HHsearch 1.5 NAME c8xy1A_ FAM FILE c8xy1A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c8xy1A_.a3m DATE Sat Jan 25 09:33:46 2025 LENG 117 match states, 117 columns in multiple alignment FILT 5 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.2 EVD 0.3913 -1.4502 SEQ >ss_pred CCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECEEECCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9389999999872168888716789999999999744688354331010000458321200021016479999999999999886313434299999999 99999889999998619 >Consensus xxxxxilxrYIxWRxxgxxxxyxdxFkklxxfDxxvxdxdxxxlIKnMkltLxDGPrLdkLxxpxxxxxxxkexIglcaxiAekVxxxxeixWexvfxxL Frxxxxxfxxxxxxlxx >c8xy1A_ ASMRTLLIRYILWRNDGDPSYYNDDFKKLILFDELVDDDDVCTLIKNMRMTLSDGPLLDRLNQPVNNVEDVKRMIAISAKVARDIGRRSEIRWEDSFTIL FRMIEKYFDDLMTDLYG >UniRef50_P21054(1-115:117) Protein N1 n=28 Tax=root RepID=VN01_VACCC E=2e-40 s/c=1.44 id=89% cov=99% --MRTLLIRYILWRNDNDQTYYNDDFKKLMLLDELVDDGDVCTLIKNMRMTLSDGPLLDRLNQPVNNIEDAKRMIAISAKVARDIGERSEIRWEESFTIL FRMIETYFDDLMIDLYG >UniRef50_Q77GG2(9-123:134) Putative secreted virulence factor n=5 Tax=Capripoxvirus RepID=Q77GG2_LSDV E=2e-07 s/c=0.49 id=24% cov=90% --IKHIIKEYIRWRGNGEDICEERElnifFKKLKKMDSFVkknikeSNNDEYDIIKSMKLSLDDGPRMDKLPEYLLDGLNAEEILGLCGIISEKVVSATy EVNWDRVYESLFNILDE----------- >UniRef50_Q9Q8F8(7-108:108) M146R n=3 Tax=Leporipoxvirus RepID=Q9Q8F8_9POXV E=4e-28 s/c=1.23 id=29% cov=82% --------RYIRWRGGDLDVPYEDVFETYTEFDAVakkkFGECGY-DLIKPMKLTLTDGPRLGKL--PTKEPMTPEEAIGLCGLLAEKVTHsHYNVNWDV VFDELFSVMKR----------- >UniRef50_Q08F24(18-135:138) Virulence factor n=2 Tax=Cervidpoxvirus RepID=Q08F24_DPV84 E=7e-25 s/c=0.97 id=37% cov=92% -----ILKYYITWR--GSSDFYDKHdcgkiFKKLMLFDdharKIMGDYDYL-FIKNMNLSLDDGPRLDKIDNNILSKLSYKELIGLCAVLAEKVVHYPyT IKWEKVFNTLFdRLTNEDFTEIKTFL-- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * A 1 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 M 3 * * * * * * * 1177 * * 842 * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1750 0 0 R 4 * * * * * * * * 1177 * * * * * 842 * * * * * 4 0 * * * * * * 1750 0 0 T 5 * * * * * * 1177 * * * * * * * * * 842 * * * 5 0 * * * * * * 1750 0 0 L 6 * * * * * * * 796 * 1238 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 2020 0 0 L 7 * * * * * * * 1670 * 544 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 2020 0 0 I 8 * * * * * * * 1238 796 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 2020 0 0 R 9 * * * 2094 * * * * * * * * * * 827 * * * * 2308 9 0 * * * * * * 2301 0 0 Y 10 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 10 0 * * * * * * 2301 0 0 I 11 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 2301 0 0 L 12 * * * * * * * * * 1547 * * * * 1133 * 2308 * * * 12 0 * * * * * * 2301 0 0 W 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 13 0 * * * * * * 2301 0 0 R 14 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 14 325 * 2308 * * * * 2301 0 0 N 15 * * * * * 795 * * * * * 1240 * * * * * * * * 15 0 * * * * * 0 2076 0 1000 D 16 * * 1240 * * 1855 * * * * * 1736 * * * * * * * * 16 0 * * * * 0 * 2076 0 1000 G 17 * * 2174 * * 722 * * * * * 2539 * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 2301 0 0 D 18 * * 1547 2094 * * * * * 2174 * * * * * 2308 * * * * 18 0 * * * * * * 2301 0 0 P 19 * * 1133 * * * * * * * * * 2556 2539 * 2308 * * * * 19 0 * * * * * * 2301 0 0 S 20 * * 2308 * * * * 2094 * * * * * * * 2556 2539 2174 * * 20 0 * * * * * * 2301 0 0 Y 21 * 2094 * * 2308 * * * * * * * 2174 * * * * * * 1547 21 0 * * * * * * 2301 0 0 Y 22 * * * 2094 * * * * * * * * * * * * * * * 385 22 0 * * * * * * 2301 0 0 N 23 * * 2308 1133 * * * * * * * 1547 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 2301 0 0 D 24 * * 827 * * * * * 2308 * * * * * 2094 * * * * * 24 0 * * * * * * 2301 0 0 D 25 * * 1547 2094 * * 2308 * * * * * * * * * * 2174 * * 25 827 1197 * 2164 364 * * 2301 1478 0 F 26 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 2301 0 0 K 27 * * * 2174 * * * * 362 * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 2301 0 0 K 28 * * * * * * * * 362 * * * * * * * 2174 * * * 28 0 * * * * * * 2301 0 0 L 29 * * * * * * * * * 362 * * * * * * * * * 2174 29 0 * * * * * * 2301 0 0 I 30 * * * * * * * 2556 2094 * 1419 * * * * * 2174 * * * 30 0 * * * * * * 2301 0 0 L 31 * * * 2174 * * * * 2094 878 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 2301 0 0 F 32 * * * * 752 * * * * 2539 2094 * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2301 0 0 D 33 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 325 2308 * 2000 415 * * 2301 1000 0 E 34 2174 * * 1547 * * * * 2308 * * * * * * 2094 * * * * 34 0 * * * * * * 2301 0 0 L 35 * * * * 2094 * * 2308 * 1547 * * * * * * * 2174 * * 35 362 2174 * 2000 415 * * 2301 1000 0 V 36 * * * * 2174 * * * * * 2308 * * * * * * 795 * * 36 385 2094 * 2585 263 * * 2301 1000 0 D 37 * * 1547 * * 1239 * * * * * * * * * 2094 * * * * 37 0 * * * * * * 2301 0 0 D 38 * * 878 2174 * * * * * * * 2094 * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 2301 0 0 D 39 * 2174 2556 * * 2539 * * * * * 2094 * * * * * * * 2308 39 0 * * * * * * 2301 0 0 D 40 * * 362 * * 2174 * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 2301 0 0 V 41 * * * 2094 * * * * * * * * * * * * * 1547 * 1239 41 362 * 2174 * * * * 2301 0 0 C 42 * 1238 * * * * * * * 1935 * * * * * * * * * 1670 42 437 * 1935 * * 0 * 2020 0 1000 T 43 * * 795 * * * * * * * * * * * * * 1240 * * * 43 0 * * * * 0 * 2076 0 1000 L 44 * * * * 2308 * * 2094 * 827 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 2301 0 0 I 45 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 2301 0 0 K 46 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 2301 0 0 N 47 * * * * * * * * * * * 878 2174 * * 2094 * * * * 47 0 * * * * * * 2301 0 0 M 48 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 2301 0 0 R 49 * * * * * * * * 1133 * * 2308 * * 1547 * * * * * 49 0 * * * * * * 2301 0 0 M 50 * * * * * * * * * 604 1547 * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 2301 0 0 T 51 * * * * * * * * * * * * * * * 1197 827 * * * 51 0 * * * * * * 2301 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 2301 0 0 S 53 * * 1197 * * * * * * * * * * * * 1547 2174 * * * 53 0 * * * * * * 2301 0 0 D 54 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 2301 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 2301 0 0 P 56 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 56 0 * * * * * * 2301 0 0 L 57 * * * * * * * * * 1547 * * * * 604 * * * * * 57 0 * * * * * * 2301 0 0 L 58 * * * * * * * * * 385 2094 * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 2301 0 0 D 59 * * 362 * * 2174 * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 2301 0 0 R 60 * * * * * * * * 604 * * * * * 1547 * * * * * 60 0 * * * * * * 2301 0 0 L 61 * * * * * * * 2308 * 325 * * * * * * * * * * 61 362 * 2174 * * * * 2301 0 0 N 62 * * 1935 * * * * * * * * 1238 1670 * * * * * * * 62 0 * * * * * 0 2020 0 1000 Q 63 * * * 1670 * * * * * * * 1935 * 1238 * * * * * * 63 0 * * * * 0 * 2020 0 1000 P 64 * * * * * * * * * * * 2308 827 * * * * * * 2094 64 0 * * * * * * 2301 0 0 V 65 * * * * * * * 2308 * 2094 * * * * * * 2174 1547 * * 65 0 * * * * * * 2301 0 0 N 66 * * * * * * * * 2174 1197 * 1547 * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 2301 0 0 N 67 * * 2094 2174 * * * * * * * 1547 * * * 2308 * * * * 67 0 * * * * * * 2301 0 0 V 68 * * * * * 2094 * 2539 2308 * * * 2174 * * * * 2556 * * 68 0 * * * * * * 2301 0 0 E 69 * * * 1547 * * * * * 1197 2174 * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 2301 0 0 D 70 * * 1547 * * * * * * * * 2094 * * * 2308 2174 * * * 70 0 * * * * * * 2301 0 0 V 71 1299 * * * * * * * * * * * 2174 * * * * 2556 * 2308 71 0 * * * * * * 2301 0 0 K 72 * * * 1133 * * * * 878 * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 2301 0 0 R 73 * * * 604 * * * * * * * * * * 1547 * * * * * 73 0 * * * * * * 2301 0 0 M 74 2174 * * * * * * 2094 * 2308 1547 * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 2301 0 0 I 75 * * * * * * * 385 * 2094 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 2301 0 0 A 76 1547 * * * * 604 * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 2301 0 0 I 77 * * * * * * * 1547 * 604 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 2301 0 0 S 78 * 604 * * * * * * * * * * * * * 1547 * * * * 78 0 * * * * * * 2301 0 0 A 79 878 * * * * 1133 * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 2301 0 0 K 80 * * * * * * * 2094 1547 2174 * * * * * * * 2308 * * 80 0 * * * * * * 2301 0 0 V 81 * * * * * * * 2094 * 1239 * * * * * * * 1547 * * 81 0 * * * * * * 2301 0 0 A 82 385 * * * * * * * * * * * * * * 2094 * * * * 82 0 * * * * * * 2301 0 0 R 83 * * * 604 * * * * * * * * * * 1547 * * * * * 83 0 * * * * * * 2301 0 0 D 84 * * 1547 * * * * * 604 * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 2301 0 0 I 85 * * * * * * * 1547 * * * * * * * * * 604 * * 85 0 * * * * * * 2301 0 0 G 86 * * * * * 1547 * * * * * * * * * * 2174 1197 * * 86 0 * * * * * * 2301 0 0 R 87 * * * 2539 * * 1239 * * * * * * * 2556 2094 * * * * 87 362 2174 * 0 * * * 2301 1000 0 R 88 2094 * * * * * 2174 * * * * * * * 1547 * * * * 2308 88 0 * * * * * * 2301 0 0 S 89 * * * * * * * * * * * * 2308 * * 1547 2094 * * 2174 89 827 1197 * 0 * * * 2301 1478 0 E 90 * * * 795 * * * * * * * 2174 * * * * 2308 * * * 90 0 * * * * * * 2301 0 0 I 91 * * * * * * * 878 * * * * * * * * * 1133 * * 91 0 * * * * * * 2301 0 0 R 92 * * * * * * * * 2308 * * 1133 * * 1547 * * * * * 92 0 * * * * * * 2301 0 0 W 93 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 93 0 * * * * * * 2301 0 0 E 94 * * 1133 878 * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 2301 0 0 D 95 * * 2556 2539 * * * * 2308 * * * * * 2094 * * 2174 * * 95 0 * * * * * * 2301 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * * * * * 1547 * 604 * * 96 0 * * * * * * 2301 0 0 F 97 * * * * 385 * * * * * * * * * * * * * * 2094 97 0 * * * * * * 2301 0 0 T 98 * * 2174 2094 * * * * * * * 2308 * * * * 1547 * * * 98 0 * * * * * * 2301 0 0 I 99 * * * 2174 * * * 1547 * * * * * * * 2094 2308 * * * 99 0 * * * * * * 2301 0 0 L 100 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 2301 0 0 F 101 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 101 325 2308 * 0 * * * 2301 1000 0 R 102 * * * * * * * * * * * 2094 * * 878 2174 * * * * 102 0 * * * * * * 2301 0 0 M 103 * * * * * * * 2094 * 2308 1547 * * * * * * 2174 * * 103 0 * * * * * * 2301 0 0 I 104 * * * * * * * 1547 * 2094 2174 * * * * * 2308 * * * 104 0 * * * * * * 2301 0 0 E 105 * * 2094 1547 * * * * 2174 * * 2308 * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 2301 0 0 K 106 * * * 1197 * * * * 2556 * * * * * 2174 * 2539 * * * 106 0 * * * * * * 2301 0 0 Y 107 * * 1290 * * * * * * * * * * * * * * * * 759 107 0 * * * * * * 1581 0 0 F 108 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1581 0 0 D 109 * * 759 * * * * * * * * * * * * * 1290 * * * 109 0 * * * * * * 1581 0 0 D 110 * * 759 1290 * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1581 0 0 L 111 * * * * * * * 1290 * 759 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1581 0 0 M 112 * * * * * * * * 1290 * 759 * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1581 0 0 T 113 * * * * * * * 1748 * * * * * * * * 510 * * * 113 0 * * * * * * 1581 0 0 D 114 * * 759 * 1290 * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1581 0 0 L 115 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1581 0 0 Y 116 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 116 0 * * * * * * 1075 0 0 G 117 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * 0 * * * 1075 0 0 //