HHsearch 1.5 NAME c8ygpC_ FAM FILE c8ygpC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c8ygpC_.a3m DATE Sat Mar 8 12:03:15 2025 LENG 151 match states, 151 columns in multiple alignment FILT 3 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.8 EVD 0.3980 -1.0033 SEQ >ss_pred CCEEEEEHHEEEEEECCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEEEEEEECHHHHEECCCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHH EEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEECCC >ss_conf 9545542120001331688089874320323786630554205758840689832635778852212110001101686268999999873785676554 024880378868514878506981483101477107887369999962379 >Consensus mxtvIqdtadxxxkRkSDxkviatgxtQtxxfsQxvxeexlkGGiGNxxlyxikSxKEixxtvxnAfFdlxwlAmtQGsExYxxexxTiaYdpdTexiys DiyiqfpnVspSgEfdmsleaGnalsPEixxxAlAdxxtkexxxxxxxxxx >c8ygpC_ MKTVIQDTADVYFKRKSDGKLVFTAEAQTASFSQAISEEKLRGGIGNKPLYILKSEKEINLTVKNAFFDLEWLAMTQGSERYEVEYRTIAYNPDTEEVYS DIYIQFPNVSPSGEFEMSLENGNALAPEIKFEALADTDTDEMAVVIEASRD >UniRef50_D1GQH1(1-230:263) Phage protein n=2 Tax=Staphylococcus RepID=D1GQH1_STAA0 E=6e-20 s/c=0.43 id=42% cov=95% MPLYIQDTADAVLERKSDKFVIATGTTQTVTLKQKVDEETVKGGIGNAAQFTIKSNKELEITMEDALFNFQWLAATQGvkvvndklvvkrtevaeveegg kvtsvnsklagelvvidtygknvkgkftagsatisdlssqvgknvtivteeevqgekvsiradrfAEKYRLQLFTYAYDQDTEAIAKDVFLTFDNVSPSS EFDLKLKAGDPLSPELQLKATANPKTKEIG-------- >UniRef50_O31963(4-228:265) SPBc2 prophage-derived uncharacterized protein yomU n=2 Tax=root RepID=YOMU_BACSU E=4e-41 s/c=0.75 id=47% cov=93% -QTVIHEVGKITAKRLSDNKVIASGVTQMTQFSQQVQQDFLKGGWGNRDLYVINSSKEVSGNVRNAFFDLDFMAMQQGvkienetisvwedesltvsdtg tvilsylplskvsltnedgdqievdaasktvtvpdtfatkgealavhyqieveaetveingekfSENYYFEIHTIEYDPKTSKIYSDLYIQLPKVNFSGE ADMSFEAGNAYTPEIGYRALADNNGK----------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1488 0 0 K 2 * * * * * * * * 1679 * * * 1514 1567 * * * * * * 2 0 * * * * * * 1824 0 0 T 3 * * * * * * * * * 1514 * * * * * * 622 * * * 3 0 * * * * * * 1824 0 0 V 4 * * * * * * * * * * * * * * * * * 622 * 1514 4 0 * * * * * * 1824 0 0 I 5 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1824 0 0 Q 6 * * * * * * 1567 * * * * * * 594 * * * * * * 6 0 * * * * * * 1824 0 0 D 7 * * 594 1567 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1824 0 0 T 8 * * * * * * * * * * * * * * * * 594 1567 * * 8 0 * * * * * * 1824 0 0 A 9 594 * * * * 1567 * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1824 0 0 D 10 * * 594 * * * * * 1567 * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1824 0 0 V 11 1514 * * * * * * 1567 * * * * * * * * * 1679 * * 11 0 * * * * * * 1824 0 0 Y 12 * * * * * * * * * * * * * * * * 1567 1514 * 1679 12 0 * * * * * * 1824 0 0 F 13 1567 * * * 1679 * * * * 1514 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1824 0 0 K 14 * * * 1514 * * * * 622 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1824 0 0 R 15 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 15 0 * * * * * * 1824 0 0 K 16 * * * * * * * * 594 1567 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1824 0 0 S 17 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 17 0 * * * * * * 1824 0 0 D 18 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1824 0 0 G 19 * * * * * 1679 * * 1514 * * 1567 * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1824 0 0 K 20 * * * * 1514 * * * 622 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1824 0 0 L 21 * * * * * * * * * 1679 * * * * * * * 540 * * 21 0 * * * * * * 1824 0 0 V 22 * * * * * * * 540 * * * * * * * * * 1679 * * 22 0 * * * * * * 1824 0 0 F 23 540 * * * 1679 * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1824 0 0 T 24 * * * * * * * * * * * * * * * 1567 594 * * * 24 0 * * * * * * 1824 0 0 A 25 1679 * * * * 540 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1824 0 0 E 26 * * * 1679 * * * * * * * * * * * * 1514 1567 * * 26 0 * * * * * * 1824 0 0 A 27 1679 * * * * * * * * * * * * * * * 540 * * * 27 0 * * * * * * 1824 0 0 Q 28 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 28 0 * * * * * * 1824 0 0 T 29 * * * * * * * * * * 1567 * * * * * 594 * * * 29 0 * * * * * * 1824 0 0 A 30 1679 * * * * * * * * * * * * * * * 1567 1514 * * 30 0 * * * * * * 1824 0 0 S 31 * * * * * * * * * * * * * 1567 * 1679 1514 * * * 31 0 * * * * * * 1824 0 0 F 32 * * * * 622 * * * * 1514 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1824 0 0 S 33 * * * * * * * * 1514 * * * * * * 622 * * * * 33 0 * * * * * * 1824 0 0 Q 34 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 34 0 * * * * * * 1824 0 0 A 35 1679 * * * * * * * 1514 * * * * 1567 * * * * * * 35 0 * * * * * * 1824 0 0 I 36 * * * * * * * 1679 * * * * * * * * * 540 * * 36 0 * * * * * * 1824 0 0 S 37 * * 1514 * * * * * * * * * * 1567 * 1679 * * * * 37 0 * * * * * * 1824 0 0 E 38 * * * 594 * * * * * * * * * 1567 * * * * * * 38 0 * * * * * * 1824 0 0 E 39 * * 1567 594 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1824 0 0 K 40 * * * * 1567 * * * 1679 * * * * * * * 1514 * * * 40 0 * * * * * * 1824 0 0 L 41 * * * * * * * * * 622 * * * * * * * 1514 * * 41 0 * * * * * * 1824 0 0 R 42 * * * * * * * * 540 * * * * * 1679 * * * * * 42 0 * * * * * * 1824 0 0 G 43 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1824 0 0 G 44 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1824 0 0 I 45 * * * * * * * 594 * * * * * * * * * * 1567 * 45 0 * * * * * * 1824 0 0 G 46 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1824 0 0 N 47 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1824 0 0 K 48 1514 * * * * * * * 1679 * * * * * 1567 * * * * * 48 0 * * * * * * 1824 0 0 P 49 1514 * 1567 * * * * * * * * * 1679 * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1824 0 0 L 50 * * * * * * * * * 622 * * * 1514 * * * * * * 50 0 * * * * * * 1824 0 0 Y 51 * * * * 1514 * * * * * * * * * * * * * * 622 51 0 * * * * * * 1824 0 0 I 52 * * * * * * * 1679 * * * * * * * * 1514 1567 * * 52 0 * * * * * * 1824 0 0 L 53 * * * * * * * 540 * 1679 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1824 0 0 K 54 * * * * * * * * 594 * * 1567 * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1824 0 0 S 55 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 55 0 * * * * * * 1824 0 0 E 56 * * * 1679 * * * * * * * 1514 * * * 1567 * * * * 56 0 * * * * * * 1824 0 0 K 57 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1824 0 0 E 58 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1824 0 0 I 59 * * * * * * * 1679 * 1514 * * * * * * * 1567 * * 59 0 * * * * * * 1824 0 0 N 60 * * * 1514 * * * * * * * 1679 * * * 1567 * * * * 60 0 * * * * * * 1824 0 0 L 61 * * * * * 1567 * 1514 * 1679 * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1824 0 0 T 62 * * * * * * * * * * * 1567 * * * * 594 * * * 62 0 * * * * * * 1824 0 0 V 63 * * * * * * * * * * 1514 * * * * * * 622 * * 63 0 * * * * * * 1824 0 0 K 64 * * * 1514 * * * * 1679 * * * * * 1567 * * * * * 64 0 * * * * * * 1824 0 0 N 65 * * 1514 * * * * * * * * 622 * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1824 0 0 A 66 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1824 0 0 F 67 * * * * 622 * * * * 1514 * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1824 0 0 F 68 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1824 0 0 D 69 * * 622 * * * * * * * * 1514 * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1824 0 0 L 70 * * * * 1514 * * * * 622 * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1824 0 0 E 71 * * 1567 1679 * * * * * * * * * 1514 * * * * * * 71 0 * * * * * * 1824 0 0 W 72 * * * * 1567 * * * * * * * * * * * * * 594 * 72 0 * * * * * * 1824 0 0 L 73 * * * * * * * * * 594 1567 * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1824 0 0 A 74 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1824 0 0 M 75 1514 * * * * * * * * * 622 * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1824 0 0 T 76 * * * * * * * * * * * * * 1567 * * 594 * * * 76 0 * * * * * * 1824 0 0 Q 77 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 77 0 * * * * * * 1824 0 0 G 78 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 78 1679 540 * 6435 17 * * 1824 1598 0 S 79 1514 * * * * * * * * * * * * * * 622 * * * * 79 0 * * * * * * 1824 0 0 E 80 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1824 0 0 R 81 * * * * * * * * 1514 * * 1567 * * 1679 * * * * * 81 0 * * * * * * 1824 0 0 Y 82 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 82 0 * * * * * * 1824 0 0 E 83 * * * 1679 * * * * * * * * * * 1514 * * * * 1567 83 0 * * * * * * 1824 0 0 V 84 * * * * 1567 * * * * 1514 * * * * * * * 1679 * * 84 0 * * * * * * 1824 0 0 E 85 * * * 622 * * * * * * * * * 1514 * * * * * * 85 0 * * * * * * 1824 0 0 Y 86 * * * * * * * 1567 * 1514 * * * * * * * * * 1679 86 0 * * * * * * 1824 0 0 R 87 * * * * 1514 * 1567 * * * * * * * 1679 * * * * * 87 0 * * * * * * 1824 0 0 T 88 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 88 0 * * * * * * 1824 0 0 I 89 * * * * * * * 622 * * * * * * * * * * * 1514 89 0 * * * * * * 1824 0 0 A 90 594 * * 1567 * * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1824 0 0 Y 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 91 0 * * * * * * 1824 0 0 N 92 * * 540 * * * * * * * * 1679 * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1824 0 0 P 93 * * * * * * * * * * * * 622 1514 * * * * * * 93 0 * * * * * * 1824 0 0 D 94 * * 594 * * * * * 1567 * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1824 0 0 T 95 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 95 0 * * * * * * 1824 0 0 E 96 * * * 594 * * * * * * * * * * * 1567 * * * * 96 0 * * * * * * 1824 0 0 E 97 1514 * * 1679 * * * * 1567 * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1824 0 0 V 98 * * * * * * * 540 * * * * * * * * * 1679 * * 98 0 * * * * * * 1824 0 0 Y 99 1514 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 622 99 0 * * * * * * 1824 0 0 S 100 * * * * * * * * 1514 * * * * * * 622 * * * * 100 0 * * * * * * 1824 0 0 D 101 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1824 0 0 I 102 * * * * * * * 1679 * 1567 * * * * * * * 1514 * * 102 0 * * * * * * 1824 0 0 Y 103 * * * * 1514 * * * * * * * * * * * * * * 622 103 0 * * * * * * 1824 0 0 I 104 * * * * * * * 622 * 1514 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1824 0 0 Q 105 * * * * * * * * * * * * * 622 * * 1514 * * * 105 0 * * * * * * 1824 0 0 F 106 * * * * 594 * * * * 1567 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1824 0 0 P 107 * * 1514 * * * * * * * * * 622 * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1824 0 0 N 108 * * * * * * * * 1567 * * 594 * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1824 0 0 V 109 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 109 0 * * * * * * 1824 0 0 S 110 * * * * * * * * * * * 1567 * * * 594 * * * * 110 0 * * * * * * 1824 0 0 P 111 * * * * 1567 * * * * * * * 594 * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1824 0 0 S 112 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 112 0 * * * * * * 1824 0 0 G 113 * * * * * 622 * * * * * * * * * 1514 * * * * 113 0 * * * * * * 1824 0 0 E 114 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1824 0 0 F 115 1567 * * * 594 * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1824 0 0 E 116 * * 540 1679 * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1824 0 0 M 117 * * * * * * * * * 1514 622 * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1824 0 0 S 118 * * * * * * * * 1514 * * * * * * 622 * * * * 118 0 * * * * * * 1824 0 0 L 119 * * * * 1567 * * * * 594 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1824 0 0 E 120 * * * 622 * * * * 1514 * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1824 0 0 N 121 540 * * * * * * * * * * 1679 * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1824 0 0 G 122 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1824 0 0 N 123 * * 1514 * * * * * * * * 622 * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1824 0 0 A 124 622 * * * * * * * * * * * 1514 * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1824 0 0 L 125 * * * * * * * * * 594 * * * * * * * * * 1567 125 0 * * * * * * 1824 0 0 A 126 1679 * * * * * * * * * * * * * * 1514 1567 * * * 126 0 * * * * * * 1824 0 0 P 127 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1824 0 0 E 128 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1824 0 0 I 129 * * * * * * * 622 * 1514 * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1824 0 0 K 130 * * * * * 1567 * * 1679 * * * * 1514 * * * * * * 130 0 * * * * * * 1824 0 0 F 131 * * * * 1679 * * * * 1514 * * * * * * * * * 1567 131 0 * * * * * * 1824 0 0 E 132 * * * 1679 * * * * 1514 * * * * * 1567 * * * * * 132 0 * * * * * * 1824 0 0 A 133 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1824 0 0 L 134 * * * * * * * * * 622 * * * * * * 1514 * * * 134 0 * * * * * * 1824 0 0 A 135 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1824 0 0 D 136 * * 622 * * * * * * * * 1514 * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1824 0 0 T 137 * * * * * * * * * * * 1567 1514 * * * 1679 * * * 137 0 * * * * * * 1824 0 0 D 138 * * 1679 * * * * * 1514 * * 1567 * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1824 0 0 T 139 * * * * * 1567 * * * * * * * * * * 594 * * * 139 0 * * * * * * 1824 0 0 D 140 * * 1679 * * * * * 540 * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1824 0 0 E 141 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1488 0 0 M 142 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1488 0 0 A 143 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1488 0 0 V 144 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 V 145 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 I 146 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 E 147 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 A 148 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 S 149 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 R 150 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 D 151 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //