91:238) Superantigen MAM n=4 Tax=Mycoplasma arthritidis RepID=B3PLU9_MYCA5 E=1e-17 s/c=1.45 id=75% cov=52% -----------------------------------------------------------RVENPKKAQKHFVQNLNNVVFTNKELEDIYNLSNKEETKEV LKLFKLKVNQFYRHAFGIVNDY-- >UniRef50_B3PN83(100-148:238) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Mycoplasma arthritidis 158L3-1 RepID=B3PN83_MYCA5 E=8e-06 s/c=1.05 id=54% cov=40% ------DIFKMMFLKLKVVLDIQRKEPNNVEQIKRNINILDDIMKSADNELSYFV--------------------------------------------- ------------------------ >UniRef50_B3PN83(29-92:238) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Mycoplasma arthritidis 158L3-1 RepID=B3PN83_MYCA5 E=1e-05 s/c=0.80 id=41% cov=49% --------------------------------------------------------------NPKRPNLPSLKAVKNEVVTLNELDKIIRLTNEnDKTKE VIAQFRSKLNEFYQHAFNILEEY-- >UniRef50_B3PLU9(98-147:238) Superantigen MAM n=4 Tax=Mycoplasma arthritidis RepID=B3PLU9_MYCA5 E=1e-13 s/c=1.55 id=69% cov=41% -----KEIFNMMFLKLSVVFDTQRKEANNVEQIKRNIAILDEIMAKADNDLSYFI--------------------------------------------- ------------------------ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * D 1 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 K 2 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 I 4 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 A 5 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 K 6 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1231 0 0 E 7 * * 1556 600 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1400 0 0 I 8 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1400 0 0 F 9 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1400 0 0 N 10 * * * * * * * * 1556 * * 600 * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1400 0 0 M 11 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1400 0 0 M 12 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1400 0 0 F 13 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1400 0 0 M 14 * * * * * * * * * 634 1492 * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1400 0 0 L 15 * * * * * * * * 634 1492 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1400 0 0 L 16 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1400 0 0 W 17 * * * * * * * * 1556 * * * * * * 1716 * * 1492 * 17 0 * * * * * * 1400 0 0 R 18 * * * * * * * * * * * * * * 1492 * * 634 * * 18 0 * * * * * * 1400 0 0 V 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 19 0 * * * * * * 1400 0 0 F 20 * * * * 600 * * * * 1556 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1400 0 0 R 21 * * 634 * * * * * * * * * * * 1492 * * * * * 21 0 * * * * * * 1400 0 0 S 22 * * * * * * * 1556 * * * * * * * 1492 1716 * * * 22 0 * * * * * * 1400 0 0 Q 23 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 23 0 * * * * * * 1400 0 0 R 24 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 24 0 * * * * * * 1400 0 0 I 25 * * * * * * * 1492 634 * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1400 0 0 D 26 * * 1492 634 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1400 0 0 A 27 600 * * * * * * * * * * * 1556 * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1400 0 0 N 28 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1400 0 0 N 29 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1400 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1400 0 0 E 31 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1400 0 0 L 32 * * * * * * * * * 1492 * * * 634 * * * * * * 32 0 * * * * * * 1400 0 0 I 33 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1400 0 0 K 34 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1400 0 0 F 35 * * * * 1492 * * * * * * * * * 634 * * * * * 35 0 * * * * * * 1400 0 0 N 36 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1400 0 0 I 37 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1400 0 0 R 38 1716 * * * * * * * * * * 1556 * * 1492 * * * * * 38 0 * * * * * * 1400 0 0 V 39 * * * * * * * 634 * * * * * * * * * 1492 * * 39 0 * * * * * * 1400 0 0 L 40 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1400 0 0 D 41 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1400 0 0 W 42 * * 1556 1716 * * * * * * * * * * * * * * 1492 * 42 0 * * * * * * 1400 0 0 I 43 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1400 0 0 M 44 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1400 0 0 A 45 600 * * * * * * * 1556 * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1400 0 0 E 46 * * * 1492 * * * * 1716 * * * * * * 1556 * * * * 46 0 * * * * * * 1400 0 0 A 47 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1400 0 0 D 48 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1400 0 0 N 49 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1400 0 0 D 50 * * 600 1556 * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1400 0 0 L 51 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1400 0 0 C 52 * 1492 * * * * * * * * * * * * * 634 * * * * 52 0 * * * * * * 1400 0 0 Y 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 53 0 * * * * * * 1400 0 0 F 54 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1400 0 0 I 55 * * * * * * * 600 * * * * * * * * * 1556 * * 55 0 * * * * * * 1400 0 0 G 56 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 T 57 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 H 58 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 D 59 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 K 60 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 60 0 * * * * * * 1179 0 0 C 61 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 61 0 * * * * * * 1179 0 0 E 62 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1179 0 0 N 63 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1620 0 0 P 64 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1620 0 0 K 65 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1620 0 0 E 66 * * * 1724 * * * * 1724 * * * * * 1342 * * * * * 66 0 * * * * * * 1620 0 0 Q 67 1724 * * * * * * * * * * * 1342 1724 * * * * * * 67 0 * * * * * * 1620 0 0 W 68 * * * * * * * * * * * 1342 * 1724 * * * * 1724 * 68 0 * * * * * * 1620 0 0 V 69 * * * * * * * * 1724 1342 * * * * * * * 1724 * * 69 0 * * * * * * 1620 0 0 A 70 1724 * * * * * 1724 * * * * * 1342 * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1620 0 0 N 71 * * * * 1724 * * * * * * 1724 * * * 1342 * * * * 71 0 * * * * * * 1620 0 0 Y 72 * * * * * * * * * 1342 * * * * * * * 1724 * 1724 72 0 * * * * * * 1620 0 0 Q 73 * * * * * * * * 1342 * * * * 724 * * * * * * 73 0 * * * * * * 1620 0 0 N 74 1342 * * * * * * * * * * 724 * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1620 0 0 L 75 * * * * * * * * * 724 * * * * * * * 1342 * * 75 0 * * * * * * 1620 0 0 N 76 * * * * * * * * 1342 * * 724 * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1620 0 0 N 77 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1620 0 0 V 78 * * * 1342 * * * * * * * * * * * * * 724 * * 78 0 * * * * * * 1620 0 0 V 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 79 0 * * * * * * 1620 0 0 F 80 * * * * 724 * * * * * * * * * * * * 1342 * * 80 0 * * * * * * 1620 0 0 T 81 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 81 0 * * * * * * 1620 0 0 N 82 * * * * * * * * * 1342 * 724 * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1620 0 0 K 83 * * * * * * * * 724 * * 1342 * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1620 0 0 E 84 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1620 0 0 L 85 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1620 0 0 E 86 * * 1342 724 * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1620 0 0 D 87 * * 724 * * * * * 1342 * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1620 0 0 I 88 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1620 0 0 Y 89 * * * * * * * 1342 * * * * * * * * * * * 724 89 0 * * * * * * 1620 0 0 D 90 * * 1724 * * * * * * * * 1724 * * 1342 * * * * * 90 0 * * * * * * 1620 0 0 L 91 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1620 0 0 S 92 * * * * * * * * * * * * * * * 724 1342 * * * 92 0 * * * * * * 1620 0 0 N 93 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1620 0 0 K 94 * * * 1342 * * * * 724 * * * * * * * * * * * 94 724 1342 * 0 * * * 1620 1000 0 E 95 * * 1342 724 * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1620 0 0 E 96 * * * 724 * * * * 1342 * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1620 0 0 T 97 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 97 0 * * * * * * 1620 0 0 K 98 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1620 0 0 E 99 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1620 0 0 V 100 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 100 0 * * * * * * 1620 0 0 L 101 * * * * * * * 1342 * 724 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1620 0 0 K 102 1342 * * * * * * * 724 * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1620 0 0 K 103 * * * * * * * * 1724 1724 * * * 1342 * * * * * * 103 0 * * * * * * 1620 0 0 F 104 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1620 0 0 K 105 * * * * * * * * 724 * * * * * 1342 * * * * * 105 0 * * * * * * 1620 0 0 E 106 * * * 1724 * * * * * 1724 * * * * * 1342 * * * * 106 0 * * * * * * 1620 0 0 K 107 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1620 0 0 V 108 * * * * * * * * * 1342 * * * * * * * 724 * * 108 0 * * * * * * 1620 0 0 N 109 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1620 0 0 Q 110 * * * 1342 * * * * * * * * * 724 * * * * * * 110 0 * * * * * * 1620 0 0 F 111 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1620 0 0 Y 112 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 112 0 * * * * * * 1620 0 0 R 113 * * * * * * * * * * * * * 1342 724 * * * * * 113 0 * * * * * * 1620 0 0 H 114 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1620 0 0 A 115 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1620 0 0 F 116 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1620 0 0 D 117 * * 1724 * * 1724 * * * * * 1342 * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1620 0 0 I 118 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1620 0 0 I 119 * * * * * * * 1724 * 1342 * * * * * * * 1724 * * 119 0 * * * * * * 1620 0 0 N 120 * * * 1342 * * * * * * * 724 * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1620 0 0 K 121 * * 1724 1342 * * * * 1724 * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1620 0 0 Y 122 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 122 0 * * * * * * 1620 0 0 G 123 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 L 124 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 124 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //