HHsearch 1.5 NAME c8xy3D_ FAM FILE c8xy3D_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c8xy3D_.a3m DATE Sat Jan 25 09:54:26 2025 LENG 115 match states, 115 columns in multiple alignment FILT 4 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.0 EVD 0.4050 -0.6888 SEQ >ss_pred CHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHCEEECCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9789999998721688886267899999999997324780300100100004583312000220165799999999999988862265331999999999 999998767776309 >Consensus xxxxilkxYIxWRgxgxxxxyexxFeklxxxDxxvxdxdxxdlIKxMkltLxDGPrldkLxxxxxxxxxxkexIglcxxlAekVxxxxeixWexvfxxLF xxxxxxxxxxxxxxx >c8xy3D_ SMRTLLIRYILWRNDGDPSYYNDDFEKLMLLDELVDDSDVCTLIKNMRMTLSDGPLLDRLNQPVNNVEDVKRMIAISAKVARDIGERPEIRWEESFTILF RMIETYFDDLMIDLY >UniRef50_Q08F24(18-120:138) Virulence factor n=2 Tax=Cervidpoxvirus RepID=Q08F24_DPV84 E=2e-06 s/c=0.52 id=38% cov=82% ----ILKYYITWR--GSSDFYDKHdcgkiFKKLMLFDdharKIMGDYDYL-FIKNMNLSLDDGPRLDKIDNNILSKLSYKELIGLCAVLAEKVVHYPyTI KWEKVFNTLF--------------- >UniRef50_Q77GG2(9-122:134) Putative secreted virulence factor n=5 Tax=Capripoxvirus RepID=Q77GG2_LSDV E=7e-07 s/c=0.48 id=23% cov=90% -IKHIIKEYIRWRGNGEDICEERElnifFKKLKKMDSFVkknikeSNNDEYDIIKSMKLSLDDGPRMDKLPEYLLDGLNAEEILGLCGIISEKVVSATyE VNWDRVYESLFNILD----------- >UniRef50_Q9Q8F8(7-107:108) M146R n=3 Tax=Leporipoxvirus RepID=Q9Q8F8_9POXV E=6e-06 s/c=0.51 id=29% cov=83% -------RYIRWRGGDLDVPYEDVFETYTEFDAVakkkFGECGY-DLIKPMKLTLTDGPRLGKL--PTKEPMTPEEAIGLCGLLAEKVTHsHYNVNWDVV FDELFSVMK----------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 M 2 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1702 0 0 R 3 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 3 0 * * * * * * 1702 0 0 T 4 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * 4 0 * * * * * * 1702 0 0 L 5 * * * * * * * 635 * 1490 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1954 0 0 L 6 * * * * * * * 1533 * 611 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1954 0 0 I 7 * * * * * * * 1490 635 * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1954 0 0 R 8 * * * 1974 * * * * * * * * * * 944 * * * * 2147 8 0 * * * * * * 2202 0 0 Y 9 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 9 0 * * * * * * 2202 0 0 I 10 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 2202 0 0 L 11 * * * * * * * * * 1829 * * * * 1021 * 2147 * * * 11 0 * * * * * * 2202 0 0 W 12 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 12 0 * * * * * * 2202 0 0 R 13 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 13 369 * 2147 * * * * 2202 0 0 N 14 * * * * * 646 * * * * * 1471 * * * * * * * * 14 0 * * * * * 0 2023 0 1000 D 15 * * 1471 * * 1705 * * * * * 1589 * * * * * * * * 15 0 * * * * 0 * 2023 0 1000 G 16 * * 2069 * * 393 * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 2202 0 0 D 17 * * 1829 1974 * * * * * 2069 * * * * * 2147 * * * * 17 0 * * * * * * 2202 0 0 P 18 * * 1021 * * * * * * * * * 1829 * * 2147 * * * * 18 0 * * * * * * 2202 0 0 S 19 * * 2147 * * * * 1974 * * * * * * * 1829 * 2069 * * 19 0 * * * * * * 2202 0 0 Y 20 * 1974 * * 2147 * * * * * * * 2069 * * * * * * 1829 20 0 * * * * * * 2202 0 0 Y 21 * * * 1974 * * * * * * * * * * * * * * * 424 21 0 * * * * * * 2202 0 0 N 22 * * 2147 1021 * * * * * * * 1829 * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 2202 0 0 D 23 * * 944 * * * * * 2147 * * * * * 1974 * * * * * 23 0 * * * * * * 2202 0 0 D 24 * * 1829 1974 * * 2147 * * * * * * * * * * 2069 * * 24 944 1058 * 2159 366 * * 2202 1464 0 F 25 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 2202 0 0 E 26 * * * 944 * * * * 1058 * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 2202 0 0 K 27 * * * * * * * * 393 * * * * * * * 2069 * * * 27 0 * * * * * * 2202 0 0 L 28 * * * * * * * * * 393 * * * * * * * * * 2069 28 0 * * * * * * 2202 0 0 M 29 * * * * * * * * 1974 * 979 * * * * * 2069 * * * 29 0 * * * * * * 2202 0 0 L 30 * * * 2069 * * * * 1974 979 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 2202 0 0 L 31 * * * * 1107 * * * * 1829 1974 * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 2202 0 0 D 32 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 369 2147 * 2000 415 * * 2202 1000 0 E 33 2069 * * 1829 * * * * 2147 * * * * * * 1974 * * * * 33 0 * * * * * * 2202 0 0 L 34 * * * * 1974 * * 2147 * 1829 * * * * * * * 2069 * * 34 393 2069 * 2000 415 * * 2202 1000 0 V 35 * * * * 2069 * * * * * 2147 * * * * * * 900 * * 35 424 1974 * 2585 263 * * 2202 1000 0 D 36 * * 1829 * * 1107 * * * * * * * * * 1974 * * * * 36 0 * * * * * * 2202 0 0 D 37 * * 979 2069 * * * * * * * 1974 * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 2202 0 0 S 38 * 2069 * * * * * * * * * 1974 * * * 1829 * * * 2147 38 0 * * * * * * 2202 0 0 D 39 * * 393 * * 2069 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 2202 0 0 V 40 * * * 1974 * * * * * * * * * * * * * 1829 * 1107 40 393 * 2069 * * * * 2202 0 0 C 41 * 1490 * * * * * * * 1744 * * * * * * * * * 1533 41 512 * 1744 * * 0 * 1954 0 1000 T 42 * * 646 * * * * * * * * * * * * * 1471 * * * 42 0 * * * * 0 * 2023 0 1000 L 43 * * * * 2147 * * 1974 * 944 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 2202 0 0 I 44 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 2202 0 0 K 45 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 2202 0 0 N 46 * * * * * * * * * * * 979 2069 * * 1974 * * * * 46 0 * * * * * * 2202 0 0 M 47 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 2202 0 0 R 48 * * * * * * * * 1021 * * 2147 * * 1829 * * * * * 48 0 * * * * * * 2202 0 0 M 49 * * * * * * * * * 477 1829 * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 2202 0 0 T 50 * * * * * * * * * * * * * * * 1058 944 * * * 50 0 * * * * * * 2202 0 0 L 51 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 2202 0 0 S 52 * * 1058 * * * * * * * * * * * * 1829 2069 * * * 52 0 * * * * * * 2202 0 0 D 53 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 2202 0 0 G 54 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 2202 0 0 P 55 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 55 0 * * * * * * 2202 0 0 L 56 * * * * * * * * * 1829 * * * * 477 * * * * * 56 0 * * * * * * 2202 0 0 L 57 * * * * * * * * * 424 1974 * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 2202 0 0 D 58 * * 393 * * 2069 * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 2202 0 0 R 59 * * * * * * * * 477 * * * * * 1829 * * * * * 59 0 * * * * * * 2202 0 0 L 60 * * * * * * * 2147 * 369 * * * * * * * * * * 60 393 * 2069 * * * * 2202 0 0 N 61 * * 1744 * * * * * * * * 1490 1533 * * * * * * * 61 0 * * * * * 0 1954 0 1000 Q 62 * * * 1533 * * * * * * * 1744 * 1490 * * * * * * 62 0 * * * * 0 * 1954 0 1000 P 63 * * * * * * * * * * * 2147 944 * * * * * * 1974 63 0 * * * * * * 2202 0 0 V 64 * * * * * * * 2147 * 1974 * * * * * * 2069 1829 * * 64 0 * * * * * * 2202 0 0 N 65 * * * * * * * * 2069 1058 * 1829 * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2202 0 0 N 66 * * 1974 2069 * * * * * * * 1829 * * * 2147 * * * * 66 0 * * * * * * 2202 0 0 V 67 * * * * * 1974 * * 2147 * * * 2069 * * * * 1829 * * 67 0 * * * * * * 2202 0 0 E 68 * * * 1829 * * * * * 1058 2069 * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 2202 0 0 D 69 * * 1829 * * * * * * * * 1974 * * * 2147 2069 * * * 69 0 * * * * * * 2202 0 0 V 70 1974 * * * * * * * * * * * 2069 * * * * 1829 * 2147 70 0 * * * * * * 2202 0 0 K 71 * * * 1021 * * * * 979 * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 2202 0 0 R 72 * * * 477 * * * * * * * * * * 1829 * * * * * 72 0 * * * * * * 2202 0 0 M 73 2069 * * * * * * 1974 * 2147 1829 * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 2202 0 0 I 74 * * * * * * * 424 * 1974 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 2202 0 0 A 75 1829 * * * * 477 * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 2202 0 0 I 76 * * * * * * * 1829 * 477 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 2202 0 0 S 77 * 477 * * * * * * * * * * * * * 1829 * * * * 77 0 * * * * * * 2202 0 0 A 78 979 * * * * 1021 * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 2202 0 0 K 79 * * * * * * * 1974 1829 2069 * * * * * * * 2147 * * 79 0 * * * * * * 2202 0 0 V 80 * * * * * * * 1974 * 1107 * * * * * * * 1829 * * 80 0 * * * * * * 2202 0 0 A 81 424 * * * * * * * * * * * * * * 1974 * * * * 81 0 * * * * * * 2202 0 0 R 82 * * * 477 * * * * * * * * * * 1829 * * * * * 82 0 * * * * * * 2202 0 0 D 83 * * 1829 * * * * * 477 * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 2202 0 0 I 84 * * * * * * * 1829 * * * * * * * * * 477 * * 84 0 * * * * * * 2202 0 0 G 85 * * * * * 1829 * * * * * * * * * * 2069 1058 * * 85 0 * * * * * * 2202 0 0 E 86 * * * 1829 * * 1107 * * * * * * * * 1974 * * * * 86 393 2069 * 0 * * * 2202 1000 0 R 87 1974 * * * * * 2069 * * * * * * * 1829 * * * * 2147 87 0 * * * * * * 2202 0 0 P 88 * * * * * * * * * * * * 979 * * * 1974 * * 2069 88 944 1058 * 0 * * * 2202 1464 0 E 89 * * * 900 * * * * * * * 2069 * * * * 2147 * * * 89 0 * * * * * * 2202 0 0 I 90 * * * * * * * 979 * * * * * * * * * 1021 * * 90 0 * * * * * * 2202 0 0 R 91 * * * * * * * * 2147 * * 1021 * * 1829 * * * * * 91 0 * * * * * * 2202 0 0 W 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 92 0 * * * * * * 2202 0 0 E 93 * * 1021 979 * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 2202 0 0 E 94 * * * 1829 * * * * 2147 * * * * * 1974 * * 2069 * * 94 0 * * * * * * 2202 0 0 S 95 * * * * * * * * * * * * * * * 1829 * 477 * * 95 0 * * * * * * 2202 0 0 F 96 * * * * 424 * * * * * * * * * * * * * * 1974 96 0 * * * * * * 2202 0 0 T 97 * * 2069 1974 * * * * * * * 2147 * * * * 1829 * * * 97 0 * * * * * * 2202 0 0 I 98 * * * 2069 * * * 1829 * * * * * * * 1974 2147 * * * 98 0 * * * * * * 2202 0 0 L 99 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 2202 0 0 F 100 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 2202 0 0 R 101 * * * * * * * * * * * 1589 * * 1471 1705 * * * * 101 0 * * * * * * 2023 0 0 M 102 * * * * * * * 1589 * * 1471 * * * * * * 1705 * * 102 0 * * * * * * 2023 0 0 I 103 * * * * * * * 1471 * 1589 1705 * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 2023 0 0 E 104 * * 1589 1471 * * * * 1705 * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 2023 0 0 T 105 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 106 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 106 0 * * * * * * 1000 0 0 F 107 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 D 108 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 D 109 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 L 110 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 M 111 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 I 112 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 D 113 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 L 114 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 115 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 115 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //