HHsearch 1.5 NAME c9d0yB_ FAM FILE c9d0yB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9d0yB_.a3m DATE Sat Aug 16 17:18:56 2025 LENG 164 match states, 164 columns in multiple alignment FILT 6 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.4149 -0.2759 SEQ >ss_pred CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC CCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9860455660332000357762111012577999999987668999997778899988789999999999999976555777763146886200678234 3679999999999998200044416018999986248999999626766235548987665319 >Consensus iEgGWeGmixGWyGyxhqnaxGxgxAADxkSTQxAIdxitxklNxlixkxnxxfxxixxefxevexrIxxlxxkvdDxxxDiwsynaellVlleNxxtid xxDsxxxxLxxkvrxxLrxnAxdxGNGCFexxHKCdnxCmxsIrngTydhxeyxxeaxxxrxxi >c9d0yB_ IENGWEGMVDGWYGFRHQNSEGRGQAADLKSTQAAIDQINGKLNRLIGKTNEKFHQIEKEFSEVEGRVQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALENQHTID LTDSEMNKLFEKTKKQLRENAEDMGNGCFKIYHKCDNACIESIRNETYDHNVYRDEALNNRFQI >UniRef50_O56140(356-519:568) Hemagglutinin HA2 chain n=10790 Tax=root RepID=HEMA_I97A1 E=7e-48 s/c=1.16 id=52% cov=101% IEGGWQGMVDGWYGYHHSNEQGSGYAADKESTQKAIDGVTNKVNSIINKMNTQFEAVGREFNNLERRIENLNKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMENERTLD FHDSNVKNLYDKVRLQLRDNAKELGNGCFEFYHKCDNECMESVKNGTYDYPQYSEEARLNREEI >UniRef50_P13103(353-516:566) Hemagglutinin HA2 chain n=174 Tax=Influenza A virus RepID=HEMA_I77AF E=4e-73 s/c=1.68 id=49% cov=101% IEGGWPGLINGWYGFQHQNEQGTGIAADKESTQKAIDQITTKINNIIDKMNGNYDSIRGEFNQVEKRINMLADRIDDAVTDIWSYNAKLLVLLENDKTLD MHDANVKNLHEQVRRELKDNAIDEGNGCFELLHKCNDSCMETIRNGTYDHTEYAEESKLKRQEI >UniRef50_P26100(359-522:570) Hemagglutinin HA2 chain n=1146 Tax=root RepID=HEMA_I77A9 E=4e-72 s/c=1.66 id=65% cov=101% IENGWEGLIDGWYGYRHQNAQGEGTAADYKSTQSAVNQITGKLNRLIEKTNQQFELIDNEFNEIEKQIGNVINWTRDSIIEIWSYNAEFLVAVENQHTID LTDSEMNKLYEKVRRQLRENAEEDGNGCFEIFHQCDNDCMASIRNNTYDHKKYRKEAIQNRIQI >UniRef50_P03446(352-515:564) Hemagglutinin HA2 chain n=993 Tax=Influenza A virus RepID=HEMA_I76A2 E=6e-72 s/c=1.65 id=51% cov=101% IEGGWPGLVAGWYGFQHQNAEGTGIAADRDSTQRAIDNMQNKLNNVIDKMNKQFEVVNHEFSEVESRINMINSKIDDQITDIWAYNAELLVLLENQKTLD EHDANVRNLHDRVRRVLRENAIDTGDGCFEILHKCDNNCMDTIRNGTYNHKEYEEESKIERQKV >UniRef50_P17504(372-525:585) Hemagglutinin HA2 chain n=2833 Tax=Orthomyxoviridae RepID=HEMA_INBBE E=4e-58 s/c=1.46 id=35% cov=95% LEGGWEGMIAGWHGYTSHGAHGVAVAADLKSTQEAINKITKNLNSLSELEVKNLQRLSGAMDELHNEILELDEKVDDLRADTISSQIELAVLLSNEGIIN SEDEHLLALERKLKKMLGPSAVDIGNGCFETKHKCNQTCLDRIAAGTFNAGEFS---------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * I 1 * * * * * * * 394 * 2066 * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 2161 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 2161 0 0 N 3 * * * * * 534 * * * * * 1692 * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 2161 0 0 G 4 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 2161 0 0 W 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 5 0 * * * * * * 2161 0 0 E 6 * * * 867 * * * * * * * * 1765 2666 * * * * * * 6 0 * * * * * * 2161 0 0 G 7 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 2161 0 0 M 8 * * * * * * * * * 1151 863 * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 2161 0 0 V 9 * * * * * * * 879 * * * * * * * * * 1131 * * 9 0 * * * * * * 2161 0 0 D 10 1380 * 1099 * * * * * * * * 2749 * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 2161 0 0 G 11 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 2161 0 0 W 12 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 12 0 * * * * * * 2161 0 0 Y 13 * * * * * * 2066 * * * * * * * * * * * * 394 13 0 * * * * * * 2161 0 0 G 14 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 2161 0 0 F 15 * * * * 1160 * * * * * * * * * * * * * * 856 15 0 * * * * * * 2161 0 0 R 16 * * * * * * 2666 * * * * * * 1765 1692 * 2066 * * * 16 0 * * * * * * 2161 0 0 H 17 * * * * * * 394 * * * * * * * * 2066 * * * * 17 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 18 * * * * * * 2066 * * * * * * 728 * 2666 * * * * 18 0 * * * * * * 2161 0 0 N 19 * * * * * 2066 * * * * * 394 * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 2161 0 0 S 20 888 * * 1707 * * * * * * * * * * * 2704 * * * * 20 0 * * * * * * 2161 0 0 E 21 * * * 1742 * * 2066 * * * * * * 1113 * * * * * * 21 0 * * * * * * 2161 0 0 G 22 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 2161 0 0 R 23 * * * 2680 * * * * * * * * * * 2704 2666 1765 2066 * * 23 0 * * * * * * 2161 0 0 G 24 2066 * * * * 394 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 25 * * * * * * * 1765 * * * * * 2704 * * 2680 2066 * 2666 25 0 * * * * * * 2161 0 0 A 26 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 2161 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 2161 0 0 D 28 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 2161 0 0 L 29 * * * * * * * * 1707 1350 * * * * 2781 * * * * 2680 29 0 * * * * * * 2161 0 0 K 30 * * 2781 1707 * * * * 867 * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 2161 0 0 S 31 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 31 0 * * * * * * 2161 0 0 T 32 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 32 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 33 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 33 0 * * * * * * 2161 0 0 A 34 2704 * * 2066 * * * * 1707 * * * * * 2781 2680 * * * * 34 0 * * * * * * 2161 0 0 A 35 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 2161 0 0 I 36 * * * * * * * 245 * * * * * * * * * 2680 * * 36 0 * * * * * * 2161 0 0 D 37 * * 725 * * * * * * * * 1341 * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 38 * * * * * 2666 * * 2066 * * 2781 * 1126 * * * * * * 38 0 * * * * * * 2161 0 0 I 39 * * * * * * * 521 * * 2781 * * * * * * 2666 * * 39 0 * * * * * * 2161 0 0 N 40 * * * * * * * * * * * 2704 * 2781 * * 512 * * * 40 0 * * * * * * 2161 0 0 G 41 * * * * * 1692 * * 2066 * * 1723 * * * * 2749 * * * 41 0 * * * * * * 2161 0 0 K 42 * * * * * * * * 394 * * 2066 * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 2161 0 0 L 43 * * * * * * * 2749 * 527 * * * * * * * 2666 * * 43 0 * * * * * * 2161 0 0 N 44 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 2161 0 0 R 45 * * * * * * * * * * * 1765 * * 1692 1335 * * * * 45 0 * * * * * * 2161 0 0 L 46 * * * * * * * 1707 * 867 * * * * * * * 2781 * * 46 0 * * * * * * 2161 0 0 I 47 * * * * * * * 394 * * * * * * * 2066 * * * * 47 0 * * * * * * 2161 0 0 G 48 * * 1765 1341 * 2704 * * * * * 2666 * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 2161 0 0 K 49 * * * * * * * * 394 2066 * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 2161 0 0 T 50 * * * 2066 * * * * * * 1147 * * * * * 1692 * * * 50 0 * * * * * * 2161 0 0 N 51 * * * * * * * * * * * 394 * * * * * 2066 * * 51 0 * * * * * * 2161 0 0 E 52 * * * 2704 * 2749 * * 1380 * * * * 2680 * * 2666 * * * 52 0 * * * * * * 2161 0 0 K 53 * * * * * * * * 2704 * * 1368 * 1123 * * * * * * 53 0 * * * * * * 2161 0 0 F 54 * * * * 707 * * * * 2066 * * * * * * * * * 2749 54 0 * * * * * * 2161 0 0 H 55 * * 2749 1123 * * 2704 * * * * * * 2066 * * * * * * 55 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 56 2666 * * * * * * * * 2680 * * * 2704 2066 2749 * 2781 * * 56 0 * * * * * * 2161 0 0 I 57 * * * * * * * 1126 * 2066 * * * * * * * 1723 * * 57 0 * * * * * * 2161 0 0 E 58 * * 2680 2704 * 2666 * * * * * 2781 * * 2749 2066 * * * * 58 0 * * * * * * 2161 0 0 K 59 * * * * * 1368 2781 * 2704 * * 2680 * * 2666 * * * * * 59 0 * * * * * * 2161 0 0 E 60 2066 * * 394 * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 2161 0 0 F 61 * * * * 394 * * * * * 2066 * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 2161 0 0 S 62 * * 2066 * * * * * * * * 1113 * * * 1742 * * * * 62 0 * * * * * * 2161 0 0 E 63 * * * 527 * * * * * * * 2666 * 2749 * * * * * * 63 0 * * * * * * 2161 0 0 V 64 * * * * * * * 2680 * 1335 * * * * * * * 1160 * * 64 0 * * * * * * 2161 0 0 E 65 * * * 394 * * 2066 * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2161 0 0 G 66 * * * * * 2704 * * 1714 * * 2066 * * 2666 2781 * * * * 66 0 * * * * * * 2161 0 0 R 67 * * * 2066 * * * * * * * * * 2680 725 * * * * * 67 0 * * * * * * 2161 0 0 V 68 * * * * * * * 240 * * * * * * * * * 2704 * * 68 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 69 * * * 2666 * 2680 * * * 2066 * 1765 * 2704 * * * * * * 69 0 * * * * * * 2161 0 0 D 70 * * 2704 2066 * * * * * * 1765 1673 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 2161 0 0 L 71 * * * * * * * 2781 * 518 * * * * * * * 2680 * * 71 0 * * * * * * 2161 0 0 E 72 2749 * 2066 2704 * * * 2680 * * * 1723 * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 2161 0 0 K 73 * * 2749 2066 * * * * 1685 * * 2680 * * * 2781 * * * * 73 0 * * * * * * 2161 0 0 Y 74 * * * * * * * * 884 * * * * * 2749 * * * 2680 2704 74 0 * * * * * * 2161 0 0 V 75 * * * * * * * 1765 * * 2666 * * * * * 2680 1350 * * 75 0 * * * * * * 2161 0 0 E 76 * * 908 1685 * * * * * * * * * * 2680 * * * * * 76 0 * * * * * * 2161 0 0 D 77 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 2161 0 0 T 78 2749 * * * * 2666 * * * 2066 * * * 2781 * 2680 2704 * * * 78 0 * * * * * * 2161 0 0 K 79 * * * * 2666 * * 1730 2704 * * * * * 2066 * * 2749 * * 79 0 * * * * * * 2161 0 0 I 80 2066 * * * * * * 1692 * 2666 * * * * * * 1765 * * * 80 0 * * * * * * 2161 0 0 D 81 * * 245 2680 * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 2161 0 0 L 82 * * * * * * * 1151 * 2704 * * * * * * 2066 2666 * * 82 0 * * * * * * 2161 0 0 W 83 * * * * * * * 2066 * * * * * * * * * * 394 * 83 0 * * * * * * 2161 0 0 S 84 2781 * * * * * * * * * * * * * * 521 2666 * * * 84 0 * * * * * * 2161 0 0 Y 85 * * * * * * * * * * * * * * * 2066 * * * 394 85 0 * * * * * * 2161 0 0 N 86 * * * * * * * * * * * 394 * 2066 * * * * * * 86 0 * * * * * * 2161 0 0 A 87 394 * * * * * * 2066 * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 2161 0 0 E 88 * * * 232 * * * * 2749 * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 2161 0 0 L 89 * * * * 2680 * * * * 245 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 2161 0 0 L 90 2066 * * * * * * * * 394 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 2161 0 0 V 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 91 0 * * * * * * 2161 0 0 A 92 1692 * * * * * * * * 534 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 2161 0 0 L 93 * * * * * * * * * 543 2666 * * * * * * 2680 * * 93 0 * * * * * * 2161 0 0 E 94 * * * 394 * * * * * * * * * * * 2066 * * * * 94 0 * * * * * * 2161 0 0 N 95 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 96 * * 2749 1335 * * * * * * * * * 1136 * * * * * * 96 0 * * * * * * 2161 0 0 H 97 * * * * * 2066 1692 * 1765 * * * * * 2666 * * * * * 97 0 * * * * * * 2161 0 0 T 98 * * * * * * * 2066 * * * * * * * * 394 * * * 98 0 * * * * * * 2161 0 0 I 99 * * * * * * * 867 * 1147 * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 2161 0 0 D 100 * * 394 * * * * * * * * 2066 * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 2161 0 0 L 101 * * * 2781 2666 * * * * 1692 2749 * * * * 2066 * * * * 101 0 * * * * * * 2161 0 0 T 102 * * * 2066 * * 1147 * * * * * * * * * 1692 * * * 102 0 * * * * * * 2161 0 0 D 103 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 2161 0 0 S 104 1765 * * 2066 * * * * * * * * * * * 1099 * * * * 104 0 * * * * * * 2161 0 0 E 105 * * * 1692 * * 2066 * * * * 1147 * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 2161 0 0 M 106 * * * * * * * * * 2066 1692 * * * * * * 1147 * * 106 0 * * * * * * 2161 0 0 N 107 * * * * * * * * 1707 2066 * 1692 * * 2781 * * * * * 107 0 * * * * * * 2161 0 0 K 108 2066 * * * * * * * 1692 * * 1147 * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 2161 0 0 L 109 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 2161 0 0 F 110 * * * 2066 2704 * 1765 * * * * * * * * * * * * 1673 110 0 * * * * * * 2161 0 0 E 111 * * 1723 1126 * * * * * * * * * * 2066 * * * * * 111 0 * * * * * * 2161 0 0 K 112 * * * * * * * * 503 * * * * 2749 2781 * * * * * 112 0 * * * * * * 2161 0 0 T 113 * * * * * * * * * 2066 * * * * * * 2704 719 * * 113 0 * * * * * * 2161 0 0 K 114 * * * * * * * * 1350 * * * * * 719 * * * * * 114 0 * * * * * * 2161 0 0 K 115 * * * * * * * * 1350 2666 * * * * 1151 * * * * * 115 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 116 * * * 2749 * * * * * * 2066 * * 1099 * * * 2781 * * 116 0 * * * * * * 2161 0 0 L 117 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 2161 0 0 R 118 * * * * * 2066 * * 2749 * * * * * 707 * * * * * 118 0 * * * * * * 2161 0 0 E 119 * * 1707 1136 * * * * * * * * 2066 * * * * * * * 119 0 * * * * * * 2161 0 0 N 120 * * * * * * * * * * * 394 * * * 2066 * * * * 120 0 * * * * * * 2161 0 0 A 121 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 2161 0 0 E 122 * * * 1692 * * * 1765 2666 * * * * * * * * 2066 * * 122 0 * * * * * * 2161 0 0 D 123 * * 543 1673 * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 2161 0 0 M 124 * * 2680 2749 * * * 2066 * 2666 2704 * * * * * 2781 * * * 124 0 * * * * * * 2161 0 0 G 125 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 2161 0 0 N 126 * * 2781 * * * * * * * * 227 * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 2161 0 0 G 127 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 2161 0 0 C 128 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 2161 0 0 F 129 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 2161 0 0 K 130 * * * 240 * * * * 2704 * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 2161 0 0 I 131 * * * * 2666 * * 1136 * 2749 * * * * * * 2066 * * * 131 0 * * * * * * 2161 0 0 Y 132 * * * * 2680 * * * 2066 1765 * * * * * * * * * 1685 132 0 * * * * * * 2161 0 0 H 133 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 2161 0 0 K 134 * * * * * * * * 245 * * * * 2680 * * * * * * 134 0 * * * * * * 2161 0 0 C 135 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 2161 0 0 D 136 * * 707 * * * * * * * * 1368 * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 2161 0 0 N 137 * * 2749 * * * * * * * * 707 * 2066 * * * * * * 137 0 * * * * * * 2161 0 0 A 138 2704 * 2680 2666 * * * * * * * 2781 * * * 2749 2066 * * * 138 0 * * * * * * 2161 0 0 C 139 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 2161 0 0 I 140 * * * * * * * 2704 * 2066 719 * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 2161 0 0 E 141 2680 * 1380 1121 * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 2161 0 0 S 142 * * * * * * * * * * * * * * 2066 1099 1765 * * * 142 0 * * * * * * 2161 0 0 I 143 * * * * * * * 247 * * * * * * * * * 2666 * * 143 0 * * * * * * 2161 0 0 R 144 2066 * * * * * * * 2666 * * * * * 728 * * * * * 144 0 * * * * * * 2161 0 0 N 145 2066 * * * * * * * * * * 394 * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 2161 0 0 E 146 * * * 2704 * 534 * * * * * 2680 * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 2161 0 0 T 147 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 147 0 * * * * * * 2161 0 0 Y 148 * * * * 2066 * * * * * * * * * * * * * * 394 148 0 * * * * * * 2161 0 0 D 149 * * 700 * * * * * * * * 1380 * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 2161 0 0 H 150 2066 * * * * * 728 * * * * * * * * * * * * 2666 150 0 * * * * * * 2161 0 0 N 151 * * * * * 2066 * * 1730 * * 2704 2666 * * * 2749 * * * 151 0 * * * * * * 2161 0 0 V 152 * * * 908 * * * * 2680 * * * * 2666 * * * 2704 * * 152 0 * * * * * * 2161 0 0 Y 153 * * * * 2066 * * * * * * * * * * * * * * 394 153 0 * * * * * * 2161 0 0 R 154 2749 * * 2781 * * * * * * * * * * 1692 1335 * * * * 154 0 * * * * * * 2161 0 0 D 155 * * 2298 749 * * * * 2310 * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1833 0 0 E 156 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1833 0 0 A 157 714 * * * * * * * * * * * * * * 1357 * * * * 157 0 * * * * * * 1833 0 0 L 158 * * * * * * * 2310 1357 2298 * * * * 2289 * * * * * 158 0 * * * * * * 1833 0 0 N 159 * * * * * * * 2359 * 1322 * 2298 * 2310 * * * * * * 159 0 * * * * * * 1833 0 0 N 160 * * * 2359 * * * * 2355 * * 714 * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1833 0 0 R 161 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 161 0 * * * * * * 1833 0 0 F 162 * * * 2289 2298 * * 2310 * * * * * 1357 * * * * * * 162 0 * * * * * * 1833 0 0 Q 163 * * * 1322 * * * * 2359 * * * * 1304 * * * * * * 163 0 * * * * * * 1833 0 0 I 164 * * * * * * * 313 * * * * * * * * * 2359 * * 164 0 * * 0 * * * 1833 0 0 //