HHsearch 1.5 NAME c9bj7S_ FAM FILE c9bj7S_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c9bj7S_.a3m DATE Sat Aug 16 15:38:19 2025 LENG 161 match states, 161 columns in multiple alignment FILT 5 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.3 EVD 0.4122 -0.6067 SEQ >ss_pred CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHH HEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9751357799999999999977887512455531203447798886666676664100133212267865354564088999999998505962210011 1001121793004568970999898999998750430246531254577769999998559 >Consensus xxxktDdxNkaidHIxxLixdaxxlxxxxSxxtsvFlsITxxEEVaKxxxglfxxxxKhrxaixpxxxmgxRLxxaiGxerxeelxxxxxxgexxxlRex slYxxxxxxxxxxPxxxvskxxaxexLLxAiExfdDxlvGyTxhsxxxxxxtdxifxxvax >c9bj7S_ SLKSTDDLNKCIDHISVLIKDAYLLYTNESFATSTFISITIIEEVGKTHIGMFISESKHAFGSLPTIKMGGRLNKAIGDEMIDKIVEDAETGELISIRES SLYADIIDDILEVPSEKISKEQSRALLLYAIECFDDSLVGYTHHSFEVSETTDELFEKLAN >UniRef50_Q9ZEH1(29-203:204) OrfI protein n=1 Tax=Pseudomonas aeruginosa RepID=Q9ZEH1_PSEAE E=1e-53 s/c=1.20 id=39% cov=99% ---KTDDFNRACDHILVLLVDAFQCFDRGSWGTSVFLSITAIEEVAKAEVGLYRREGkigkakrgkdklfnhqeKHRMAILPTVFMSKRLEEALGKEKCA ELLKEAAHGEFRNLRESSLYFSNENGQFVTPANVVSQNRAKEFLLLALEAADDRLVGYTNHTGILEAKINEIFSVVAH >UniRef50_C7CW94(15-189:199) Predicted protein n=3 Tax=Enterococcus faecalis RepID=C7CW94_ENTFA E=2e-50 s/c=1.14 id=38% cov=99% NIDKTDDFNKAIDHIITLLDDSFTLLNKKSYGSCVFFAITSMEEVSKTHFSLFMKHdteknnnkdplfnhsKKQRLSITPVFQMGSRLPEVIGPERVEQL ISLvYKNNDFFTLRNNAIYWNTSQFGNKFPNDYIDKKLAQEILLFAIEAFDDSLVGYTSHSIQASKHTDSLFEKI-- >UniRef50_A4CB92(27-195:220) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Pseudoalteromonas tunicata D2 RepID=A4CB92_9GAMM E=3e-48 s/c=1.14 id=34% cov=94% -----DEYNSAIMHVKELINAANVLFMAKSYAPSVFLSITIFEEIAKIKSGhmrswgqeikqvrrskdpLFQHVKKHKIALDNMYLIGDRLENSMGKDRA EEFFRKYQTGEYSNFREESLYFARCKNKLHIPSQQFDIKLSAEHLLVAIEMFSDEFWGVTAEASTICDTTDAIY----- >UniRef50_UPI00019082B9(37-87:87) hypothetical protein RetlK5_19442 n=1 Tax=Rhizobium etli Kim 5 RepID=UPI00019082B9 E=2e-05 s/c=0.98 id=44% cov=30% ---------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------PLTEVSKERAREILLVALESADDVLVGYTNHSFALGERFEAMIKEVA- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 1 0 * * * * * * 1540 0 0 L 2 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1540 0 0 K 3 * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1540 0 0 S 4 * * * * * * * * 577 * * * * * * 1601 * * * * 4 0 * * * * * * 1906 0 0 T 5 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 5 0 * * * * * * 1906 0 0 D 6 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 2278 0 0 D 7 * * 443 1919 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 2278 0 0 L 8 * * * * 1013 * * * * 2058 * * * * * * * * * 1919 8 0 * * * * * * 2278 0 0 N 9 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 2278 0 0 K 10 * * * * * * * * 1026 * * * * * 2032 1919 * * * * 10 0 * * * * * * 2278 0 0 C 11 396 2058 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 2278 0 0 I 12 * 2032 * * * * * 404 * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 2278 0 0 D 13 * * 443 * * * * * * * 1919 * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 2278 0 0 H 14 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 2278 0 0 I 15 * * * * * * * 443 * * * * * * * * * 1919 * * 15 0 * * * * * * 2278 0 0 S 16 * * * * * * * 1994 1919 2032 * * * * * 2058 * * * * 16 0 * * * * * * 2278 0 0 V 17 * * * 1919 * * * * * * * * * * * * 1994 1045 * * 17 0 * * * * * * 2278 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 2278 0 0 I 19 * * * * * * * 987 * 1013 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 2278 0 0 K 20 * * 1994 * * * * * 2058 * * 1919 * * * * * 2032 * * 20 0 * * * * * * 2278 0 0 D 21 1919 * 443 * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 2278 0 0 A 22 417 * * * * * * * * * * * * * * 1994 * * * * 22 0 * * * * * * 2278 0 0 Y 23 * * * * 1013 * * * * * * 1919 * * * * * * * 2058 23 0 * * * * * * 2278 0 0 L 24 * * * * * * * * * 2058 * * * 2032 * * 1994 1919 * * 24 0 * * * * * * 2278 0 0 L 25 * 2032 * * * * * * * 404 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 2278 0 0 Y 26 * * * * 975 * * * * 1994 * * * * * * * * * 2058 26 0 * * * * * * 2278 0 0 T 27 * * 2032 * * * * * * * 1919 1994 * * * * 2058 * * * 27 0 * * * * * * 2278 0 0 N 28 1919 * * * * * * * 1994 * * 2058 * * 2032 * * * * * 28 0 * * * * * * 2278 0 0 E 29 * * * 2058 * 2032 * * 956 * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 2278 0 0 S 30 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 30 0 * * * * * * 2278 0 0 F 31 * * * * 2058 * * * * * * * * * * * * * 2032 956 31 0 * * * * * * 2278 0 0 A 32 987 * * * * 1013 * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2278 0 0 T 33 * * * * * * * * * * * * 1919 * * 1994 1045 * * * 33 0 * * * * * * 2278 0 0 S 34 * 1994 * * * * * * * * * * * * * 417 * * * * 34 0 * * * * * * 2278 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * * * * * * 2058 396 * * 35 0 * * * * * * 2278 0 0 F 36 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 2278 0 0 I 37 * * * * 1994 * * 2058 * 975 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 2278 0 0 S 38 1994 * * * * * * * * * * * * * * 417 * * * * 38 0 * * * * * * 2278 0 0 I 39 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 2278 0 0 T 40 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 40 0 * * * * * * 2278 0 0 I 41 2032 * * * * * * 987 * * * * * * * 1994 * * * * 41 0 * * * * * * 2278 0 0 I 42 * * * * 1919 * * 1045 * * 1994 * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 2278 0 0 E 43 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 2278 0 0 E 44 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 2278 0 0 V 45 * * * * * * * 1919 * * * * * * * * * 443 * * 45 0 * * * * * * 2278 0 0 G 46 975 * * * * 2058 * * * * * * * * * 1994 * * * * 46 0 * * * * * * 2278 0 0 K 47 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 2278 0 0 T 48 2032 * * * * * * 1919 * * * * * * * * 1026 * * * 48 0 * * * * * * 2278 0 0 H 49 * * * 2032 * * 1026 * 1919 * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 2278 0 0 I 50 * * * * 1994 * * 2058 * * * * * * * 1919 * 2032 * * 50 0 * * * * * * 2278 0 0 G 51 * * * * * 417 * * * * * * * * * 1994 * * * * 51 443 1919 * 4170 82 * * 2278 1000 0 M 52 * * * * * * * * * 396 2058 * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 2278 0 0 F 53 * * * * 404 * * * * * * * * * * * * * * 2032 53 0 * * * * * * 2278 0 0 I 54 * * * * * * * 2058 * * 1994 * * 1919 2032 * * * * * 54 0 * * * * * * 2278 0 0 S 55 * * * * * * 1919 * 1994 * * * * * 2032 2058 * * * * 55 0 * * * * * * 2278 0 0 E 56 * * * 1045 * * 1994 * * * * * * * * * * 1919 * * 56 417 1994 * 3907 100 * * 2278 1000 0 S 57 * * * * * 2032 * * 956 * * * * * * 2058 * * * * 57 404 2032 * 4087 87 * * 2278 1000 0 K 58 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 2278 0 0 H 59 * * * * * * 417 * * * * * * 1994 * * * * * * 59 0 * * * * * * 2278 0 0 A 60 2058 * * * * * * * 1919 * * * * * 1013 * * * * * 60 0 * * * * * * 2278 0 0 F 61 * * * * 2058 * * 1919 * 1994 2032 * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 2278 0 0 G 62 975 * * * * 2058 * * * * * * * * * 1994 * * * * 62 0 * * * * * * 2278 0 0 S 63 * * * * * * * 1013 * 1919 * * * * * 2058 * * * * 63 0 * * * * * * 2278 0 0 L 64 * * 1919 * * * * * * 1045 * * * * * * 1994 * * * 64 0 * * * * * * 2278 0 0 P 65 * * * * * * * * * * * 1919 443 * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2278 0 0 T 66 * * * * * * * * * * 1919 * * * * * 1045 1994 * * 66 0 * * * * * * 2278 0 0 I 67 * * * * 1994 * * 2058 * * * * * * * * * 2032 * 1919 67 0 * * * * * * 2278 0 0 K 68 * * * * 2032 * * * 2058 1919 * * * 1994 * * * * * * 68 0 * * * * * * 2278 0 0 M 69 * * * * * * * 1919 * * 443 * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 2278 0 0 G 70 * * * * * 404 * * * * * * * * * 2032 * * * * 70 0 * * * * * * 2278 0 0 G 71 * * 1919 * * 2058 * * 2032 * * * * * * 1994 * * * * 71 0 * * * * * * 2278 0 0 R 72 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 72 0 * * * * * * 2278 0 0 L 73 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 2278 0 0 N 74 * * * 975 * * * * * * * 2058 1994 * * * * * * * 74 0 * * * * * * 2278 0 0 K 75 * * * 1013 * * * * 2058 * * 1919 * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 2278 0 0 A 76 1045 * * * * * * * * * * * * * * 1919 * 1994 * * 76 0 * * * * * * 2278 0 0 I 77 * * * * * * * 1026 * 2032 1919 * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 2278 0 0 G 78 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 2278 0 0 D 79 * * 2058 * * * * * 975 * * * 1994 * * * * * * * 79 0 * * * * * * 2278 0 0 E 80 * * 1919 443 * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 2278 0 0 M 81 * * * * * * * * 2032 * 2058 * * * 956 * * * * * 81 0 * * * * * * 2278 0 0 I 82 1919 2032 * * * * * 2058 * * * * * * * * * 1994 * * 82 0 * * * * * * 2278 0 0 D 83 2032 * 2058 956 * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 2278 0 0 K 84 * * * 975 * * * * 2058 * * * * 1994 * * * * * * 84 0 * * * * * * 2278 0 0 I 85 * * * * 1919 * * 2058 * 1013 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 2278 0 0 V 86 * * * * 1919 * * 1994 * 2032 * * * * * * * 2058 * * 86 0 * * * * * * 2278 0 0 E 87 * * * 2058 * * * * 2032 * * * * * 1919 1994 * * * * 87 0 * * * * * * 2278 0 0 D 88 * * 2058 2032 * * * * 1919 1994 * * * * * * * * * * 88 417 1994 * 0 * * * 2278 1000 0 A 89 1045 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 956 89 0 * * * * * * 2278 0 0 E 90 2032 * * 2058 * * * * 1994 * * * * 1919 * * * * * * 90 0 * * * * * * 2278 0 0 T 91 * * * * * * 2032 * * * * 1994 * * * * 987 * * * 91 0 * * * * * * 2278 0 0 G 92 * * * * * 417 * * * * * 1994 * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 2278 0 0 E 93 * * 1994 417 * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 2278 0 0 L 94 * * * * 1013 * * * * 2058 * * * * * * * * * 1919 94 0 * * * * * * 2278 0 0 I 95 * * * * 1994 * * 2058 * * * * * * 2032 1919 * * * * 95 0 * * * * * * 2278 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * 975 * * * 2058 1994 * * * 96 0 * * * * * * 2278 0 0 I 97 * * * * 1919 * * 2058 * 1013 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 2278 0 0 R 98 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 98 0 * * * * * * 2278 0 0 E 99 * * * 417 * * * * * * * 1994 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 2278 0 0 S 100 * * * 1919 * * * * * * * 1994 * * * 1045 * * * * 100 0 * * * * * * 2278 0 0 S 101 1994 * * * * * * * * * * * * * * 417 * * * * 101 0 * * * * * * 2278 0 0 L 102 * * * * * * * 1994 * 417 * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 2278 0 0 Y 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 103 0 * * * * * * 2278 0 0 A 104 2058 * * * 975 * * * * * * * * * * * * * 1994 * 104 0 * * * * * * 2278 0 0 D 105 1919 * 2058 * * * * * * * * 1994 * * * 2032 * * * * 105 0 * * * * * * 2278 0 0 I 106 * * * * * * * 2058 * * * 2032 * * 1919 * 1994 * * * 106 0 * * * * * * 2278 0 0 I 107 * 1919 * 2032 * * * 2058 * * * * * * * 1994 * * * * 107 0 * * * * * * 2278 0 0 D 108 * * 2058 * * * * * 1919 * * 2032 * 1994 * * * * * * 108 0 * * * * * * 2278 0 0 D 109 * * 2058 * 1994 2032 * * * * * 1919 * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 2278 0 0 I 110 * * * * * 1994 * 2058 1919 * * * * 2032 * * * * * * 110 0 * * * * * * 2278 0 0 L 111 * * * * 2032 * * * * 987 * 1994 * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 2278 0 0 E 112 * * * 2058 * * 1919 * 1994 * * * * * * * * 2032 * * 112 0 * * * * * * 2278 0 0 V 113 * * * * 1994 * * 1919 * * * * * * * * 2032 2058 * * 113 0 * * * * * * 2278 0 0 P 114 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 114 0 * * * * * * 2359 0 0 S 115 2280 * * * * * * * * 2403 * 2471 * * * 1236 * * * * 115 0 * * * * * * 2359 0 0 E 116 * * 2471 2471 * * * * * * * 2280 * 2033 * * 2403 * * * 116 0 * * * * * * 2359 0 0 K 117 * * * 2403 * * * * 2471 * * * * 2033 * * * 2280 * 2471 117 0 * * * * * * 2359 0 0 I 118 * * * * 2033 * * 1471 * * * * * * * * * 1340 * * 118 0 * * * * * * 2359 0 0 S 119 * * 1236 * * * * * * * * * * * * 798 * * * * 119 0 * * * * * * 2359 0 0 K 120 * * * * * * * 2033 863 * * * * 2280 * * * * * * 120 0 * * * * * * 2359 0 0 E 121 * * * 1437 * * * * 1236 * * 2280 * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 2359 0 0 Q 122 * * * * * * * * * 1236 * * * 2471 1340 * * * * * 122 0 * * * * * * 2359 0 0 S 123 798 * * * * * * * * * * * * * * 1236 * * * * 123 0 * * * * * * 2359 0 0 R 124 2033 * * * * * * * 2280 * * * * 2471 1437 * * * * * 124 0 * * * * * * 2359 0 0 A 125 2471 * * 287 * * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 2359 0 0 L 126 * * * * 2280 * 2033 1437 * 2471 * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 2359 0 0 L 127 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 2359 0 0 L 128 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 2359 0 0 Y 129 * * * * 2471 * * * * 2280 * * * * * * * 1206 * 2471 129 0 * * * * * * 2359 0 0 A 130 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 2359 0 0 I 131 * * * * * * * 725 * 1340 * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 2359 0 0 E 132 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 2359 0 0 C 133 1372 2471 * * * * * * * * 2033 * * * * 2403 * * * * 133 0 * * * * * * 2359 0 0 F 134 1340 * * * 725 * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 2359 0 0 D 135 * * 404 * * * * * * * * * * * * 2033 * * * * 135 0 * * * * * * 2359 0 0 D 136 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 2359 0 0 S 137 * * * 2033 * * * * * * * * * * 2280 1471 * 2403 * * 137 0 * * * * * * 2359 0 0 L 138 * * * * 2033 * * * * 404 * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 2359 0 0 V 139 * * * * * * * * * * * * * * * * * 404 2033 * 139 0 * * * * * * 2359 0 0 G 140 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 2359 0 0 Y 141 * * * * * * * * * * * * * * * * * 2033 * 404 141 0 * * * * * * 2359 0 0 T 142 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 142 0 * * * * * * 2359 0 0 H 143 2033 * * * * * 2471 * * * * 1340 * * * 2471 * * * * 143 0 * * * * * * 2359 0 0 H 144 * * * 2033 * * 404 * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 2359 0 0 S 145 2033 * * * * * * * * * * * * * * 863 2280 * * * 145 0 * * * * * * 2359 0 0 F 146 * * * * 1437 2280 * 2471 * * * * * * * 2033 * * * * 146 0 * * * * * * 2359 0 0 E 147 2403 * * 2471 * * * 2280 * * * * * 2471 * * 2033 * * * 147 0 * * * * * * 2359 0 0 V 148 2471 * * * * * * 2033 * 1340 * * * * * * * 2471 * * 148 0 * * * * * * 2359 0 0 S 149 * 2033 * 2280 * 2403 * * * * * * * * * 1471 * * * * 149 0 * * * * * * 2359 0 0 E 150 2280 * 2033 1437 * * * * 2471 * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 2359 0 0 T 151 * * * * * * 2471 * 2280 * * * * * 2403 * 1236 * * * 151 0 * * * * * * 2359 0 0 T 152 * * * * 2403 * * 2280 * * * * * * * * 725 * * * 152 0 * * * * * * 2359 0 0 D 153 * * 725 2403 * * * * * * * 2280 * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 2359 0 0 E 154 1206 * * 1372 * * * * * * * * * * * 2471 * * * * 154 0 * * * * * * 2359 0 0 L 155 * * * * * * * 1151 * 1471 2403 * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 2359 0 0 F 156 * * * * 820 * * 2403 * * * * * * * * * * * 2033 156 0 * * * * * * 2359 0 0 E 157 * * * 1032 * * * * 2021 * * * * * * 1919 * * * * 157 0 * * * * * * 2028 0 0 K 158 * * * 2021 * * * * 1032 * * * * * * * * 1919 * * 158 0 * * * * * * 2028 0 0 L 159 * * * * * * * 2021 * 2042 * * * * * * * 969 * * 159 0 * * * * * * 2028 0 0 A 160 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1790 0 0 N 161 * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * 161 0 * * 0 * * * 1524 0 0 //