HHsearch 1.5 NAME c8xwyD_ FAM FILE c8xwyD_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c8xwyD_.a3m DATE Sat Jan 25 10:25:39 2025 LENG 162 match states, 162 columns in multiple alignment FILT 2 out of 4 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.3930 -2.0880 SEQ >ss_pred CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHCCCCEEHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >ss_conf 9731787976436768857999999765888764202556315345743487702008886720686686879987788898876520000120699999 99840689898755353220552041589999999999999999999999996622575569 >Consensus pxxxlxxlrxefxislxlxrkllseirgxahxfaxshlxgvxlxxlplxqxpxvsxtxxxwxxlsdpxrlcxxsxxlxxfxaxlxxlgxqgwxxxxrxxl wxxxldlrdlqxhlxfqixaxgxqxswpqllstyxllxslelvxxrairxxlllskxghsvw >c8xwyD_ PQLSLQELRREFTVSLHLARKLLSEVRGQAHRFAESHLPGVNLYLLPLGQLPDVSLTFQAWRRLSDPERLCFISTTLQPFHALLGGLGTQGWTNMERMQL WAMRLDLRDLQRHLRFQVLAAGFQVSWPQLLSTYRLLHSLELVLSRAVRELLLLSKAGHSVW >UniRef50_UPI0000F2DAFA(29-211:218) PREDICTED: similar to IL-27 p28 subunit n=1 Tax=Monodelphis domestica RepID=UPI0000F2DAFA E=4e-57 s/c=1.21 id=58% cov=98% PPHDLLDLRSEFKISLRLSRKLLSEIRGIAHLFADTHLVGVSLDFLPLrEQFPNVTMTLKTWIQLSDPDRLCSLSRLLGHFQAPLRELkGHQGWKGSLRK RLWMAQLDLRDLQSHLHFQIKANGYcaledketqelekrnlerfslpvhQASWPQLLSTYQLLRSLELVMARAIRDFLLLSKG----- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * P 1 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1332 0 0 Q 2 * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * 2 0 * * * * * * 1332 0 0 L 3 * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1332 0 0 S 4 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 4 0 * * * * * * 1332 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1332 0 0 Q 6 * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * 6 0 * * * * * * 1332 0 0 E 7 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1332 0 0 L 8 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1332 0 0 R 9 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 9 0 * * * * * * 1332 0 0 R 10 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 10 0 * * * * * * 1332 0 0 E 11 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1332 0 0 F 12 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1332 0 0 T 13 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 13 0 * * * * * * 1332 0 0 V 14 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 14 0 * * * * * * 1332 0 0 S 15 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 15 0 * * * * * * 1332 0 0 L 16 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1332 0 0 H 17 * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * 17 0 * * * * * * 1332 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1332 0 0 A 19 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 19 0 * * * * * * 1332 0 0 R 20 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 20 0 * * * * * * 1332 0 0 K 21 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1332 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1332 0 0 L 23 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1332 0 0 S 24 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 24 0 * * * * * * 1332 0 0 E 25 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1332 0 0 V 26 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 26 0 * * * * * * 1332 0 0 R 27 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 27 0 * * * * * * 1332 0 0 G 28 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1332 0 0 Q 29 * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * 29 0 * * * * * * 1332 0 0 A 30 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1332 0 0 H 31 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1332 0 0 R 32 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * 32 0 * * * * * * 1332 0 0 F 33 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1332 0 0 A 34 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1332 0 0 E 35 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1332 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 36 0 * * * * * * 1332 0 0 H 37 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1332 0 0 L 38 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1332 0 0 P 39 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * 39 0 * * * * * * 1332 0 0 G 40 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1332 0 0 V 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 41 0 * * * * * * 1332 0 0 N 42 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 42 0 * * * * * * 1332 0 0 L 43 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1332 0 0 Y 44 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 44 0 * * * * * * 1332 0 0 L 45 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1332 0 0 L 46 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1332 0 0 P 47 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1332 0 0 L 48 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 48 1000 1000 * 0 * * * 1332 1000 0 G 49 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1332 0 0 Q 50 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 50 0 * * * * * * 1332 0 0 L 51 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1332 0 0 P 52 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1332 0 0 D 53 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1332 0 0 V 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 54 0 * * * * * * 1332 0 0 S 55 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 55 0 * * * * * * 1332 0 0 L 56 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1332 0 0 T 57 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 57 0 * * * * * * 1332 0 0 F 58 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1332 0 0 Q 59 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 59 0 * * * * * * 1332 0 0 A 60 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 60 0 * * * * * * 1332 0 0 W 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 61 0 * * * * * * 1332 0 0 R 62 * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * 62 0 * * * * * * 1332 0 0 R 63 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 63 0 * * * * * * 1332 0 0 L 64 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1332 0 0 S 65 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 65 0 * * * * * * 1332 0 0 D 66 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1332 0 0 P 67 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1332 0 0 E 68 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1332 0 0 R 69 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 69 0 * * * * * * 1332 0 0 L 70 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1332 0 0 C 71 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1332 0 0 F 72 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * 72 0 * * * * * * 1332 0 0 I 73 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1332 0 0 S 74 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 74 0 * * * * * * 1332 0 0 T 75 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * 75 0 * * * * * * 1332 0 0 T 76 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 76 0 * * * * * * 1332 0 0 L 77 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1332 0 0 Q 78 * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * 78 0 * * * * * * 1332 0 0 P 79 * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1332 0 0 F 80 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1332 0 0 H 81 * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * 81 0 * * * * * * 1332 0 0 A 82 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1332 0 0 L 83 * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1332 0 0 L 84 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1332 0 0 G 85 * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * 85 0 * * * * * * 1332 0 0 G 86 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1332 0 0 L 87 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 87 1000 1000 * 0 * * * 1332 1000 0 G 88 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1332 0 0 T 89 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * 89 0 * * * * * * 1332 0 0 Q 90 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 90 0 * * * * * * 1332 0 0 G 91 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1332 0 0 W 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 92 0 * * * * * * 1332 0 0 T 93 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 93 0 * * * * * * 1332 0 0 N 94 * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1332 0 0 M 95 * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * 95 0 * * * * * * 1332 0 0 E 96 * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1332 0 0 R 97 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 97 0 * * * * * * 1332 0 0 M 98 * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1332 0 0 Q 99 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 99 0 * * * * * * 1332 0 0 L 100 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1332 0 0 W 101 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 101 0 * * * * * * 1332 0 0 A 102 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1332 0 0 M 103 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1332 0 0 R 104 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 104 0 * * * * * * 1332 0 0 L 105 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1332 0 0 D 106 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1332 0 0 L 107 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1332 0 0 R 108 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 108 0 * * * * * * 1332 0 0 D 109 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1332 0 0 L 110 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1332 0 0 Q 111 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 111 0 * * * * * * 1332 0 0 R 112 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 112 0 * * * * * * 1332 0 0 H 113 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1332 0 0 L 114 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1332 0 0 R 115 * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * 115 0 * * * * * * 1332 0 0 F 116 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1332 0 0 Q 117 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 117 0 * * * * * * 1332 0 0 V 118 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 118 0 * * * * * * 1332 0 0 L 119 * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1332 0 0 A 120 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1332 0 0 A 121 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1332 0 0 G 122 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1332 0 0 F 123 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 123 1000 1000 * 4585 61 * * 1332 1000 0 Q 124 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 124 0 * * * * * * 1332 0 0 V 125 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 125 0 * * * * * * 1332 0 0 S 126 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 126 0 * * * * * * 1332 0 0 W 127 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 127 0 * * * * * * 1332 0 0 P 128 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1332 0 0 Q 129 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 129 0 * * * * * * 1332 0 0 L 130 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1332 0 0 L 131 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1332 0 0 S 132 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 132 0 * * * * * * 1332 0 0 T 133 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 133 0 * * * * * * 1332 0 0 Y 134 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 134 0 * * * * * * 1332 0 0 R 135 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 135 0 * * * * * * 1332 0 0 L 136 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1332 0 0 L 137 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1332 0 0 H 138 * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * 138 0 * * * * * * 1332 0 0 S 139 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 139 0 * * * * * * 1332 0 0 L 140 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1332 0 0 E 141 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1332 0 0 L 142 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1332 0 0 V 143 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 143 0 * * * * * * 1332 0 0 L 144 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1332 0 0 S 145 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 145 0 * * * * * * 1332 0 0 R 146 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 146 0 * * * * * * 1332 0 0 A 147 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1332 0 0 V 148 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 148 0 * * * * * * 1332 0 0 R 149 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 149 0 * * * * * * 1332 0 0 E 150 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1332 0 0 L 151 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1332 0 0 L 152 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1332 0 0 L 153 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1332 0 0 L 154 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1332 0 0 S 155 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 155 0 * * * * * * 1332 0 0 K 156 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1332 0 0 A 157 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1332 0 0 G 158 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 H 159 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 S 160 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 V 161 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 W 162 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 162 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //