HHsearch 1.5 NAME c9c7yB_ FAM FILE c9c7yB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9c7yB_.a3m DATE Sat Jan 11 09:00:37 2025 LENG 114 match states, 114 columns in multiple alignment FILT 3 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.4320 -0.0993 SEQ >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHH HCCCCCCCCCCCCC >ss_conf 9508999999999999999999888874157513577678888855999999999985202058999999999998875113677235452699999974 04643236571339 >Consensus xxsieaRLdrIdEKLSxIlGlLxTlxVAtAGPTxARDgIRDAmiGlREElIexIxxealxxndrxxamaxlrxEExxxxxkdxxxxvxLtxxaxxLnkiv xxnxxxxdlxxxdx >c9c7yB_ NDNITARLDRIDEKLSEILGMLHTLVVASAGPTSARDGIRDAMIGLREEMIEKIRTEALMTNDRLEAMARLRNEESEKMAKDTSDEVSLNPTSEKLNNLL EGNDSDNDLSLEDF >UniRef50_Q5MKM7(175-289:295) Phosphoprotein n=3 Tax=Murine pneumonia virus RepID=PHOSP_MPV15 E=2e-34 s/c=1.27 id=45% cov=100% SSSVEQRLDRIEEKLSYIIGLLNTIMVATAGPTTARDEIRDALIGTREELIEMIKSDILTVNDRIVAMEKLRDEECSRADTDDGSACYLTDRARILDKIV SSNaeEAKEDLDVDD- >UniRef50_Q2Y2M5(123-262:294) Phosphoprotein n=726 Tax=root RepID=PHOSP_AMPV1 E=4e-16 s/c=0.48 id=49% cov=83% ALSLEARLESIDEKLSMILGLLRTLNVATAGPTAARDGIRDAMVGLREELIADIIKEAKG------KAAEMMKEEAKQKSKIGNGSVGLTEKAKELNKIV -------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * N 1 1686 * * * * * * * * * * 1553 * * * 1521 * * * * 1 0 * * * * * * 1694 0 0 D 2 * * 1553 * * * * * * 1686 * * * * * 1521 * * * * 2 0 * * * * * * 1694 0 0 N 3 * * * * * * * * * * * 1553 * * * 601 * * * * 3 0 * * * * * * 1694 0 0 I 4 * * * * * * * 1553 * 1686 * * * * * * * 1521 * * 4 0 * * * * * * 1694 0 0 T 5 * * * 601 * * * * * * * * * * * * 1553 * * * 5 0 * * * * * * 1694 0 0 A 6 618 * * * * * * * * * * * * 1521 * * * * * * 6 0 * * * * * * 1694 0 0 R 7 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 7 0 * * * * * * 1694 0 0 L 8 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1694 0 0 D 9 * * 537 1686 * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1694 0 0 R 10 * * * * * * * * * * * * * * 537 1686 * * * * 10 0 * * * * * * 1694 0 0 I 11 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1694 0 0 D 12 * * 618 1521 * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1694 0 0 E 13 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1694 0 0 K 14 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1694 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1694 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 16 0 * * * * * * 1694 0 0 E 17 * * * 1553 * * * * * * 1686 * * * * * * * * 1521 17 0 * * * * * * 1694 0 0 I 18 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1694 0 0 L 19 * * * * * * * 1521 * 618 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1694 0 0 G 20 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1694 0 0 M 21 * * * * * * * * * 601 1553 * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1694 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1694 0 0 H 23 * * * * * * 1553 * * * * 1521 * * 1686 * * * * * 23 0 * * * * * * 1694 0 0 T 24 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 24 0 * * * * * * 1694 0 0 L 25 * * * * * * * 1521 * 618 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1694 0 0 V 26 * * * * * * * * * * 1521 1686 * * * * * 1553 * * 26 0 * * * * * * 1694 0 0 V 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 27 0 * * * * * * 1694 0 0 A 28 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1694 0 0 S 29 * * * * * * * * * * * * * * * 1553 601 * * * 29 0 * * * * * * 1694 0 0 A 30 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1694 0 0 G 31 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1694 0 0 P 32 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1694 0 0 T 33 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 33 0 * * * * * * 1694 0 0 S 34 1686 * * * * * * * * * * * * * * 1553 1521 * * * 34 0 * * * * * * 1694 0 0 A 35 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1694 0 0 R 36 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 36 0 * * * * * * 1694 0 0 D 37 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1694 0 0 G 38 * * * 1521 * 618 * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1694 0 0 I 39 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1694 0 0 R 40 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 40 0 * * * * * * 1694 0 0 D 41 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1694 0 0 A 42 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1694 0 0 M 43 * * * * * * * * * 1521 618 * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1694 0 0 I 44 * * * * * * * 537 * * * * * * * * * 1686 * * 44 0 * * * * * * 1694 0 0 G 45 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1694 0 0 L 46 * * * * * * * * * 618 * * * * * * 1521 * * * 46 0 * * * * * * 1694 0 0 R 47 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 47 0 * * * * * * 1694 0 0 E 48 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1694 0 0 E 49 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1694 0 0 M 50 * * * * * * * * * 601 1553 * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1694 0 0 I 51 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1694 0 0 E 52 1686 * * 537 * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1694 0 0 K 53 * * 1686 * * * * * 1553 * 1521 * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1694 0 0 I 54 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1694 0 0 R 55 * * * * * * * 1686 1521 * * * * * 1553 * * * * * 55 0 * * * * * * 1694 0 0 T 56 * * * * * * * * 1686 * * * * * * 1521 1553 * * * 56 0 * * * * * * 1694 0 0 E 57 * * 1521 618 * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1694 0 0 A 58 618 * * * * * * 1521 * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1694 0 0 L 59 * * * * * * * * 1686 537 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1694 0 0 M 60 * * * * * 1686 * * * * 1553 * * * * * 1521 * * * 60 537 * 1686 * * * * 1694 0 0 T 61 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 61 0 * * * * * 0 1463 0 1000 N 62 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 62 0 * * * * * 0 1463 0 1000 D 63 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * 0 1463 0 1000 R 64 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 64 0 * * * * * 0 1463 0 1000 L 65 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * 0 1463 0 1000 E 66 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 66 0 * * * * 0 * 1463 0 1000 A 67 537 * * * * * * * 1686 * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1694 0 0 M 68 1686 * * * * * * * * * 537 * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1694 0 0 A 69 618 * * 1521 * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1694 0 0 R 70 * * * 1686 * * * * 1521 * * * * * 1553 * * * * * 70 0 * * * * * * 1694 0 0 L 71 * * * * * * * * * 537 1686 * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1694 0 0 R 72 * * * * * * * * * * 1686 * * * 537 * * * * * 72 0 * * * * * * 1694 0 0 N 73 * * 1521 * * * * * 1686 * * 1553 * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1694 0 0 E 74 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1694 0 0 E 75 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1694 0 0 S 76 1686 1521 * * * * * * * * * * * * * 1553 * * * * 76 0 * * * * * * 1694 0 0 E 77 * * * 1553 * * * * 1686 * * * * * * 1521 * * * * 77 0 * * * * * * 1694 0 0 K 78 * * * * * * * * 1553 * * * * 1686 1521 * * * * * 78 0 * * * * * * 1694 0 0 M 79 1521 * * * * * * * 1686 * 1553 * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1694 0 0 A 80 1553 * 1521 * * * * * * * * * * * * 1686 * * * * 80 0 * * * * * * 1694 0 0 K 81 * * * * * * * * 618 * * * * * * * 1521 * * * 81 0 * * * * * * 1694 0 0 D 82 * * 537 * * * * 1686 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1694 0 0 T 83 * * 1521 * * 1686 * * * * * * * * * * 1553 * * * 83 0 * * * * * * 1694 0 0 S 84 * * * * * 1521 * * * * * 1686 * * * 1553 * * * * 84 0 * * * * * * 1694 0 0 D 85 * * 1553 * * 1686 * * * * * * * * * 1521 * * * * 85 0 * * * * * * 1694 0 0 E 86 1521 * * 1553 * * * * * * * * * * * 1686 * * * * 86 0 * * * * * * 1694 0 0 V 87 * 1521 * * * * * * * * * * * * * * * 618 * * 87 0 * * * * * * 1694 0 0 S 88 * * * * * 1686 * * * * * * * * * 1553 * * * 1521 88 0 * * * * * * 1694 0 0 L 89 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1694 0 0 N 90 * * * * * * * * * * * 1553 * * * * 601 * * * 90 0 * * * * * * 1694 0 0 P 91 * * 1521 1686 * * * * * * * * 1553 * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1694 0 0 T 92 * * * * * * * * 1686 * * * * * 1521 * 1553 * * * 92 0 * * * * * * 1694 0 0 S 93 601 * * * * * * * * * * * * * * 1553 * * * * 93 0 * * * * * * 1694 0 0 E 94 * * * 1553 * * * * 1686 * * * * * 1521 * * * * * 94 0 * * * * * * 1694 0 0 K 95 * * * 1686 * * * 1521 1553 * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1694 0 0 L 96 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1694 0 0 N 97 * * 1521 * * * * * * * * 618 * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1694 0 0 N 98 * * * * * * * * 601 * * 1553 * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1694 0 0 L 99 * * * * * * * 601 * 1553 * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1694 0 0 L 100 * * * * * * * * * 1553 * * * * * * * 601 * * 100 0 * * * * * * 1694 0 0 E 101 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 101 0 * * * * * * 1463 0 0 G 102 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 102 0 * * * * * * 1463 0 0 N 103 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 103 1000 1000 * 1000 1000 * * 1463 1000 0 D 104 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1463 0 0 S 105 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 105 0 * * * * * * 1463 0 0 D 106 * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1463 0 0 N 107 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1463 0 0 D 108 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1463 0 0 L 109 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1463 0 0 S 110 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 110 0 * * * * * * 1463 0 0 L 111 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 111 0 * * * * * * 1463 0 0 E 112 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1463 0 0 D 113 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1463 0 0 F 114 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //