HHsearch 1.5 NAME c8w5pC_ FAM FILE c8w5pC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c8w5pC_.a3m DATE Sat Mar 1 10:52:08 2025 LENG 126 match states, 126 columns in multiple alignment FILT 2 out of 4 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.2 EVD 0.3982 -1.1134 SEQ >ss_pred CCCCEEEHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHEEEEEEEEEECCCCCHHH HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCC >ss_conf 9540466132167874269973578884221012332157421001368886189618999960863113578767001000011147886303641035 67888889874171022366306889 >Consensus aklxxvtlxxigkxgxqtlxlxprgvnptngvaslsxagavpalekrvtvsvxqpnxkvqvkxqnptactxxgxcdpsvtrxaxadvtxsftxystdeer axvrtelaallaxplxidaidxlnpa >c8w5pC_ AKLETVTLGNIGKDGKQTLVLNPRGVNPTNGVASLSQAGAVPALEKRVTVSVSQPNYKVQVKIQNPTACTANGSCDPSVTRQAYADVTFSFTQYSTDEER AFVRTELAALLASPLLIDAIDQLNPA >UniRef50_P09677(2-131:331) Coat protein n=47 Tax=Allolevivirus RepID=VA1_BPSP E=2e-49 s/c=1.51 id=79% cov=100% AKLNQVTLSKIGKNGDQTLTLTPRGVNPTNGVASLSEAGAVPALEKRVTVSVAQPsrnrkNFKVQIKLQNPTACTRD-ACDPSVTRSAFADVTLSFTSYS TDEERALIRTELAALLADPLIVDAIDNLNPA # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * A 1 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1154 0 0 K 2 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1154 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1154 0 0 E 4 * * * 989 * * * * * * * 1011 * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1154 0 0 T 5 * * * * * * * * * * * * * 1011 * * 989 * * * 5 0 * * * * * * 1154 0 0 V 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 6 0 * * * * * * 1154 0 0 T 7 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 7 0 * * * * * * 1154 0 0 L 8 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1154 0 0 G 9 * * * * * 989 * * * * * * * * * 1011 * * * * 9 0 * * * * * * 1154 0 0 N 10 * * * * * * * * 1011 * * 989 * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1154 0 0 I 11 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1154 0 0 G 12 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1154 0 0 K 13 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1154 0 0 D 14 * * 989 * * * * * * * * 1011 * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1154 0 0 G 15 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1154 0 0 K 16 * * 1011 * * * * * 989 * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1154 0 0 Q 17 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 17 0 * * * * * * 1154 0 0 T 18 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 18 0 * * * * * * 1154 0 0 L 19 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1154 0 0 V 20 * * * * * * * * * * * * * * * * 1011 989 * * 20 0 * * * * * * 1154 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1154 0 0 N 22 * * * * * * * * * * * 989 * * * * 1011 * * * 22 0 * * * * * * 1154 0 0 P 23 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1154 0 0 R 24 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 24 0 * * * * * * 1154 0 0 G 25 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1154 0 0 V 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 26 0 * * * * * * 1154 0 0 N 27 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1154 0 0 P 28 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1154 0 0 T 29 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 29 0 * * * * * * 1154 0 0 N 30 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1154 0 0 G 31 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1154 0 0 V 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 32 0 * * * * * * 1154 0 0 A 33 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1154 0 0 S 34 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 34 0 * * * * * * 1154 0 0 L 35 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1154 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 36 0 * * * * * * 1154 0 0 Q 37 * * * 1011 * * * * * * * * * 989 * * * * * * 37 0 * * * * * * 1154 0 0 A 38 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1154 0 0 G 39 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1154 0 0 A 40 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1154 0 0 V 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 41 0 * * * * * * 1154 0 0 P 42 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1154 0 0 A 43 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1154 0 0 L 44 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1154 0 0 E 45 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1154 0 0 K 46 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1154 0 0 R 47 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 47 0 * * * * * * 1154 0 0 V 48 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 48 0 * * * * * * 1154 0 0 T 49 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 49 0 * * * * * * 1154 0 0 V 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 50 0 * * * * * * 1154 0 0 S 51 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 51 0 * * * * * * 1154 0 0 V 52 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 52 0 * * * * * * 1154 0 0 S 53 1011 * * * * * * * * * * * * * * 989 * * * * 53 0 * * * * * * 1154 0 0 Q 54 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 54 0 * * * * * * 1154 0 0 P 55 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 55 989 1011 * 2322 322 * * 1154 1000 0 N 56 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1154 0 0 Y 57 * * * * 1011 * * * * * * * * * * * * * * 989 57 0 * * * * * * 1154 0 0 K 58 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1154 0 0 V 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 59 0 * * * * * * 1154 0 0 Q 60 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 60 0 * * * * * * 1154 0 0 V 61 * * * * * * * 1011 * * * * * * * * * 989 * * 61 0 * * * * * * 1154 0 0 K 62 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1154 0 0 I 63 * * * * * * * 989 * 1011 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1154 0 0 Q 64 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 64 0 * * * * * * 1154 0 0 N 65 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1154 0 0 P 66 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1154 0 0 T 67 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 67 0 * * * * * * 1154 0 0 A 68 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1154 0 0 C 69 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1154 0 0 T 70 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 70 0 * * * * * * 1154 0 0 A 71 989 * * * * * * * * * * * * * 1011 * * * * * 71 0 * * * * * * 1154 0 0 N 72 * * 1011 * * * * * * * * 989 * * * * * * * * 72 989 * 1011 * * * * 1154 0 0 G 73 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 S 74 1011 * * * * * * * * * * * * * * 989 * * * * 74 0 * * * * * * 1154 0 0 C 75 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1154 0 0 D 76 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1154 0 0 P 77 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1154 0 0 S 78 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 78 0 * * * * * * 1154 0 0 V 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 79 0 * * * * * * 1154 0 0 T 80 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 80 0 * * * * * * 1154 0 0 R 81 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 81 0 * * * * * * 1154 0 0 Q 82 * * * * * * * * * * * * * 989 * 1011 * * * * 82 0 * * * * * * 1154 0 0 A 83 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1154 0 0 Y 84 * * * * 1011 * * * * * * * * * * * * * * 989 84 0 * * * * * * 1154 0 0 A 85 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1154 0 0 D 86 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1154 0 0 V 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 87 0 * * * * * * 1154 0 0 T 88 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 88 0 * * * * * * 1154 0 0 F 89 * * * * 989 * * * * 1011 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1154 0 0 S 90 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 90 0 * * * * * * 1154 0 0 F 91 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1154 0 0 T 92 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 92 0 * * * * * * 1154 0 0 Q 93 * * * * * * * * * * * * * 989 * 1011 * * * * 93 0 * * * * * * 1154 0 0 Y 94 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 94 0 * * * * * * 1154 0 0 S 95 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 95 0 * * * * * * 1154 0 0 T 96 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 96 0 * * * * * * 1154 0 0 D 97 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1154 0 0 E 98 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1154 0 0 E 99 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1154 0 0 R 100 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 100 0 * * * * * * 1154 0 0 A 101 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1154 0 0 F 102 * * * * 989 * * * * 1011 * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1154 0 0 V 103 * * * * * * * 1011 * * * * * * * * * 989 * * 103 0 * * * * * * 1154 0 0 R 104 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 104 0 * * * * * * 1154 0 0 T 105 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 105 0 * * * * * * 1154 0 0 E 106 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1154 0 0 L 107 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1154 0 0 A 108 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1154 0 0 A 109 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1154 0 0 L 110 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1154 0 0 L 111 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1154 0 0 A 112 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1154 0 0 S 113 * * 1011 * * * * * * * * * * * * 989 * * * * 113 0 * * * * * * 1154 0 0 P 114 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1154 0 0 L 115 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1154 0 0 L 116 * * * * * * * 1011 * 989 * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1154 0 0 I 117 * * * * * * * 989 * * * * * * * * * 1011 * * 117 0 * * * * * * 1154 0 0 D 118 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1154 0 0 A 119 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1154 0 0 I 120 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1154 0 0 D 121 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1154 0 0 Q 122 * * * * * * * * * * * 1011 * 989 * * * * * * 122 0 * * * * * * 1154 0 0 L 123 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1154 0 0 N 124 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1154 0 0 P 125 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1154 0 0 A 126 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * 0 * * * 1154 0 0 //