HHsearch 1.5 NAME c8zosK_ FAM FILE c8zosK_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c8zosK_.a3m DATE Sat Dec 28 10:52:37 2024 LENG 57 match states, 57 columns in multiple alignment FILT 2 out of 4 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.4990 3.1092 SEQ >ss_pred CCCHHCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC >ss_conf 942010247620233310000456777787641667877611332101110453069 >Consensus xxsvaxrsgpfapvlsatsrgvagalrplvqaxxpatxexpvldxkrxflxreslsg >c8zosK_ MLSVASRSGPFAPVLSATSRGVAGALRPLVQAALPATSESPVLDAKRSFLCRESLSG >UniRef50_P0C7P4(1-166:283) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1 n=61 Tax=cellular organisms RepID=UCRIL_HUMAN E=7e-84 s/c=0.55 id=81% cov=102% IRSVAARSGPFAPVLSATSRGVAGALRPLVQATVPATPEQPVLDLKRPFLSRESLSG # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1129 0 0 L 2 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * 2 0 * * * * * * 1129 0 0 S 3 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 3 0 * * * * * * 1129 0 0 V 4 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 4 0 * * * * * * 1129 0 0 A 5 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1129 0 0 S 6 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 6 0 * * * * * * 1129 0 0 R 7 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 7 0 * * * * * * 1129 0 0 S 8 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 8 0 * * * * * * 1129 0 0 G 9 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1129 0 0 P 10 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1129 0 0 F 11 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1129 0 0 A 12 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1129 0 0 P 13 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1129 0 0 V 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 14 0 * * * * * * 1129 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1129 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 16 0 * * * * * * 1129 0 0 A 17 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1129 0 0 T 18 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 18 0 * * * * * * 1129 0 0 S 19 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 19 0 * * * * * * 1129 0 0 R 20 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 20 0 * * * * * * 1129 0 0 G 21 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1129 0 0 V 22 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 22 0 * * * * * * 1129 0 0 A 23 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1129 0 0 G 24 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1129 0 0 A 25 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1129 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1129 0 0 R 27 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 27 0 * * * * * * 1129 0 0 P 28 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1129 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1129 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1129 0 0 Q 31 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 31 0 * * * * * * 1129 0 0 A 32 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1129 0 0 A 33 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 33 0 * * * * * * 1129 0 0 L 34 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 34 0 * * * * * * 1129 0 0 P 35 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1129 0 0 A 36 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1129 0 0 T 37 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 37 0 * * * * * * 1129 0 0 S 38 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * 38 0 * * * * * * 1129 0 0 E 39 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1129 0 0 S 40 * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * 40 0 * * * * * * 1129 0 0 P 41 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1129 0 0 V 42 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 42 0 * * * * * * 1129 0 0 L 43 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1129 0 0 D 44 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1129 0 0 A 45 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1129 0 0 K 46 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1129 0 0 R 47 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 47 0 * * * * * * 1129 0 0 S 48 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * 48 0 * * * * * * 1129 0 0 F 49 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1129 0 0 L 50 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1129 0 0 C 51 * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 51 0 * * * * * * 1129 0 0 R 52 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 52 0 * * * * * * 1129 0 0 E 53 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1129 0 0 S 54 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 54 0 * * * * * * 1129 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1129 0 0 S 56 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 56 0 * * * * * * 1129 0 0 G 57 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * 0 * * * 1129 0 0 //