HHsearch 1.5 NAME c9c39D_ FAM FILE c9c39D_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9c39D_.a3m DATE Sat Feb 8 11:10:58 2025 LENG 129 match states, 129 columns in multiple alignment FILT 2 out of 4 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.3868 -1.4729 SEQ >ss_pred CCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC CCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCCEEEECC >ss_conf 9887668300357887407887046514677557662672378999999999999998521100130112052578779999999974243456324764 50000001045345444431034144039 >Consensus tgxpxxnpldririlctdtdnxxxxidxsvlexfyxxxxkxexxaaixalxyxlxqxakmxdekvggvyxrnsxrfxxxkxxxddlvkxxixgxpyaggi xxcdixxrxxnpxsvxkxxeygdaxxyyg >c9c39D_ TGDPANNPLDRVRILCTDTDNNEILIDQSVLEWFYQESGKDEKKAAIKALKYLLFQVAKMGDEKVGGVYLRNSSRFKSLKAVYDDLVKSSVSGLPYAGGI NQCDIDMRRQNPCSVKKYTEYGDAVRYYG >UniRef50_B8QTV1(3-129:155) Putative uncharacterized protein 53 n=4 Tax=unclassified Myoviridae RepID=B8QTV1_9CAUD E=1e-42 s/c=1.37 id=62% cov=99% TGNPSTNPLDRIRILCTDTDNDDLMIDDSVLEFFYVSNDKNERRAAIQALRYILMQFAKMADEKVGGVYERNSDRFANFKSALDDLVKNGIVGTPYAGGI SKCDIELRKCNPDSVNKSVEYGDAFSY-- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * T 1 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 1 0 * * * * * * 1299 0 0 G 2 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1299 0 0 D 3 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1299 0 0 P 4 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1299 0 0 A 5 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 5 0 * * * * * * 1299 0 0 N 6 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 6 0 * * * * * * 1299 0 0 N 7 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1299 0 0 P 8 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1299 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1299 0 0 D 10 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1299 0 0 R 11 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 11 0 * * * * * * 1299 0 0 V 12 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 12 0 * * * * * * 1299 0 0 R 13 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 13 0 * * * * * * 1299 0 0 I 14 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1299 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1299 0 0 C 16 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1299 0 0 T 17 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 17 0 * * * * * * 1299 0 0 D 18 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1299 0 0 T 19 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 19 0 * * * * * * 1299 0 0 D 20 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1299 0 0 N 21 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1299 0 0 N 22 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1299 0 0 E 23 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1299 0 0 I 24 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1299 0 0 L 25 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1299 0 0 I 26 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1299 0 0 D 27 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1299 0 0 Q 28 * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 28 0 * * * * * * 1299 0 0 S 29 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 29 0 * * * * * * 1299 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1299 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1299 0 0 E 32 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1299 0 0 W 33 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * 33 0 * * * * * * 1299 0 0 F 34 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1299 0 0 Y 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 35 0 * * * * * * 1299 0 0 Q 36 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * 36 0 * * * * * * 1299 0 0 E 37 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 37 0 * * * * * * 1299 0 0 S 38 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 38 0 * * * * * * 1299 0 0 G 39 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1299 0 0 K 40 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1299 0 0 D 41 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1299 0 0 E 42 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1299 0 0 K 43 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 43 0 * * * * * * 1299 0 0 K 44 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 44 0 * * * * * * 1299 0 0 A 45 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1299 0 0 A 46 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1299 0 0 I 47 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1299 0 0 K 48 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 48 0 * * * * * * 1299 0 0 A 49 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1299 0 0 L 50 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1299 0 0 K 51 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 51 0 * * * * * * 1299 0 0 Y 52 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 52 0 * * * * * * 1299 0 0 L 53 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1299 0 0 L 54 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1299 0 0 F 55 * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1299 0 0 Q 56 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 56 0 * * * * * * 1299 0 0 V 57 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 57 0 * * * * * * 1299 0 0 A 58 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1299 0 0 K 59 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1299 0 0 M 60 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1299 0 0 G 61 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1299 0 0 D 62 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1299 0 0 E 63 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1299 0 0 K 64 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1299 0 0 V 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 65 0 * * * * * * 1299 0 0 G 66 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1299 0 0 G 67 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1299 0 0 V 68 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 68 0 * * * * * * 1299 0 0 Y 69 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 69 0 * * * * * * 1299 0 0 L 70 * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1299 0 0 R 71 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 71 0 * * * * * * 1299 0 0 N 72 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1299 0 0 S 73 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 73 0 * * * * * * 1299 0 0 S 74 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 74 0 * * * * * * 1299 0 0 R 75 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 75 0 * * * * * * 1299 0 0 F 76 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1299 0 0 K 77 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1299 0 0 S 78 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 78 0 * * * * * * 1299 0 0 L 79 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1299 0 0 K 80 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1299 0 0 A 81 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 81 0 * * * * * * 1299 0 0 V 82 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 82 0 * * * * * * 1299 0 0 Y 83 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 83 0 * * * * * * 1299 0 0 D 84 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1299 0 0 D 85 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1299 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1299 0 0 V 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 87 0 * * * * * * 1299 0 0 K 88 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1299 0 0 S 89 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 89 0 * * * * * * 1299 0 0 S 90 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 90 0 * * * * * * 1299 0 0 V 91 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 91 0 * * * * * * 1299 0 0 S 92 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * 92 0 * * * * * * 1299 0 0 G 93 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1299 0 0 L 94 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 94 0 * * * * * * 1299 0 0 P 95 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1299 0 0 Y 96 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 96 0 * * * * * * 1299 0 0 A 97 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1299 0 0 G 98 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1299 0 0 G 99 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1299 0 0 I 100 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1299 0 0 N 101 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 101 0 * * * * * * 1299 0 0 Q 102 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 102 0 * * * * * * 1299 0 0 C 103 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1299 0 0 D 104 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1299 0 0 I 105 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1299 0 0 D 106 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1299 0 0 M 107 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1299 0 0 R 108 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 108 0 * * * * * * 1299 0 0 R 109 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 109 0 * * * * * * 1299 0 0 Q 110 * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 110 0 * * * * * * 1299 0 0 N 111 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1299 0 0 P 112 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1299 0 0 C 113 * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1299 0 0 S 114 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 114 0 * * * * * * 1299 0 0 V 115 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 115 0 * * * * * * 1299 0 0 K 116 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1299 0 0 K 117 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1299 0 0 Y 118 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 118 0 * * * * * * 1299 0 0 T 119 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 119 0 * * * * * * 1299 0 0 E 120 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1299 0 0 Y 121 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 121 0 * * * * * * 1299 0 0 G 122 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1299 0 0 D 123 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1299 0 0 A 124 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1299 0 0 V 125 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 125 0 * * * * * * 1299 0 0 R 126 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 126 0 * * * * * * 1299 0 0 Y 127 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 127 0 * * * * * * 1299 0 0 Y 128 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 128 0 * * * * * * 1000 0 0 G 129 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //