HHsearch 1.5 NAME c9crqL_ FAM FILE c9crqL_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9crqL_.a3m DATE Sat Aug 16 13:08:27 2025 LENG 122 match states, 122 columns in multiple alignment FILT 6 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.2 EVD 0.4013 -0.6814 SEQ >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCCCCEECCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHCEECC >ss_conf 9401178999987765564305704788876304988999999999999984103100003553226420010345837897327881579999999986 1577888878876420000029 >Consensus xxxxxxxxriaNlLaxxfvxxexxtxvDRiaNALSxExvxxalxDaxRifxsxxxrxxixxxtxexxxxvxxxxxxxkyxxxxxlpssedIexFLxxvee DixxARkxaxlAlaixnxxxxx >c9crqL_ SEKENIIGRIANLLAVGFLYSESPTLVDRFANALSKEAVTKVLYDVQRIVQMGIDRSEIATTTIKDYPAVNVNSSGAKYTVVGYLPTSQDIEDFLRMIEE DVYYARKAGALAMSIANRIKLG >UniRef50_C7P9K9(17-112:116) CRISPR-associated protein, Csa5 family n=2 Tax=Methanocaldococcus RepID=C7P9K9_METFA E=6e-27 s/c=1.26 id=29% cov=80% -----------------FVRTKNFSYIDRIGNALTYEPVEVAIKDALRDFQSIHNSAKI-----EDGKKVIYDKETNKPIYLPSIPSSEEVEAFLKKAKE DISYARKLAIFALTIPQK---- >UniRef50_Q9UZW9(16-121:125) Putative uncharacterized protein n=3 Tax=Thermococcaceae RepID=Q9UZW9_PYRAB E=2e-11 s/c=0.66 id=25% cov=83% -------GEIINMLRF-FVRIKNFGYVDRIGNALTPEPVEIALHEAMRAFRSIWEGAK----TDEEGRR--YIEKDGEKIYLPKIPSDTEIESFLNEVRR DIRIAKRVATLALA-------- >UniRef50_A2BKJ1(9-105:107) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Hyperthermus butylicus DSM 5456 RepID=A2BKJ1_HYPBU E=5e-05 s/c=0.51 id=33% cov=64% -------------------------VLDRIANALSPDQALAALYDALRVFRS----SCLSESPDKKCPnNAEELVEKARYEV-------EKITELLldsH RAEEGLRLARTAAILAL--------- >UniRef50_C3NJ27(1-162:162) CRISPR-associated protein, Csa5 family n=10 Tax=Sulfolobus RepID=C3NJ27_SULIN E=2e-74 s/c=0.81 id=85% cov=101% EEKEGIIVRVANLLAVGFLYSESPTLVDRFANALSKEAVAKVLYDVQRIVQMGIDRGEIVSTTTmiqgKEYPAVNVSSSEGKYTVVGYLPTNQDIEYFLR MIEEDVYYARKAGALAMSIANRTKLV >UniRef50_A4YFV3(7-118:121) CRISPR-associated protein, Csa5 family n=1 Tax=Metallosphaera sedula DSM 5348 RepID=A4YFV3_METS5 E=5e-37 s/c=1.30 id=45% cov=90% --------RVANLLATASIYAETPTLLDRISNALSKEAAVKVIGDCERIVNTGLNRGEIRLQTGENpriYIDVKEGERTKTYELYGSLSSSEDVTQFIED VERDIYTARKVGAVAMATVN----- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1 0 * * * * * * 1101 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1101 0 0 K 3 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1101 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1101 0 0 N 5 * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1101 0 0 I 6 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1101 0 0 I 7 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1101 0 0 G 8 * * * * * 503 * * * * * * * * * * * 1764 * * 8 0 * * * * * * 1689 0 0 R 9 * * * 1637 * * * * * * * * * * 560 * * * * * 9 0 * * * * * * 2019 0 0 I 10 * * * * * * * 931 * * * * * * * * * 1072 * * 10 0 * * * * * * 2019 0 0 A 11 560 * * * * * * 1637 * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 2019 0 0 N 12 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 2019 0 0 L 13 * * * * * * * * * 560 1637 * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 2019 0 0 L 14 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 2019 0 0 A 15 560 * * * * * * * * * * * * * 1637 * * * * * 15 0 * * * * * * 2019 0 0 V 16 * * * * 1637 * * * * * * * * * * * 1858 1313 * * 16 560 * 1637 * * * * 2019 0 0 G 17 1306 * * * * 748 * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * 0 * 1497 0 1000 F 18 * * * * 378 * * * * * * * * * * 2116 * * * * 18 0 * * * * * * 2244 0 0 L 19 * * * * * * * 2116 * 1553 * * * * * * * 1222 * * 19 0 * * * * * * 2244 0 0 Y 20 * * * * * * * * * * * * * * 1222 * * * * 807 20 0 * * * * * * 2244 0 0 S 21 2116 * * * * * * 2188 * * * * * * * 1553 2257 * * * 21 0 * * * * * * 2244 0 0 E 22 * * * 807 * * * * 1222 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 2244 0 0 S 23 * * * * * * * * * * * 1222 * * * 1553 2116 * * * 23 0 * * * * * * 2244 0 0 P 24 * * * * 1222 * * * * * * * 807 * * * * * * * 24 0 * * * * * * 2244 0 0 T 25 * * * * * 2188 * * * * * * * * * 2257 807 * * * 25 0 * * * * * * 2244 0 0 L 26 * * * * * * * * * 1097 * * * * * * * 2466 * 1508 26 0 * * * * * * 2478 0 0 V 27 * * * * * * * 2562 * 1437 * * * * * * * 1116 * * 27 0 * * * * * * 2478 0 0 D 28 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 2478 0 0 R 29 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 29 0 * * * * * * 2478 0 0 F 30 * * * * 1840 * * 472 * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 2478 0 0 A 31 1120 * * * * 1508 * * * * * * * * * 2409 * * * * 31 0 * * * * * * 2478 0 0 N 32 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2478 0 0 A 33 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 2478 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 2478 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 625 1508 * * * 35 0 * * * * * * 2478 0 0 K 36 * * * * * * * * 1097 * * * 1461 * * * * * * 2562 36 0 * * * * * * 2478 0 0 E 37 * * 2466 288 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 2478 0 0 A 38 1097 * * * * * * * * * * * 1508 2466 * * * * * * 38 0 * * * * * * 2478 0 0 V 39 1437 * * * * * * * * * * * * * * * * 665 * * 39 0 * * * * * * 2478 0 0 T 40 2827 * * 1508 * * * * * 2466 * * * * * * 2854 2409 * * 40 0 * * * * * * 2478 0 0 K 41 2466 * * * * * * 2456 1097 * * * * * * * * 2562 * * 41 0 * * * * * * 2478 0 0 V 42 909 * * * * * * * * * * * * * * * * 1097 * * 42 0 * * * * * * 2478 0 0 L 43 * * * * * * * 1484 * 638 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 2478 0 0 Y 44 * * * * * 2409 2456 * 2562 * * * * * * * * * * 1120 44 0 * * * * * * 2478 0 0 D 45 * * 290 2456 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 2478 0 0 V 46 909 2409 * * * * * * * * * * * * * * * 1840 * * 46 0 * * * * * * 2478 0 0 Q 47 * * * 2409 * * * * * 1513 2456 * * 1840 * * * * * * 47 0 * * * * * * 2478 0 0 R 48 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 48 0 * * * * * * 2478 0 0 I 49 2456 * 2562 * * * * 1097 * * * * * * * * * 2466 * * 49 0 * * * * * * 2478 0 0 V 50 * * * * 909 * * * * * * * * * * * * 1097 * * 50 0 * * * * * * 2478 0 0 Q 51 * * * * * * * * * * * 2409 * 1157 1461 * * * * * 51 0 * * * * * * 2478 0 0 M 52 * * * * * * * * * * 1840 * * * * 909 2409 * * * 52 288 * 2466 * * * * 2478 0 0 G 53 * * * * * 807 * 1222 * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * 0 2244 0 1000 I 54 * * * * * * 2257 1553 * 2116 * * * * * * * * 2188 * 54 0 * * * * * 0 2244 0 1000 D 55 * * 1553 2188 * * * * * * * 1185 * * * * * * * * 55 0 * * * * * 0 2244 0 1000 R 56 * * * * * 2188 * * * * * * * * 807 2257 * * * * 56 0 * * * * 0 * 2244 0 1000 S 57 1508 * * * * 1603 * * * * * * * * * 1647 * * * * 57 0 * * * * * * 2478 0 0 E 58 * 2466 * 1097 * * * * 1508 * * * * * * * * * * * 58 290 * 2456 * * * * 2478 0 0 I 59 * * * * * * * 346 * 2229 * * * * * * * * * * 59 392 * 2072 * * * 0 2260 0 1000 A 60 2263 * * * * * * * * * * * * * 1750 1830 * 2231 * * 60 0 * * * * * 0 1923 0 1363 T 61 * * * 1830 * * * * * 1750 * * * * * 2231 2263 * * * 61 0 * * * * * 0 1923 0 1363 T 62 * * * * * * * * * * * * * 1750 * 1830 1247 * * * 62 0 * * * * 1015 985 1923 0 1363 T 63 * * * * * * * * * * * * 2249 * * * 341 * * * 63 0 * * * * * 0 2331 0 1000 I 64 * * 1129 * * 2160 * 2651 * * * * * * * * 2647 * * * 64 251 2647 * 2000 415 0 * 2331 1000 1000 K 65 * * * 889 * * * * 1120 * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2478 0 0 D 66 * * 1701 1630 * * * * 2466 * * 2409 * * * * * * * * 66 301 2409 * 1585 585 * * 2478 1000 0 Y 67 * 2466 * * * 1508 * * * * * * * * * * * * * 1097 67 0 * * * * * * 2478 0 0 P 68 * * * * * * * 2409 2562 * * * 1120 * 2456 * * * * * 68 288 2466 * 0 * * * 2478 1000 0 A 69 1840 * 2409 * * * * * 2562 * * 2466 * * 2456 * * * * * 69 290 * 2456 * * * * 2478 0 0 V 70 2229 * * * * * * * * * * * * * * * * 346 * * 70 0 * * * * * 0 2260 0 1000 N 71 * * * 2229 * * * 2072 2173 * * 1612 * * * * * * * * 71 0 * * * * 0 * 2260 0 1000 V 72 * * * 1437 * * * * * * * * * * * * * 1840 * 1508 72 0 * * * * * * 2478 0 0 N 73 * * 2562 * * 2409 * 2456 * 2466 * 2854 * * * 2827 * * * * 73 0 * * * * * * 2478 0 0 S 74 * * * 1433 * * * * 2562 * * * * * * 1840 * 2466 * * 74 0 * * * * * * 2478 0 0 S 75 * * * 1513 * * * * 2456 * * * * * 2409 1840 * * * * 75 0 * * * * * * 2478 0 0 G 76 * * 2456 2827 * 2854 * * 2466 * * * * * * * 1484 * * * 76 0 * * * * * * 2478 0 0 A 77 1647 * * * * 1630 * * 2409 * * 2562 * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 2478 0 0 K 78 * * * 2456 * * * * 1157 * * * * * 2466 * 2409 * * * 78 0 * * * * * * 2478 0 0 Y 79 * * * * * * * * 2456 * * * 2562 * * * * * * 625 79 0 * * * * * * 2478 0 0 T 80 * * * 1437 * * * 1508 * * * * * * * * 1840 * * * 80 0 * * * * * * 2478 0 0 V 81 * * * * * * * * * 2409 * * * * * * * 1120 * 1508 81 288 * 2466 * * * * 2478 0 0 V 82 * * * * * * * * * 1222 * * * * * * * 1553 * 2116 82 0 * * * * * 0 2244 0 1000 G 83 * * * * * 807 * * * * * * 1222 * * * * * * * 83 0 * * * * * 0 2244 0 1000 Y 84 * * * * * * * * 2188 * * * * * * 1185 * * * 1553 84 0 * * * * * 0 2244 0 1000 L 85 * * * * * * * 1222 * 807 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * 0 2244 0 1000 P 86 * * * * * * * * * * * * 378 * * 2116 * * * * 86 0 * * * * * 0 2244 0 1000 T 87 * * * * * * * * * * * * * * * 601 1553 * * * 87 0 * * * * * 0 2244 0 1000 S 88 * * 2188 * * * * * * * * 2556 * * * 712 * * * * 88 0 * * * * 0 * 2244 0 1000 Q 89 * * * 893 * * * * * * * * * 1840 * * 2456 * * * 89 0 * * * * * * 2478 0 0 D 90 * * 1097 1508 * * * * 2466 * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 2478 0 0 I 91 * * * * * * * 638 * * * * * * * * * 1484 * * 91 0 * * * * * * 2478 0 0 E 92 * * * 665 * * * * * * * * * * * * 1437 * * * 92 0 * * * * * * 2478 0 0 D 93 2562 * 2854 2466 * * * * * * * * * 2409 * 2456 * * * 2827 93 0 * * * * * * 2478 0 0 F 94 * * * * 288 * * * * 2466 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 2478 0 0 L 95 * * * * * * * 2409 * 301 * * * * * * * * * * 95 288 2466 * 1585 585 * * 2478 1000 0 R 96 * * * 2409 * * 2466 * 2562 * * 2456 * * 1840 * * * * * 96 0 * * * * * * 2478 0 0 M 97 * * 2409 2456 * * * * 2562 * 1840 * * * 2466 * * * * * 97 0 * * * * * * 2478 0 0 I 98 1513 * * * * * * 1840 * * * * * * * * * 1433 * * 98 0 * * * * * * 2478 0 0 E 99 * * * 625 * * * * 2562 * * * * * 2456 * * * * * 99 0 * * * * * * 2478 0 0 E 100 * * * 668 * * * * * * * * * * 1433 * * * * * 100 0 * * * * * * 2478 0 0 D 101 * * 288 * * 2466 * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 2478 0 0 V 102 * * * * * * * 889 * 2466 * * * * * * * 1840 * * 102 0 * * * * * * 2478 0 0 Y 103 * * * * * * * * * * * * * * 1461 2562 * * * 1097 103 0 * * * * * * 2478 0 0 Y 104 * * * * * * * 2456 * 2466 * * * * * * 2409 * * 1157 104 0 * * * * * * 2478 0 0 A 105 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 2478 0 0 R 106 * * * * * * * * 2456 * * * * * 290 * * * * * 106 0 * * * * * * 2478 0 0 K 107 * * * * * * * * 651 * * * * * 2456 * 2466 * * * 107 0 * * * * * * 2478 0 0 A 108 1120 * * * * * * * * 2562 * * * * * * * 1433 * * 108 0 * * * * * * 2478 0 0 G 109 909 * * * * 1097 * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 2478 0 0 A 110 1097 * * * * * * 1513 * * * * * * * * 2456 * * * 110 0 * * * * * * 2478 0 0 L 111 * * * * 2562 * * * * 638 * * * * * * * 2409 * * 111 0 * * * * * * 2478 0 0 A 112 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 2478 0 0 M 113 * * * * * * * * * 909 1097 * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 2478 0 0 S 114 1152 * * * * * * * * * * * * * * 1553 2257 * * * 114 0 * * * * * * 2244 0 0 I 115 * * * * * * * 472 * * * * * * * * 1841 * * * 115 0 * * * * * * 2001 0 0 A 116 1298 * * * * * * * * * * * 1670 * * * * 1841 * * 116 0 * * * * * * 2001 0 0 N 117 * * * * * * * * * * * 544 * 1670 * * * * * * 117 0 * * * * * * 2001 0 0 R 118 * * * * * * * * 1260 * * * * * 780 * * * * * 118 0 * * * * * * 1672 0 0 I 119 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 119 0 * * * * * * 1101 0 0 K 120 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1101 0 0 L 121 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1101 0 0 G 122 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * 122 0 * * 0 * * * 1101 0 0 //