HHsearch 1.5 NAME c8rv3A_ FAM FILE c8rv3A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c8rv3A_.a3m DATE Sat Feb 15 09:57:39 2025 LENG 126 match states, 126 columns in multiple alignment FILT 3 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4356 0.7398 SEQ >ss_pred CCHHHHHHHHHCCHHEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCC >ss_conf 9304767765507002688852027989999877888765066731248999999963011000694210478999999870421011999987779899 99999860552279999988653069 >Consensus rrvklrkhxxeinadeititlskytsxealersitalaamtghaxssixeecxelidkldxlkvxxxvxxyxtlskxiexynsqxhlsiexlisglavrr kvcklvxxxxxdxxvxxaldemaxga >c8rv3A_ RRVKLRKHLVEINADEITITLSRYTSPEALERSITALAAMTGHAPSSIKEECVELIDKLDWLRVENDVIQYPTLSKLLELYNSQNHLSIEKLIAGLAVRR KVCKLVQDGHIDETVYRALDEMAAGA >UniRef50_B5ES90(535-661:661) RctB n=92 Tax=Vibrionales RepID=B5ES90_VIBFM E=3e-41 s/c=1.33 id=68% cov=98% RRVKLRKHSAEINADELTITLTKYTSEQALERSITALSAMTGHSSSSISDECKELLDKLDYLKVAGEILPYETLSKTIEFYNSQDhgkHLSIENLISGLA VRRKICKLVYSQNYDQDVLHALDEMA--- >UniRef50_C9P7Q7(578-705:706) Putative uncharacterized protein n=3 Tax=Vibrionaceae RepID=C9P7Q7_VIBME E=8e-55 s/c=1.67 id=80% cov=100% RRVKLRKHLVEINADEITITLSKYTSAEALERSITALAAMTGHAPSSIREECQELIDKLDWLKVDDCVVPYSTLSKVIELYNTQHrnkHLSIERLISGLA VRRKVCKLVYEEHIDDTVFRALDEVAIG- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * R 1 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 1 0 * * * * * * 1310 0 0 R 2 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 2 0 * * * * * * 1310 0 0 V 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 3 0 * * * * * * 1310 0 0 K 4 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1310 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1310 0 0 R 6 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 6 0 * * * * * * 1310 0 0 K 7 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1310 0 0 H 8 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1310 0 0 L 9 * * * * * * * * * 627 * * * * * 1505 * * * * 9 0 * * * * * * 1310 0 0 V 10 1505 * * * * * * * * * * * * * * * * 627 * * 10 0 * * * * * * 1310 0 0 E 11 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1310 0 0 I 12 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1310 0 0 N 13 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1310 0 0 A 14 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1310 0 0 D 15 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1310 0 0 E 16 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1310 0 0 I 17 * * * * * * * 627 * 1505 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1310 0 0 T 18 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 18 0 * * * * * * 1310 0 0 I 19 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1310 0 0 T 20 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 20 0 * * * * * * 1310 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1310 0 0 S 22 * * * * * * * * * * * * * * * 627 1505 * * * 22 0 * * * * * * 1310 0 0 R 23 * * * * * * * * 573 * * * * * 1609 * * * * * 23 0 * * * * * * 1310 0 0 Y 24 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 24 0 * * * * * * 1310 0 0 T 25 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 25 0 * * * * * * 1310 0 0 S 26 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 26 0 * * * * * * 1310 0 0 P 27 1645 * * 1505 * * * * * * * * 1609 * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1310 0 0 E 28 * * * 627 * * * * * * * * * 1505 * * * * * * 28 0 * * * * * * 1310 0 0 A 29 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1310 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1310 0 0 E 31 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1310 0 0 R 32 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 32 0 * * * * * * 1310 0 0 S 33 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 33 0 * * * * * * 1310 0 0 I 34 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1310 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 35 0 * * * * * * 1310 0 0 A 36 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1310 0 0 L 37 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1310 0 0 A 38 627 * * * * * * * * * * * * * * 1505 * * * * 38 0 * * * * * * 1310 0 0 A 39 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1310 0 0 M 40 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1310 0 0 T 41 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 41 0 * * * * * * 1310 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1310 0 0 H 43 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1310 0 0 A 44 627 * * * * * * * * * * * * * * 1505 * * * * 44 0 * * * * * * 1310 0 0 P 45 * * * * * * * * * * * * 627 * * 1505 * * * * 45 0 * * * * * * 1310 0 0 S 46 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 46 0 * * * * * * 1310 0 0 S 47 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 47 0 * * * * * * 1310 0 0 I 48 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1310 0 0 K 49 * * * * * * * * 1609 * * * * * 1645 1505 * * * * 49 0 * * * * * * 1310 0 0 E 50 * * 1505 627 * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1310 0 0 E 51 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1310 0 0 C 52 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1310 0 0 V 53 * * * * * * * * 1505 * * * * 1645 * * * 1609 * * 53 0 * * * * * * 1310 0 0 E 54 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1310 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1310 0 0 I 56 * * * * * * * 627 * 1505 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1310 0 0 D 57 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1310 0 0 K 58 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1310 0 0 L 59 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1310 0 0 D 60 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1310 0 0 W 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 627 1505 61 0 * * * * * * 1310 0 0 L 62 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1310 0 0 R 63 * * * * * * * * 573 * * * * * 1609 * * * * * 63 0 * * * * * * 1310 0 0 V 64 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 64 0 * * * * * * 1310 0 0 E 65 1505 * 1645 1609 * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1310 0 0 N 66 * * 1645 * * 1505 * * * * * 1609 * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1310 0 0 D 67 * 1645 1609 1505 * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1310 0 0 V 68 * * * * * * * 1505 * * * * * * * * * 627 * * 68 0 * * * * * * 1310 0 0 I 69 * * * * * * * 1609 * 1505 * * * * * * * 1645 * * 69 0 * * * * * * 1310 0 0 Q 70 * * * * * * * * * * * * 573 1609 * * * * * * 70 0 * * * * * * 1310 0 0 Y 71 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 71 0 * * * * * * 1310 0 0 P 72 * * * 1505 * * * * * * * * 1609 * * 1645 * * * * 72 0 * * * * * * 1310 0 0 T 73 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 73 0 * * * * * * 1310 0 0 L 74 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1310 0 0 S 75 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 75 0 * * * * * * 1310 0 0 K 76 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1310 0 0 L 77 * * * * * * * * * 1609 * * * * * * 1505 1645 * * 77 0 * * * * * * 1310 0 0 L 78 * * * * * * * 573 * 1609 * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1310 0 0 E 79 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1310 0 0 L 80 * * * * 1505 * * * * 627 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1310 0 0 Y 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 81 0 * * * * * * 1310 0 0 N 82 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1310 0 0 S 83 * * * * * * * * * * * * * * * 556 1645 * * * 83 0 * * * * * * 1310 0 0 Q 84 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 84 0 * * * * * * 1310 0 0 N 85 * * 1505 * * * 1645 * * * * 1609 * * * * * * * * 85 1609 573 * 1585 585 * * 1310 1218 0 H 86 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1310 0 0 L 87 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1310 0 0 S 88 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 88 0 * * * * * * 1310 0 0 I 89 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1310 0 0 E 90 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1310 0 0 K 91 * * * * * * * * 1609 * * 1505 * * 1645 * * * * * 91 0 * * * * * * 1310 0 0 L 92 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1310 0 0 I 93 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1310 0 0 A 94 1609 * * * * * * * * * * * * * * 573 * * * * 94 0 * * * * * * 1310 0 0 G 95 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1310 0 0 L 96 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1310 0 0 A 97 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1310 0 0 V 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 98 0 * * * * * * 1310 0 0 R 99 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 99 0 * * * * * * 1310 0 0 R 100 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 100 0 * * * * * * 1310 0 0 K 101 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1310 0 0 V 102 * * * * * * * 1505 * * * * * * * * * 627 * * 102 0 * * * * * * 1310 0 0 C 103 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1310 0 0 K 104 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1310 0 0 L 105 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1310 0 0 V 106 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 106 0 * * * * * * 1310 0 0 Q 107 * * * * * * * * * * * * * 1609 * * * * * 573 107 0 * * * * * * 1310 0 0 D 108 * * 1609 1645 * * * * * * * * * * * 1505 * * * * 108 0 * * * * * * 1310 0 0 G 109 * * * 1645 * 1609 * * * * * * * 1505 * * * * * * 109 0 * * * * * * 1310 0 0 H 110 * * * * * * 627 * * * * 1505 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1310 0 0 I 111 * * * * * * * 627 * * * * * * * * * * * 1505 111 0 * * * * * * 1310 0 0 D 112 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1310 0 0 E 113 * * 1645 1609 * * * * * * * * * 1505 * * * * * * 113 0 * * * * * * 1310 0 0 T 114 * * 1505 * * * * * * * * * * * * * 627 * * * 114 0 * * * * * * 1310 0 0 V 115 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 115 0 * * * * * * 1310 0 0 Y 116 * * * * 1645 * * * * 1505 * * * * * * * * * 1609 116 0 * * * * * * 1310 0 0 R 117 * * * * * * 1505 * * * * * * * 627 * * * * * 117 0 * * * * * * 1310 0 0 A 118 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1310 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1310 0 0 D 120 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1310 0 0 E 121 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1310 0 0 M 122 * * * * * * * * * * 556 * * * * * * 1645 * * 122 0 * * * * * * 1310 0 0 A 123 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1310 0 0 A 124 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1142 0 0 G 125 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1142 0 0 A 126 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //